主要記事: SARS-CoV-2の変異体
系統B.1.617.1については、SARS-CoV-2 Kappa変異体を参照してください。

この記事は、COVID-19を引き起こすウイルスの変異体に関するものであり、鳥類やヒト以外の哺乳類に影響を及ぼすコロナウイルス種のデルタコロナウイルスグループと混同しないでください。

SARS-CoV-2変異株
SARS-CoV-2の外部構造を科学的に正確に表した原子モデル。それぞれの「ボール」は原子です。
SARS-CoV-2の外部構造を科学的に正確に表した原子モデル。それぞれの「ボール」は原子です。
一般的な詳細
症状
主な変異体
シリーズの一部
COVID-19 パンデミック
Scientifically accurate atomic model of the external structure of SARS-CoV-2. Each "ball" is an atom.
SARS-CoV-2の外部構造を科学的に正確に表した原子モデル。それぞれの「ボール」は原子です。
タイムライン
2019
2020
2021
2022
2023
場所
国と地域別
輸送手段
国際的な反応
国の対応
医療対応
ワクチン
現在のワクチン
変種
懸念される変異株
その他のバリエーション
経済への影響と景気後退
国別
スポーツ別
影響
Long COVID
Society
Politics
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デルタ変異株（B.1.617.2）は[ 3 ] [ 4 ] 、 COVID-19を引き起こすウイルスであるSARS-CoV-2の変異株である。2020年10月5日にインドで初めて検出された。デルタ変異株は2021年5月31日に命名され、2021年11月22日までに179カ国以上に広がった。世界保健機関（WHO）は2021年6月、デルタ変異株が世界的に優勢な株になりつつあると指摘した。[ 5 ]

これはSARS-CoV-2スパイクタンパク質をコードする遺伝子に変異があり[ 6 ] 、T478K、 P681R 、およびL452Rの置換を引き起こし、[ 7 ] [ 8 ]これらはウイルスの伝染性に影響を与えることが知られているだけでなく、以前に循環していたCOVID-19ウイルスの変異体に対する抗体によって中和されるかどうかにも影響を及ぼします。[ 9 ]イングランド公衆衛生局（PHE）は2021年8月に、旅行に関連しないまたは不明な症例の家庭内接触におけるデルタ株の二次感染率がアルファ株の10.2％に対して10.8％であると報告しました。[ 10 ]デルタ株に感染した386,835人の致死率は0.3％で、症例の46％と死亡者の6％はワクチン接種を受けておらず、50歳未満です。[ 11 ]以前の回復による免疫[ 12 ] [ 13 ]またはCOVID-19ワクチンは、変異株の感染による重症化や入院を予防するのに効果的である。[ 14 ]

2021年5月7日、PHEは、B.1.617.2系統の分類を、 B.1.1.7（アルファ変異株）と少なくとも同等の伝染性があるとの評価に基づき、調査中の変異株（VUI）から懸念される変異株（VOC）に変更しました。 [ 15 ]英国のSAGEは、5月のデータを使用して、伝染性が50％高いという「現実的な」可能性を推定しました。[ 16 ] 2021年5月11日、WHOもこの系統をVOCに分類し、伝染性が高く、中和効果が低下しているという証拠が示されていると述べました。2021年6月15日、米国疾病予防管理センター（CDC）はデルタを懸念される変異株と宣言しました。[ 17 ]

この変異株は、 2021年2月に始まったインドでの致命的なパンデミックの第二波の一部に関与していると考えられています。 [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]その後、フィジー、英国[ 21 ] [ 22 ] [ 23 ]、南アフリカ[ 24 ]で第三波の原因となり、WHOは2021年7月にヨーロッパとアフリカの他の地域でも同様の影響を及ぼす可能性があると警告しました。[ 25 ] [ 24 ] 7月下旬までに、アジアの一部、[ 26 ]米国、[ 27 ]オーストラリア、ニュージーランドでも1日あたりの感染者数が増加しました。[ 28 ]

分類

デルタ変異株は、SARS-CoV-2スパイクタンパク質をコードする遺伝子に変異を有しており[ 6 ] 、 D614G、T478K、P681R、L452Rの置換を引き起こしている[ 29 ] [ 8 ]。これは、 Nextstrain系統分類システムの下で21A、21I、および21J系統群として識別されている[ 30 ] 。

名前

このウイルスは、インドで最初に検出されたことから、「インド変異株」とも呼ばれています[ 31 ]。しかし、デルタ変異株はB.1.617系統の3つの変異株のうちの1つに過ぎず、これらはすべてインドで最初に検出されました[32]。2021年5月末、WHOは、懸念される変異株と関心のある変異株にギリシャ文字を使用するという新しい方針を導入した後、系統B.1.617.2にデルタというラベルを付けました[ 33 ] 。

B.1.617の他の亜系統

系統 B.1.617には、現在までに 3 つのサブ系統が分類されています。

B.1.617.1（カッパ変異体）は、2021年4月にイングランド公衆衛生局（Public Health England）によって調査中の変異体に指定されました。2021年4月後半には、さらに2つの変異体、B.1.617.2とB.1.617.3が調査中の変異体に指定されました。B.1.617.3はB.1.617.1に見られるL452RおよびE484Q変異を共有していますが、B.1.617.2にはE484Q変異がありません。B.1.617.2にはT478K変異がありますが、これはB.1.617.1およびB.1.617.3には見られません。[ 34 ] [ 35 ]同時に、ECDCはB.1.617の3つの亜系統すべてをVOIとして維持するという概要を発表し、「現在の措置の修正を検討する前に、これらのB.1.617系統に関連するリスクをより深く理解する必要がある」と推定しました。[ 36 ]

突然変異

  • SARS-CoV-2デルタ変異体のアミノ酸変異をSARS-CoV-2のゲノム地図上にプロットし、スパイクに焦点を当てた[37]
    SARS-CoV-2デルタ変異体のアミノ酸変異をSARS-CoV-2のゲノム地図上にプロットし、スパイク遺伝子に焦点を当てた[ 37 ]

