ジェノグラフィックプロジェクト

ジェノグラフィックプロジェクト
シリーズの一部
遺伝的系譜学
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ジェノグラフィック・プロジェクトは、ナショナルジオグラフィック協会とIBMが2005年4月13日に開始した、 DNAサンプルを収集・分析することで人類の歴史的な移動パターンをマッピングすることを目的とした遺伝人類学的研究（2019年5月31日に販売終了）でした。[1]

プロジェクトの最終段階はGeno 2.0 Next Generationでした。[2]

サイトの閉鎖時点で、140カ国以上から1,006,543人がこのプロジェクトに参加していた。[3]

プロジェクトの履歴

始まり

2005年、プロジェクトディレクターのスペンサー・ウェルズは、ナショナルジオグラフィック協会、IBM、ウェイト財団による民間資金による非営利の共同プロジェクトであるジェノグラフィック・プロジェクトを創設し、主導しました。 [4]世界11の地域センターのフィールド研究者は、先住民からDNAサンプルを収集することから始めました。[要出典]

ミトコンドリアDNAハプログループの系統発生（2007年）。

2012年秋、ジェノグラフィック・プロジェクトは、遺伝人類学に特化した新たなジェノタイピングアレイ「GenoChip」の完成を発表しました。GenoChipは人類学的検査用に特別に設計されており、常染色体DNA、X染色体DNA、Y染色体DNA、ミトコンドリアDNA （mtDNA）のSNPを含んでいました。この新しいチップの設計は、ナショナルジオグラフィックのウェルズ氏、ジョンズホプキンス大学のエラン・エルハイク氏、ファミリーツリーDNA、イルミナの共同作業でした。[5]

ウェルズとエルハイクによって開発された常染色体混合分析は、北東アジア、地中海、南アフリカ、南西アジア、オセアニア、東南アジア、北ヨーロッパ、サハラ以南のアフリカ、アメリカ先住民の9つの祖先地域に関連するゲノム祖先の割合を評価することによって個人を分類しました。[6]

2015年8月、ジェノグラフィック主任科学者であるビラールとファミリーツリーDNAの共同作業により、新しいチップが設計されました。[7]

2015年秋、ミゲル・ビラールがプロジェクトのリーダーを引き継ぎました。[8]

ジェノ 2.0 次世代

2016年に、このプロジェクトは最先端の[2] ヘリックスDNAシーケンシングを活用し、ジェノグラフィックプロジェクトの新しいフェーズであるジェノ2.0次世代を開始しました。[2] [9]

以前のフェーズでは9つの地域区分を使用していましたが、Geno 2.0 Next Generationでは、18または22の地域区分を使用して世界中の現代の先住民集団を分析しました。[10]

HelixはDNA採取キットを用いて被験者から唾液サンプルを採取し、それを分析して、個人の遺伝的起源に関する前例のない[2]洞察を提供するように設計されたゲノム識別子を抽出します。 [2]その後、データはGenographic Project DNAデータベースにアップロードされます。[2]

人口地中海北ヨーロッパ南西アジアサハラ以南のアフリカ南アフリカ北東アジア東南アジアネイティブアメリカンオセアニア合計
アルタイ語2172253498
アメリカインディアン（メキシコ）45348399
バミューダ人1520748374100
イギリス335017100
ブルガリア語4731202100
中国語7228100
デンマーク語30531699
ドミニカ2911147111495
東インド224350299
エジプト人65181497
フィンランド語175717798
ジョージア語6173199
ドイツ語36461799
ギリシャ語54281799
イベリア48371398
イラン人42842597
日本語7525100
コイサン475299
キン5743100
クウェート人574278298
レバノン人66526299
ルヒヤ289899
マダガスカル語2574152098
メキシコ28208423698
モンゴル語2776105100
北コーカサス人461633499
北インド6534262798
オセアニア1288100
パプア人5491100
ペルー高地229599
ペルー人1510326898
プエルトリコ人312192521199
ルーマニア語4336192100
ロシア人255118498
サルデーニャ6724899
南インド42583599
タジキスタン2222441098
タタール語2140211698
チュニジア6261019299
トスカーナ54281799
バヌアツ4157897
西インド諸島96582699
ヨルバ族973100
生物地理学的祖先に基づく次世代参照集団[11]
人口アラビア小アジア中央アジア東アフリカ東欧イギリスおよびアイルランドユダヤ人のディアスポラ北アフリカ南アフリカ南アジア南西アジアとペルシャ湾南ヨーロッパ西アフリカと中央アフリカ
アフリカ系アメリカ人（アメリカ南西部）2%4%9%3%81%
エジプト人3%3%4%68%17%3%
エチオピア人11%64%5%7%8%5%
ギリシャ語9%7%2%2%79%
イラン人56%6%4%4%2%24%2%
クウェート人7%3%4%84%
ルヒヤ（ケニア）81%4%4%4%2%5%
チュニジア88%4%5%2%
ヨルバ語（西アフリカ）2%3%6%89%

