TBX22

TBX22
識別子
エイリアスTBX22、ABERS、CLPA、CPX、TBXX、dJ795G23.1、Tボックス22、Tボックス転写因子22
外部IDオミム：300307; MGI : 2389465;ホモロジーン: 9666;ジーンカード：TBX22; OMA :TBX22 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

50945

245572

アンサンブル

ENSG00000277800
ENSG00000122145

ENSMUSG00000031241

ユニプロット

Q9Y458

Q8K402

RefSeq (mRNA)

NM_001109878
NM_001109879
NM_001303475
NM_016954

NM_001290747
NM_145224
NM_181319

RefSeq（タンパク質）

NP_001103348
NP_001103349
NP_001290404
NP_058650

NP_001277676
NP_660259
NP_851836

場所（UCSC）染色体X: 80.01 – 80.03 Mb染色体X: 106.71 – 106.73 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
人間の表示/編集マウスの表示/編集

Tボックス転写因子TBX22は、ヒトではTBX22遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]

TBX22は、共通のDNA結合ドメインであるTボックスを共有する、系統学的に保存されたタンパク質ファミリーの一員です。Tボックス遺伝子は、発達過程の制御に関与する転写因子をコードしています。この遺伝子の変異は、遺伝性X連鎖疾患である舌小帯短縮症（舌小帯短縮症）と関連付けられており、ヒトの口蓋形成において重要な役割を果たしていると考えられています。[5]この遺伝子は、以前はX染色体の長腕にマッピングされていましたが、現在ではTBX22遺伝子の変異がこの症候群の原因であることが実証されています。[6] TBX22の変異は、一部の集団において非症候群性口蓋裂を引き起こすこともあります。[7]

TBX22は、 Xq21.1領域に8.7キロベースにわたる7つのエクソンから構成されています。TBX22 mRNAは2099塩基対の長さで、400アミノ酸からなるタンパク質をコードしています。このタンパク質は、 NH2末端領域にTドメインを有しており、このTドメインは、他の既知のTドメインと比較して20アミノ酸が欠落しているという特徴を持っています。[8]

関数

Tボックス遺伝子は、約200アミノ酸からなる保存されたDNA結合モチーフ（Tドメイン）をコードする領域を含む転写制御因子ファミリーのメンバーです。これらの遺伝子は、その産物とマウスのブラキュリ（またはT）タンパク質との間の相同性に基づいてグループ化されています。ヒトとマウスでは、これまでに多数のTドメイン含有遺伝子が同定され、ゲノム全体にマッピングされています。これらの遺伝子の時空間的発現は、脊椎動物と無脊椎動物の両方において、発生過程において厳密に制御されています。[8]

機能研究により、マウスまたはアフリカツメガエルの胚発生において、複数のTボックス遺伝子が中胚葉の規定に関与していることが実証されています。マウスでは、Brachyury遺伝子は初期の中胚葉細胞で発現し、その後、脊索に限定して発現します。Brachyuryタンパク質は、Tドメインによって認識される20ヌクレオチドの部分的回文配列に二量体として結合します。より一般的には、Tボックス遺伝子は、発生過程において適切な形態形成および器官形成に不可欠であることが示されている。マウス、ショウジョウバエ、ゼブラフィッシュでは、複数のTボックス遺伝子の異常発現が発生異常を引き起こすことが示されている。

臨床的意義

2家系におけるTBX22変異は、X連鎖性口蓋裂および舌小帯短縮症を呈すると予測された。エクソン5（K家系）およびエクソン4（W家系）から増幅したゲノムDNAの配列電気泳動図は、罹患（変異）男性と非罹患（対照）女性のものである。*は配列変異の部位を示す。

ヒトでは、2つのTボックス遺伝子が遺伝性疾患に関与している。TBX5の変異はホルト・オーラム症候群を引き起こし、TBX3の変異は尺骨乳房症候群を引き起こす。[8]

TBX22の変異は、X連鎖性口蓋裂および舌癒着症を引き起こす。[9] CPXは、強いX連鎖メンデル遺伝を示す少数の家系で報告されている。口蓋裂の表現型は主に男性に発生し、二次口蓋の完全な裂、粘膜下裂、または二分口蓋垂から高弓状口蓋までさまざまなバリエーションを示す。舌癒着症は、罹患患者および保因者の女性に頻繁に見られ、CPXの有用な指標であることが証明されている。ヒトおよびマウスの両方でin situハイブリダイゼーションを使用した時間的および空間的研究では、TBX22/Tbx22は口蓋形成中に主に口蓋棚と舌で発現することが示されており、口蓋と舌の両方の発達におけるTBX22の特定の役割を示している。 X連鎖遺伝が明確に定義されている家系に加えて、家系規模や家族歴が限定的で遺伝様式を予測できない複数の家系でもTBX22変異が同定されている。これらの症例では、主に舌癒着症と口蓋裂の有無に基づいて診断が行われた。[10]

