ヒトのタンパク質コード遺伝子
CHD8 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス CHD8 、AUTS18、HELSNF1、クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質8、IDDAM 外部ID オミム :610528; MGI : 1915022; ホモロジーン :72405; ジーンカード :CHD8; OMA :CHD8 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 14番染色体(マウス) [2] バンド 14|14 C2 始める 52,435,608 bp [2] 終わり 52,495,237 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 腓骨神経 心室帯 小脳の右半球 顆粒球 神経節隆起 脚の皮膚 腹部の皮膚 結腸上皮 下垂体前葉 脾臓
上位の表現 胚の尾 性器結節 吻側回遊流 接合子 内頸動脈 心室帯 二次卵母細胞 外頸動脈 窩 回腸上皮
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遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 ヌクレオチド結合 DNAに作用するATP依存性活性 ヘリカーゼ活性 クロマチン結合 メチル化ヒストン結合 酸無水物に作用する加水分解酵素活性 DNAヘリカーゼ活性 タンパク質結合 加水分解酵素活性 ATP結合 p53結合 β-カテニン結合 ヒストン結合 アルマジロ反復ドメイン結合 細胞成分 生物学的プロセス 転写の制御、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 Wntシグナル伝達経路 転写、DNAテンプレート 転写の正の制御、DNAテンプレート 脳の発達 消化管の発達 RNAポリメラーゼIIIによる転写の正の制御 標準的なWntシグナル伝達経路の負の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 DNA二重鎖の巻き戻し クロマチン組織 Wntシグナル伝達経路の負の制御 転写の負の制御、DNAテンプレート 標準的なWntシグナル伝達経路 アポトーシス過程の負の調節 子宮内胚発生 驚愕反応 社会的行動 プレパルス抑制 線維芽細胞のアポトーシス過程の負の調節 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質8 は、ヒトでは CHD8 遺伝子によってコードされる 酵素 である 。 [5] [6]
関数 CHD8遺伝子は、タンパク質クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質8をコードしており [7] 、これは 胎児の発育に不可欠な クロマチン調節酵素である。 [8] CHD8はATP依存性酵素である。 [9]
このタンパク質には、ATPをADPに加水分解するSnf2ヘリカーゼドメインが含まれています。 [9] CHD8は、ヌクレオソームの位置を変化させることでクロマチン構造をリモデリングし、転写抑制因子として機能するDNAヘリカーゼをコードしています。 [8] CHD8はWntシグナル伝達を負に制御します。 [10] Wntシグナル伝達は脊椎動物の初期発生と形態形成において重要です。CHD8はリンカーヒストンH1をリクルートし、β-カテニンとp53標的遺伝子の抑制を引き起こすと考えられています。 [7] CHD8の重要性は、CHD8ノックアウトマウスがp53誘導性アポトーシスの広範な発現により胎生5.5日後に死亡したという研究結果からも明らかです。 [7]
最近、CD8は長鎖非コードRNA(lncRNA)の調節に関与していることがわかってきました [11]。 また、XCIのマスター調節因子であるXist長鎖非コードRNAをXist調節領域に競合的に結合させることで、X染色体不活性化(XCI)の開始を調節していることもわかってきました [12] 。
臨床的意義 この遺伝子の変異は、ヒトおよびマウスモデルにおける 自閉症の 症例の一部と関連付けられている [13 ]。 [14]
CHD8の変異はβ-カテニン調節遺伝子の上方制御につながる可能性があり、脳の一部ではこの上方制御が大頭症としても知られる脳の過成長を引き起こす可能性があります。 [8]
いくつかの研究により、自閉症スペクトラム障害(ASD)におけるCHD8の役割が明らかにされています。 [8] CHD8の発現は、ヒトの中期胎児期の発達中に著しく増加します。 [7] クロマチンリモデリング活性と転写調節因子との相互作用は、ASDの病因において重要な役割を果たすことが示されている。 [15] 発達中の哺乳類の脳には、ASDリスク遺伝子に関連するCHD8標的領域が保存されています。 [8] ヒト神経幹細胞におけるCHD8のノックダウンは、CHD8が標的とするASDリスク遺伝子の調節異常をもたらします。 [16]
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外部リンク
さらに読む 中島 D、岡崎 N、山川 H、菊野 R、大原 O、長瀬 T (2002 年 6 月)。 「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。 DNA 研究 。 9 (3): 99–106 . 土井 : 10.1093/dnares/9.3.99 。 PMID 12168954。 Epplen C, Epplen JT (1994年1月). 「ヒトリンパ球mRNAにおける(cac)n/(gtg)n単純反復配列の発現」. Human Genetics . 93 (1): 35– 41. doi :10.1007/BF00218910. PMID 7505766. S2CID 22998633. 坂本 郁、岸田 聡、福井 明、岸田 正治、山本 秀、日野 聡、他 (2000年10月). 