ナノブデラティ

Kingdom of archaea grouping taxa that display various environmental and metabolic features

ナノアーキア 時間範囲:古始生代～現在[1]
パルヴァルケウム・アシディフィラム
科学的分類
ドメイン：	古細菌
王国：	Nanobdellati Rinke et al. 2024年
タイプ属
ナノブデラ 加藤ら2022 [3]
門[2]
「アエニグマターキオータ」 「フベラルカオータ」 「イアンアーキオータ」 「ミクラカオータ」 ミクロカルドタ ナノブデロタ 「ナノハラルカオータ」 「パルヴァルカオータ」 「ウンディナーキオータ」
同義語
「DPANN」井町他2013

ナノブデラティ（同義語： DPANN ）は、 2013年に初めて提唱された古細菌の界です。 ^{[4]多くのメンバーは、他の}生命領域からの水平遺伝子伝播の新たな兆候を示しています。^{[4]他の古細菌と比較してサイズが小さい（ナノメートル）ため、}ナノ古細菌または超小型古細菌として知られています。

「DPANN」は、最初に発見された5つのグループ（Diapherotrites、Parvarchaeota、Aenigmarchaeota、Nanoarchaeota、Nanohaloarchaeota ）の頭文字を組み合わせた頭字語です。その後、 WoesearchaeotaとPacearchaeotaが発見され、「DPANN」大門に提案されました。^[5] 2017年には、別の門であるAltiarchaeotaが「DPANN」大門に配置されました。^[6] Nanobdellatiの単系統性は、含まれる門の突然変異率が高いため、まだ確立されていないと考えられています。これは、系統樹の基底部で、系統が近縁関係がないにもかかわらず、基底的に、または人為的にグループ化される長枝誘引（LBA）のアーティファクトにつながる可能性があります。^{[7] [8]これらの分析は、Nanobdellatiが}Euryarchaeotaに属するか、Euryarchaeota内の様々な位置を占める多系統であることを示唆しています。^{[7] [8] [9]}

ナノブデラティ門は、ナノアーキオタのような共生型・好熱型、パルヴァルカオータのような好酸性型、そしてエニグマルカオータやジアフェロトライトのような非極限環境好性型など、多様な環境分布と代謝を持つ異なる門をグループ化しています。ナノブデラティは、硝酸塩に富む地下水面でも検出されましたが、地下水面下では検出されませんでした。これは、これらの分類群の発見が依然として非常に困難であることを示しています。^[10]

ICNPによる王国の地位の承認以来、このグループの唯一有効な公表名はナノブデラティ王国である。^[11]

特徴

他の古細菌と比較してサイズが小さく（ナノメートルサイズ）、その小さなゲノムに見合うように、限られたものの自由な生活を送るのに十分な分解能力を有することが特徴である。しかし、その多くは他の生物との共生または寄生関係に依存するエピシンビオントであると考えられている。その特性の多くは、超小型細菌（CPRグループ）の特性と類似または類似している。^[5]

限られた代謝能力はゲノムの小ささに起因しており、多くのナノブデラティ古細菌がヌクレオチド、アミノ酸、脂質の中心的な生合成経路を欠いているという事実に反映されています。そのため、 ARMAN古細菌などのナノブデラティ古細菌のほとんどは、生物学的必要量を満たすために他の微生物に依存しています。しかし、自由に生存できる可能性のあるものは、発酵性および好気性従属栄養生物です。^[5]

これらは主に嫌気性で、養殖は行われていません。好熱性、超好酸性、超好塩性、金属耐性といった極端な環境、あるいは海水や湖沼の堆積物といった温帯環境にも生息します。陸上や外洋ではほとんど見られません。^[5]

