テックス9

テックス9
識別子
エイリアスTEX9、精巣発現9
外部IDMGI : 1201610; HomoloGene : 32072; GeneCards : TEX9; OMA :TEX9 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

374618

21778

アンサンブル

ENSG00000151575

ENSMUSG00000090626

ユニプロット

Q8N6V9

Q9D845

RefSeq (mRNA)

NM_001286449
NM_198524

NM_009359

RefSeq（タンパク質）

NP_001273378
NP_940926

NP_033385

場所（UCSC）15章: 56.24 – 56.45 Mb9章: 72.45 – 72.49 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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精巣発現タンパク質9は、ヒトではTEX9遺伝子にコードされているタンパク質です。TEX9は、 2つのコイルドコイル領域を含む391個のアミノ酸からなるタンパク質をコードしています。[5]この遺伝子は多くの種で保存されており、真核生物、古細菌、および1種の細菌において相同タンパク質をコードしています。[6] TEX9の機能はまだ完全には解明されていませんが、 ATP結合能を持つことが示唆されています。[5]

遺伝子

軌跡

TEX9は15q21.3に位置し、18のエクソンを有する。[5]しかし、一部のエクソンは重複しているため、ヒトゲノムには識別可能なエクソンが13個しかない。[7] TEX9はセンス鎖上にあり、塩基番号56,365,573から56,428,441まで広がる。TEX9はCD24P2、RFX7、MNS1、HMGB1P33の遺伝子近傍に位置する。 [5] [8]

転写制御

TEX9のプロモーターは、19個の転写産物を用いてGXP_7531542であると決定され、第15染色体のセンス鎖上の塩基56,364,254から塩基56,365,775に及んでいる。[9] TEX9の転写を制御すると予測されるマトリックス類似度が0.780以上の転写因子のいくつかは、それぞれの結合部位とともに以下にリストされている。

転写因子結合部位ストランド
エストロゲン応答要素（ERアルファ）ATTGGTCAGGCTGGTCTTG+
レチノイド受容体関連精巣関連受容体CCGACCAGAACTTGAGGGT と

TTGTAATTCAAGGTCATAA

- と +
癌における高メチル化1CTCTGCCCAGCCT および CTTCACCCGTGAT+と-
TボックスTF TBX21、二量体結合部位タクトGCTTTGGTGTCATATCTAAG+
サインオキュリスホメオボックスホモログ 4CTTTTGGTGTCATAT+
エコトロピックウイルス統合部位1にコードされる因子、アミノ末端ジンクフィンガードメインAAAACCACAGTATAGAT-
エストロゲン関連受容体αGAATTGTAATTCAAGGTCATAAA および AGTGATTTGCCCAAGG/CCATATA+と+
調節因子X、4TTAGGTCTTTGATACATT および AGCCATTGGCGCAGCGTCA+と-
甲状腺ホルモン受容体βTCGAGGATTCAAATCCAGAAACT および CTGGTATGTAGTATAGTGCCA- そして -
ホメオドメインタンパク質NKX3.2ACTGTGAAGTGGGCACTAT+
レンチウイルスLTR TATAボックスCCATATAACTGGTAAGT+
Cdx-2 哺乳類尾部関連腸管TFGTTCCGGTATATTGACCAT-
GA結合タンパク質TF、アルファCTCTCGCGGGAAGATGCGTCG+
嗅覚ニューロン特異的因子ACCTTTGAGAGCGCCCCTTCTACG-
腎臓に富むクルッペル様因子GAAGATGGCGGGGCGAAGT+
ヒト組織サンプルにおけるTEX9の発現

表現

TEX9の発現は精巣で最も高く、次いで甲状腺、十二指腸、腎臓と続くが、他の組織でもTEX9が発現していることが示されている。[5] TEX9は細胞質または核内に細胞内局在すると予想される。[10]

mRNA

アイソフォーム1の特徴

TEX9のアイソフォーム1は、27塩基対の5' UTR領域と356塩基対の3' UTR領域を有する。 [11]転写産物の長さは1,559塩基対である。[12]

追加プライマリシーケンスおよび変異体（アイソフォーム）

TEX9のあまり一般的ではないアイソフォームには、アイソフォーム2、X1、X2、X3、X4、X5、X6があります。[5]

タンパク質

391アミノ酸からなるTEX9タンパク質の理論上の分子量は45kDa、理論上のpIは6である。[13]しかし、実験的な分子量は約55kDaであることが示された。[14]

ドメイン、モチーフ、そして二次構造

TEX9で最も顕著なドメインは、アミノ酸32-59と194-351を含む2つのコイルドコイル領域です。[15]タンパク質内の反復ドメインには、ALEE（34-37と302-305）とEKYK（251-254と307-310）が含まれます。[16] TEX9は、典型的なヒトタンパク質と比較して、グルタミン酸、リジン、グルタミン残基が多く、グリシン残基が少ないです。[16]

翻訳後修飾

TEX9はチロシン（Y）残基85と264でリン酸化され、リジン（K）残基159にユビキチン化部位を持つことが示されています。 [12]他にも複数のリン酸化、糖化、O-β-GlcNAc、SUMOタンパク質結合部位があると予測されています。 [17] [18] [19] [20]

三次構造

リン酸化部位（オレンジ）とユビキチン化部位（青）を有するTEX9アイソフォーム1。構造の信頼性は99%、カバレッジは98%である。[10]

TEX9の2つのコイルドコイル領域は三次構造を構成しており、Phyre2の予測構造を使用して視覚化できます。[10]構造には、2つの既知のリン酸化部位と1つのユビキチン化部位が示されています。