SARS-CoV-2デルタ変異株の変異の定義
遺伝子ヌクレオチドアミノ酸
ORF1bP314L
P1000L
スパイクG142D
T19R
R158G
L452R
T478K
D614G
P681R
D950N
E156del
F157del
MI82T
北D63G
R203M
D377Y
ORF3aS26L
ORF7aV82A
T120I
出典：CDC [ 38 ] Covariants.org [ 39 ]

Delta/B.1.617.2ゲノムには少なくとも13の変異があり、それがコードするタンパク質のアミノ酸配列に変化を引き起こします。[ 40 ]

スパイクタンパク質の変異のリストは以下のとおりである。GVNによれば19R、(G142D)、Δ156-157、R158G、L452R、T478K、D614G、P681R、D950N [ 41 ]、またはGenscriptによればT19R、G142D、del 156–157、R158G、L452R、T478K、D614G、P681R [ 42 ]。 これらのうち、ウイルスのスパイクタンパク質コードにある4つが特に懸念される。

E484Q変異はB.1.617.2ゲノムには存在しない。[ 46 ] [ 47 ]

系譜

2021年8月現在、デルタ変異株はパンゴ系統指定システムにおいてAY.1からAY.28までの変異株に細分化されている。しかし、このような分類がウイルスの生物学的特性の変化と相関しているかどうかについては情報がない。[ 48 ] 2021年8月現在、英国ではAY.4からAY.11、イスラエルではAY.12、米国ではAY.2、AY.3、AY.13、AY.14、AY.25、米国とメキシコではAY.20、カナダではAY.15、ケニアではAY.16、アイルランドと北アイルランドではAY.17、南アフリカではAY.19、イタリアとスイスではAY.21、ポルトガルではAY.22、インドネシアではAY.24、インドネシア、シンガポール、日本、韓国ではAY.23が主流と言われている。[ 49 ]

「デルタプラス」バリアント

参照: SARS-CoV-2 § Delta の変異株 (系統 B.1.617.2)

K417Nを持つデルタは、もともと系統AY.1とAY.2に対応していましたが[ 50 ] 、その後系統AY.3にも対応し[ 51 ]、「デルタプラス」または「ネパール変異体」という愛称で呼ばれています。[ 52 ] K417N変異を有しており[ 53 ] 、これはベータ変異体にも存在します。[ 54 ] 417番目の位置の置換はリジンからアスパラギンへの置換です。[ 55 ]

2021年10月中旬の時点で、AY.3変異株の累積有病率は米国で約5％、世界全体では2％を占めていた。[ 56 ] 10月中旬、AY.4.2 Delta亜系統は英国で拡大しており、監視と評価が行われていた。この亜系統はスパイクタンパク質にA222VとY145Hの変異を含んでいるが、[ 57 ]特に懸念されるものではないと考えられている。AY.4.2は元のDelta変異株よりも10～15％伝染性が高い可能性があることが示唆されている。2021年10月中旬の時点で、AY.4.2は症例の約10％を占めており、約5日間の世代時間ごとに約1％（10％の10％）の追加増加率につながっている。この追加増加率は、有病率の増加に伴って大きくなるだろう。 AY.4.2がなく、他の変更もなければ、英国の症例数は約10％少なかったでしょう。[ 58 ] AY.4.2は週ごとに約15％速く増加します。[ 59 ]英国では、2021年10月下旬に「調査中の変異株」（「懸念される」ではない）に再分類されました。[ 60 ]デンマークでは、AY.4.2の症例数の減少後、新たな急速な増加が検出され監視されましたが、まだ懸念の原因とは見なされていませんでした。[ 61 ] [ 62 ]

症状

主要記事: COVID-19の症状

全体的に、デルタ変異株の感染症状は他のSARS-CoV-2変異株の症状と類似している。一般的な症状としては、発熱、乾いた咳、脱力感、痰の絡む咳、頭痛、息切れ（呼吸困難）、筋肉痛などがある。ほとんどの人が最初の症状として、体の一部の感覚が部分的に失われる（知覚低下）か、嗅覚と味覚が失われると報告している。重症の場合、症状発症から約1週間後に呼吸困難と血中酸素濃度の低下（低酸素血症）が現れ、急性呼吸窮迫症候群、敗血症性ショック、代謝性アシドーシス、凝固機能障害、多臓器不全を急速に発症する人もいる。[ 63 ]

防止

参照: COVID-19 § 予防、オックスフォード–アストラゼネカ COVID-19 ワクチン § 有効性、ファイザー–ビオンテック COVID-19 ワクチン § 有効性、モデルナ COVID-19 ワクチン § 有効性、ヤンセン COVID-19 ワクチン § 臨床試験、シノファーム BIBP COVID-19 ワクチン § 変異体、スプートニク V COVID-19 ワクチン § 有効性、コロナバック § 変異体、コバキシン § 有効性、ZF2001 § 有効性、アブダラ (ワクチン) § 有効性
デルタに対するワクチン予防の要約
（WHOの最新情報、2021年8月24日[ 64 ]）
病気や感染症重度：保護は維持される
症状あり：保護が低下する可能性がある
重症安定した:アストラゼネカ-ヴァクゼブリア(1)、モデルナ(1)、ファイザー-ビオンテック(2)
症状のある病気安定したへ中立的な減少: ファイザー-BioNTech(3)
中立的な減少:コヴァキシン(1) : アストラゼネカ-ヴァクスゼブリア(2)
中立的な減少中立的な減少
感染中立的な減少: アストラゼネカ-ヴァクゼブリア(1)、ファイザー-バイオNテック(1)
記号はワクチン効果（VE）の低下の程度を示しています。VEの低下は防御力の低下を意味するものではありません。元々の高い防御率（例：95%）がある程度（例：10%）低下しても、防御力（例：85%）は維持されるためです。括弧内は、適応症を裏付ける研究数です。研究は対象集団、アウトカムの定義、研究デザインなどが異なるため、同じ製品のVE推定値が研究によって異なる場合があります。また、低下はVE推定値を示すものであり、推定値に関する不確実性を表すものではありません。不確実性は研究によって大きく異なる場合があります。VEの低下は、これらの制限を踏まえて解釈する必要があります。