分類

• ジアフェロトライト。アメリカ合衆国の廃坑となった金鉱山の地下水ろ過装置から回収されたゲノムの系統解析によって発見された。^{[12] [13]}
• パルヴァルカオータとミクラカオータ。2006年に米国の鉱山の酸性鉱山排水から発見されました。 ^{[14] [15] [16]}これらは非常に小さく、暫定的にARMAN（リッチモンド鉱山古細菌好酸性ナノ生物）と呼ばれています。
• ウォエサーカオータとパセアーカオータ。これらは堆積物だけでなく、帯水層や湖沼の表層水にも存在が確認されており、特に塩分濃度の高い条件で多く見られます。^{[5] [17]}
• Aenigmarchaeota鉱山の廃水や温泉の堆積物中に生息する。 ^[18]
• ナノハラルカオータ。塩分濃度の高い環境に分布する。^[19]
• ナノアーキオータ。アイスランド沿岸の熱水源で初めて（2002年に）発見された。他のアーキアと共生して生息する。^{[20] [21]}

系統発生

トム・A・ウィリアムズら2017、[22] Castelle et al. 2015 [5]および Dombrowski et al. 2020年。[23]

Jordan et al. 2017 [9] Cavalier-Smith2020 [8]および Feng et al 2021. [24]

ナノブデラティは、いくつかの系統解析によると、古細菌の最初の分岐群である可能性がある。最近の系統解析では、門間の系統関係が以下のように示されている。[5] [22] [23] 細菌 古細菌 ナノブデラティ アルタルカオータ ダイアフェロトライト ミクラカオタ ウンディナーキオータ アエニグマターキオータ ナノハロアーキオタ ナノアーキオタ パルヴァルカオータ ママカオータ ペースアーキオタ ウォエサーチャエオタ ユーリアキオータ タック アスガルド ロキアーキオータ オディナクアオータ ソラルカエオタ ヘイムダラルカオータ （+ α─プロテオバクテリア） 真核生物

他の系統解析では、ナノブデラティはユーリアーキオータに属する可能性、あるいはユーリアーキオータ内で異なる位置を占める多系統性を持つ可能性が示唆されている。また、アルティアーキオータ門をナノブデラティ門に分類すべきか、ユーリアーキオータ門に分類すべきかについても議論がある。 [23] [7]系統樹におけるナノブデラティの別の位置付けは以下の通りである。[9] [8] [24]引用符で囲まれたグループはナノブデラティに属する系統であるが、系統学的には他のグループとは分離されている。 細菌 古細菌 ユーリアキオータ サーモコッカス ハデサルカエア メタノバクテリア メタノピリ メタノコッカス サーモプラズマ アーキオグロビ メタンミクロビア 「ナノハロアーキオータ」 ハロアーキア 「アルタルケオータ」 ナノブデラティ ダイアフェロトライト ミクラカオタ ウンディナーキオータ アエニグマターキオータ ナノアーキオタ パルヴァルカオータ ママカオータ ペースアーキオタ ウォエサーチャエオタ タック アスガルド ロキアーキオータ オディナクアオータ ソラルカエオタ ヘイムダラルカオータ （+ α─プロテオバクテリア） 真核生物

分類学

現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）^[25]と国立生物工学情報センター（NCBI） ^[26]に基づいています。

ナノブデラティのGTDB系統樹[27] [28] [29]

「アルタルケオータ」 「アルタルカエイア」 「アルタルカエアレス」 「イアンアーキオータ」 「イアナルカエイア」 「フォルテレアレス」 「イアンアーキアレス」 「ミクラカオータ」 「ミクラケア」 「ノロンガラガリナレス」 「ミクラケア目」 「アンストネラレス」 「グガラルカ目」 「ブラルカエアレス」 「ファーメンティミクラカエア目」 「ウンディナーキオータ」 「ウンディナルカエイア」 「ウンディナーカエア目」 「ヒューベルアーキオータ」 「フベルアルカエイア」 「Huberarchaeales」 「アエニグマターキオータ」 「アエニグマタルカエイア」 「アエニグマターカエアレス」 「ナノハラルカオータ」 「ナノハロビア」 「ナノハロビアレス」 ナノブデロタ ナノブデリア 「ティダリカルカエア目」 「ジンウェイアーケアレス目」 JAPDLS01 「パルヴァルカエアレス」 「Pacearchaeles」 「Woesearchaeales」 ナノブデラレス

