CVNHドメイン

利用可能なタンパク質構造:
PDB	IPR011058 PF08881 ( ECOD ; PDBsum )
アルファフォールド	IPR011058; PF08881;

CVNH
CVNH
	1:2シアノビリン-N:マン-α1,2-マン-α複合体の溶液NMR構造（拘束正規化平均座標）
識別子
シンボル	CVNH
ファム	PF08881
インタープロ	IPR011058
PDB
利用可能なタンパク質構造:
PDB	IPR011058 PF08881 ( ECOD ; PDBsum )
アルファフォールド	IPR011058; PF08881;

分子生物学において、CVNHドメイン（シアノビリン-Nホモロジードメイン）は保存されたタンパク質ドメインである。このドメインは、糖結合性抗ウイルスタンパク質であるシアノビリン-N（CVN）のほか、糸状子嚢菌やシダ植物Ceratopteris richardiiのタンパク質にも見られる。^[¹^]

シアノビリン-N（CV-N）は、シアノバクテリアNostoc ellipsosporum由来の 11 kDa タンパク質で、ヒト免疫不全ウイルス（AIDS）を含むいくつかのウイルスに対して殺ウイルス活性を示します。CV-N の殺ウイルス活性は、ウイルス表面エンベロープ糖タンパク質gp120およびgp41、ならびに HIV エンベロープにある高マンノースオリゴ糖との特異的な高親和性相互作用を介しています。^{[ 2 ]}さらに、CV-N はライノウイルス、ヒトパラインフルエンザウイルス、RS ウイルス、および腸管ウイルスに対して活性があります。インフルエンザウイルスに対する CV-N の殺ウイルス活性は、ウイルスのヘマグルチニンに向けられています。^{[ 3 ]} CV-N は、3 本鎖のβ シートとβ ヘアピンからなる 2 つの相同モチーフのタンデムリピートの複製で構成された複雑なフォールドを持っています。^{[ 4 ]}

参考文献

^ Percudani R, Montanini B, Ottonello S (2005年9月). 「抗HIVシアノビリンNドメインは進化的に保存されており、真核生物ではタンパク質モジュールとして存在する」. Proteins . 60 (4): 670–8 . doi : 10.1002/prot.20543 . PMID 16003744 .
^ Wlodawer A, Botos I (2003). 「シアノビリン-N：新たな工夫を凝らした糖結合性抗ウイルスタンパク質」 . Cell . Mol. Life Sci . 60 ( 2): 277– 287. doi : 10.1007/s000180300023 . PMC 11138712. PMID 12678493. S2CID 10579615 .
^ Mori T, O'keefe BR, Smee DF, Turpin JA, Saucedo CJ, Gustafson KR, Blakeslee D, Buckheit R, Boyd MR (2003). 「シアノビリンNの強力な抗インフルエンザ活性とウイルスヘマグルチニンとの相互作用」 . Antimicrob . Agents Chemother . 47 (8): 2518– 2525. doi : 10.1128/aac.47.8.2518-2525.2003 . PMC 166092. PMID 12878514 .
^ Wlodawer A, Botos I, Boyd MR, O Keefe BR, Cartner LK, Shenoy SR, Ratner DM, Seeberger PH (2002). 「強力な抗HIVタンパク質シアノビリンNと高マンノースオリゴ糖の複合体の構造」 . J. Biol. Chem . 277 (37): 34336– 34342. doi : 10.1074/jbc.M205909200 . PMID 12110688 .

この記事には、パブリックドメインのPfamおよびInterPro : IPR011058からのテキストが含まれています。

[pmid16003744-1] Percudani R, Montanini B, Ottonello S (2005年9月). 「抗HIVシアノビリンNドメインは進化的に保存されており、真核生物ではタンパク質モジュールとして存在する」. Proteins . 60 (4): 670–8 . doi : 10.1002/prot.20543 . PMID 16003744 .

[PUB00014252-2] Wlodawer A, Botos I (2003). 「シアノビリン-N：新たな工夫を凝らした糖結合性抗ウイルスタンパク質」 . Cell . Mol. Life Sci . 60 ( 2): 277– 287. doi : 10.1007/s000180300023 . PMC 11138712. PMID 12678493. S2CID 10579615 .

[PUB00014253-3] Mori T, O'keefe BR, Smee DF, Turpin JA, Saucedo CJ, Gustafson KR, Blakeslee D, Buckheit R, Boyd MR (2003). 「シアノビリンNの強力な抗インフルエンザ活性とウイルスヘマグルチニンとの相互作用」 . Antimicrob . Agents Chemother . 47 (8): 2518– 2525. doi : 10.1128/aac.47.8.2518-2525.2003 . PMC 166092. PMID 12878514 .

[PUB00014254-4] Wlodawer A, Botos I, Boyd MR, O Keefe BR, Cartner LK, Shenoy SR, Ratner DM, Seeberger PH (2002). 「強力な抗HIVタンパク質シアノビリンNと高マンノースオリゴ糖の複合体の構造」 . J. Biol. Chem . 277 (37): 34336– 34342. doi : 10.1074/jbc.M205909200 . PMID 12110688 .

[

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]