NUP98

NUP98
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1KO6、2Q5X、2Q5Y、3MMY、4OWR、5A9Q​​
識別子
エイリアス	NUP98、ADIR2、NUP196、NUP96、ヌクレオポリン98kDa、ヌクレオポリン98
外部ID	オミム: 601021 ; MGI : 109404 ;ホモロジーン: 35472 ;ジーンカード：NUP98 ; OMA : NUP98 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 11番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 11p15.4 始める 3,671,083 bp [ 1 ] 終わり 3,797,792 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 7番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 7 E2|7 54.71 cM 始める 101,768,605 bp [ 2 ] 終わり 101,859,383 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 左精巣 右精巣 結腸上皮 二次卵母細胞 心室帯 太ももの筋肉 左卵巣 アキレス腱 左卵管 左肺の上葉 上位の表現 二次卵母細胞 接合子 精子細胞 一次卵母細胞 蝸牛管の前庭膜 胚の尾 内頸動脈 外頸動脈 精母細胞 性器結節 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 トランスポーター活性 ペプチド結合 タンパク質結合 核局在配列結合 RNA結合 ペプチダーゼ活性 セリン型ペプチダーゼ活性 加水分解酵素活性 転写コアクチベーター活性 mRNA結合 プロモーター特異的クロマチン結合 核膜孔の構造成分 細胞成分 細胞質 核膜 核膜 核周辺 膜 核孔 核膜孔外輪 核封入体 核孔 核バスケット 核 動原体 核孔細胞質フィラメント 核質 細胞内膜小器官 核体 リボ核タンパク質複合体 宿主細胞 生物学的プロセス mRNA輸送 核膜孔複合体の組み立て DNA複製 タンパク質輸送 ウイルスプロセス 核膜孔の組織化 RNAポリメラーゼII遺伝子DNAの核周辺部における転写後固定 核からのRNAの輸出 核周縁部のテロメア結合 核からのmRNAの輸出 核へのタンパク質の輸入 タンパク質分解 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 スプライソソームを介したmRNAスプライシングの正の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写 核質輸送 核酸テンプレート転写の正の制御 解糖系の調節 核からのtRNAの輸出 タンパク質のSUMO化 ウイルス転写 miRNAによる遺伝子サイレンシングの制御 ウイルスの細胞内輸送 熱に対する細胞反応の調節 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 4928 269966 アンサンブル ENSG00000110713 ENSMUSG00000063550 ユニプロット P52948 Q6PFD9 RefSeq (mRNA) NM_005387 NM_016320 NM_139131 NM_139132 NM_001287164 NM_001287165 NM_001287166 NM_001287167 NM_022979 RefSeq（タンパク質） NP_005378 NP_057404 NP_624357 NP_624358 NP_001352054 NP_001352055 NP_001352056 NP_001352057 NP_001352058 NP_001274093 NP_001274094 NP_001274095 NP_001274096 NP_075355 NP_001391063 NP_001391064 NP_001391065 NP_001391066 NP_001391067 NP_001391068 NP_001391069 NP_001391070 場所（UCSC） 11章: 3.67 – 3.8 Mb 7章: 101.77 – 101.86 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

核膜孔複合体タンパク質Nup98-Nup96は、ヒトではNUP98遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ]}

関数

シグナルを介した核内輸送および核外輸送は、核膜孔複合体（NPC）を介して進行します。NPCは、ヌクレオポリンと呼ばれる約30種類の固有のタンパク質で構成されています。98 kDのヌクレオポリンは、186 kDの前駆体タンパク質の合成とタンパク質分解による切断を伴う生合成経路によって生成されます。この切断により、98 kDのヌクレオポリンと96 kDのヌクレオポリンが生成され、どちらもNPCの核質側に局在します。ラットを用いた研究では、98 kDのヌクレオポリンは、輸送基質のドッキング部位となるヌクレオポリンの1つとして機能することが示されています。ヒト遺伝子は、急性骨髄性白血病（AML）およびT細胞急性リンパ性白血病（T-ALL）における染色体転座に続いて、複数の遺伝子と融合することが確認されています。この遺伝子は、重要な腫瘍抑制遺伝子領域である11p15.5のインプリント遺伝子ドメインに位置する複数の遺伝子のうちの1つです。この領域の変異は、ベックウィズ・ヴィーデマン症候群、ウィルムス腫瘍、横紋筋肉腫、副腎皮質癌、肺癌、卵巣癌、乳癌と関連付けられています。この遺伝子の選択的スプライシングにより、いくつかの転写バリアントが生じますが、すべてのバリアントが完全に解明されているわけではありません。^{[ 6 ]}

相互作用

NUP98 は以下と相互作用することが示されています。

• CREB結合タンパク質、^{[ 7 ]}
• KPNB1 , ^{[ 8 ] [ 9 ]}
• NUP88 , ^{[ 10 ]}
• RAE1、^{[ 11 ]} および
• TNPO2 ^{[ 12 ]}​

