ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| HLA-DQB1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1JK8、1S9V、1UVQ、2NNA、4GG6 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | HLA-DQB1、CELIAC1、HLA-DQB、IDDM1、主要組織適合遺伝子複合体、クラスII、DQベータ1、HLA-DRB1 |
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| 外部ID | オミム:604305; MGI : 103070;ホモロジーン: 1603;遺伝子カード: HLA-DQB1; OMA :HLA-DQB1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 17番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 17 B1|17 17.98 cM | 始める | 34,476,663 bp [2] |
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| 終わり | 34,488,393 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 右肺
- 脾臓
- 左肺の上葉
- 胆嚢
- リンパ節
- 単球
- 顆粒球
- 右冠動脈
- 直腸
- 臓側胸膜
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| | 上位の表現 | - 腸間膜リンパ節
- 脾臓
- 胸腺
- 顎下腺
- 外耳の皮膚
- 右肺葉
- リップ
- 白色脂肪組織
- 右腎臓
- 皮下脂肪組織
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | - ペプチド抗原結合
- MHCクラスII受容体活性
- タンパク質結合
| | 細胞成分 | - 膜の不可欠な構成要素
- エンドサイトーシス小胞膜
- クラスリン被覆エンドサイトーシス小胞膜
- エンドソーム
- ゴルジ体
- トランスゴルジネットワーク膜
- 小胞体膜
- 膜
- ゴルジ膜
- 細胞膜
- 輸送小胞膜
- MHCクラスIIタンパク質複合体
- リソソーム膜
- 小胞体
- ERからゴルジ体への輸送小胞膜
- リソソーム
- 小胞体膜の内腔側の不可欠な成分
- エンドソーム膜
| | 生物学的プロセス | - 抗原処理と提示
- MHCクラスIIを介した外因性ペプチド抗原の抗原処理と提示
- インターフェロンγを介したシグナル伝達経路
- 免疫グロブリン産生は免疫グロブリンを介した免疫応答に関与する
- 免疫システムのプロセス
- T細胞共刺激
- MHCクラスIIを介したペプチドまたは多糖抗原の抗原処理および提示
- 循環免疫グロブリンを介した体液性免疫応答
- 免疫反応
- T細胞受容体シグナル伝達経路
- 適応免疫応答
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | ENSG00000233209 ENSG00000206237 ENSG00000231286 ENSG00000206302 ENSG00000179344
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ENSG00000231939 ENSG00000225824 |
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| ユニプロット | | P14483 P01921 P06342 P06343 P06345
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P06346 |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_002123 NM_001243961 NM_001243962 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001230890 NP_001230891 NP_002114 |
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| 場所(UCSC) | 6章: 32.66 – 32.67 Mb | 17章: 34.48 – 34.49 MB |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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主要組織適合遺伝子複合体クラスII DQベータ1(HLA-DQB1とも呼ばれる)はヒト遺伝子であり、この遺伝子を含む遺伝子座も表す。 [5]この遺伝子によってコードされるタンパク質は、免疫系の機能に不可欠な細胞表面受容体であるDQヘテロダイマーを形成するために必要な2つのタンパク質のうちの1つである。
関数
HLA-DQB1は、HLAクラスIIβ鎖パラログに属します。このクラスII分子は、膜に固定されたα鎖(DQA)とβ鎖(DQB)からなるヘテロ二量体です。細胞外タンパク質由来のペプチドを提示することで、免疫系において中心的な役割を果たします。クラスII分子は、抗原提示細胞(APC:Bリンパ球、樹状細胞、マクロファージ)に発現しています。[5]
