ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
H2AC21 識別子 エイリアス H2AC21 、H2AB、ヒストンクラスター2、H2ab、ヒストンクラスター2 H2Aファミリーメンバーb、H2Aクラスター化ヒストン21、HIST2H2AB 外部ID オミム :615014; MGI : 2448314; ホモロジーン : 111318; ジーンカード :H2AC21; OMA :H2AC21 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 3番染色体(マウス) [2] バンド 3|3 F2.1 始める 96,127,181 bp [2] 終わり 96,127,624 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 アキレス腱 骨髄細胞 睾丸 脳梁 結腸上皮 顆粒球 腓骨神経 扁桃腺 血 膀胱
上位の表現 性器結節 精母細胞 桑実胚 子宮 胚 胚 胚の尾 膀胱 精子細胞 神経軸の線条体
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ウィキデータ
ヒストンH2Aタイプ2-B は、 ヒト では HIST2H2AB 遺伝子 によって コードされる タンパク質 で ある。 [5] [6]
ヒストンは、 真核生物の 染色体 繊維 の ヌクレオソーム 構造を担う基本的な 核タンパク質 です。 ヌクレオソーム は、4つのコアヒストン(H2A、H2B、H3、H4)がそれぞれ対になって構成される ヒストン八量 体に巻き付いた約146 bpの DNA で構成されています。 クロマチン繊維は、 リンカーヒストンH1と ヌクレオソーム間のDNAとの相互作用によってさらに凝縮され、高次のクロマチン構造を形成します。この遺伝子はイントロンを含まず、 ヒストンH2A ファミリーのメンバーをコードしています 。この遺伝子からの転写産物には、回文終結要素が含まれています。 [6]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000184270 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000063689 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (2002年10月). 「ヒトおよびマウスにおける複製依存性ヒストン遺伝子」. Genomics . 80 (5): 487–98 . doi :10.1016/S0888-7543(02)96850-3. PMID 12408966. ^ ab 「Entrez Gene: HIST2H2AB ヒストン クラスター 2、H2ab」。
さらに読む El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). 「統合型クロマチン関連ヒト免疫不全ウイルス1型プロモーターの転写活性化」. Mol. Cell. Biol . 18 (5): 2535–44 . doi :10.1128/mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873 . Deng L, de la Fuente C, Fu P, et al. (2001). 「CBP/P300によるHIV-1 Tatのアセチル化は、組み込まれたHIV-1ゲノムの転写を増加させ、コアヒストンへの結合を強化する」 Virology . 277 (2): 278–95 . doi : 10.1006/viro.2000.0593 . PMID 11080476. Deng L、Wang D、de la Fuente C 他(2001)。 「クロマチン DNA 上の HIV-1 Tat による p300 HAT 活性の増強」。 ウイルス学 。 289 (2): 312–26 . 土井 : 10.1006/viro.2001.1129 。 PMID 11689053。 Chen A, Kleiman FE, Manley JL, et al. (2002). 「BRCA1*BARD1 RINGユビキチンリガーゼの自己ユビキチン化」. J. Biol. Chem . 277 (24): 22085–92 . doi : 10.1074/jbc.M201252200 . PMID 11927591. Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). 「ヒストンアセチル化とLTRプロモーターにおける因子リクルートメントによるHIV-1遺伝子発現の制御」 EMBO J. 22 ( 24): 6550–61 . doi :10.1093/emboj/cdg631. PMC 291826. PMID 14657027 . Zhang Y, Griffin K, Mondal N, Parvin JD (2004). 「ヒストンH2Aのリン酸化はクロマチンテンプレート上の転写を阻害する」 J. Biol. Chem . 