安定した: VE が 10% 未満減少、または比較対象なしで VE が 90% 以上
中立的な減少減少: VE が 10% から 20% 未満減少

中立的な減少中立的な減少: VEは20～30%減少
中和効果（完全ワクチン接種）[ 65 ]
安定した宛先中立的な減少：安徽省-ZIFIVAX（2）、Covaxin（3）
中立的な減少：ヤンセン（3）、モデルナ（3）、コビシールド（2）
中立的な減少宛先：アストラゼネカ-Vaxzevria（4）、ファイザー-BioNTech（8）：モデルナ＆ファイザー-BioNTech（1）*宛先：コロナバック（2）中立的な減少中立的な減少
中立的な減少中立的な減少
中立的な減少中立的な減少中立的な減少中立的な減少
記号は、完全ワクチン接種による中和効果の減少度合いを示しています。括弧内は、適応症を裏付ける研究の数です。

安定した: 中和により 2 分の 1 未満に減少
中立的な減少: 中和により 2 分の 1 ～ 5 分の 1 未満に減少: 中和により 5 分の 1 ～ 10 分の 1 未満に減少: 中和により 10 分の 1 以上に減少* Moderna と Pfizer-BioNTech は一緒に評価されました。
中立的な減少中立的な減少
中立的な減少中立的な減少中立的な減少

WHOはデルタ株に対する予防措置を特に発表していないが、野生型のCOVID-19の予防に推奨される非医薬品対策は依然として有効であると考えられる。これには、手洗い、マスクの着用、他人との距離の確保、口、鼻、目に触れないこと、換気の悪い特に人々が話しているような混雑した屋内空間を避けること、症状が出たら検査を受けること、病気になったら隔離することなどが含まれる。[ 66 ] 公衆衛生当局は、検査によって感染者を発見し、接触者を追跡し、陽性反応が出た人や感染にさらされた人を隔離し続けるべきである。[ 67 ] イベント主催者は、あらゆる大規模集会の潜在的リスクを評価し、こうしたリスクを軽減する計画を策定すべきである。[ 68 ]非医薬品介入（疫学） も参照。

インド医学研究評議会（ICMR）は、COVID-19症例の回復期血清とBharat BiotechのBBV152（Covaxin）投与を受けた人は、効力は低いものの、VUI B.1.617を中和できることを発見した。[ 69 ]

ゲノミクス・統合生物学研究所（IGIB）の所長アヌラグ・アグラワル氏は、B.1.617系統に対する既存のワクチンの有効性に関する研究では、ワクチン接種後は感染が軽度になることが示唆されていると述べた。[ 70 ]

アメリカ合衆国大統領首席医学顧問のアンソニー・ファウチ氏も、この予備的な結果に自信を示しました。4月28日のインタビューで、彼は次のように述べました。

これは現在も日々データが蓄積されている分野です。しかし、最新のデータは、COVID-19感染者の回復期血清と、インドで使用されているワクチン「コバクシン」を接種した人々の血清を調べたものです。このワクチンは617の変異株を中和することが判明しました。[ 71 ]

ハイデラバードの細胞分子生物学センター（CCMB）による別の研究では、コビシールド（オックスフォード・アストラゼネカ）ワクチン接種血清がB.1.617系統に対する防御効果を発揮することが判明した。 [ 72 ]

イングランド公衆衛生局（PHE）が実施した調査によると、ファイザー・ビオンテックまたはアストラゼネカ・オックスフォードのワクチンを接種した人は、接種を受けなかった人に比べて、1回目の接種後に変異株による症状のある疾患の発症例が33％少なかった。ファイザー・ビオンテックのワクチンの2回目の接種から2週間後では、デルタ変異株による症状のある疾患の発症例が、接種を受けなかった人に比べて88％少なかった。アストラゼネカ・オックスフォードのワクチンの2回目の接種から2週間後では、デルタ変異株による症状のある疾患の発症例が、接種を受けなかった人に比べて60％少なかった。[ 73 ] [ 74 ]

フランシス・クリック研究所の研究者グループがランセット誌に発表した研究によると、ファイザー・ビオンテックのワクチンを完全に接種した人間は、元のCOVID-19株と比較して、デルタ変異株に対する中和抗体のレベルが5倍以上低い可能性が高いことが示されています。[ 75 ] [ 76 ]

2021年6月、PHEは、2回の接種後、ファイザー・ビオンテックワクチンとアストラゼネカワクチンは、デルタ変異株による入院をそれぞれ96％と92％予防する効果があるという研究を実施したと発表した。[ 77 ] [ 78 ]

7月3日、カナダのオンタリオ州にあるトロント大学とオタワ大学の研究者らは、モデルナ社のワクチンがデルタ変異株による死亡や入院に対して効果があるかもしれないことを示唆するプレプリント研究を発表しました。[ 79 ] [信頼できない医療情報源? ]

2021年7月にスリ・ジャヤワルダナプラ大学が行った研究では、シノファームBIBPワクチンを2回接種した被験者の95%で抗体陽転が認められました。この割合は20～39歳層では98.9%と高く、60歳以上層では93.3%とやや低かった。ワクチン接種を受けた被験者の81.25%に中和抗体が存在した。[ 80 ] [ 81 ]

2021年6月29日、ガマレヤ研究所所長デニス・ログノフ氏は、スプートニクVはデルタ変異株に対して約90％の効果があると述べた。[ 82 ]

7月21日、PHEの研究者らは、ファイザーのワクチンは2回接種後、デルタによる症状のある疾患に対して93.7%の有効性を示したのに対し、アストラゼネカのワクチンは67%の有効性を示したという研究結果を発表しました。[ 83 ]

8月2日、複数の専門家は、デルタ変異株は現在のワクチンで免疫を獲得した人々の間で伝染するため、集団免疫の達成は現時点では不可能かもしれないという懸念を表明した。[ 84 ]

