PTRF

キャビン1
識別子
エイリアス	CAVIN1、CAVIN、CGL4、cavin-1、FKSG13、PTRF、ポリメラーゼIおよび転写産物放出因子、caveolae関連タンパク質1
外部ID	オミム：603198; MGI : 1277968;ホモロジーン: 7499;ジーンカード：CAVIN1; OMA :CAVIN1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	17番染色体（ヒト）
終わり	42,423,256 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	11番染色体（マウス）
終わり	100,861,713 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	右冠動脈; ; 上腕二頭筋腱; ; 膝窩動脈; ; 脛骨動脈; ; 下行胸部大動脈; ; 伏在静脈; ; 上行大動脈; ; 左冠動脈; ; 子宮体部; ; 胃粘膜;
	上位の表現
	乳腺; ; 上行大動脈; ; 大動脈弁; ; 臍帯; ; 白色脂肪組織; ; 足首関節; ; 原腸胚; ; 皮下脂肪組織; ; 足底筋; ; 大動脈領域の中膜;
	より多くの参照表現データ
	; ;
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	rRNA結合; rRNA一次転写産物結合; タンパク質結合; RNA結合; 同一のタンパク質結合;
細胞成分	細胞質; 細胞質; 膜; 核質; 小胞体; ミトコンドリア; カベオラ; 膜ラフト; 核; 細胞膜; 細胞内膜小器官; タンパク質含有複合体;
生物学的プロセス	RNAポリメラーゼI転写の終結; 転写の制御、DNAテンプレート; RNAポリメラーゼIプロモーターからの転写開始; DNAテンプレート転写、終結; 転写、DNAテンプレート; rRNA転写; 細胞運動の正の調節; タンパク質分泌;
	出典：Amigo / QuickGO
オルソログ
	284119
	19285
	ENSG00000177469
	ENSMUSG00000004044
	Q6NZI2
	O54724
	NM_012232
	NM_008986 ; NM_001359105 ; NM_027160
	NP_036364
	NP_033012 ; NP_001346034
	ウィキデータ
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ポリメラーゼIおよび転写産物放出因子は、 Cavin1、Cavin-1、またはPTRFとしても知られ、ヒトではPTRF遺伝子によってコードされるタンパク質です。^[5]^[6]

関数

PTRF（Cavin1）は、カベオラの形成と機能に重要であることが示されている。^[7]カベオラの変形は、cavin-1のカベオラから核への移行を促進する^[8]

RNAポリメラーゼI触媒による転写終結は、転写伸長の一時停止と、プレリボソームRNAとポリメラーゼIのDNA鋳型からの遊離という2段階のプロセスである。この一時停止はTTF1とPTRFによって媒介される。^[9]^[10]

PTRFは、推定ロイシンジッパー、核局在シグナル、およびPEST ドメインを含む可溶性タンパク質である。^[11]

相互作用

PTRF（Cavin1）はCavin2およびCavin3とカベオラ形成において三量体を形成し、 EHD2やカベオリンなどの他の膜結合タンパク質と相互作用することが示されている。^[12]

PTRFはZNF148と相互作用することが示されている。^[13]

参考文献

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さらに読む

Jansa P, Mason SW, Hoffmann-Rohrer U, Grummt I (1998年5月). 「一時停止中の三元転写複合体の解離を誘導する新規タンパク質PTRFのクローニングと機能解析」. The EMBO Journal . 17 (10): 2855– 2864. doi :10.1093/emboj/17.10.2855. PMC 1170626. PMID 9582279 .
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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000177469 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000004044 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[entrez-5] 「Entrez Gene: PTRFポリメラーゼIおよび転写産物放出因子」。

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[8] Qifti A, Balaji S, Scarlata S (2022年6月). 「caveolaeの変形はcavin-1の再局在化を介して転写および翻訳プロセス全体に影響を及ぼす」. The Journal of Biological Chemistry . 298 (6) 102005. doi : 10.1016/j.jbc.2022.102005 . PMC 9168624. PMID 35513070 .

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[12] コフトゥン O、ティル VA、アリオッティ N、パートン RG、コリンズ BM (2015 年 4 月)。「カビンファミリータンパク質とカベオラの集合体」。細胞科学ジャーナル。128 (7): 1269 ～ 1278 年。土井:10.1242/jcs.167866。PMC 4379724。PMID 25829513。

[pmid10727401-13] 長谷川剛志、竹内明生、宮石修、肖浩、毛俊一、磯部功（2000年4月）。「PTRF（ポリメラーゼIおよび転写産物放出因子）は組織特異的であり、マウスの2つのI型コラーゲン遺伝子プロモーターに結合するBFCOL1（I型コラーゲンプロモーター結合因子）ジンクフィンガー転写因子と相互作用する」。生化学ジャーナル。347 Pt 1（Pt 1）：55– 59。doi ： 10.1042/ 0264-6021 ：3470055。PMC 1220930。PMID 10727401。