279 (21): 21866–72 . doi : 10.1074/jbc.M400099200 . PMID 15010469. 相原 浩、中川 剛、安井 健、他 (2004). 「ヌクレオソームヒストンキナーゼ-1はショウジョウバエ初期胚の有糸分裂中にH2A Thr 119をリン酸化」. Genes Dev . 18 (8): 877–88 . doi :10.1101/gad.1184604. PMC 395847. PMID 15078818 . Wang H, Wang L, Erdjument-Bromage H, et al. (2004). 「ポリコームサイレンシングにおけるヒストンH2Aユビキチン化の役割」. Nature . 431 (7010): 873–8 . Bibcode :2004Natur.431..873W. doi :10.1038/nature02985. PMID: 15386022. S2CID : 4344378. 萩原 哲也、日高 裕也、山田 正樹 (2005) 「HL-60顆粒球のアルギニン3におけるヒストンH2AおよびH4の脱イミネーション」。 生化学 。 44 (15): 5827–34 . 土井 :10.1021/bi047505c。 PMID 15823041。 曹R、塚田裕、張裕(2006)。 「H2A ユビキチン化と Hox 遺伝子サイレンシングにおける Bmi-1 と Ring1A の役割」。 モル。セル 。 20 (6): 845–54 . 土井 : 10.1016/j.molcel.2005.12.002 。 PMID 16359901。 Bergink S, Salomons FA, Hoogstraten D, et al. (2006). 「DNA損傷はヌクレオチド除去修復依存性のヒストンH2Aモノユビキチン化を誘導する」. Genes Dev . 20 (10): 1343–52 . doi :10.1101/gad.373706. PMC 1472908. PMID 16702407 . Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, et al. (2006). 「ヒト染色体1のDNA配列と生物学的アノテーション」. Nature . 441 (7091): 315–21 . Bibcode :2006Natur.441..315G. doi : 10.1038/nature04727 . PMID 16710414.
PDBギャラリー
1aoi :ヌクレオソームコア粒子(H3、H4、H2A、H2B)と146 bp長のDNA断片との複合体
1eqz :ヌクレオソームコア粒子の2.5Å分解能でのX線構造
1hq3 :KCL/リン酸中のヒストンコアオクタマーの結晶構造
1kx3 :ヌクレオソームコア粒子NCP146の2.0Å分解能でのX線構造
1kx4 :ヌクレオソームコア粒子NCP146bの2.6Å分解能でのX線構造
1kx5 :ヌクレオソームコア粒子NCP147の1.9Å分解能でのX線構造
1m18 :リガンド結合はヌクレオソームDNAの構造とダイナミクスを変化させる
1m19 : リガンド結合はヌクレオソームDNAの構造とダイナミクスを変化させる
1m1a :リガンド結合はヌクレオソームDNAの構造とダイナミクスを変化させる
1p34 :ヒストン「Sin」変異体を含むヌクレオソームコア粒子の結晶構造解析
1p3a :ヒストン「Sin」変異体を含むヌクレオソームコア粒子の結晶構造解析
1p3b :ヒストン「Sin」変異体を含むヌクレオソームコア粒子の結晶構造解析
1p3f :ヒストン「Sin」変異体を含むヌクレオソームコア粒子の結晶構造解析
1p3g :ヒストン「Sin」変異体を含むヌクレオソームコア粒子の結晶構造解析
1p3i :ヒストン「Sin」変異体を含むヌクレオソームコア粒子の結晶構造解析
1p3k :ヒストン「Sin」変異体を含むヌクレオソームコア粒子の結晶構造解析
1p3l :ヒストン「Sin」変異体を含むヌクレオソームコア粒子の結晶構造解析
1p3m :ヒストン「Sin」変異体を含むヌクレオソームコア粒子の結晶構造解析
1p3o :ヒストン「Sin」変異体を含むヌクレオソームコア粒子の結晶構造解析
1p3p :ヒストン「Sin」変異体を含むヌクレオソームコア粒子の結晶構造解析
1s32 : ヌクレオソーム「スーパーグルーブ」の分子認識
1tzy :コアヒストン八量体の1.90オングストローム分解能での結晶構造
1zbb :4_601_167テトラヌクレオソームの構造
1zla :カポジ肉腫ヘルペスウイルスの核オソームコアに結合したLANAペプチドのX線構造
2aro :S-ニトロソグルタチオン存在下で結晶化された天然ヒストン八量体の2.1オングストローム分解能の結晶構造
2cv5 :ヒトヌクレオソームコア粒子の結晶構造
2f8n :ハイブリッドマクロH2Aヌクレオソームの2.9オングストロームX線構造
2fj7 :ポリ(dA.dT)配列要素を含むヌクレオソームコア粒子の結晶構造
2hio :ヒストン八量体(ニワトリ)、染色体タンパク質
2nzd :145 bpのDNAを含むヌクレオソームコア粒子