ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
ステップ1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1ELR、1ELW、2LNI、3ESK、3FWV
識別子 エイリアス STIP1 、HEL-S-94n、HOP、IEF-SSP-3521、P60、STI1、STI1L、ストレス誘導リン酸化タンパク質1 外部ID オミム :605063; MGI : 109130; ホモロジーン : 4965; ジーンカード :STIP1; OMA :STIP1 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 19番染色体(マウス) [2] バンド 19|19 A 始める 6,998,070 bp [2] 終わり 7,017,335 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 左精巣 神経節隆起 心室帯 右精巣 ランゲルハンス島 右副腎 左副腎 右副腎皮質 左副腎皮質 子宮内膜間質細胞
上位の表現 桑実胚 桑実胚 胚の尾 卵黄嚢 胚葉上層 胚盤胞 心室帯 胚 性器結節 神経管
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 Hsp70タンパク質結合 タンパク質C末端結合 シャペロン結合 タンパク質結合 RNA結合 Hsp90タンパク質結合 細胞成分 細胞質 ミエリン鞘 ゴルジ体 核 細胞質 タンパク質含有複合体 シャペロン複合体 生物学的プロセス ストレスへの反応 インターロイキン-7に対する細胞応答 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_006819 NM_001282652 NM_001282653
RefSeq(タンパク質) NP_001269581 NP_001269582 NP_006810
場所(UCSC) 11章: 64.19 – 64.2 Mb 19章7節 – 7.02MB PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ストレス誘導リン酸化タンパク質1( Hsp70-Hsp90形成タンパク質 、 Hop )は、 ヒトにおいて STIP1遺伝子によってコードされています。Hopは、タンパク質 シャペロン Hsp70 と Hsp90 を可逆的に連結するコシャペロンとして機能します 。 [5]
STI1は、主要な シャペロン (主に 熱ショックタンパク質)を制御・補助する コシャペロン の大きなグループに属します 。Hsp70-Hsp90複合体の中で最も研究が進んでいるコシャペロンの一つです。 酵母 で初めて発見され、ヒト、マウス、ラット、昆虫、植物、寄生虫、ウイルスで 相同遺伝子 が同定されています。これらのタンパク質ファミリーはSTI1(ストレス誘導性タンパク質)と呼ばれ、酵母、植物、動物のSTI1(ホップ)に分類されます。
同義語 ホップ Hsc70/Hsp90組織化タンパク質 NY-REN-11抗原 P60 STI1 STI1L ステップ1 形質転換感受性タンパク質IEF-SSP-3521
遺伝子 STIP1は 染色体 11q 13.1 に位置し、14 個の エクソン から構成されます。
構造 STIタンパク質は、いくつかの構造的特徴によって特徴付けられます。すべてのホモログは9つの テトラトリコペプチドリピート (TPR)モチーフを有し、これらは3つのTPRドメインにクラスター化されています。TPRモチーフは多くのタンパク質で用いられる非常に一般的な構造的特徴であり、タンパク質間相互作用を誘導する能力を有しています。N 末端 TPR1ドメインと中央TPR2Aドメインは、Hsp90およびHsp70 リガンド ペプチドと複合体を形成しており、 結晶 構造情報が得られています 。 [6]
Hsp70-Hsp90 組織化タンパク質(ホップ、ヒトではSTIP1)は、Hsp70とHsp90間のクライアントタンパク質の輸送を担うコシャペロンです。ホップは真核生物において進化的に保存されており、核と細胞質の両方に存在します。 [7] ショウジョウバエの ホップは、3つのテトラトリコペプチドリピートドメイン領域(TPR1、TPR2A、TPR2B)と1つのアスパラギン酸-プロリンリピートドメイン(DP)からなる単量体タンパク質です。TPRドメインはHsp90とHsp70のC末端と相互作用し、TPR1とTPR2BはHsp70に結合し、TPR2AはHsp90に優先的に結合します。熱ショック装置の中間構造は、シャペロン機能が一過性かつ高速であるため、完全に特徴づけることが困難です。 [8]
関数 ホップの主な機能は、 Hsp70 と Hsp90を 結合させることです。しかし、最近の研究では、ホップは結合したタンパク質のシャペロン活性も調節し、他のシャペロンやタンパク質と相互作用する可能性があることが示唆されています。Hsp70/Hsp90の「シャペロンマシン」における役割に加え、ホップは他のタンパク質複合体(例えば、 シグナル伝達 複合体EcR/USPや、ウイルスの複製を可能にするB型 肝炎 ウイルス 逆転写酵素複合体)にも関与しているようです。また、 プリオン タンパク質の受容体としても機能します 。 [9] [10]ホップは様々な細胞領域に存在し、 細胞質 と 核 の間を移動します 。
