HOXC6

HOXC6
識別子
エイリアス	HOXC6、CP25、HHO.C8、HOX3、HOX3C、ホメオボックスC6
外部ID	オミム: 142972 ; MGI : 96197 ;ホモロジーン: 19533 ;ジーンカード：HOXC6 ; OMA : HOXC6 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	12番染色体（ヒト）
終わり	54,030,823 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	15番染色体（マウス）
終わり	102,920,313 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	腎髄質; 精巣上体頭; 胚上皮; 乳首; 伏在静脈; 精巣上体; ヒップの皮膚; 腹直筋の骨格筋組織; 脊髄神経節; 乳管;
	上位の表現
	胚の尾; 胸椎; 輸出管; 太ももの筋肉; 性器結節; 女性の尿道; 副腎; 男性尿道; 脊髄の腰椎亜節; 卵黄嚢;
	より多くの参照表現データ
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合転写因子活性; 配列特異的DNA結合; DNA結合; 転写コリプレッサー活性; DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的; RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合; DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的; 転写因子活性、RNAポリメラーゼII遠位エンハンサー配列特異的結合;
細胞成分	核; 核質; 細胞質;
生物学的プロセス	RNAポリメラーゼIIによる転写の調節; 転写の制御、DNAテンプレート; 転写、DNAテンプレート; 前後パターンの指定; 胎児骨格系の発達; 核酸テンプレート転写の負の制御; 多細胞生物の発達; RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	3223
	15425
	ENSG00000197757
	ENSMUSG00000001661
	P09630
	P10629
	NM_153693 NM_004503
	NM_010465
	NP_004494 NP_710160
	NP_034595
	ウィキデータ
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ホメオボックスタンパク質Hox-C6は、ヒトではHOXC6遺伝子によってコードされているタンパク質です。^[⁵^]^[⁶^]^[⁷^] Hox-C6の発現は卵管と卵巣で最も高くなっています。^[⁸^] HoxC6は、前立腺がん、乳がん、食道扁平上皮がんなど、多くの種類のがんにおいて高発現しています。^[⁹^]

関数

この遺伝子はホメオボックスファミリーに属し、このファミリーのメンバーは、あらゆる多細胞生物の形態形成に重要な役割を果たす、高度に保存された転写因子ファミリーをコードしています。哺乳類は、異なる染色体上に位置し、縦列に並んだ9～11個の遺伝子からなる、類似のホメオボックス遺伝子クラスターを4つ持っています。この遺伝子、HOXC6は、12番染色体上のクラスターに位置するいくつかのHOXC遺伝子の1つです。3つの遺伝子、HOXC5、HOXC4、HOXC6は、5'非コードエクソンを共有しています。転写産物には、遺伝子特異的エクソンにスプライスされた共有エクソンが含まれる場合もあれば、遺伝子特異的エクソンのみが含まれる場合もあります。HOXC6については、異なるアイソフォームをコードする選択的スプライス転写バリアントが特定されています。転写バリアント2には共有エクソンが含まれ、転写バリアント1には遺伝子特異的エクソンのみが含まれます。^{[ 7 ]} HOXC6はリンパ腫において役割を果たしている。HOXC6アイソフォームであるHOXC6-2は胃癌の活性発癌物質である。これは癌遺伝子として作用し、胃癌細胞の増殖を刺激する。この遺伝子アイソフォームのダウンレギュレーションは、特定の癌細胞の増殖を抑制する可能性がある。HOXC6-1アイソフォームでは、ダウンレギュレーションによって遊走、浸潤、アポトーシス、増殖に統計的に有意な影響は見られなかった。^{[ 10 ]} Cancer Cell International誌に掲載された研究によると、HOXC6遺伝子の抑制はTGF-β/SMADカスケードを阻害する役割を果たしている。これは子宮頸癌における上皮間葉転換の弱化につながる。^{[ 11 ]}

ノックアウトモデル

低分子干渉RNAを用いたノックアウトモデルでは、HOXC6のノックアウトがアポトーシスと関連することが示された。さらに、HOXC6の存在はパクリタキセル誘導性アポトーシスの阻害と関連していた。したがって、HOXC6は増殖活性を誘導することが実証された。^{[ 12 ]}

参照

ホメオボックス

参考文献

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さらに読む

Acampora D、D'Esposito M、Faiella A、Pannese M、Migliaccio E、Morelli F、他。（1989年12月）。「ヒトHOX遺伝子ファミリー」。核酸研究。17 (24): 10385–10402。土井: 10.1093/nar/17.24.10385。PMC 335308。PMID 2574852。
Boncinelli E、Acampora D、Pannese M、D'Esposito M、Somma R、Gaudino G、他。（1990年）。「ヒトクラスIホメオボックス遺伝子の構成」。ゲノム。31 (2): 745–756 .土井: 10.1139/g89-133。PMID 2576652。
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外部リンク

HOXC6+タンパク質、+ヒト米国国立医学図書館医学件名表題集（MeSH）

この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000197757 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000001661 – Ensembl、2017年5月

[3] 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid1973146-5] McAlpine PJ, Shows TB (1990年7月). 「ヒトホメオボックス遺伝子の命名法」. Genomics . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . PMID 1973146 .

[pmid1358459-6] Scott MP (1992年11月). 「脊椎動物ホメオボックス遺伝子命名法」. Cell . 71 (4): 551– 553. doi : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . PMID 1358459. S2CID 13370372 .

[entrez-7] 「Entrez遺伝子：HOXC6ホメオボックスC6」。

[8] 「HOXC6の組織発現 - 概要 - ヒトタンパク質アトラス」 www.proteinatlas.org . 2022年4月11日閲覧。

[9] Tang L, Cao Y, Song X, Wang X, Li Y, Yu M, et al. (2019-03-14). 「HOXC6は悪性表現型に関与する遺伝子の発現を調節することにより、食道扁平上皮癌細胞の遊走、浸潤、増殖を促進する」 . PeerJ . 7 e6607. doi : 10.7717/peerj.6607 . PMC 6421064. PMID 30886783 .

[10] Lin J, He J, He X, Wang L, Xue M, Zhuo W, et al. (2020年10月). 「HoxC6はがん遺伝子として機能し、アイソフォームHoxC6-2は胃がんの発生において主要な役割を果たす可能性がある」.消化器疾患・科学. 65 (10): 2896– 2906. doi : 10.1007/s10620-019-06013-7 . PMID 31900716. S2CID 209541406 .

[11] Zhang F, Ren CC, Liu L, Chen YN, Yang L, Zhang XA (2018年12月). 「HOXC6遺伝子サイレンシングは子宮頸癌細胞におけるTGF-β/Smadシグナル伝達経路を介して上皮間葉転換および細胞生存率を阻害する」 . Cancer Cell International . 18 (1) 204. doi : 10.1186/s12935-018-0680-2 . PMC 6290547. PMID 30559605 .

[12] Moon SM, Kim SA, Yoon JH, Ahn SG (2012年10月). 「ヒト頭頸部扁平上皮癌におけるHOXC6の脱制御とBcl-2発現の調節」. The Journal of Biological Chemistry . 287 (42): 35678– 35688. doi : 10.1074/jbc.M112.361675 . PMC 3471680. PMID 22896703 .

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