結末

2019 年の春に、ジェノ プロジェクトは終了したが、結果は 2020 年までオンラインで公開されることが[いつ] [誰が] [なぜ]発表されました。 [明確化が必要] [引用が必要]

2020年7月にこのサイトは廃止されました。[要出典]

遺産

ジェノグラフィック・プロジェクトへの一般参加。

2005年から2019年までのこの取り組み期間中、ジェノグラフィックはボランティア（フィールドワークとDNAサンプル提供）と市民科学プロジェクトに携わりました。この間、ナショナルジオグラフィック協会は、「市民科学者」としてプロジェクトへの参加を希望する一般市民に、非営利の自己検査キットを販売しました。このような研究への市民参加を促す活動は、科学研究の利益促進を目指す国際遺伝子系譜学会（ISOGG）などの組織によって奨励されています。[12] [13] [14]これには、個人のDNA（遺伝子）検査の支援、組織化、普及が含まれます。

ISOGGは遺伝子研究への市民参加を支援しており[15]、そのようなボランティアが専門家の科学コミュニティに貴重な情報と研究を提供してきたと考えています。[16]

2013年、スペンサー・ウェルズは南カリフォルニア系譜学会でスピーチを行い、市民科学者の奨励について強調しました。

2005年以来、ジェノグラフィック・プロジェクトは最新の遺伝子技術を用いて人類の歴史に関する知識を広げてきました。また、DNA検査を先駆的に活用し、一般市民を研究活動に巻き込むことで、新たなタイプの「市民科学者」の育成に貢献しました。ジェノ2.0は市民科学の領域を拡大し、群衆の力を活用して人類の集団史に関する新たな詳細を発見します。[17]

批判

2005年4月、このプロジェクトの発表直後、バイオコロニアリズムに関する先住民評議会（IPCB）は、このプロジェクトが物議を醸す問題（例えば、一部の部族が、遺伝的人類移住研究の結果からネイティブアメリカンが北米の先住民ではないと示唆される可能性があると懸念していることなど）と関連していることを指摘し、先住民の参加を推奨しなかった。[18]

IPCBの創設者であるデブラ・ハリーは、先住民がジェノグラフィック・プロジェクトへの参加を躊躇した理由について、ある論拠を示した。北部パイユート族出身で、ネバダ大学先住民研究准教授のハリーによると、ジェノグラフィック・プロジェクトは、単なる科学的研究ではなく、隠れた動機を隠蔽するようなヒト遺伝子検査の実施につながったという。特に、ジェノグラフィック・プロジェクトの背後に政治的な利害関係が潜んでいる可能性に対する強い懸念が、IPCBが世界中の先住民コミュニティに対し、このプロジェクトの「利他的ではない動機」[19]について事前に警告する動機となった。さらにIPCBは、ジェノグラフィック・プロジェクトは先住民に直接的な利益をもたらさないだけでなく、むしろ相当なリスクをもたらすと主張した。ハリーが2005年12月に公開されたインタビューで指摘したこうしたリスクは、先住民のプロジェクト参加に反対する論拠として利用された[20] 。