ショウジョウバエの RNA干渉 経路において、ホップは siRNA のpre-RISC複合体の不可欠な部分であることが示されている 。 [11] ショウジョウバエの Piwi相互作用RNA 経路(転位要素(トランスポゾン)の抑制を担うRNA干渉経路) において、ホップはPiwiと相互作用することが示されており、 [12] ホップがない場合、トランスポゾンは抑制解除され、重度のゲノム不安定性と不妊症につながる。 [13]
相互作用 STI1はPRNP [14] および 熱ショックタンパク質90kDaアルファ(細胞質)メンバーA1 と 相互作用する ことが示されている 。 [15] [16]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000168439 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000024966 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Odunuga OO, Longshaw VM, Blatch GL (2004年10月). 「ホップ:Hsp70/Hsp90アダプタータンパク質以上のもの」 BioEssays . 26 (10): 1058–68 . doi :10.1002/bies.20107. PMID 15382137. S2CID 45168091. ^ Scheufler C, Brinker A, Bourenkov G, Pegoraro S, Moroder L, Bartunik H, Hartl FU, Moarefi I (2000年4月). 「TPRドメイン-ペプチド複合体の構造:Hsp70-Hsp90マルチシャペロン機構の組み立てにおける重要な要素」. Cell . 101 (2): 199– 210. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80830-2 . PMID 10786835. S2CID 18200460. ^ Schmid AB, et al. (2012). 「Hsp90コシャペロンSti1/Hopの機能モジュールのアーキテクチャ」. EMBO J. 31 ( 6): 1506–17 . doi :10.1038/emboj.2011.472. PMC 3321170. PMID 22227520 . ^ Yamamoto S, et al. (2014). 「共シャペロンHSP70/HSP90構成タンパク質(HOP)におけるATPase活性とATP依存性構造変化」 J. Biol. Chem . 289 (14): 9880–6 . doi : 10.1074/jbc.m114.553255 . PMC 3975032. PMID 24535459 . ^ マルティンス VR、グラナー E、ガルシア=アブリュー J、デ・ソウザ SJ、メルカダンテ AF、ベイガ SS、ザナタ SM、ネト VM、ブレンターニ RR (1997 年 12 月)。 「相補性ハイドロパシーは細胞のプリオンタンパク質受容体を特定する」。 自然医学 。 3 (12): 1376–82 . 土井 :10.1038/nm1297-1376。 PMID 9396608。S2CID 20605773 。 ^ ザナタ SM、ロペス MH、メルカダンテ AF、ハッジ GN、キアリーニ LB、野溝 R、フレイタス AR、カブラル AL、リー KS、ジュリアーノ MA、デ オリベイラ E、ジャキエリ SG、バーリンゲーム A、ファン L、リンデン R、ブレンターニ RR、マルティンズ VR (2002 年 7 月)。 「ストレス誘導性タンパク質 1 は、神経保護を引き起こす細胞プリオンの細胞表面リガンドです。」 EMBO ジャーナル 。 21 (13): 3307–16 . 土井 :10.1093/emboj/cdf325。 PMC 125391 。 PMID 12093732。 ^ 岩崎 誠、佐々木 秀次、坂口 勇、鈴木 剛、多田隈 秀、泊 勇 (2015年5月). 「ショウジョウバエRNAi酵素複合体の構築における基本ステップの定義」 Nature . 521 (7553): 533–6 . Bibcode :2015Natur.521..533I. doi :10.1038/nature14254. PMID 25822791. S2CID 4450303. ^ ガンガラージュ VK、イン H、ウェイナー MM、ワン J、ファン XA、リン H (2011 年 2 月)。 「ショウジョウバエ Piwi は、Hsp90 を介した表現型変動の抑制において機能します。」 自然遺伝学 。 43 (2): 153–8 . 土井 :10.1038/ng.743。 PMC 3443399 。 PMID 21186352。 ^ Karam JA, Parikh RY, Nayak D, Rosenkranz D, Gangaraju VK (2017年4月). 「コシャペロンHsp70/Hsp90-organizing protein (Hop)はトランスポゾンサイレンシングとPiwi相互作用RNA (piRNA)の生合成に必須である」. The Journal of Biological Chemistry . 