海洋および非海洋属の暫定登録簿

海洋および非海洋属の暫定登録簿
サイトの種類
（主に）属および上位の分類階級を対象とした分類データベースシステム
本部オステンド、ベルギー
原産国オーストラリア、2006-2016年;ベルギー、2016年現在
サービスエリア全世界
所有者フランダース海洋研究所（VLIZ）
創設者トニー・リース、オーストラリア
URLwww.irmng.org​​
コマーシャルいいえ
発売2006 （2006年）
現在の状況アクティブ

海洋および非海洋属暫定登録簿（IRMNG ）は、生物多様性情報科学イニシアチブおよび生物多様性（分類）情報の一般利用者のために、1758年（植物学では1753年）の動物学から現在までの生命のあらゆるドメイン（動物学の亜属も含む）の公表属名を、単一の内部的に一貫性のある分類階層に整理して網羅することを目的とした分類データベースです。2024年7月時点で公表されている50万件以上の属名（動物学の亜属名も含む）に加え、170万件以上の種名（うち130万件は「承認済み」としてリストアップ）を収録していますが、このデータコンポーネントは属レベルの保有情報ほど最新かつ完全な状態で維持されていません。 IRMNGは、オンラインでクエリを実行し、データセットの最新バージョンにアクセスできます。また、定期的なスナップショットまたはデータダンプとして提供され、必要に応じて他のシステムにインポート/アップロードできます。このデータベースは、2006年に当時のオーストラリア連邦海洋科学研究機構（CSIRO）海洋大気研究部門で開始され、2016年からはベルギーのフランダース海洋研究所（VLIZ）でホストされています。

説明

IRMNGにおける「あいまい」属検索結果の例（2023年12月）
IRMNG の属レベルの分類群ページの例（2023 年 12 月）

IRMNGには、標準化された分類階層内で、属（および動物学上の亜属、下記参照）の学名（のみ）、種のサブセット、ほとんどの植物、動物、その他の界（現生および絶滅）の主な上位階級が含まれており、大部分のエントリについて、生息地（海洋/非海洋など）や現存/化石の状態に関する機械可読情報が関連付けられています。 [ 1 ]データベースは、すべての界で承認されている属名と承認されていない属名の両方を完全に網羅することを目指しており、種名のサブセットのみを二次的な活動として含めています。 IRMNGの名称は、動物学では国際動物命名規約（動物、動物学的原生生物、動物の活動に起因する痕跡化石を対象）、植物学では藻類、菌類、植物の国際命名規約（ICNまたはICNafp）、細菌と古細菌の原核生物の国際命名規約、そしてそのグループでは国際ウイルス分類委員会の管轄下にあります。[ 2 ]

2024年7月のリリースでは、IRMNGには508,851の属名が含まれており、そのうち240,625が「承認済み」、123,117が「未承認」、23,192が「その他」（暫定未発表、疑問名、裸名、分類学照会または仮名）、121,917が「不確実」（現時点で分類学的ステータスが評価されていない）と記載されています。[ 3 ]データは、動物のNomenclator Zoologicusや植物のIndex Nominum Genericorumなどを含む、（多くの場合ドメイン固有の）印刷物、オンライン、データベースソースから取得され、さまざまなオンラインクエリ、個々の分類ページの生成、および他の生物多様性情報科学プロジェクトへの大量データ供給をサポートするために、共通のデータ構造に再編成されています。 IRMNGコンテンツはウェブ経由で自由に検索・表示でき、特定の日付における属の分類学的ランクまで詳細なデータファイルは、ダーウィンコアアーカイブ（DwC-A）形式でダウンロードできます。データには同名（出典付き）が含まれており、有効な（有効に公表された）学名と一部の未公表名の両方が含まれています。[ 4 ]

動物学（のみ）では、亜属の名前が属とともに「属グループ」に含まれており、「調整の原則」により、最初の出版時に明示的にそうでなくても両方のランクで同時に出版されたとみなされるため、[ 5 ]それらはIRMNG編集物では利用可能な属名として含まれていますが、現在属の受け入れられた名前として使用されている場合を除き、「未承認名」（現在属の受け入れられた名前として使用されていない）としてマークされています。対照的に、藻類、菌類、植物を対象とする植物学規約（ICN）にはそのような規定がないため、その規約に基づいて発表された亜属は、明示的に植物学上の属として再ランク付けされた場合を除き、IRMNGには含まれません。その場合、その時点で新しい「名前」が作成されたとみなされ、亜属の元の著者の名前が括弧内に示され、その後に新しく昇格した地位に責任を持つ著者の名前が続きます。[ 6 ] [ a ]

2023 年 5 月時点での「承認された名前」の推定値は、Rees ら (2020 年) で使用された方法論に従って、王国ごとに次のように分類されています (2023 年のデータを使用して更新)。