8月10日、ある研究で、16カ国におけるSARS-CoV-2デルタ変異株の変異頻度とワクチン接種率の完全相関が示されました（R2=0.878）。データは、COVID-19に対するワクチン接種の完全実施がウイルスの進化を遅らせる可能性を強く示唆しています。[ 85 ]

処理

参照：COVID-19の治療と管理

試験管内実験では、バムラニビマブ単独ではデルタ株に効果がない可能性があることが示唆されている。[ 86 ] 十分な濃度であれば、カシリビマブ、エテセビマブ、イムデビマブは依然として有効であるように見える。プレプリント研究では、ソトロビマブもデルタ株に効果がある可能性があることが示唆されている。[ 87 ]シンガポールの医師は、以前の変異株よりも多くのデルタ株患者に酸素補給、レムデシビル、コルチコステロイド を使用している。[ 88 ]

疫学

デルタへの影響の要約*
（WHOの最新情報、2021年8月24日[ 64 ]）
伝染性伝染性と二次感染率が増加しますが、ワクチン接種を受けた人と接種を受けていない人の間では伝染性は同様です。
毒性入院リスクの増加
再感染中和活性の低下
診断影響はまだ報告されていない
* 査読を受けていない出版物を含む証拠に基づいて、他の株と比較した一般化された調査結果。

伝染性

英国の科学者らは、デルタ変異株は、英国で最初に特定された（ケント変異株として）それまで優勢だったアルファ変異株よりも40％～60％伝染性が高いと述べている。 [ 89 ]アルファ変異株の伝染力がすでに2019年後半に武漢で発生した元のSARS-CoV-2株の150％であることを考えると、[ 89 ]デルタ変異株の伝染力がアルファ変異株の150％であれば、デルタ変異株の伝染力は元の株の225％である可能性がある。[ 90 ] BBCは、最初に検出されたSARS  - CoV-2ウイルスの基本再生産数、つまりすべての個人が感染の影響を受けやすい集団で1つの症例によって直接生成される症例の予想数は2.4～2.6であるのに対し、アルファの再生産数は4～5、デルタの再生産数は5～9であると報告した。[ 91 ] [ 92 ]これらの基本再生産数は、MERS（0.29～0.80 [ 93 ]）、季節性インフルエンザ（1.2～1.4 [ 94 ]）、エボラ出血熱（1.4～1.8 [ 95 ]）、風邪（2～3 [ 96 ]）、SARS（2～4 [ 97 ]）、天然痘（3.5～6 [ 98 ]）、水痘（10～12 [ 99 ]）と比較することができます。デルタウイルスは感染力が高いため、ワクチン接種を受けた人でも、程度は低いものの、感染する可能性があります[ 100 ] 。 [ 74 ]

広東省疾病予防管理センターがオンラインで発表した研究（査読なし）[ 101 ]は、感染力の増加を部分的に説明できるかもしれない。デルタによる感染者の呼吸器系におけるウイルスのコピー数は、パンデミック初期に最初に特定された変異株による感染者よりも1,000倍多かった。また、デルタに感染した人がウイルスを検出できるようになるまでには、平均4日かかったのに対し、最初に特定された変異株では6日かかった。[ 102 ] [ 103 ]

2021年6月と7月の米国、ドイツ、オランダの監視データによると、デルタ変異株はアルファ変異株に比べて2週間ごとに約4倍に増加していました。[ 104 ] [ 105 ] [ 106 ]

インド、イギリス、[ 107 ]ポルトガル、[ 108 ]ロシア、[ 109 ]メキシコ、オーストラリア、インドネシア、[ 110 ]南アフリカ、ドイツ、[ 111 ]ルクセンブルク、[ 112 ]アメリカ、[ 113 ]オランダ、[ 114 ]デンマーク、[ 115 ]フランス[ 116 ] 、そしておそらく他の多くの国々では、デルタ変異株が2021年7月までに優勢な株となっていた。国によって、症例と変異株の報告の間には通常、数日から数週間のタイムラグがある。2021年7月20日時点で、この変異株は124か国に広がっており、[ 65 ] WHOは、すでに優勢な株の1つではないにしても、優勢な株になりつつあると示唆していた。[ 117 ]

オランダでは、2021年28週目以降、献血者の93.4%以上がSARS-CoV-2抗体検査で陽性反応を示し、ウイルスは依然として人口内で顕著に増殖している。オランダでは多くの人がワクチン接種を完了していないため、これらの抗体は野生ウイルスへの曝露またはワクチン接種によって生成されたものと考えられる。[ 118 ] [ 119 ]英国でも、献血者と一般サーベイランスで同様の高い血清免疫レベルが認められる。[ 120 ] [ 121 ] [ 122 ]

プレプリントによると、変異株による感染の最初の陽性検査におけるウイルス量は、2020年に比較された感染者と比較して平均で約1000倍高かった。 [ 123 ] [ 124 ]デルタが急速に蔓延していた2021年5月から7月にかけて英国で10万人のボランティアを対象に行われた研究の予備データによると、無症状の症例も含め、COVID-19の検査で陽性となったワクチン接種済みの人のウイルス量は平均して低いことが示されている。米国、英国、シンガポールのデータによると、デルタに感染したワクチン接種済みの人のウイルス量は、ワクチン接種を受けていない感染者と同程度に高くなる可能性があるが、感染力を維持できる期間は短い可能性があることが示されている。[ 125 ]

感染年齢層

インド政府の統合疾病監視プログラム（IDSP）の監視データによると、入院患者と院外患者の両方において、第2波では30歳未満の患者が約32%を占め、第1波では31%であったのに対し、第2波では約32%に増加した。30～40歳の感染率は21%にとどまった。20～39歳の入院率は23.7%から25.5%に増加し、0～19歳は4.2%から5.8%に増加した。また、第2波では無症状の患者の割合が増加し、呼吸困難の訴えも増加した。[ 126 ]