「新規β-カテニン結合タンパク質はβ-カテニン依存性Tcf活性化および軸形成を阻害する」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (42): 32871–8 . doi : 10.1074/jbc.M004089200 . PMID 10921920. 小林正治、花井亮(2001年9月)「ヒトトポイソメラーゼIIIβと染色体のM期特異的な会合」 生化学および生物物理学的研究通信 . 287 (1): 282–7 . doi :10.1006/bbrc.2001.5580. PMID 11549288. 小林正治、岸田聡、福井明生、道上毅、宮本雄一、岡本毅、他 (2002年2月). 「β-カテニン結合タンパク質であるデュプリンの核局在は、Wntシグナル伝達経路における阻害活性に必須である」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (8): 5816–22 . doi : 10.1074/jbc.M108433200 . PMID 11744694. 西山正之、中山健一、常松亮、月山剛志、菊池明生、中山紀一 (2004年10月). 「β-カテニン結合タンパク質デュプリンを欠損するマウスにおける早期胚死亡」. 分子細胞生物学 . 24 (19): 8386–94 . doi :10.1128/MCB.24.19.8386-8394.2004. PMC 516734. PMID 15367660 . Lin KT, Lu RM, Tarn WY (2004年10月). 「WWドメイン含有タンパク質は初期スプライソソームと相互作用し、in vivoでpre-mRNAスプライシングに関与する」. Molecular and Cellular Biology . 24 (20): 9176–85 . doi :10.1128/MCB.24.20.9176-9185.2004. PMC 517884. PMID 15456888 . 石原 功、押村 正之、中尾 正治 (2006年9月). 「CTCF依存性クロマチンインシュレーターはエピジェネティックリモデリングに関連する」. Molecular Cell . 23 (5): 733–42 . doi : 10.1016/j.molcel.2006.08.008 . PMID 16949368. Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006年10月). 「確率に基づくアプローチによるハイスループットタンパク質リン酸化解析と部位局在化」. Nature Biotechnology . 24 (10): 1285–92 . doi :10.1038/nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292. Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, et al. (2006年11月). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. Yuan CC, Zhao X, Florens L, Swanson SK, Washburn MP, Hernandez N (2007年12月). 「CHD8はヒトStafと会合し、効率的なU6 RNAポリメラーゼIII転写に寄与する」. Molecular and Cellular Biology . 27 (24): 8729–38 . doi :10.1128/MCB.00846-07. PMC 2169411. PMID 17938208 . Thompson BA, Tremblay V, Lin G, Bochar DA (2008年6月). 「CHD8はATP依存性クロマチンリモデリング因子であり、β-カテニン標的遺伝子を制御する」. Molecular and Cellular Biology . 28 (12): 3894–904 . doi :10.1128/MCB.00322-08. PMC 2423111. PMID 18378692 . Caldon CE, Sergio CM, Schütte J, Boersma MN, Sutherland RL, Carroll JS, et al. (2009年9月). 「エストロゲンによるサイクリンE2の調節にはサイクリンD1が必要であるが、c-Mycは必要ない」. Molecular and Cellular Biology . 29 (17): 4623–39 . doi :10.1128/MCB.00269-09. PMC 2725719. PMID 19564413 . 西山 正之、押川 健、塚田 雄二、中川 剛、家村 聡、夏目 剛、他 (2009年2月). 「CHD8は初期胚発生においてヒストンH1のリクルートメントを介してp53を介したアポトーシスを抑制する」 Nature Cell Biology . 11 (2): 172–82 . doi :10.1038/ncb1831. PMC 3132516. PMID 19151705 . Rodríguez-Paredes M, Ceballos-Chávez M, Esteller M, García-Domínguez M, Reyes JC (2009年5月). 「クロマチンリモデリング因子CHD8は伸長RNAポリメラーゼIIと相互作用し、サイクリンE2遺伝子の発現を制御する」. Nucleic Acids Research . 37 (8): 2449–60 . doi :10.1093/nar/gkp101. PMC 2677868. PMID 19255092 . Yates JA, Menon T, Thompson BA, Bochar DA (2010年2月). 「ATP依存性クロマチンリモデリング酵素CHD8によるHOXA2遺伝子発現の制御」 (PDF) . FEBS Letters . 584 (4): 689–93 . doi :10.1016/j.febslet.2010.01.022. hdl : 2027.42/116349 . PMID 20085832. S2CID 9956275.