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000110713 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000063550 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Arai Y, Hosoda F, Kobayashi H, Arai K, Hayashi Y, Kamada N, Kaneko Y, Ohki M (1997年6月). 「de novoおよび治療関連骨髄悪性腫瘍におけるinv(11)(p15q22)染色体転座は、核孔タンパク質遺伝子NUP98と推定RNAヘリカーゼ遺伝子DDX10の融合を引き起こす」 Blood . 89 ( 11): 3936–44 . doi : 10.1182/blood.V89.11.3936 . PMID 9166830 . 
6. 「Entrez Gene: NUP98 核ポリン 98kDa」。
7. Kasper LH, Brindle PK, Schnabel CA, Pritchard CE, Cleary ML, van Deursen JM (1999年1月). 「CREB結合タンパク質は、転写を活性化しNUP98-HOXA9の発癌性を媒介する核膜特異的FGリピートと相互作用する」 . Mol. Cell. Biol . 19 (1): 764– 76. doi : 10.1128 /mcb.19.1.764 . PMC 83933. PMID 9858599 .  
8. Moroianu J, Blobel G, Radu A (1997年9月). 「RanGTPを介したカリオフェリンαの核外輸送は核孔タンパク質Nup153との相互作用を伴う」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 ( 18): 9699– 704. Bibcode : 1997PNAS...94.9699M . doi : 10.1073/pnas.94.18.9699 . PMC 23253. PMID 9275187 .  
9. Bonifaci N, Moroianu J, Radu A, Blobel G (1997年5月). 「Karyopherin beta2はmRNA結合タンパク質の核内輸送を仲介する」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 94 (10): 5055–60 . Bibcode : 1997PNAS...94.5055B . doi : 10.1073/pnas.94.10.5055 . PMC 24630. PMID 9144189 .  
10. Griffis ER, Xu S, Powers MA (2003年2月). 「Nup98は核膜孔の核側と細胞質側の両方に局在し、2つの異なる核膜孔サブ複合体に結合する」 . Mol. Biol. Cell . 14 (2): 600–10 . doi : 10.1091 / mbc.E02-09-0582 . PMC 149995. PMID 12589057 .  
11. Pritchard CE, Fornerod M, Kasper LH, van Deursen JM (1999年4月). 「RAE1は、複数のドメインを介して核膜孔複合体のGLEBS様NUP98モチーフに結合するシャトルmRNA輸出因子である」 . J. Cell Biol . 145 (2): 237–54 . doi : 10.1083 / jcb.145.2.237 . PMC 2133102. PMID 10209021 .  
12. Fontoura BM, Blobel G, Yaseen NR (2000年10月). 「核膜タンパク質Nup98は、ranにおけるGDP/GTP交換とカリオフェリンβ2を介した核内輸送の終結部位である」 . J. Biol. Chem . 275 (40): 31289–96 . doi : 10.1074/jbc.M004651200 . PMID 10875935 . 