毒性

参照:毒性

いくつかの初期の研究では、デルタ変異株は他の株よりも重篤な病気を引き起こすことが示唆されている。[ 127 ] 2021年6月7日、シンガポール国立感染症センターの研究者らは、デルタ陽性の患者は野生型やアルファ型の患者よりも肺炎を発症したり酸素を必要とする可能性が高くなることを示唆する論文を発表した。[ 128 ] 6月11日、イングランド公衆衛生局は、アルファ型と比較してデルタ型では「入院リスクが著しく高い」という報告書を発表した。[ 129 ]デルタ変異株に感染した人ではリスクが約2倍高かった。[ 130 ] 6月14日、スコットランド公衆衛生局の研究者らは、デルタ型による入院リスクはアルファ型の約2倍であることを発見した。[ 131 ] 7月7日、トロント大学の疫学者によるプレプリント研究では、デルタ株はSARS-COV-2の懸念のない変異株と比較して、入院リスクが120％（2倍以上）、ICU入院リスクが287％、死亡リスクが137％高いことがわかった。[ 132 ]しかし、7月9日、イングランド公衆衛生局は、イングランドでのデルタ変異株の症例致死率（CFR）は0.2％であるのに対し、アルファ変異株の症例致死率は1.9％であったと報告した。ただし、この報告書では、「症例致死率は、パンデミックの異なる時点でピークに達したため、変異株間で比較することはできず、病院の背景にある逼迫状況、ワクチンの可用性と率、症例プロファイル、治療の選択肢、報告の遅れの影響など、さまざまな要因が異なる」と警告している。[ 133 ]イングランド公衆衛生局の広報担当者ジェームズ・マクリーディー氏は、「他の変異株と比較した致死率を評価するのは時期尚早だ」と明言した。[ 134 ]

2021年10月5日に発表されたカナダの研究によると、デルタ変異株は他の変異株と比較して入院が108％増加し、ICU入院が235％増加し、死亡が133％急増したことが明らかになりました。デルタ変異株は以前の変異株と比較してより深刻で、死亡リスクが高まっていますが、そのオッズは予防接種によって大幅に減少します。[ 135 ] [ 136 ]

統計

デルタ症例を検出する可能性は、特に国のシークエンシング率によって大きく異なります（シークエンシング率が最も低い国では、COVID-19症例全体の0.05％未満しかシークエンシングされていませんが、最も高い国では約50％です）。[ 137 ] [ 138 ]

2021年6月22日までに、約78か国で4,500以上の変異体の配列が検出されました。[ 139 ] [ 140 ] [ 141 ]検出された国で報告された配列数は次のとおりです。

国別の症例数
国/地域確認された症例（PANGOLIN）[ 142 ]
12月19日現在		11月23日現在、確認された症例（GISAID）[ 139 ]