IPCB創設者デブラ・ハリーによるもう一つの主張は、ジェノグラフィック・プロジェクトは、先祖のアイデンティティが無効化され、先住民が長年居住してきた資源の豊富な領土へのアクセスと権限を否定するために悪用される可能性があり、血縁関係を信用できないものにする手段として機能したというものである。[20]

IPCBはまた、ジェノグラフィック・プロジェクトにおけるバイオコロニアリズムのもう一つの試みとして、遺伝子検査の結果が偽陰性や偽陽性などの統計的エラーを生み出す可能性が高いため、先住民を非先住民と誤認したり、その逆を行ったりする可能性があると示唆した。[21]

トールベアは、ジェノグラフィック・プロジェクトのようなバイオコロニアリズムのプロジェクトを通じて、個人の文化的アイデンティティが決定的に確立されるリスクも、もう一つの可能​​性のある悪影響であると述べた。[21]最終的に、トールベアの主張は、ジェノグラフィック・プロジェクトに関するハリーの懸念と密接に一致するとみなされ、IPCBがバイオコロニアリズムに反対する大きな動機となった。[要出典]

2006年5月、このプロジェクトは国連先住民族問題常設フォーラム（UNPFII）の注目を集めました。UNPFIIはジェノグラフィック・プロジェクトの目的について調査を行い、ナショナルジオグラフィックをはじめとするスポンサーに対し、プロジェクトの中止を勧告しました。[22]研究から得られる知見が先住民族の長年の信念と衝突し、彼らの文化を脅かす可能性があるという懸念がありました。また、先住民族の土地権やその他の資源に対する権利が脅かされる可能性も懸念されました。[23]

2006年12月現在、マサチューセッツ州インディアン問題委員会の委員長であり、マシュピー・ワンパノアグ族の一員であるモーリス・フォックス氏を含む、米国連邦政府公認の部族の一部は、この研究への参加を辞退している。[22]

すべての先住民が彼の立場に賛同しているわけではない。2012年12月時点で、アメリカ大陸、アフリカ、アジア、ヨーロッパ、オセアニアから7万人以上の先住民がプロジェクトに参加している。[10]