TBX22は、少なくともブラジルと北米のコホートにおいて、口蓋裂の有病率に大きく寄与していることが実証されている。[8]現在までに、CPおよび/または舌小帯短縮症の患者において10種類の異なるTBX22変異が報告されている。[11]これらには、小さな欠失/挿入、ナンセンス、スプライスサイト、フレームシフト、ミスセンス変異が含まれる。[7]

参考文献

  1. ^ abc ENSG00000122145 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000277800, ENSG00000122145 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000031241 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ ab "Entrez Gene: TBX22 T-box 22".
  6. ^ Braybrook C, Doudney K, Marçano AC, et al. (2001). 「Tボックス転写因子遺伝子TBX22はX連鎖性口蓋裂および舌小帯短縮症において変異している」Nat. Genet . 29 (2): 179–83 . doi :10.1038/ng730. PMID  11559848. S2CID  28939959.
  7. ^ ab Suphapeetiporn K, Tongkobpetch S, Siriwan P, Shotelersuk V (2008). 「TBX22変異はタイ人における非症候群性口蓋裂の頻繁な原因である」. Clin. Genet . 72 (5): 478– 83. doi : 10.1111/j.1399-0004.2007.00891.x . PMID  17868388. S2CID  2244618.
  8. ^ abcd Laugier-Anfossi F, Villard L (2000). 「切断型Tドメインを含むタンパク質をコードする、xq21.1に位置する新規ヒトTボックス遺伝子（TBX22）の分子特性解析」. Gene . 255 (2): 289–96 . doi :10.1016/S0378-1119(00)00326-7. PMID  11024289.
  9. ^ Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (2011年3月). 「口唇裂・口蓋裂：遺伝的および環境的影響の理解」Nat. Rev. Genet . 12 (3): 167–78 . doi :10.1038/nrg2933. PMC 3086810. PMID 21331089  . 
  10. ^ Marçano AC, Doudney K, Braybrook C, et al. (2004). 「TBX22遺伝子変異は口蓋裂の頻繁な原因である」J. Med. Genet . 41 (1): 68– 74. doi :10.1136/jmg.2003.010868. PMC 1757272. PMID 14729838  . 
  11. ^ オンラインメンデル遺伝学（OMIM）：T-BOX 22; TBX22 - 300307

さらに読む

  • Laugier-Anfossi F, Villard L (2000). 「xq21.1に局在し、短縮型Tドメインを含むタンパク質をコードする新規ヒトTボックス遺伝子（TBX22）の分子生物学的特徴」Gene . 255 (2): 289–96 . doi :10.1016/S0378-1119(00)00326-7. PMID  11024289.
  • Braybrook C, Doudney K, Marçano AC, et al. (2001). 「Tボックス転写因子遺伝子TBX22はX連鎖性口蓋裂および舌癒着症において変異している」Nat. Genet . 29 (2): 179–83 . doi :10.1038/ng730. PMID  11559848. S2CID  28939959.
  • Aldred MA (2002). 「口唇裂・口蓋裂：新たな遺伝学的手がかり」. Trends in Molecular Medicine . 7 (12): 539–40 . doi :10.1016/S1471-4914(01)02223-7. PMID  11733204.
  • Braybrook C, Lisgo S, Doudney K, et al. (2003). 「ヒトおよびマウスのTBX22の頭蓋顔面発現は、CPX患者に観察される口蓋裂および舌癒着の表現型と相関する」Hum. Mol. Genet . 11 (22): 2793–804 . doi : 10.1093/hmg/11.22.2793 . PMID  12374769.
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  • 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Marçano AC, Doudney K, Braybrook C, et al. (2004). 「TBX22遺伝子変異は口蓋裂の頻繁な原因である」. J. Med. Genet . 41 (1): 68– 74. doi :10.1136/jmg.2003.010868. PMC  1757272. PMID  14729838 .
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928.  PMID 15489334  .
  • Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ, et al. (2005). 「ヒトX染色体のDNA配列」. Nature . 434 (7031): 325–37 . Bibcode :2005Natur.434..325R. doi :10.1038/nature03440. PMC  2665286. PMID  15772651 .
  • Andreou AM, Pauws E, Jones MC, et al. (2007). 「X連鎖性口蓋裂患者に認められたTBX22ミスセンス変異はDNA結合、SUMO化、および転写抑制に影響を与える」Am. J. Hum. Genet . 81 (4): 700–12 . doi :10.1086/521033. PMC 2227921.  PMID 17846996  .
  • Suphapeetiporn K, Tongkobpetch S, Siriwan P, Shotelersuk V (2008). 「TBX22変異はタイ人における非症候性口蓋裂の頻繁な原因である」. Clin. Genet . 72 (5): 478– 83. doi : 10.1111/j.1399-0004.2007.00891.x . PMID  17868388. S2CID  2244618.
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