2022年1月19日時点の症例数（他の情報源）		最初の検出最終検出
 イギリス985,491826,4651,625,557 [ 143 ]2021年2月22日
 アメリカ合衆国1,099,811947,47299.4%の症例[ 144 ]2021年2月23日
 カナダ78,41262,008196,866 [ 145 ]2021年3月15日
 ドイツ150,416117,5132021年3月1日
 デンマーク138,33689,7062021年3月8日
 日本86,38370,97386,037 [ 146 ] [ 147 ]2021年3月28日
 フランス75,22470,8222021年2月21日
 七面鳥54,13450,5785 [ 148 ]2021年4月28日
 フィジー49550747,639 [ 149 ] [ 150 ] [ 151 ]2021年4月19日
 インド45,63845,0552020年10月5日
  スイス48,30438,0032021年3月29日
 スウェーデン46,01837,7732021年3月26日
 ベルギー37,33431,6112021年3月25日
 イタリア33,64229,2822021年4月2日
 スペイン30,61828,2572021年4月22日
 オランダ33,12827,8702021年4月6日
 オーストラリア23,69622,71525,750 [ 152 ]2021年3月16日
 アイルランド22,42521,0612021年2月26日
 ブラジル27,73317,9871051 [ 153 ] [ 154 ]2021年5月20日[ 155 ] [ 156 ] [ 157 ] [ 158 ] [ 159 ]
 メキシコ20,23017,7102021年4月5日
 スロベニア16,33413,4392021年4月20日
 イスラエル15,78712,25941 [ 160 ] [ 161 ] [ 162 ]2021年4月16日
 ノルウェー15,71612,1301 [ 163 ]2021年4月15日
 ポルトガル12,98411,9832021年4月5日
 南アフリカ2,58210,6194 [ 164 ]2021年4月30日
 ポーランド16,48410,32016 [ 165 ]2021年4月26日
 リトアニア8999,0701 [ 166 ]2021年6月17日
 フィンランド1,5708,7332,876 [ 167 ] [ 168 ] [ 169 ] [ 170 ]2021年3月18日
 チェコ共和国11,2258,4872021年4月24日
 シンガポール2,7277,5102021年2月26日
 スロバキア3537,1462021年6月15日
 フィリピン8703,2208,612 [ 171 ] [ 172 ]2021年5月11日
 韓国7066,4972021年3月26日
 クロアチア4796,1652021年6月11日
 チリ645,8582021年6月13日
 ルクセンブルク1,1535,5152021年4月15日
 インドネシア1,6234,9802021年4月3日
 ルーマニア2944,6552021年4月26日
 ブルガリア2314,6142021年4月5日
 ロシア1,4684,29516 [ 173 ]2021年4月21日
 タイ2364,2932 [ 174 ]2021年4月24日
 アイスランド-3,7672021年8月30日
 マレーシア1463,6242021年4月10日
 オーストリア1,5783,6222021年4月17日
 ニュージーランド922,844107 [ 175 ] [ 176 ]2021年3月9日
 エストニア-2,7402021年7月21日
 ギリシャ172,6422021年3月23日
 ペルー62,5802021年6月10日
 バーレーン1172,0132021年4月5日
 ナイジェリア361,7951 [ 177 ]2021年8月7日
 ケニア2561,7005 [ 177 ] [ 178 ]2021年7月17日
 アルバ901,5922021年4月16日
 ベトナム541,41412 [ 179 ] [ 180 ]2021年4月18日
 プエルトリコ1,3551,3602021年9月9日
 カタール1211,3432021年4月19日
 バングラデシュ2831,2739 [ 181 ] [ 182 ]2021年4月28日
 セント・マーチン1,2251,2312021年3月19日
 エクアドル9551,0232021年7月20日
 スリランカ1179841 [ 183 ]2021年4月30日
 コロンビア-9742021年7月3日
 ボツワナ1969122 [ 184 ]2021年4月28日
 ジブラルタル8358482021年9月5日
 コソボ8298342021年5月2日
 再会547542021年5月4日
 カンボジア1717332021年4月5日
 パプアニューギニア7107172021年8月10日
 コスタリカ356892021年7月7日
 パキスタン496762021年5月16日
 中国5205362021年4月24日
 モルディブ65252021年7月31日
 ガーナ1015222021年4月20日
 キュラソー-4672021年4月23日
 ボネール島-4582021年7月13日
 ボスニア・ヘルツェゴビナ314302021年7月26日
 エチオピア-4242021年8月16日
 セイシェル-4072021年9月30日
 アルゼンチン43852 [ 185 ]2021年4月24日
 マルティニーク83652021年8月10日
 グアドループ-3622021年3月10日
 ヨルダン53602021年4月21日
 ウガンダ1343401 [ 186 ]2021年3月26日
 ザンビア823262021年5月29日
 ガンビア423162021年7月12日
 モザンビーク-3142021年7月16日
 グアテマラ43022021年7月29日
 ルワンダ912832021年7月9日
 カメルーン-2822021年9月28日
 ジョージア（国）192722021年5月15日
 フランス領ギアナ532642021年7月22日
 アメリカ領ヴァージン諸島-2472021年8月18日
   ネパール1002389 [ 187 ]2021年4月28日
 コンゴ民主共和国192285 [ 177 ]2021年5月3日
 マラウイ52132021年4月30日
 クウェート1081912021年6月5日
 モンテネグロ-1782021年8月8日
 ウクライナ131702021年6月24日
 カザフスタン-1672021年8月19日
 オマーン81592021年5月17日
 アンゴラ61592021年1月14日
 香港1531452021年4月22日
 スリナム-1502021年8月3日
 モロッコ31382 [ 188 ]2021年5月3日
 持ち帰り-1302021年7月31日
 トリニダード・トバゴ-1142021年8月3日
 ナミビア-1102021年6月
 パラグアイ41002021年7月8日
 ベリーズ-982021年6月30日
 エジプト-982021年7月15日
 ジンバブエ-962021年7月26日
 リヒテンシュタイン-952021年7月15日
 セネガル13932021年5月6日
 コンゴ共和国-872021年7月15日
 ヴェストラ・イェータランド-862021年7月19日
 エスワティニ-812021年7月26日
 レバノン-802021年7月3日
 ラトビア22732021年5月27日
 モナコ34702021年5月15日
 モーリシャス15672021年5月8日
 マルタ42632021年6月23日
 ギニアビサウ-622021年11月3日
 ブルンジ3572021年5月31日
 アンティグア・バーブーダ-572021年8月6日
 リベリア-562021年7月10日
 アルメニア-502021年8月5日
 ウズベキスタン3047（未報告数）[ 189 ]2021年6月25日
 ベナン-472021年7月23日
 北マケドニア6382021年7月11日
 バハマ-382021年8月8日
 ケイマン諸島-372021年7月30日
 ミャンマー12332021年6月1日
 セルビア5332021年7月6日
 東ティモール-3312 [ 190 ]2021年8月8日
 南スーダン-292021年6月7日
 アラブ首長国連邦-282021年6月23日
 ブルネイ-282021年8月17日
 ガボン-272021年8月2日
 マヨット-272021年10月21日
 アルジェリア17256 [ 191 ]2021年7月28日
 アンドラ-252021年7月17日
 バルバドス3232021年5月24日
 シエラレオネ-222021年9月8日
 イラン11213 [ 192 ]2021年5月11日
 ブルキナファソ-212021年4月21日
 クリミア-212021年7月1日
 アフガニスタン-202021年5月24日
 北マリアナ諸島2192021年7月7日
 中央アフリカ共和国-172021年8月14日
 台湾10152021年6月14日
 グアム-142021年4月26日
 ドミニカ共和国-142021年5月3日
 ハンガリー--14 [ 193 ]2021年7月22日
 赤道ギニア-142021年8月30日
 イラク2132021年4月27日
 モルドバ11112021年7月6日
 アルバニア11112021年7月13日
 コモロ11112021年10月26日
 ジャマイカ10102021年7月23日
 アンギラ882021年4月20日
 セントルシア772021年7月26日
 モントセラト772021年8月1日
 サン・バルテルミー島772021年8月17日
 イギリス領ヴァージン諸島552021年7月27日
 キプロス114 [ 194 ]2021年5月19日
 タークス・カイコス諸島442021年7月12日
 アゼルバイジャン222021年7月14日
 ホンジュラス222021年7月31日
 エルサルバドル222021年8月2日
 セントビンセント・グレナディーン諸島222021年8月8日
 マリ222021年8月11日
 サウジアラビア222021年9月9日
 ハイチ11（未報告数）[ 189 ]2021年7月27日
 パナマ111 [ 195 ]2021年4月29日
 チュニジア112021年5月21日
 セーデルマンランド112021年7月7日
 ベネズエラ112021年7月7日
 モンゴル112021年9月23日
 キルギスタン11（未報告数）[ 189 ]2021年5月16日[ 189 ]
 世界（178カ国）合計: 3,119,592
(B.1.617.2 のみ)		合計: 2,768,050
(B.1.617.2+AY.1+AY.2+AY.3)		合計: 1,862,122


歴史

インド国外での変異株の最初の症例は2021年2月下旬に検出され、英国では2月22日、米国では2月23日、シンガポールでは2月26日に確認された。[ 196 ] [ 40 ] [ 139 ]

