HLA-B53
主要組織適合遺伝子複合体(ヒト)、クラスI、B53 | ||
| 対立遺伝子 | B*5301 B*5302 | |
| 構造(HLA-Bを参照) | ||
| シンボル | HLA-B | |
| EBI-HLA | B*5301 | |
| EBI-HLA | B*5302 | |
| 軌跡 | 6章6節21.31節 | |
HLA-B53(B53)はHLA - B血清型の一種です。この血清型は、より一般的なHLA-B*53遺伝子産物を識別します。[ 1 ] B53の配列はB35と同一ですが、短い配列はB35に見られるBw6モチーフではなくBw4モチーフを指しており、B53は遺伝子変換によって最近生じた産物であることを示しています。[ 2 ]このことから、HLA-B53の起源は、このBw4配列を含む対立遺伝子によるHLA-B35の遺伝子変換であることが示唆されます。(用語の詳細については、HLA血清型チュートリアルをご覧ください。)
血清型
| B*53 | B53 | B35 | サンプル |
| 対立遺伝子 | % | % | サイズ(N) |
| 5301 | 86 | 5 | 3054 |
| 5302 | 80 | 20 | 5 |
B*5301アレル頻度
| 頻度 | ||
| 参照 | 人口 | (%) |
| [ 4 ] | アカンアディポドゥーム(コートジボワール) | 22.7 |
| [ 4 ] | リマイベ(ブルキナファソ) | 22.3 |
| [ 4 ] | モシ(ブルキナファソ) | 20.8 |
| [ 4 ] | バンディアガラ(マリ) | 15.9 |
| [ 4 ] | サワ(カメルーン) | 11.5 |
| [ 4 ] | ルサカ(ザンビア) | 10.2 |
| [ 4 ] | バカ・ピグミー(カメルーン) | 10.0 |
| [ 4 ] | ギニアビサウ | 10.0 |
| [ 4 ] | ハラレ・ショナ語(ジンバブエ) | 9.3 |
| [ 4 ] | バローチ語(イラン) | 9.1 |
| [ 4 ] | ケニア | 8.7 |
| [ 4 ] | カノンシト・ナバホ(米国) | 8.5 |
| [ 4 ] | ブラフイ(パキスタン) | 7.7 |
| [ 4 ] | ニオホロ・マンデンカ(セネガル) | 5.3 |
| [ 4 ] | クロアチア (2) | 5.0 |
| [ 4 ] | モンゴル ホトン タリアラン | 4.9 |
| [ 4 ] | パキスタン・バローチ | 4.6 |
| [ 4 ] | カサブランカ(モロッコ) | 3.7 |
| [ 4 ] | アラティア・バスク語(スペイン) | 3.3 |
| [ 4 ] | クレタ島(ギリシャ) | 3.2 |
| [ 4 ] | イスラエル・アラブ・ドルーズ | 2.5 |
| [ 4 ] | イスラエル ガザ パレスチナ人 | 2.4 |
| [ 4 ] | アンマン(ヨルダン) | 2.4 |
| [ 4 ] | チュニス(チュニジア) | 2.3 |
| [ 4 ] | トゥヴァ(2)(ロシア) | 2.2 |
| [ 4 ] | オマーン | 2.1 |
| [ 4 ] | フランス南東部 | 1.6 |
| [ 4 ] | サウジアラビアのグライアートと雹 | 1.5 |
| [ 4 ] | ベルベル語(モロッコ) | 1.4 |
| [ 4 ] | ジョージア・スヴァネティ・スヴァンス | 1.3 |
| [ 4 ] | モンゴル ハルハ ウランバートル | 1.2 |
| [ 4 ] | スペイン カタルーニャ ジローナ | 1.1 |
| [ 4 ] | インド アーンドラ・プラデーシュ州 ゴラ | 1.0 |
| [ 4 ] | モンゴル・ハルハ | 1.0 |
ハプロタイプ頻度
| 頻度 | ||
| 参照 | 人口 | (%) |
| ジンバブエ | 3.6 | |
| [ 4 ] | ザンビア ルサカ | 2.3 |
| 北アフリカ系ネグロイド | 2.1 | |
| [ 4 ] | ルオ・ケニア | 1.9 |
| [ 4 ] | カメルーン ヤウンデ | 1.7 |
| [ 5 ] | アフリカ系アメリカ人 | 1.5 |
| [ 4 ] | ケニア・ナンディ | 1.3 |
| [ 5 ] | アメリカのヒスパニック | 0.2 |
| ' | ||
| A*6802 : Cw*0401 : B*5301 | ||
| [ 4 ] | マリ・バンディハガラ | 2.7 |
| [ 5 ] | アフリカ系アメリカ人 | 1.4 |
| [ 4 ] | ケニア・ナンディ | 1.0 |
| [ 5 ] | ヒスパニック系アメリカ人 | 0.6 |
| [ 5 ] | 白人アメリカ人 | 0.2 |
A36-Cw4-B53 ハプロタイプは頻度は低いものの、アフリカ系アメリカ人では 4 番目に多いため、最も一般的な A-Cw-B ハプロタイプの 1 つです。
参考文献
- ^マーシュ、シンガポール;アルバート、ED。ウェストバージニア州ボドマー。ボントロップ、レバノン州。デュポン、B.アーリッヒ、HA;フェルナンデス・ビニャ、M.デラウェア州ジェラティ。ホールズワース、R.ハーリー、CK;ラウ、M.リー、KW。マッハ、B.マイヤーズ、M.マイヤー、WR;ミュラー、CR;パーハム、P.ピータースドルフ、EW;笹月 哲;ストロミンガー、JL;スヴェイゴール、A.寺崎主任。ティアシー、JM。 Trowsdale、J. (2010)。「HLA システムの因子の命名法、2010 年」。組織抗原。75 (4): 291– 455. doi : 10.1111/j.1399-0039.2010.01466.x . PMC 2848993 . PMID 20356336 .
- ^ Allsopp CE, Hill AV, Kwiatkowski D, et al. (1991). 「西アフリカでよく見られるアレルHLA-Bw53の配列解析は、HLA-B35の遺伝子変換による起源を示唆している」Hum. Immunol . 30 (2): 105–9 . doi : 10.1016/0198-8859(91)90078-N . PMID 2022493 .
- ^ IMGT/HLA由来
- ^ a b c d e f g h i j k l m no p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ag ai ajak al am anミドルトンD、メンチャカ L、ルードH、コメロフスキー R (2003)。「新しい対立遺伝子頻度データベース」。組織抗原。61 (5): 403– 7.土井: 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x。PMID 12753660。
- ^ a b c d e Maiers M, Gragert L, Klitz W (2007). 「米国人集団における高解像度HLAアレルとハプロタイプ」Hum. Immunol . 68 (9): 779– 88. doi : 10.1016/j.humimm.2007.04.005 . PMID 17869653 .