TCF12

TCF12
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスTCF12、CRS3、HEB、HTF4、HsT17266、bHLHb20、TCF-12、転写因子12、p64、HH26
外部IDオミム: 600480 ; MGI : 101877 ;ホモロジーン: 40774 ;ジーンカード: TCF12 ; OMA : TCF12 - オルソログ
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_001253862 NM_001253863 NM_001253864 NM_001253865 NM_011544

RefSeq(タンパク質)

NP_001240791 NP_001240792 NP_001240793 NP_001240794 NP_035674

場所(UCSC)15章: 56.92 – 57.3 Mb9章: 71.75 – 72.02 Mb
PubMed検索[ 3 ][ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集マウスの表示/編集

転写因子12は、ヒトではTCF12遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ] [ 6 ]

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、コンセンサス結合部位(Eボックス)CANNTGを認識する基本ヘリックス・ループ・ヘリックス(bHLH)Eタンパク質ファミリーのメンバーである。このコードされるタンパク質は、骨格筋、胸腺、B細胞およびT細胞など多くの組織で発現しており、他のbHLH Eタンパク質とのヘテロ二量体形成を介して系統特異的な遺伝子発現の調節に関与している可能性がある。この遺伝子の選択的スプライシング転写バリアントがいくつか報告されているが、これらのバリアントの全長は未だ決定されていない。[ 6 ] TCF12は、関連する一塩基多型との関連を示すGWAS研究を通じて、ヒトの男性の性的指向との関連が推測されている。[ 7 ]この遺伝子の変異は、冠状頭蓋縫合癒合症の症例とも関連している。[ 8 ]

TCF12は、腫瘍抑制遺伝子でありSRY / SOX9活性の標的であるTCF21の主要なヘテロ二量体形成パートナーである。[ 9 ]

参考文献

  1. ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000140262Ensembl、2017年5月
  2. ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000032228Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「ヒトPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^ Zhang Y, Babin J, Feldhaus AL, Singh H, Sharp PA, Bina M (1991年8月). 「HTF4:新規ヒトヘリックス・ループ・ヘリックスタンパク質」 . Nucleic Acids Research . 19 (16): 4555. doi : 10.1093 / nar/19.16.4555 . PMC 328652. PMID 1886779 .  
  6. ^ a b「Entrez Gene: TCF12転写因子12(HTF4、ヘリックスループヘリックス転写因子4)」
  7. ^ Ganna A, Verweij KJ, Nivard MG, Maier R, Wedow R, Busch AS, et al. (2019年8月). 「大規模GWASにより同性間の性行動の遺伝的構造に関する知見が明らかに」 . Science . 365 (6456) eaat7693. doi : 10.1126/science.aat7693 . PMC 7082777. PMID 31467194 .  
  8. ^ Sharma VP, Fenwick AL, Brockop MS, McGowan SJ, Goos JA, Hoogeboom AJ, et al. (2013年3月). 「TWIST1の基本的なヘリックス・ループ・ヘリックスパートナーをコードするTCF12の変異は、冠状頭蓋縫合早期癒合症の頻繁な原因である」 . Nature Genetics . 45 (3): 304–7 . doi : 10.1038/ng.2531 . PMC 3647333. PMID 23354436 .  
  9. ^ Bhandari RK, Sadler-Riggleman I, Clement TM, Skinner MK (2011-05-17). 「塩基性ヘリックス・ループ・ヘリックス転写因子TCF21は男性性決定遺伝子SRYの下流標的である」 . PLOS ONE . 6 (5) e19935. Bibcode : 2011PLoSO...619935B . doi : 10.1371/journal.pone.0019935 . PMC 3101584. PMID 21637323 .  

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