イングランド公衆衛生局の英国科学者らは、2021年5月7日にB.1.617.2変異株を「懸念される変異株」（VOC-21APR-02）に再指定した。[ 197 ]これは、同年5月にこの変異株が元のウイルスよりも急速に拡散するという証拠を警告した後のことである。[ 21 ]もう1つの理由は、B.1.617.2のクラスターを48個特定し、そのうちのいくつかである程度市中感染が明らかになったことである。[ 198 ] [ 199 ]デルタ変異株の症例が急増したことから、英国の科学者らは、2021年6月初旬に英国におけるSARS-CoV-2の優勢な変異株としてデルタ変異株がアルファ変異株を追い抜いたと考えた。[ 200 ]イングランド公衆衛生局の研究者らはその後、2021年6月初旬の英国における新規症例の90%以上がデルタ変異株であったことを発見した。また、デルタ変異株はアルファ変異株と比較して家庭内感染のリスクが約60％増加するという証拠も挙げている。[ 201 ]

カナダで最初に確認された変異株の症例は、 2021年4月21日にケベック州で確認され、同日、ブリティッシュコロンビア州で39件の変異株の症例が確認されました。[ 202 ] アルバータ州は2021年4月22日に変異株の症例を1件報告しました。[ 203 ] ノバスコシア州は2021年6月にデルタ変異株の症例を2件報告しました。[ 204 ]

フィジーでも2021年4月19日にラウトカでこの変異株の最初の症例が確認され、それ以来症例数は47,000件にまで増加し、増加し続けています。[ 205 ]この変異株はスーパースプレッダーとして特定されており、国の人口のほぼ3分の2を占める地域であるラウトカ、ナンディ、スバ、ラミ、ナウソリの5つの都市のロックダウンにつながっています。

2021年4月29日、フィンランド社会保健省（STM）とフィンランド保健福祉研究所（THL）の保健当局は、2021年3月まで遡る3つのサンプルで変異株が検出されたと報告した。[ 167 ]

フィリピンは、インド亜大陸諸国（ブータンとモルディブを除く）からの渡航禁止措置にもかかわらず、2021年5月11日に変異株の最初の症例2例を確認した。両症例とも過去14日間にインドへの渡航歴はなく、オマーンとUAEからの渡航歴があった。[ 206 ]

北マケドニアは、2021年6月7日にイラクでウイルスから回復した人が北マケドニアに移送された後、同国で最初の変異株の症例を確認した。検査で、この人から変異株が検出された。2021年6月22日、同国は最初の症例の同僚で、イラクに滞在していた後に症状が出たデルタ変異株の2例目を報告した。[ 207 ]

一部の国では、変異株専用のキットや遺伝子検査を実施できる研究所の不足により、B.1.617の検出が阻害されている。[ 208 ] [ 209 ]例えば、5月18日時点でパキスタンでは症例は報告されていないが、当局は国内のCOVID-19検体の15%が「未知の変異株」であったと指摘している。検査が不可能なため、B.1.617であるかどうかは断言できない。他の国では、パキスタンから到着した旅行者がB.1.617に感染していたことが報告されている。[ 208 ]

2021年6月、インドのゲノミクス・統合生物学研究所の科学者ヴィノド・スカリア氏は、デルタ変異体と比較してK417N変異が追加されているB.1.617.2.1変異体（AY.1またはデルタプラスとも呼ばれる）の存在を強調しました。[ 53 ] B.1.617.2.1は2021年3月にヨーロッパで検出され、その後アジアとアメリカでも検出されています。[ 53 ]

2021年6月23日、欧州疾病予防管理センター（ECDC）は、この変異株が8月末までに欧州連合（EU）における新規感染者の90%を占めるだろうと警告した。[ 210 ]

2021年7月3日までに、デルタ航空は米国で優位に立った。[ 211 ]

2021年7月9日、イングランド公衆衛生局はSARS-CoV-2変異株に関する技術ブリーフィング18を発表し、28日間の追跡調査で英国におけるSARS-CoV-2デルタ変異株の症例45,136件のうち112件が死亡し、致死率は0.2%であったと報告した。[ 212 ]ブリーフィング16は、「死亡率は遅行指標であり、28日間の追跡調査を完了した症例数は非常に少ないことを意味する。したがって、デルタ変異株の症例致死率を年齢別に他の変異株と比較して正式に評価するには時期尚早である」と指摘している。[ 213 ] ブリーフィング18は、「症例致死率は、変異株ごとにパンデミックの異なる時点でピークを迎えたため、比較することはできない。また、病院の負担、ワクチン接種の可用性と接種率、症例プロファイル、治療の選択肢、報告遅延の影響など、さまざまな要因が異なる」と警告している。[ 212 ] 最も懸念されるのは、アルファ変異株と比較したロジスティック増加率が0.93/週である点です。これは、デルタ変異株のサンプル数/症例数がアルファ変異株に対してexp(0.93)=2.5倍増加していることを意味します。このため、同じ感染予防対策を講じたとしても、時間の経過とともに症例数は大幅に増加し、最終的には多くの人がデルタ変異株に感染することになります。[ 214 ] [ 215 ]

政府の対応

第二波による感染者数の増加を受け、少なくとも20カ国が4月と5月にインドからの渡航者に対して渡航禁止および制限措置を講じた。英国のボリス・ジョンソン首相はインド訪問を2度キャンセルし、日本の菅義偉首相は4月の訪問を延期した。[ 216 ] [ 217 ] [ 218 ]

2021年5月、ドイツのフェルバートにある2棟の高層ビルの住民は、建物内の女性がデルタ変異株の検査で陽性反応を示したため、隔離された。[ 219 ]

5月、デリーのアルビンド・ケジリワル首相は、シンガポールから来た新たなコロナウイルス変異株は子供にとって極めて危険であり、インドで第3波を引き起こす可能性があると述べた。

2021年5月16日から6月13日まで、および2021年7月22日から2021年8月10日まで、シンガポールは2020年と同様に「フェーズ2強化警戒」と呼ばれるロックダウンに入りました。

6月14日、英国のボリス・ジョンソン首相は、新規感染者の大半（90％）を占めるデルタ変異株への懸念を受けて、英国で6月21日に予定されていたすべての制限措置の解除を最大4週間延期し、ワクチン接種の展開を加速すると発表した。[ 220 ]英国の科学者らは、デルタ変異株は、英国で最初に確認された（ケント変異株として）これまで優勢だったアルファ変異株よりも40％から60％伝染性が高いと述べている。[ 221 ]