292 (15): 6039– 6046. doi : 10.1074/jbc.C117.777730 . PMC 5391737. PMID 28193840 . ^ ザナタ SM、ロペス MH、メルカダンテ AF、ハッジ GN、キアリーニ LB、野溝 R、フレイタス AR、カブラル AL、リー KS、ジュリアーノ MA、デ オリベイラ E、ジャキエリ SG、バーリンゲーム A、ファン L、リンデン R、ブレンターニ RR、マルティンズ VR (2002 年 7 月)。 「ストレス誘導性タンパク質 1 は、神経保護を引き起こす細胞プリオンの細胞表面リガンドです。」 EMBO ジャーナル 。 21 (13): 3307–16 . 土井 :10.1093/emboj/cdf325。 PMC 125391 。 PMID 12093732。 ^ Scheufler C, Brinker A, Bourenkov G, Pegoraro S, Moroder L, Bartunik H, Hartl FU, Moarefi I (2000年4月). 「TPRドメイン-ペプチド複合体の構造:Hsp70-Hsp90マルチシャペロン機構の組み立てにおける重要な要素」. Cell . 101 (2): 199– 210. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80830-2 . PMID 10786835. S2CID 18200460. ^ Johnson BD, Schumacher RJ, Ross ED, Toft DO (1998年2月). 「ホップはタンパク質フォールディングにおけるHsp70/Hsp90相互作用を制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 273 (6): 3679–86 . doi : 10.1074/jbc.273.6.3679 . PMID 9452498.
さらに読む Rasmussen HH, van Damme J, Puype M, Gesser B, Celis JE, Vandekerckhove J (1992年12月). 「正常ヒト表皮ケラチノサイトの2次元ゲルタンパク質データベースに記録された145種類のタンパク質のマイクロシーケンス」. Electrophoresis . 13 (12): 960–9 . doi :10.1002/elps.11501301199. PMID 1286667. S2CID 41855774. Honoré B, Leffers H, Madsen P, Rasmussen HH, Vandekerckhove J, Celis JE (1992年4月). 「TPRモチーフを含み、ストレス誘導性酵母タンパク質STI1と同一性を有する形質転換感受性ヒトタンパク質の分子クローニングと発現」. The Journal of Biological Chemistry . 267 (12): 8485–91 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)42471-4 . PMID 1569099. 丸山 憲治、菅野 誠(1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」. 遺伝子 . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996年9月). 「正規化と減算:遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」. Genome Research . 6 (9): 791–806 . doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548. Dittmar KD, Pratt WB (1997年5月). 「再構成されたHsp90をベースとしたシャペロン機構によるグルココルチコイド受容体のフォールディング。最初のhsp90、p60、hsp70依存的なステップは、ステロイド結合コンフォメーションの形成に十分である」. The Journal of Biological Chemistry . 272 (20): 13047–54 . doi : 10.1074/jbc.272.20.13047 . PMID 9148915. Dittmar KD, Demady DR, Stancato LF, Krishna P, Pratt WB (1997年8月). 「熱ショックタンパク質(HSP)90を基盤としたシャペロン機構によるグルココルチコイド受容体のフォールディング。p23の役割は、HSP90、p60、HSP70によって形成される受容体・HSP90ヘテロ複合体を安定化させることである」 The Journal of Biological Chemistry . 272 (34): 21213–20 . doi : 10.1074/jbc.272.34.21213 . PMID 9261129. 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一(1997年10月)「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」 Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Zou J, Guo Y, Guettouche T, Smith DF, Voellmy R (1998年8月). 「熱ショック転写因子HSF1の活性化を、HSF1とストレス感受性複合体を形成するHSP90(HSP90複合体)によって抑制する」. Cell . 