システインプロテアーゼATG4A

ATG4A
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2P82
識別子
別名	ATG4A、APG4A、AUTL2、オートファジー関連4Aシステインペプチダーゼ、HsAPG4A
外部ID	OMIM : 300663 ; MGI : 2147903 ; HomoloGene : 70873 ; GeneCards : ATG4A ; OMA : ATG4A - オーソログ
遺伝子の位置（ヒト） 染色体 X染色体（ヒト）[ 1 ] バンド Xq22.3 開始 108,091,668 bp [ 1 ] 終了 108,154,671 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） 染色体 X染色体（マウス）[ 2 ] バンド X|X F1 開始 140,956,907 bp [ 2 ] 終了 141,164,270 bp [ 2 ]
RNA発現パターン Bgee ヒト マウス（相同遺伝子） 最もよく発現している 膵臓小体 腓腹筋 大腿筋 直腸 ランゲルハンス島 前脛骨筋 下垂体前葉 左心室 三角筋 右肺 最もよく発現している 骨髄 大腿四頭筋 大腿筋 近位尿細管 筋組織 右腎臓 骨格筋組織 回腸 顆粒球 水晶体 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 ペプチダーゼ活性 システイン型ペプチダーゼ活性 タンパク質結合 加水分解酵素活性 システイン型エンドペプチダーゼ活性 細胞成分 細胞質 細胞質 生物学的プロセス オートファジー タンパク質輸送 核のオートファジー C末端タンパク質の脂質化 タンパク質の脱脂質化 ミトコンドリアのオートファジー オートファゴソームの組み立て タンパク質分解 膜へのタンパク質の標的化 出典：Amigo / QuickGO
相同遺伝子 種 ヒト マウス Entrez 115201 666468 アンサンブル ENSG00000101844 ENSMUSG00000079418 ユニプロット Q8WYN0 Q8C9S8 RefSeq (mRNA) NM_052936 NM_178270 NM_178271 NM_001321287 NM_001321288 NM_001321289 NM_001321290 NM_174875 RefSeq（タンパク質） NP_001308216 NP_001308217 NP_001308218 NP_001308219 NP_443168 NP_840054 NP_840055 NP_777364 NP_001366610 NP_001366611 NP_001366612 NP_001366613 場所（UCSC） 染色体X：108.09～108.15 Mb 染色体X：140.96～141.16 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
ヒトの表示/編集 マウスの表示/編集

システインプロテアーゼATG4Aは、ヒトではATG4A遺伝子によってコードされている酵素です。^{[ 5 ] [ 6 ]}

オートファジーは、内因性タンパク質や損傷した細胞小器官が細胞内で破壊されるプロセスです。オートファジーは、分化、変態、非アポトーシス性細胞死、そして老化における細胞の恒常性と細胞リモデリングに不可欠であると仮定されています。一部の悪性腫瘍ではオートファジーレベルの低下が報告されており、癌に関連する制御されていない細胞増殖の制御におけるオートファジーの役割が提唱されています。この遺伝子は、オートファジンタンパク質ファミリーのメンバーをコードしています。コードされているタンパク質は、システインプロテアーゼのC-54ファミリーのメンバーとしても指定されています。異なるアイソフォームをコードする転写バリアントが同定されています。^{[ 6 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000101844 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000079418 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Scherz-Shouval R, Sagiv Y, Shorer H, Elazar Z (2003年4月). 「ゴルジ体内輸送調節因子GATE-16のCOOH末端はヒトシステインプロテアーゼHsApg4Aによって切断される」 . J Biol Chem . 278 (16): 14053–8 . doi : 10.1074/jbc.M212108200 . PMID 12473658 . 
6. 「Entrez Gene: ATG4A ATG4 オートファジー関連 4 ホモログ A (S. cerevisiae)」。

外部リンク

• UCSCゲノムブラウザにおけるヒトATG4Aゲノムの位置とATG4A遺伝子の詳細ページ

さらに詳しい情報

• Scherz-Shouval R, Shvets E, Fass E, et al. (2007). 「活性酸素種はオートファジーに必須であり、Atg4の活性を特異的に制御する」 . EMBO J. 26 ( 7): 1749–60 . doi : 10.1038/sj.emboj.7601623 . PMC  1847657. PMID 17347651 
• Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ, et al. (2005). 「ヒトX染色体のDNA配列」 . Nature . 434 ( 7031): 325–37 . Bibcode : 2005Natur.434..325R . doi : 10.1038/nature03440 . PMC  2665286. PMID  15772651 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）の現状、品質、および拡大」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC  528928. PMID 15489334  .
• 壁谷 勇、水島 暢、山本 明、他 (2005). 「LC3、GABARAP、GATE16はフォームII形成に依存してオートファゴソーム膜に局在する」 . J. Cell Sci . 117 (Pt 13): 2805–12 . doi : 10.1242/jcs.01131 . PMID  15169837 .
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」 Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039 .
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