さらに読む

• Slape C, Aplan PD (2004) . 「造血悪性腫瘍におけるNUP98遺伝子融合の役割」. Leuk. Lymphoma . 45 (7): 1341–50 . doi : 10.1080/10428190310001659325 . PMID  15359631. S2CID  20926084 .
• ムーア MA、チョン KY、プラシロバ M、シュリンガ JJ、シー・JH、周 P、モローネ G (2007)。 「骨髄性白血病発生におけるNUP98調節不全」。アン。ニューヨークアカデミー。科学。1106 (1): 114–42。書誌コード: 2007NYASA1106..114M。土井：10.1196/annals.1392.019。PMID  17442773。S2CID  25039911。
• Radu A, Moore MS, Blobel G (1995). 「核孔タンパク質Nup98のペプチドリピートドメインは、核孔複合体を介した輸送においてドッキング部位として機能する」 . Cell . 81 ( 2): 215–22 . doi : 10.1016/0092-8674(95)90331-3 . PMID  7736573. S2CID  19024872 .
• Nakamura T, Largaespada DA, Lee MP, Johnson LA, Ohyashiki K, Toyama K, Chen SJ, Willman CL, Chen IM, Feinberg AP, Jenkins NA, Copeland NG, Shaughnessy JD (1996). 「ヒト骨髄性白血病における染色体転座t(7;11)(p15;p15)による核膜タンパク質遺伝子NUP98とHOXA9の融合」Nat. Genet . 12 (2): 154–8 . doi : 10.1038/ng0296-154 . PMID  8563753 . S2CID  6400265 .
• Borrow J, Shearman AM, Stanton VP, Becher R, Collins T, Williams AJ, Dubé I, Katz F, Kwong YL, Morris C, Ohyashiki K, Toyama K, Rowley J, Housman DE (1996). 「急性骨髄性白血病におけるt(7;11)(p15;p15)転座は、核膜タンパク質NUP98とクラスIホメオタンパク質HOXA9の遺伝子を融合させる」Nat. Genet . 12 (2): 159– 67. doi : 10.1038/ ng0296-159 . PMID  8563754. S2CID  21252465 .
• Hu T, Guan T, Gerace L (1996). 「核膜孔複合体糖タンパク質の集合体であるp62複合体の分子的および機能的特性」 . J. Cell Biol . 134 (3): 589– 601. doi : 10.1083 / jcb.134.3.589 . PMC  2120945. PMID  8707840 .
• Stutz F, Izaurralde E, Mattaj IW, Rosbash M (1996). 「ヒト免疫不全ウイルス1型Revタンパク質およびRNAの核外輸送における核膜FGリピートドメインの役割」 . Mol. Cell. Biol . 16 (12): 7144–50 . doi : 10.1128/mcb.16.12.7144 . PMC  231718. PMID  8943370 .
• Yaseen NR, Blobel G (1997). 「ヒトカリオフェリンβ3のクローニングと特性解析」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (9): 4451–6 . Bibcode : 1997PNAS...94.4451Y . doi : 10.1073/ pnas.94.9.4451 . PMC  20743. PMID  9114010 .
• Bonifaci N, Moroianu J, Radu A, Blobel G (1997). 「カリオフェリンβ2はmRNA結合タンパク質の核内輸送を媒介する」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (10): 5055–60 . Bibcode : 1997PNAS ...94.5055B . doi : 10.1073/pnas.94.10.5055 . PMC  24630. PMID  9144189 .
• Grandi P, Dang T, Pané N, Shevchenko A, Mann M, Forbes D, Hurt E (1997). 「酵母Nic96pの脊椎動物ホモログであるNup93は、新規205kDaタンパク質と複合体を形成し、核膜孔の正しい形成に必須である」 . Mol . Biol. Cell . 8 (10): 2017–38 . doi : 10.1091/mbc.8.10.2017 . PMC  25664. PMID  9348540 .
• Zolotukhin AS, Felber BK (1999). 「核孔タンパク質nup98とnup214はヒト免疫不全ウイルス1型Revの核外輸送に関与する」 . J. Virol . 73 (1): 120–7 . doi : 10.1128/JVI.73.1.120-127.1999 . PMC  103815. PMID  9847314 .
• Kasper LH, Brindle PK, Schnabel CA, Pritchard CE, Cleary ML, van Deursen JM (1999). 「CREB結合タンパク質は、転写を活性化しNUP98-HOXA9の発がん性を媒介する核膜特異的FGリピートと相互作用する」 . Mol. Cell. Biol . 19 (1): 764– 76. doi : 10.1128/mcb.19.1.764 . PMC  83933. PMID  9858599 .
• Fontoura BM, Blobel G, Matunis MJ (1999). 「核孔タンパク質の保存された生合成経路：186キロダルトンの前駆体のタンパク質分解によりNup98と新規核孔タンパク質Nup96が生成される」 . J. Cell Biol . 144 (6): 1097– 112. doi : 10.1083/jcb.144.6.1097 . PMC  2150585. PMID  10087256 .
• Pritchard CE, Fornerod M, Kasper LH, van Deursen JM (1999). 「RAE1は、核膜孔複合体において複数のドメインを介してGLEBS様NUP98モチーフに結合するシャトル輸送性mRNA輸出因子である」 . J. Cell Biol . 145 (2): 237–54 . doi : 10.1083/ jcb.145.2.237 . PMC  2133102. PMID  10209021 .
• Ahuja HG, Felix CA, Aplan PD (1999). 「治療関連骨髄異形成症候群に関連するt(11;20)(p15;q11)染色体転座はNUP98-TOP1融合を引き起こす」Blood . 94 (9): 3258–61 . doi : 10.1182/blood.V94.9.3258 . PMID  10556215 .
• Bachi A, Braun IC, Rodrigues JP, Panté N, Ribbeck K, von Kobbe C, Kutay U, Wilm M, Görlich D, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (2000). 「TAPのC末端ドメインは核膜孔複合体と相互作用し、特異的なCTE含有RNA基質の輸送を促進する」 . RNA . 6 (1): 136– 58. doi : 10.1017 / S1355838200991994 . PMC  1369901. PMID  10668806 .
• Fontoura BM, Blobel G, Yaseen NR (2000). 「核孔タンパク質Nup98は、ranにおけるGDP/GTP交換とカリオフェリンβ2を介した核内輸送の終結に関与する」 . J. Biol. Chem . 275 (40): 31289–96 . doi : 10.1074/jbc.M004651200 . PMID  10875935 .
• Rodrigues JP, Sitterlin D, Bachi A, Wu X, Wilm M, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (2000). 「水疱性口内炎ウイルスマトリックスタンパク質は核膜タンパク質Nup98を標的として宿主細胞の遺伝子発現を阻害する」 . Mol. Cell . 6 (5): 1243–52 . doi : 10.1016/S1097-2765(00)00120-9 . PMID  11106761 .
• Hofmann W, Reichart B, Ewald A, Müller E, Schmitt I, Stauber RH, Lottspeich F, Jockusch BM, Scheer U, Hauber J, Dabauvalle MC (2001). 「Rev応答エレメント（RRE）および構成輸送エレメント（CTE）を含むレトロウイルスRNAの核外輸送に必要な補因子要件。アクチンの意外な役割」 . J. Cell Biol . 152 (5): 895– 910. doi : 10.1083/jcb.152.5.895 . PMC  2198816. PMID  11238447 .

「 https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=NUP98&oldid=1300844899」より取得