6月23日、カナダのオンタリオ州は、トロント、ピール、ハミルトンなどのデルタ州のホットスポットに住む人々に対する2回目のワクチン接種の予約を加速させた。[ 222 ]

6月25日、イスラエルはデルタの脅威を理由にマスク着用義務を復活させた。[ 223 ]

6月28日、シドニーとダーウィンはデルタ州の感染拡大により再びロックダウンに入った。[ 224 ] 南アフリカは葬儀を除く屋内外の集会を禁止し、夜間外出禁止令を発令し、アルコールの販売を禁止した。[ 225 ]

7月3日、インドネシアのバリ島とジャワ島は緊急封鎖された。[ 226 ]

7月8日、菅義偉首相は東京が再び緊急事態宣言を発令し、7月23日に開幕予定のオリンピックへの観客の大半の入場を禁止すると発表した。 [ 227 ]

7月9日、韓国のソウルは、屋外でのマスク着用を促し、集会の規模を制限するなどの規制を強化した。[ 228 ]

7月12日、フランスのエマニュエル・マクロン大統領は、すべての医療従事者は9月15日までにワクチン接種を受ける必要があり、フランスでは8月からバー、カフェ、レストラン、ショッピングセンターへの入場に健康パスポートの使用を開始すると発表した。[ 229 ]

ロサンゼルスは、 2021年7月17日から屋内でのマスク着用を義務付けると発表した。[ 230 ]

英国は、デルタ株の優勢化に伴う感染者数の急増にもかかわらず、7月19日にCOVID-19に関する規制の大部分を解除した。政府はCOVID-19ワクチン接種プログラムの保護と広範な普及率を理由に挙げたが、保健専門家はこの措置に懸念を表明した。[ 231 ] [ 232 ]

7月23日、ベトナムはホーチミン市の封鎖措置を8月1日まで延長し、ハノイにも封鎖措置を導入すると発表した。これは同国の人口の3分の1に影響を与える。デルタ変異株は、 2020年を通して概ね成功を収めてきた封じ込め策の後、同国でこれまでで最大の感染拡大を引き起こした。 [ 233 ] [ 234 ]

8月17日、ニュージーランドはオークランドで陽性者が報告されたことを受け、警戒レベル4のロックダウンに入った。コロマンデル半島でもすぐに感染者が続出した。[ 235 ]これは、ニュージーランドで170日ぶり（2021年2月以来）に報告された市中感染事例であった。[ 236 ]

絶滅

2021年10月、英国保健安全保障局の最高経営責任者であるジェニー・ハリーズ博士は、アルファ変異株などの以前に流行していた変異株は「消滅し」、デルタ変異株に取って代わられたと述べた。[ 237 ] 2022年3月、世界保健機関は、デルタ変異株とそれに続くオミクロン変異株の優勢により、過去数週間および数か月間に検出された症例がなかったことを理由に、アルファ、ベータ、ガンマ変異株を以前に流行していた変異株としてリストした。[ 238 ]しかし、数か月以内にデルタ変異株は以前に流行した変異株としてリストされ、オーストラリアなどの国では12週間デルタが検出されなかった。[ 4 ]

参照

注記

参考文献

  1. ^ a b c d グローバー、ナタリー（2021年6月14日）「デルタ変異株のCOVIDの症状には頭痛、喉の痛み、鼻水などが含まれる」「 .ガーディアン. ロンドン. 2021年6月14日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年6月30日閲覧。
  2. ^ a b Roberts, Michelle (2021年6月14日). 「デルタ変異株に関連する頭痛と鼻水」 . BBCニュース. ロンドン. 2021年6月14日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年7月2日閲覧。
  3. ^ 「SARS-CoV-2変異株の追跡」 www.who.int . 2021年6月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。2022年8月17日閲覧。
  4. ^ a b 「懸念される変異株」 CDGN . 2021年7月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2022年8月17日閲覧。
  5. ^ Lovelace, Berkeley Jr. (2021年6月18日). 「WHOはデルタ株が世界的に主要なCOVID変異株になりつつあると述べている」 . CNBC . 2021年11月4日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年11月1日閲覧。
  6. ^ a b Shang, Jian; Yushun, Wan; Lou, Chuming; Ye, Gang; Geng, Qibin; Auerbach, Ashley; Fang, Li (2020). 「SARS-CoV-2の細胞侵入メカニズム」 . Proceedings of the National Academy of Sciences . 117 (21): 11727– 11734. Bibcode : 2020PNAS..11711727S . doi : 10.1073 / pnas.2003138117 . PMC 7260975. PMID 32376634 .  
  7. ^ 「PHEがVUI-21APR-02/B.1.617.2を懸念すべき変異株として分類したことに対する専門家の反応」 sciencemediacentre.org 2021年5月7日。2021年7月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月18日閲覧。
  8. ^ a b c Starr, Tyler N.; Greaney, Allison J.; Dingens, Adam S.; Bloom, Jesse D. (2021年4月). 「モノクローナル抗体LY-CoV555およびLY-CoV016との混合抗体を回避するSARS-CoV-2 RBD変異の完全マップ」 . Cell Reports Medicine . 2 (4) 100255. doi : 10.1016/j.xcrm.2021.100255 . PMC 8020059. PMID 33842902 .  
  9. ^ a b c 「2021年5月24日現在、懸念されるSARS-CoV-2変異株」。欧州疾病予防管理センター。2021年4月30日。 2021年6月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年8月6日閲覧。
  10. ^ 「テクニカルブリーフィング 20 SARS-CoV-2 懸念変異株とイングランドで調査中の変異株」(PDF)。2021年8月6日。 2021年12月15日時点のオリジナルよりアーカイブ(PDF) 。 2021年8月10日閲覧。 この記事にはOGLライセンスのテキストが含まれています この記事には、British Open Government Licence  v3.0 に基づいて公開されたテキストが組み込まれています。
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