キングダムナノブデラティ リンケ 他2013年

• ミクロカルドタ 門Sakai et al. 2023
  • ミクロカルディア綱Sakai et al. 2023
    • 目 ?Microcaldales Sakai et al. 2023
• 門「ウンディナーキオータ」Dombrowski et al. 2020
  • クラス「ウンディナルカエイア」Dombrowski et al. 2020
    • 目「ウンディナーカエアルス」Dombrowski et al. 2020
• 「フーベラルキオータ門」Probst et al. 2019年
  • クラス「Huberarchaeia」訂正。Probst et al. 2019
    • 「Huberarchaeales」を注文してください。Rinke et al. 2020年
• 門「Aenigmatarchaeota」corrig。リンケら。 2013 (DSEG、DUSEL2)
  • クラス「エニグマタルカエア」コリッグ。リンケら。 2020年
    • 「Aenigmatarchaeales」のコリッグを注文します。リンケら。 2020年
• 門「ナノハラキエオタ」コリグ。リンケら。 2013年
  • クラス「ナノハロビア」corrig.La Cono et al. 2020年
    • 「ナノハロビア目」ラ・コノらを注文する。 2020年
  • クラス「ナノハラルカエア」訂正。Narasingarao et al. 2012
    • ナノハラルカ目
    • オーダー?「ナノヒドロサーマル」Xie et al. 2022年
    • 目：「ヌクレオチドイソテラレス」Xie et al. 2022
• Altarchaeota 門Probst et al. 2018年（SM1）
  • クラス「アルタルケイア」コリッグ。プロブストら。 2014年
    • 「Altarchaeales」コリッグを注文。プロブストら。 2014年
• 門「イアイナルキエオタ」コルグ。リンケら。 2013 [「ディアフェロトライト」Rinke et al. 2013 ] (DUSEL-3)
  • クラス「イアナーキア」リンケ他 2020
    • プロブスト＆バンフィールド 2017「Forterreales」を注文する
    • 「Iainarchaeales」Rinke et al. を注文します。 2020年
• 門「ミクラカオータ」ベイカー＆ディック 2013
  • クラス「ミクラクアエ」Vazquez-Campos et al. 2021
    • 「Anstonellales」バスケス・カンポスらを注文する。 2021 (LFWA-IIIc)
    • 「Burarchaeales」バスケス・カンポスらを注文する。 2021 (LFWA-IIIb)
    • 目「Fermentimicrarchaeales」Kadnikov et al. 2020
    • 「Gugararchaeales」を注文するVazquez-Campos et al. 2021 (LFWA-IIIa)
    • 「Micrarchaeales」バスケス・カンポスらを注文する。 2021年
    • 「ノロンガラガリナ目」を注文バスケス・カンポスら。 2021 (LFWA-II)
• ナノブデロタ 門Huber et al. 2023
  • ナノブデリアクラス加藤 他 2022
    • JAPDLS01を注文する
    • 「Jingweiarchaeales」を注文するRao et al. 2023年[DTBS01]
    • Nanobdellales 加藤らを注文します。 2022年
    • オーダー「Pacearchaeales」（DHVE-5、DUSEL-1）
    • 「Parvarchaeales」を注文してください。Rinke et al. 2020 (アルマン 4 & 5)
    • 目「ティダリカルカエアルス」Vazquez-Campos et al. 2021 (LFW-252_1)
    • 目「Woesearchaeales」（DHVE-6）
• 門「ママカオータ門」
• 目：「Wiannamattarchaeales」

参照

• 古細菌の属一覧

参考文献

1. Zhang, Jiawei; Feng, Xiaoyuan; Li, Meng; Liu, Yang; Liu, Min; Hou, Li-Jun; Dong, Hong-Po (2025-05-07). 「アスガルダルカエオタにおけるヘイムダルアーチアエア外真核生物の深部起源」. Nature . 642 (8069): 990– 998. doi : 10.1038/s41586-025-08955-7 . ISSN  1476-4687. PMC 12222021.  PMID 40335687  .
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