IRMNG保有数：界別に推定される属の総数 - 以前の総数はRees et al., 2020に基づく
  • 動物界：承認された属名189,287件と、未確定の104,583件の名目上の50%：承認された属の総数は推定241,578件
  • 植物界：承認された属名25,394件と、未確定の13,838件の名目上の50%：承認された属の総数は推定32,313件
  • 菌類：承認された属名10,702件と、358件の「不確かな」名前の50%を合わせた、承認された属の総数は推定10,881件
  • クロミスタ：承認された属名9,912件と、未確定の2,379件の名目上の50%：承認された属の総数は推定11,102件
  • 原生動物: 承認された属名999種と、未確定の2,164種の名詞の50%を合わせた、承認された属の総数は推定2,081種
  • 細菌：承認された属名3,337個と、223個の「不確かな」名前の50%を合わせた、承認された属の総数は推定3,393個
  • 古細菌: 140 の属名が認められている（「不確かな」属はない）
  • ウイルス: 851 の属名が認められている (「不確かな」属はない)

データベースの場所とホスティング

IRMNGは、オーストラリアの生物学者でデータマネージャーのトニー・リース氏によって2006年に開始および設計されました。[ 1 ] [ 7 ]このプロジェクトと他のプロジェクトでの彼の仕事により、GBIFは2014年のエッベ・ニールセン賞を彼に授与しました。[ 7 ] 2006年から2014年まで、IRMNGはCSIRO海洋大気研究センターに置かれ、 2014年から2016年にかけてフランダース海洋研究所（VLIZ）に移転されました。2016年以降、すべてのリリースはVLIZがホストする新しいウェブサイトwww.irmng.orgで利用できます。[ 1 ] [ 8 ] VLIZは、共通のインフラストラクチャを使用して、世界海洋生物登録簿（WoRMS）もホストしています。[ 9 ]

IRMNGの使用

IRMNGのコンテンツは、Open Tree of Life [ 10 ] 、 Global Biodiversity Information Facility (GBIF) [ 11 ] 、Encyclopedia of Life (EOL) [ 12 ] 、 Atlas of Living Australia [ 13 ]、Global Names Architecture (GNA)のGlobal Names Resolver [ 14 ]など、いくつかの世界的な生物多様性情報プロジェクトで使用されています。 2018年以降、IRMNGデータは、生命カタログ[ 15 ]の原生生物（原生動物界と色素体）と植物藻類（車軸藻類、緑藻類、灰色藻類、紅藻類）の領域における分類階層の作成と一般名の提供にも使用されています。

注記

  1. ^動物学上の亜属を含めることは、SA NeaveとNomenclator Zoologicusの編纂者のこれまでの慣例にも従っており、その作品（最初の4巻）の最初の拡張タイトルは「Linnaeus 1758の第10版から1935年末までの動物学における属と亜属の名前のリスト」でした。

参考文献

  1. ^ a b c「IRMNG - 海洋および非海洋属の暫定登録簿」 IRMNG 2019年5月23日閲覧。
  2. ^リース、トニー;リーン・ヴァンデピット。デコック、ウィム。ヴァンホーン、バート (2017)。「IRMNG 2006–2016: 世界的な分類データベースの 10 年間」。生物多様性情報学。12 : 1–44 .土井: 10.17161/bi.v12i0.6522。
  3. ^ "IRMNG - ダウンロード" . IRMNG . 2025年2月3日閲覧。
  4. ^ 「IRMNG: Homonyms」 IRMNG 2018年12月10日閲覧。
  5. ^ ICZN、1999年、「コードオンライン」を参照。関連部分は 第42条「属グループ」および第43条「調整の原則」である。
  6. ^例えば、Schuster（1963）はDrepanolejeunea属に植物亜属Acantholejeuneaを作成し、その後1967年に属として再分類しました。その結果、その属名はAcantholejeunea (RM Schuster) RM Schuster, 1967となり、IRMNGへの収録対象となりました。「Tropicos」データベースにおけるこの分類群の扱いに従い、IRMNGは現在、この属名をCeratolejeuneaのシノニムとして扱っています。AcantholejeuneaのIRMNG分類群ページを参照してください。
  7. ^ a b「CSIROのトニー・リースが2014年のエベ・ニールセン賞を受賞」 GBIF 2018年12月10日閲覧。
  8. ^ 「海洋および非海洋属暫定登録簿（IRMNG）はCSIROからVLIZに移行します」 marinespecies.org . 2018年12月10日閲覧。
  9. ^ 「海洋および非海洋属の暫定登録簿（IRMNG）」 Lifewatch地域ポータル。LifeWatch 。 2018年12月11日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2018年12月10日閲覧。
  10. ^ Open Tree of Life開発者。「Taxonomy release ott3.0 -」。Open Tree of Life 。 2018年12月10日閲覧。
  11. ^ 「海洋および非海洋属の暫定登録簿」 GBIF 2018年doi : 10.15468/6tkudz 2018年12月10日閲覧。
  12. ^ "IRMNG" . Encyclopedia of Life . 2018年4月1日時点のオリジナルよりアーカイブ。
  13. ^ GitHubのala-name-matching
  14. ^ 「Global Names Resolver: Names Data Sources」 . 2018年12月18日閲覧。
  15. ^ "IRMNG" . Catalogue of Life . 2025年3月3日閲覧。

さらに読む

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