第四次構造およびタンパク質相互作用

TEX9 は、コイルドコイル 112 (CCDC112)、第 20染色体オープンリーディングフレーム112 (C20orf112)、核小体タンパク質 4 ( NOL4 ) などの相互作用があることが実験的に判明しています。[21] テキストマイニングにより、TEX9 は嗅覚受容体ファミリー 4、サブファミリー C、メンバー 3、嗅覚受容体 ( OR4C3 )とも相互作用することが示唆されています。 [21]その他の相互作用としては、ヒト遺伝子NOL4-2 (位置は不明)、GOGA2 (シスゴルジ体ネットワーク膜、細胞骨格の紡錘体極、ER-ゴルジ体中間区画膜内)、KDM1A (核内) の遺伝子産物が挙げられます。[13] TEX9 間のもう 1 つの相互作用として、分子量 11kDa の SUMO タンパク質との結合が考えられています。[20] TEX9の実際の分子量は55kDaであるが、理論上の分子量は45kDaであり、これがこの相互作用の証拠となる。[22]

相同性と進化

パラログ

ヒトにはTEX9の相同遺伝子は存在しない。 [23]

オーソログ

TEX9は、脊椎動物、無脊椎動物、古細菌、および1種の細菌を含む260種以上の生物に相同遺伝子を持つ。[5] TEX9は陸上植物を除くすべての生物群で発見されている。[23]

属種通称分類群分岐（MYA）受入番号シーケンス長 (aa)IDとHPの相関率（％）HPへの補正シミュレーション（％）
ホモ・サピエンス人間ホミニニ0NP_940926.1391100100
パン・パニスカスボノボ霊長類6.65XP_008951441.13919999
アフリカトビネズミアフリカのブッシュゾウ/サバンナゾウ哺乳類105XP_010596294.13918390
アプテリクス・ロウィオカリト（茶色）キウイ鳥312XP_025916696.14226174
ヤモリヤモリを呼ぶ爬虫類312XP_015264647.13594963
アフリカツメガエルアフリカツメガエル両生類352XP_018108534.14346076
アステュアナクス・メキシカヌスメキシカンテトラ/盲目の洞窟魚硬骨魚類432XP_007244936.23945168
アポスティコプス・ジャポニクストゲナマコ棘皮動物684PIK45906.14044356
カピテラ・テレタカピテラ環形動物797ELT92672.12573445
アノプロフォラ・グラブリペニスアジアカミキリムシ軟体動物797XP_018561745.12591831
ポシロポーラ・ダミコルニスカリフラワー（レース）コーラル刺胞動物824XP_027039795.13874260
肝吸虫中国肝吸虫扁形動物824RJW72461.19522741
多包条虫エキノコックス扁形動物824CDS43228.12991833
トリコプラックス属 H2トリコプラックス板状動物948RDD37208.14513044
アンフィメドン・クイーンズランディカアンフィメドン海綿動物951.8XP_003384031.23392741
スピゼロミセス プンクタトゥス DAOM BR117スピゼロミセスツボカビ（真菌）1105XP_016611327.13733152
プラノプロトステリウム・ファンギボラムプラノプロトステリウムアメーボゾア （原生生物）1480PRP73397.13731218
クレブソルミディウム・ニテンスクレブソルミジウム車軸藻類 （緑藻類）1496GAQ91967.13452945
ホンダア・ファーメンタルギアナホンダアストラメノパイル （原生生物）1768GBG25987.13792235
テカモナス・トラヘンス ATCC 50062テカモナスアプソゾア （原生生物）2101XP_013753981.13241323
クラミジア・トラコマティスクラミジア細菌4290CPS19605.1721414
フィブリノーゲン、ベータグロビン、シトクロム c と比較した TEX9 の変異率。

TEX9の相対的な変化率はフィブリノーゲンやβグロビンに比べるとかなり遅いが、シトクロムcほど遅くはない。[24]

相同ドメイン

ヒトと他の生物間で最も保存されているTEX9配列は、2つのコイルドコイル領域内に存在し、この領域では一部のアミノ酸が脊椎動物、無脊椎動物、微生物間で保存されています。細菌相同遺伝子は、無脊椎動物や微生物よりも脊椎動物に最も類似しています。

系統発生

TEX9相同遺伝子の系統樹（根なし）図。枝の長さは生物間の相対的な進化距離を表す。

TEX9の相同遺伝子はすべて同じ共通祖先に由​​来するが、クラミジアに見られる遺伝子はヒトから細菌に移ったと考えられている。[25]

臨床的意義

病理学

TEX9と直接関連する疾患は報告されていないが、エストロゲン受容体のノックダウンとTEX9発現の増加[26] 、およびTEX9発現の低下した大腸癌細胞との相関関係が見つかっている[27]。

疾病協会

TEX9の発現低下は、免疫能正常マウスでは腫瘍の増殖を促進することが示されていますが、免疫不全マウスでは促進されません。[28]この結果は、TEX9が一部の腫瘍において腫瘍抗原として機能する可能性を示唆しています。TEX9タンパク質の変異は、子宮内膜がん、頭頸部がん、大腸がん、扁平上皮がんなど、特定のがんから採取した腫瘍の1～2%で発見されています。[29]

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000151575 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000090626 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ abcdefg "TEX9 精巣発現 9 [ホモサピエンス (ヒト)] - 遺伝子 - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov 。2019-02-08に取得。
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