HLA-B53

主要組織適合遺伝子複合体(ヒト)、クラスI、B53
対立遺伝子 B*5301 B*5302
構造HLA-Bを参照)
シンボルHLA-B
EBI-HLAB*5301
EBI-HLAB*5302
軌跡6章6節21.31節

HLA-B53(B53)はHLA - B血清型の一種です。この血清型は、より一般的なHLA-B*53遺伝子産物を識別します。[ 1 ] B53の配列はB35と同一ですが、短い配列はB35に見られるBw6モチーフではなくBw4モチーフを指しており、B53は遺伝子変換によって最近生じた産物であることを示しています。[ 2 ]このことから、HLA-B53の起源は、このBw4配列を含む対立遺伝子によるHLA-B35の遺伝子変換であることが示唆されます。(用語の詳細については、HLA血清型チュートリアルをご覧ください。)

血清型

B53およびB35血清型による一部のHLA B*35対立遺伝子群遺伝子産物の認識[ 3 ]
B*53B53B35サンプル
対立遺伝子%%サイズ(N)
53018653054
530280205

B*5301アレル頻度

HLA B*7801頻度
頻度
参照人口(%)
[ 4 ]アカンアディポドゥーム(コートジボワール)22.7
[ 4 ]リマイベ(ブルキナファソ22.3
[ 4 ]モシ(ブルキナファソ)20.8
[ 4 ]バンディアガラマリ15.9
[ 4 ]サワカメルーン11.5
[ 4 ]ルサカザンビア10.2
[ 4 ]バカ・ピグミー(カメルーン)10.0
[ 4 ]ギニアビサウ10.0
[ 4 ]ハラレ・ショナ語(ジンバブエ9.3
[ 4 ]バローチ語イラン9.1
[ 4 ]ケニア8.7
[ 4 ]カノンシト・ナバホ(米国)8.5
[ 4 ]ブラフイパキスタン7.7
[ 4 ]ニオホロ・マンデンカ(セネガル)5.3
[ 4 ]クロアチア (2)5.0
[ 4 ]モンゴル ホトン タリアラン4.9
[ 4 ]パキスタン・バローチ4.6
[ 4 ]カサブランカ(モロッコ)3.7
[ 4 ]アラティア・バスク語(スペイン)3.3
[ 4 ]クレタ島(ギリシャ)3.2
[ 4 ]イスラエル・アラブ・ドルーズ2.5
[ 4 ]イスラエル ガザ パレスチナ人2.4
[ 4 ]アンマン(ヨルダン)2.4
[ 4 ]チュニス(チュニジア)2.3
[ 4 ]トゥヴァ(2)(ロシア)2.2
[ 4 ]オマーン2.1
[ 4 ]フランス南東部1.6
[ 4 ]サウジアラビアのグライアートと雹1.5
[ 4 ]ベルベル語(モロッコ)1.4
[ 4 ]ジョージア・スヴァネティ・スヴァンス1.3
[ 4 ]モンゴル ハルハ ウランバートル1.2
[ 4 ]スペイン カタルーニャ ジローナ1.1
[ 4 ]インド アーンドラ・プラデーシュ州 ゴラ1.0
[ 4 ]モンゴル・ハルハ1.0

ハプロタイプ頻度

A*3601 : Cw*0401 : B*5301
頻度
参照人口(%)
ジンバブエ3.6
[ 4 ]ザンビア ルサカ2.3
北アフリカ系ネグロイド2.1
[ 4 ]ルオ・ケニア1.9
[ 4 ]カメルーン ヤウンデ1.7
[ 5 ]アフリカ系アメリカ人1.5
[ 4 ]ケニア・ナンディ1.3
[ 5 ]アメリカのヒスパニック0.2
'
A*6802 : Cw*0401 : B*5301
[ 4 ]マリ・バンディハガラ2.7
[ 5 ]アフリカ系アメリカ人1.4
[ 4 ]ケニア・ナンディ1.0
[ 5 ]ヒスパニック系アメリカ人0.6
[ 5 ]白人アメリカ人0.2

A36-Cw4-B53 ハプロタイプは頻度は低いものの、アフリカ系アメリカ人では 4 番目に多いため、最も一般的な A-Cw-B ハプロタイプの 1 つです。

参考文献

  1. ^マーシュ、シンガポール;アルバート、ED。ウェストバージニア州ボドマー。ボントロップ、レバノン州。デュポン、B.アーリッヒ、HA;フェルナンデス・ビニャ、M.デラウェア州ジェラティ。ホールズワース、R.ハーリー、CK;ラウ、M.リー、KW。マッハ、B.マイヤーズ、M.マイヤー、WR;ミュラー、CR;パーハム、P.ピータースドルフ、EW;笹月 哲;ストロミンガー、JL;スヴェイゴール、A.寺崎主任。ティアシー、JM。 Trowsdale、J. (2010)。「HLA システムの因子の命名法、2010 年」組織抗原75 (4): 291– 455. doi : 10.1111/j.1399-0039.2010.01466.x . PMC  2848993 . PMID  20356336 .
  2. ^ Allsopp CE, Hill AV, Kwiatkowski D, et al. (1991). 「西アフリカでよく見られるアレルHLA-Bw53の配列解析は、HLA-B35の遺伝子変換による起源を示唆している」Hum. Immunol . 30 (2): 105–9 . doi : 10.1016/0198-8859(91)90078-N . PMID 2022493 . 
  3. ^ IMGT/HLA由来
  4. ^ a b c d e f g h i j k l m no p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ag ai ajak al am anミドルトンD、メンチャカ L、ルードH、コメロフスキー R (2003)。「新しい対立遺伝子頻度データベース」組織抗原61 (5): 403– 7.土井: 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.xPMID 12753660 
  5. ^ a b c d e Maiers M, Gragert L, Klitz W (2007). 「米国人集団における高解像度HLAアレルとハプロタイプ」Hum. Immunol . 68 (9): 779– 88. doi : 10.1016/j.humimm.2007.04.005 . PMID 17869653 .