ユビキチンA-52残基リボソームタンパク質融合産物1

Human protein

UBA52
利用可能な構造 PDB ヒトUniProt検索：PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2LJ5、2MBH、2MJB、2MUR、2RSU、4HJK、4JIO、4P4H、4PIG、4PIH、4PIJ、4RF0、4RF1、4S1Z、4UG0、4V6X、5AJ0、4UJD、4D67、4UJC、3J7P、 3J7Q、4XKL、3J92、4D5Y、3J7O、3J7R、3PHD、2KOX、4UJE、5A5B、2N3V、2N3U、2N3W、2NBD、2NBE、3VDZ、5HPS、3I3T、5HPT、5JBV、5HPL、 5HPK、5J8P
識別子
エイリアス	UBA52、CEP52、HUBCEP52、L40、RPL40、ユビキチンA-52残基リボソームタンパク質融合産物1
外部ID	オミム：191321; MGI : 3644625;ホモロジーン: 68307;ジーンカード：UBA52; OMA :UBA52 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 19番染色体（ヒト）[1] バンド 19p13.11 始める 18,571,730 bp [1] 終わり 18,577,550 bp [1]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 血 右精巣 左精巣 顆粒球 精子 子宮内膜間質細胞 リンパ節 左卵巣 単核細胞 単球 該当なし より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 リボソームの構造構成要素 タンパク質結合 タンパク質タグ ユビキチンタンパク質リガーゼ結合 細胞成分 細胞質 エンドサイトーシス小胞膜 核 リボソーム 細胞外エクソソーム エンドソーム膜 リソソーム膜 細胞外空間 核質 ミトコンドリア外膜 小胞体 細胞質 細胞膜 小胞体品質管理コンパートメント 小胞 小胞体膜 宿主細胞 細胞質大リボソームサブユニット 細胞質小リボソームサブユニット シナプス 生物学的プロセス DNA損傷応答、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達により細胞周期停止に至る 上皮成長因子受容体シグナル伝達経路の負の調節 鎖間架橋修復 ヌクレオチド除去修復、DNA損傷認識 標準的なWntシグナル伝達経路の正の制御 腫瘍壊死因子を介したシグナル伝達経路 I型インターフェロン産生の調節 TRIF依存性Toll様受容体シグナル伝達経路 Fc-ε受容体シグナル伝達経路 エンドソーム輸送 ゲノム全域ヌクレオチド除去修復 NIK/NF-κBシグナル伝達 有糸分裂細胞周期のG2/M移行 ストレス活性化MAPKカスケード トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路 マクロオートファジー 標準的なWntシグナル伝達経路の負の制御 ヌクレオチド除去修復、DNAギャップフィリング ウイルス転写 エラーのないトランスレジョン合成 腫瘍壊死因子を介したシグナル伝達経路の調節 刺激性C型レクチン受容体シグナル伝達経路 トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路の負の制御 SRP依存性共翻訳タンパク質の膜への標的化 JNKカスケード 低酸素状態に対するRNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写の制御 ヌクレオチド除去修復、DNA切断 I-κBキナーゼ/NF-κBシグナル伝達 自然免疫反応 ノッチシグナル伝達経路 mRNAの安定性の調節 タンパク質ポリユビキチン化 アポトーシス過程の負の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 ビリオンアセンブリ NF-κB転写因子活性の正の制御 後期促進複合体依存性分解プロセス I型インターフェロン産生の負の調節 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解 ヌクレオチド結合オリゴマー化ドメインを含むシグナル伝達経路 ウイルスの細胞内輸送 ウイルスのライフサイクル MyD88依存性Toll様受容体シグナル伝達経路 エラーを起こしやすいトランスレジョン合成 MAPKカスケード 線維芽細胞増殖因子受容体シグナル伝達経路 イオン膜輸送 グリコーゲン生合成プロセス アポトーシス過程の正の調節 翻訳開始 I-κBキナーゼ/NF-κBシグナル伝達の正の制御 トランスレジョン合成 転写連動ヌクレオチド除去修復 T細胞受容体シグナル伝達経路 MyD88非依存性Toll様受容体シグナル伝達経路 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 上皮成長因子受容体シグナル伝達経路の正の調節 プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の制御 Wntシグナル伝達経路、平面細胞極性経路 ヌクレオチド除去修復、DNA切断、5'-損傷 タンパク質生合成 ヌクレオチド除去修復、切断前複合体の組み立て rRNA処理 Wntシグナル伝達経路 ERBB2シグナル伝達経路 ヌクレオチド除去修復、DNA二重鎖の巻き戻し タンパク質の折り畳み 有糸分裂細胞周期のG2/M移行の負の調節 タンパク質のユビキチン化 タンパク質の脱ユビキチン化 SCF依存性プロテアソームユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 細菌の宿主細胞への侵入 膜輸送 壊死過程の調節 膜組織 小胞体マンノーストリミング 細胞の鉄イオン恒常性 造血幹細胞の分化の制御 ペルオキシソームへのタンパク質標的化 サイトカインを介したシグナル伝達経路 修飾依存性タンパク質分解プロセス インターロイキン-1を介したシグナル伝達経路 殺虫剤への反応 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 7311 665964 アンサンブル ENSG00000221983 該当なし ユニプロット P62987 該当なし RefSeq (mRNA) NM_001033930 NM_003333 NM_001321017 NM_001321018 NM_001321019 NM_001321020 NM_001321021 NM_001321022 該当なし RefSeq（タンパク質） NP_001029102 NP_001307946 NP_001307947 NP_001307948 NP_001307949 NP_001307950 NP_001307951 NP_003324 該当なし 場所（UCSC） 19章: 18.57 – 18.58 Mb 該当なし PubMed検索 [2] [3]
ウィキデータ
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60Sリボソームタンパク質L40（RPL40）は、ヒトではUBA52遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[4] [5]}