参照

参考文献

  1. ^ 「責任ある遺伝学のための評議会」。2008年5月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。2015年5月16日閲覧。
  2. ^ abcdef 「Geno 2.0 Next Generation」ナショナルジオグラフィック、2018年6月28日。2013年1月22日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2018年6月28日閲覧。
  3. ^ “National Geographic Geno DNA Ancestry Kit | Human Migration, Population Genetics”. 2020年6月17日. 2020年6月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2024年11月16日閲覧。
  4. ^ 「海洋保護基金」ウェイト財団、カリフォルニア州ラホヤ。 2022年1月25日閲覧。
  5. ^ Elhaik, Eran; Greenspan, Elliott; Staats, Sean; Krahn, Thomas; Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Tofanelli, Sergio; Francalacci, Paolo; Cucca, Francesco; Pagani, Luca; Jin, Li; Li, Hui; Schurr, Theodore G.; Greenspan, Bennett; Spencer Wells, R. (2013年5月9日). 「ジェノチップ：遺伝人類学のための新たなツール」. Genome Biology and Evolution . 5 (5): 1021– 1031. doi : 10.1093/gbe/evt066 . PMC 3673633. PMID 23666864.  2018年6月28日閲覧。 
  6. ^ “Who Am I: Regions Overview”. 2014年10月30日時点のオリジナルよりアーカイブ。2022年11月30日閲覧。
  7. ^ “『ジェノ2.0：次世代』が古代祖先の新たな詳細を明らかにする | ナショナルジオグラフィック（ブログ）”. 2015年9月5日. 2015年9月5日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2024年11月16日閲覧。
  8. ^ 「ミゲル・ビラール博士がグアム大学学長講演シリーズの第29回講演者に」。グアム大学。 2022年5月10日閲覧。
  9. ^ “Helix DNA Sequencing and Geno 2.0”. Helix . 2018年1月26日. 2023年10月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2018年6月28日閲覧。
  10. ^ ab 「次世代リファレンス人口」ナショナルジオグラフィック、2018年2月23日。2016年4月7日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2018年6月28日閲覧。
  11. ^ National Geographic Geno 2.0 Project、2017年2月7日時点のオリジナルよりアーカイブ、 2018年10月22日閲覧。
  12. ^ Bonney, R.; LaBranche, M. (2004). 「市民科学：研究への市民の参加」ASTC Dimensions (2004年5/6月): 13.
  13. ^ Baretto, C.; Fastovsky, D.; Sheehan, P. (2003). 「科学研究への一般市民の参加を促すモデル」 . J​​ournal of Geoscience Education . 50 (1): 71– 75. Bibcode :2003JGeEd..51...71B. doi :10.5408/1089-9995-51.1.71. S2CID  67761505.
  14. ^ McCaffrey, RE (2005). 「都市の鳥類研究における市民科学の活用」. Urban Habitats . 3 (1): 70–86 .
  15. ^ King, Turi E.; Jobling, Mark A. (2009). 「名前の真髄：Y染色体、姓、そして遺伝系図革命」. Trends in Genetics . 25 (8): 351–60 . doi :10.1016/j.tig.2009.06.003. hdl : 2381/8106 . PMID  19665817.国際遺伝系図学会 (www.isogg.org) は、系図研究のツールとして遺伝学を活用することを提唱し、遺伝系図学者のための支援ネットワークを提供しています。同学会はISOGG Yハプログループツリーを運営しており、定期的に更新されるという利点があります。
  16. ^ Mendex, et. al., Fernando (2013年2月28日). 「アフリカ系アメリカ人の父系系統がヒトY染色体系統樹に極めて古いルーツを加える」アメリカ人類遺伝学ジャーナル92 ( 3). アメリカ人類遺伝学会誌: 454–459 . doi :10.1016/j.ajhg.2013.02.002. PMC 3591855. PMID  23453668 . 
  17. ^ ウェルズ、スペンサー (2013). 「ジェノグラフィック・プロジェクトと市民科学の台頭」. 南カリフォルニア系譜学会 (SCGS). 2013年7月10日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2013年7月10日閲覧。
  18. ^ ハリー、デブラ、カネヘ、レア・マリア（2010年5月7日）「遺伝子研究：文化保存のための血液採取？」 『カルチュラル・サバイバル』第29巻第4号（2005年冬） 。 2014年2月4日閲覧。
  19. ^ 「バイオコロニアリズムに関する先住民評議会」ipcb.org . 2022年11月9日閲覧。
  20. ^ ab 「デブラ・ハリーとバイオコロニアリズムに関する先住民評議会へのインタビュー」ニュー・インターナショナリスト、2005年12月1日。2022年10月24日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年11月9日閲覧。
  21. ^ エレン・サミュエルズ (2014). 『同一化の幻想：障害、ジェンダー、人種』 ニューヨーク大学出版局. ISBN 978-1-4798-1298-1. OCLC  900357752。
  22. ^ ab ハーモン、エイミー（2006年12月10日）「DNA採取業者が行き詰まり：部族は彼らを信頼していない」ニューヨーク・タイムズ。
  23. ^ 「国連がジェノグラフィック・プロジェクトの中止を勧告」IPCB。

参考文献

ニュース記事

  • 「現代人のルーツを探る」CNN、2005年4月14日。
  • 「『ジェノグラフィック・プロジェクト』は、私たちの起源を明らかにすることを目指している」USAトゥデイ、2005年4月17日。
  • 「先住民がナショナル ジオグラフィックに反対」バイオコロニアリズムに関する先住民評議会、2005 年 4 月 13 日。
  • 「真実の追跡」、DB2 Magazine (IBM)、プロジェクトにおける IBM の役割に関する情報。2006 年 12 月。
  • ジェノグラフィックの成功事例
  • 「十字軍は遺伝的遺産を残した」BBCニュース、2008年3月27日。
  • 「人間の列は『ほぼ二分』」BBCニュース、2008年4月24日。

公式サイト

  • ナショナルジオグラフィックのジェノグラフィック・プロジェクト公式サイト
  • アリゾナ研究所（ARL） 2022年10月9日アーカイブ - Wayback Machine
  • ウェイトファミリー財団

ビデオ

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