遺伝子構造と多型
β鎖は約26~28 kDaで、6つのエクソンから構成されています。エクソン1はリーダーペプチドを、エクソン2と3は2つの細胞外タンパク質ドメインを、エクソン4は膜貫通ドメインを、エクソン5は細胞質末端をコードしています。DQ分子内では、α鎖とβ鎖の両方にペプチド結合特異性を決定する多型が含まれており、最大4つの異なる分子が存在します。これらの多型のタイピングは、骨髄移植において日常的に行われています。[5] [6]
疾患との関連性
自閉症
4つの遺伝子座の遺伝子型研究により、A*01-B*07-DRB1*0701-DQB1*0602(P = 0.001、OR 41.9)およびA*31-B*51-DRB1*0103-DQB1*0302(P = 0.012、OR 4.8)がサウジアラビアの患者における自閉症と正の相関関係にあることが示されました。
糖尿病
HLA-DQB1のいくつかのアレルは、 1型糖尿病の発症リスク増加と関連している。[7] [8] [9] この遺伝子座は、1型糖尿病の遺伝的リスクが最も高いことから、IDDM1という遺伝子名も付けられている。DQB1*0201およびDQB1*0302アレル、特にDQB1*0201/*0302の表現型は、1型糖尿病の発症が遅いリスクが高い。このリスクは、HLA-DR遺伝子座(DR3およびDR4血清型)と部分的に共通している。
セリアック病
Celiac1はDQB1の遺伝子名であり、HLA DQB1*0201、*0202、*0302は自己免疫性 セリアック病を媒介する遺伝子をコードしています。DQB1*0201のホモ接合体は、他の遺伝子座と比較してセリアック病を発症するリスクが高くなります。[10]
多発性硬化症
特定のHLA-DQB1アレルは、多発性硬化症のリスクをわずかに増加させることにも関連している。[11] [12]
ナルコレプシー
他のHLA-DQB1アレルはナルコレプシーの素因と関連しており[13]、特にHLA-DQB1*0602はナルコレプシー-カタプレキシー患者の90%以上が保有している[14] 。
対立遺伝子
参照
参考文献
- ^ abc ENSG00000206237, ENSG00000231286, ENSG00000206302, ENSG00000179344, ENSG00000231939, ENSG00000225824 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000233209, ENSG00000206237, ENSG00000231286, ENSG00000206302, ENSG00000179344, ENSG00000231939, ENSG00000225824 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000073421 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ abc 「Entrez Gene: HLA-DQB1主要組織適合遺伝子複合体、クラスII、DQベータ1」。
- ^ Lau M, Terasaki PI, Park MS (1994). 「国際細胞交換 1994」. Clinical Transplants : 467–88 . PMID 7547576.
- ^ Todd JA (1990年4月). 「1型糖尿病における自己免疫の遺伝的制御」. Immunology Today . 11 (4): 122–9 . doi :10.1016/0167-5699(90)90049-F. PMID 2187469.
- ^ Todd JA (1997年3月). 「1型糖尿病の遺伝学」. Pathologie-Biologie . 45 (3): 219–27 . PMID 9296067.
- ^ Redondo MJ, Fain PR, Eisenbarth GS (2001). 「1A型糖尿病の遺伝学」.ホルモン研究の最近の進歩. 56 : 69–89 . doi : 10.1210/rp.56.1.69 . PMID 11237226.
- ^ Murray JA, Moore SB, Van Dyke CT, Lahr BD, Dierkhising RA, Zinsmeister AR, Melton LJ, Kroning CM, El-Yousseff M, Czaja AJ (2007年12月). 「HLA DQ遺伝子量とセリアック病のリスクおよび重症度」. Clinical Gastroenterology and Hepatology . 5 (12): 1406–12 . doi :10.1016/j.cgh.2007.08.013. PMC 2175211. PMID 17919990 .
- ^
- ^ Schmidt H, Williamson D, Ashley-Koch A (2007年5月). 「HLA-DR15ハプロタイプと多発性硬化症:HuGEレビュー」. American Journal of Epidemiology . 165 (10): 1097–109 . doi : 10.1093/aje/kwk118 . PMID 17329717.
- ^ Kadotani H, Faraco J, Mignot E (1998年5月). 「睡眠障害ナルコレプシーの遺伝学的研究」. Genome Research . 8 (5): 427–34 . doi : 10.1101/gr.8.5.427 . PMID 9582188.
- ^ 「ナルコレプシー研究 - FAQ」.
外部リンク