SNRPB

SNRPB
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1D3B、3CW1、3PGW、4PJO、4WZJ、3JCR​​
識別子
エイリアス	SNRPB、COD、SNRPB1、Sm-B/B'、SmB/B'、SmB/SmB'、snRNP-B、CCMS、小核リボ核タンパク質ポリペプチドBおよびB1
外部ID	オミム: 182282 ; MGI : 98342 ;ホモロジーン: 134543 ;ジーンカード: SNRPB ; OMA : SNRPB - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 20番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 20p13 始める 2,461,634 bp [ 1 ] 終わり 2,470,853 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 2番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 2 F1|2 63.19 cM 始める 130,013,555 bp [ 2 ] 終わり 130,021,323 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 顆粒球 横行結腸粘膜 食道粘膜 脚の皮膚 腹部の皮膚 胸腺 左卵管 咽頭粘膜 リンパ節 歯肉上皮 上位の表現 第四脳室脈絡叢 体節 乳腺 腹壁 下顎突出 上顎突出 原始的な条線 嗅内皮質 胚 CA3領域 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 ヒストンpremRNA DCP結合 U2 snRNA結合 タンパク質結合 テロメラーゼRNA結合 RNA結合 U1 snRNP結合 U2 snRNP結合 細胞成分 細胞質 SMN-Smタンパク質複合体 細胞質 触媒ステップ2スプライソソーム U4/U6 x U5 トリスnRNP複合体 ヒストンpre-mRNA 3'末端プロセシング複合体 U5 snRNP U12型スプライセオソーム複合体 U2 snRNP U1 snRNP メチロソーム U7 snRNP 小さな核リボ核タンパク質複合体 テロメラーゼホロ酵素複合体 スプライセオソーム複合体 U4 snRNP 細胞外エクソソーム U2型プレスプライソソーム 核 核質 U2型プレカタラーゼスプライソソーム U2型触媒ステップ2スプライソソーム 生物学的プロセス スプライソソームを介したmRNAスプライシング RNAポリメラーゼII転写の終結 mRNA処理 スプライソソーム snRNP アセンブリ RNAスプライシング ヒストンmRNA代謝プロセス タンパク質のメチル化 核へのインポート 脳の発達 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6628 20638 アンサンブル ENSG00000125835 ENSMUSG00000027404 ユニプロット P14678 P27048 RefSeq (mRNA) NM_198216 NM_003091 NM_009225 RefSeq（タンパク質） NP_003082 NP_937859 NP_033251 場所（UCSC） 20章: 2.46 – 2.47 MB 2章: 130.01 – 130.02 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

小核リボ核タンパク質関連タンパク質BおよびB'は、ヒトではSNRPB遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ]}

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、U1、U2、U4/U6、およびU5小分子リボ核タンパク質粒子（snRNP）に共通して見られる核タンパク質の1つです。これらのsnRNPはpre-mRNAスプライシングに関与しており、コードされるタンパク質もpre-mRNAスプライシングやsnRNP構造に関与している可能性があります。全身性エリテマトーデス患者の自己抗体は、コードされるタンパク質上のエピトープを頻繁に認識します。この遺伝子には、異なるアイソフォーム（BおよびB'）をコードする2つの転写バリアントが見つかっています。^{[ 6 ]}

相互作用

SNRPBはDDX20 ^{[ 7 ]}およびコイリン^{[ 8 ]}と相互作用することが示されている。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000125835 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000027404 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Griffith AJ, Schmauss C, Craft J (1992年7月). 「高度に保存されたSm Bタンパク質をコードするマウス遺伝子は、機能しない選択的3'スプライス部位を含む」. Gene . 114 (2): 195– 201. doi : 10.1016/0378-1119(92)90574-9 . PMID 1376292 . 
6. 「Entrez Gene: SNRPB 小型核リボ核タンパク質ポリペプチド B および B1」。
7. Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (1999年12月). 「Gemin3：脊髄性筋萎縮症遺伝子産物SMNと相互作用し、gemsの構成要素となる新規DEADボックスタンパク質」 . J. Cell Biol . 147 (6): 1181–94 . doi : 10.1083/jcb.147.6.1181 . PMC 2168095. PMID 10601333 .  
8. Hebert MD, Szymczyk PW, Shpargel KB, Matera AG (2001年10月). 「コイリンはカハール小体と脊髄性筋萎縮症タンパク質SMNの間に橋渡しを形成する」 . Genes Dev . 15 (20): 2720–9 . doi : 10.1101/gad.908401 . PMC 312817. PMID 11641277 .  