94 (4): 471–80 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)81588-3 . PMID 9727490. S2CID 9234420. Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (1999年11月). 「腎細胞癌患者における自己抗体による抗原認識」. International Journal of Cancer . 83 (4): 456– 64. doi :10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5. PMID 10508479. S2CID 21839750. Scheufler C, Brinker A, Bourenkov G, Pegoraro S, Moroder L, Bartunik H, Hartl FU, Moarefi I (2000年4月). 「TPRドメイン-ペプチド複合体の構造:Hsp70-Hsp90マルチシャペロン機構の組み立てにおける重要な要素」. Cell . 101 (2): 199– 210. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80830-2 . PMID 10786835. S2CID 18200460. Hernández MP, Chadli A, Toft DO (2002年4月). 「HSP40への結合は、プロゲステロン受容体に対するHSP90シャペロン経路の第一段階である」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (14): 11873–81 . doi : 10.1074/jbc.M111445200 . PMID 11809754. Brinker A, Scheufler C, Von Der Mulbe F, Fleckenstein B, Herrmann C, Jung G, Moarefi I, Hartl FU (2002年5月). 「TPRドメインによるリガンド識別.Hsp70 x Hop x Hsp90複合体におけるEEVD認識の関連性と選択性」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (22): 19265–75 . doi : 10.1074/jbc.M109002200 . PMID 11877417. ザナタ SM、ロペス MH、メルカダンテ AF、ハッジ GN、キアリーニ LB、野溝 R、フレイタス AR、カブラル AL、リー KS、ジュリアーノ MA、デ オリベイラ E、ジャキエリ SG、バーリンゲーム A、ファン L、リンデン R、ブレンタニ RR、マルティンズ VR (2002 年 7 月)。 「ストレス誘導性タンパク質 1 は、神経保護を引き起こす細胞プリオンの細胞表面リガンドです。」 EMBO ジャーナル 。 21 (13): 3307–16 . 土井 :10.1093/emboj/cdf325。 PMC 125391 。 PMID 12093732。 Hernández MP, Sullivan WP, Toft DO (2002年10月). 「hsp70-Hop-hsp90分子シャペロン複合体の集合と分子間特性」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (41): 38294–304 . doi : 10.1074/jbc.M206566200 . PMID 12161444. Abbas-Terki T, Briand PA, Donzé O, Picard D (2002年9月). 「Hsp90コシャペロンCdc37とSti1は物理的および遺伝的に相互作用する」. 生物化学 . 383 (9): 1335–42 . doi :10.1515/BC.2002.152. PMID 12437126. S2CID 9277739. 今井 雄一、曽田 正之、村上 剛、庄司 正治、阿部 健、高橋 亮(2003年12月)「パーキンに隣接するヒト遺伝子の産物はレビー小体の構成因子であり、パエル受容体誘導性細胞死を抑制する」 The Journal of Biological Chemistry . 278 (51): 51901–10 . doi : 10.1074/jbc.M309655200 . PMID 14532270. Longshaw VM, Chapple JP, Balda MS, Cheetham ME, Blatch GL (2004年2月). 「Hsp70/Hsp90形成タンパク質mSTI1の核移行は細胞周期キナーゼによって制御される」. Journal of Cell Science . 117 (Pt 5): 701–10 . doi :10.1242/jcs.00905. PMID 14754904. S2CID 11902067. Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2005年1月). 「がん細胞におけるチロシンリン酸化の免疫親和性プロファイリング」. Nature Biotechnology . 23 (1): 94– 101. doi :10.1038/nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.