関数

ユビキチンは、核および細胞質に高度に保存されたタンパク質であり、26Sプロテオソームによる細胞タンパク質の分解を標的とする上で重要な役割を果たしています。また、クロマチン構造の維持、遺伝子発現の調節、ストレス応答にも関与しています。ユビキチンは、ポリユビキチン鎖、または無関係なタンパク質に融合した単一のユビキチン残基からなる前駆体タンパク質として合成されます。この遺伝子は、N末端にユビキチン、C末端にリボソームタンパク質L40からなる融合タンパク質（C末端延長タンパク質（CEP））をコードしています。この遺伝子に由来する複数の加工された擬遺伝子がゲノム内に存在する。^[5]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000221983 – Ensembl、2017年5月
2. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
3. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. Webb GC, Baker RT, Coggan M, Board PG (1994年6月). 「ヒトUBA52ユビキチン融合遺伝子の染色体バンド19p13.1-p12への局在」. Genomics . 19 (3​​): 567–9 . doi :10.1006/geno.1994.1108. PMID  8188300.
5. 「Entrez Gene: UBA52 ユビキチンA-52残基リボソームタンパク質融合産物1」。

さらに読む

• Wool IG, Chan YL, Glück A (1996). 「哺乳類リボソームタンパク質の構造と進化」. Biochem. Cell Biol . 73 ( 11–12 ): 933–47 . doi :10.1139/o95-101. PMID  8722009.
• Murphey RK, Godenschwege TA (2002). 「神経回路の構築と機能におけるユビキチンの新たな役割」. Neuron . 36 (1): 5– 8. doi : 10.1016/S0896-6273(02)00943-1 . PMID  12367500. S2CID  15764136.
• Baker RT, Board PG (1992). 「ヒトユビキチン/52残基リボソームタンパク質融合遺伝子サブファミリー（UbA52）は、主にプロセスされた擬似遺伝子から構成されている」. Genomics . 14 (2): 520–2 . doi :10.1016/S0888-7543(05)80258-7. PMID  1330885.
• Baker RT, Board PG (1991). 「ヒトユビキチン-52アミノ酸融合タンパク質遺伝子は、哺乳類リボソームタンパク質遺伝子といくつかの構造的特徴を共有している」. Nucleic Acids Res . 19 (5): 1035–40 . doi :10.1093/nar/19.5.1035. PMC  333777. PMID  1850507 .
• Monia BP, Ecker DJ, Jonnalagadda S, et al. (1989). 「ヒトユビキチンカルボキシル伸長タンパク質の遺伝子合成、発現、およびプロセシング」J. Biol. Chem . 264 (7): 4093–103 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)84967-0 . PMID  2537304.
• Lund PK, Moats-Staats BM, Simmons JG, et al. (1985). 「ヒトユビキチンをコードするcDNAのヌクレオチド配列解析により、ユビキチンは前駆体として合成されることが明らかになった」J. Biol. Chem . 260 (12): 7609–13 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)39652-7 . PMID  2581967.
• Salvesen G, Lloyd C, Farley D (1987). 「酵母ユビキチン1のヒトホモログをコードするcDNA」. Nucleic Acids Res . 15 (13): 5485. doi :10.1093/nar/15.13.5485. PMC  305980. PMID  3037496 .
• Cross SH, Charlton JA, Nan X, Bird AP (1994). 「メチル化DNA結合カラムを用いたCpGアイランドの精製」Nat. Genet . 6 (3): 236–44 . doi :10.1038/ng0394-236. PMID  8012384. S2CID  12847618.
• Cook WJ, Jeffrey LC, Kasperek E, Pickart CM (1994). 「テトラユビキチンの構造はマルチユビキチン鎖の形成過程を示す」J. Mol. Biol . 236 (2): 601–9 . doi :10.1006/jmbi.1994.1169. PMID  8107144.
• Vadlamudi RK, Joung I, Strominger JL, Shin J (1996). 「p56lckのSH2ドメインのリン酸化チロシン非依存性リガンドであるp62は、新しいクラスのユビキチン結合タンパク質に属する」J. Biol. Chem . 271 (34): 20235–7 . doi : 10.1074/jbc.271.34.20235 . PMID  8702753.
• Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). 「正規化と減算：遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548.
• Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, et al. (1998). 「ヒトリボソームタンパク質遺伝子75種の地図」Genome Res . 8 (5): 509–23 . doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID  9582194.
• クルーズ C、ベンチュラ F、バートロンズ R、ローザ JL (2001)。 「HERC3のユビキチンへの結合とユビキチンによる調節」。FEBS レット。488 ( 1–2 ): 74–80 .土井:10.1016/S0014-5793(00)02371-1。PMID  11163799。S2CID 20091003  。
• Lee TA, Tyers M (2002). 「ユビキチンジャンクション、その機能とは？」Genome Biol . 2 (10) REPORTS4025. doi : 10.1186/gb-2001-2-10-reports4025 . PMC  138970. PMID  11597332 .
• 吉浜 正之、上地 剛志、浅川 聡、他 (2002). 「ヒトリボソームタンパク質遺伝子：73遺伝子の配列決定と比較解析」Genome Res . 12 (3): 379–90 . doi :10.1101/gr.214202. PMC  155282. PMID  11875025 .
• Bishop N, Horman A, Woodman P (2002). 「哺乳類のクラスE vpsタンパク質はユビキチンを認識し、エンドソームタンパク質-ユビキチン複合体の除去に作用する」J. Cell Biol . 157 (1): 91– 101. doi :10.1083/jcb.200112080. PMC 2173266.  PMID 11916981  .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .

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