さらに読む

• Will CL, Lührmann R (2001). 「スプライソソームUsnRNPの生合成、構造および機能」. Curr. Opin. Cell Biol . 13 (3): 290– 301. doi : 10.1016/S0955-0674(00)00211-8 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F770-0 . PMID  11343899 .
• Schmauss C, Lerner MR (1990). 「近縁性の小さな核内リボ核タンパク質ポリペプチドNとB/B'は、抗体だけでなく、mRNAや遺伝子構造の違いによっても識別可能である」 . J. Biol. Chem . 265 (18): 10733–9 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)87008-9 . PMID  1693924 .
• Elkon KB, Hines JJ, Chu JL, Parnassa A (1990). 「ポリメラーゼ連鎖反応により得られた組み換えHeLa細胞SmBおよびB'ペプチドのエピトープマッピング」 . J. Immunol . 145 (2): 636–43 . doi : 10.4049/jimmunol.145.2.636 . PMID  1694885 .
• Chu JL, Elkon KB (1991). 「核内小リボ核タンパク質SmBとB'は単一遺伝子の産物である」. Gene . 97 (2): 311–2 . doi : 10.1016/0378-1119(91)90069-N . PMID  1825643 .
• Sharpe NG, Williams DG, Latchman DS (1990). 「胚性幹細胞分化における小核リボ核タンパク質粒子SmNの発現制御」 . Mol . Cell. Biol . 10 (12): 6817–20 . doi : 10.1128/mcb.10.12.6817 . PMC  362965. PMID  2174118 .
• Schmauss C, McAllister G, Ohosone Y, Hardin JA, Lerner MR (1989). 「snRNP関連Sm自己抗原の比較：ヒトN、ラットN、ヒトB/B」「 .核酸研究. 17 (4): 1733–43 . doi : 10.1093 / nar/17.4.1733 . PMC  331831. PMID  2522186 .
• Feeney RJ, Sauterer RA, Feeney JL, Zieve GW (1989). 「成熟した小さな核内リボ核タンパク質粒子の細胞質内集合と核内蓄積」 . J. Biol. Chem . 264 (10): 5776– 83. doi : 10.1016/S0021-9258(18)83617-1 . PMID  2522439 .
• Ohosone Y, Mimori T, Griffith A, Akizuki M, Homma M, Craft J, Hardin JA (1989). 「Sm自己抗原をコードするcDNAの分子クローニング：Uシリーズの小核リボ核タンパク質粒子のBポリペプチドのcDNAの誘導」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 86 (11): 4249–53 . Bibcode : 1989PNAS...86.4249O . doi : 10.1073/pnas.86.11.4249 . PMC  287428. PMID  2524838 .
• van Dam A, Winkel I, Zijlstra-Baalbergen J, Smeenk R, Cuypers HT (1989). 「クローン化されたヒトsnRNPタンパク質BとB'はカルボキシ末端部分のみが異なる」 . EMBO J. 8 ( 12): 3853–60 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1989.tb08563.x . PMC  402073. PMID  2531083 .
• Huntriss JD、Latchman DS、Williams DG (1993)。「ループス自己抗体は、B/B'に限定されたエピトープに結合することで、高度に相同性の高いSmポリペプチドB/B'とSmNを区別する。「 . Clin. Exp. Immunol . 92 (2): 263–7 . doi : 10.1111 / j.1365-2249.1993.tb03390.x . PMC  1554819. PMID  7683587 .
• Gerrelli D, Grimaldi K, Horn D, Mahadeva U, Sharpe N, Latchman DS (1993). 「組織特異的SmNタンパク質の心臓型は、脳型および胎児型と同一である」. J. Mol. Cell. Cardiol . 25 (3): 321–9 . doi : 10.1006/jmcc.1993.1038 . PMID  8510173 .
• Simons A, Melamed-Bessudo C, Wolkowicz R, Sperling J, Sperling R, Eisenbach L, Rotter V (1997). 「PACT：Rbと相互作用する細胞性p53結合タンパク質のクローニングと特性解析」 . Oncogene . 14 (2): 145–55 . doi : 10.1038/sj.onc.1200825 . PMID  9010216 .
• Liu Q, Fischer U, Wang F, Dreyfuss G (1997). 「脊髄性筋萎縮症遺伝子産物SMNとその関連タンパク質SIP1は、スプライセオソームsnRNPタンパク質と複合体を形成する」 . Cell . 90 (6): 1013–21 . doi : 10.1016 / S0092-8674(00)80367-0 . PMID  9323129. S2CID  10855404 .
• Fury MG, Zhang W, Christodoulopoulos I, Zieve GW (1997). 「多重タンパク質：snRNP共通コアタンパク質間のタンパク質相互作用」. Exp. Cell Res . 237 (1): 63–9 . doi : 10.1006/excr.1997.3750 . PMID  9417867 .
• Bedford MT, Reed R, Leder P (1998). 「WWドメインを介した相互作用は、プロリンリッチモチーフの3番目のクラスであるプロリングリシンおよびメチオニンリッチモチーフに結合するスプライソソーム関連タンパク質を明らかにする」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 ( 18): 10602–7 . Bibcode : 1998PNAS...9510602B . doi : 10.1073/pnas.95.18.10602 . PMC  27941. PMID  9724750 .
• Kambach C, Walke S, Young R, Avis JM, de la Fortelle E, Raker VA, Lührmann R, Li J, Nagai K (1999). 「2つのSmタンパク質複合体の結晶構造とスプライセオソームsnRNPsの集合への影響」 . Cell . 96 ( 3): 375–87 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80550-4 . PMID  10025403. S2CID  17379935 .
• Gray TA, Smithwick MJ, Schaldach MA, Martone DL, Graves JA, McCarrey JR, Nicholls RD (1999). 「重複したSNRPB'/BおよびSNRPN遺伝子座の協調制御と分子進化」 . Nucleic Acids Res . 27 (23): 4577–84 . doi : 10.1093 / nar/27.23.4577 . PMC  148745. PMID  10556313 .
• Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (1999). 「Gemin3：脊髄性筋萎縮症遺伝子産物SMNと相互作用し、gemを構成する新規DEADボックスタンパク質」 . J. Cell Biol . 147 (6): 1181–94 . doi : 10.1083/jcb.147.6.1181 . PMC  2168095. PMID  10601333 .
• Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Yong J, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (2000). 「Gemin4. gemと核小体の両方に存在するSMN複合体の新規構成要素」 . J. Cell Biol . 148 (6): 1177–86 . doi : 10.1083/ jcb.148.6.1177 . PMC  2174312. PMID 10725331  .

「 https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SNRPB&oldid=1301335419」から取得