ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
NMNAT1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1GZU、1KKU、1KQN、1KQO、1KR2
識別子 エイリアス NMNAT1 、LCA9、NMNAT、PNAT1、ニコチンアミドヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ1、SHILCA 外部ID オミム :608700; MGI : 1913704; ホモロジーン : 39074; ジーンカード :NMNAT1; OMA :NMNAT1 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 4番染色体(マウス) [2] バンド 4|4 E2 始める 149,552,029 bp [2] 終わり 149,569,659 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 太ももの筋肉 横行結腸粘膜 睾丸 腓腹筋 ランゲルハンス島 単球 アキレス腱 子宮内膜間質細胞 直腸 心臓の頂点
上位の表現 耳板 耳小胞 球形嚢 太ももの筋肉 右腎臓 大腿四頭筋 前脛骨筋 骨格筋組織 胚 肋間筋
より多くの参照表現データ
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能 トランスフェラーゼ活性 ヌクレオチド結合 ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性 タンパク質結合 ATP結合 触媒活性 ニコチンアミドヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ活性 ニコチン酸ヌクレオチドアデニルトランスフェラーゼ活性 同一のタンパク質結合 細胞成分 生物学的プロセス ピリジンヌクレオチド生合成プロセス NAD代謝プロセス NAD生合成プロセス 生合成 アスパラギン酸からのNADの「de novo」生合成プロセス 負傷への反応 ポリADP-D-リボースからのATP生成 MAPKカスケードの正の制御 ニューロンのアポトーシス過程の負の調節 アポトーシスDNA断片化の負の制御 ヌクレオチド生合成プロセス 出典:Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001297778 NM_001297779 NM_022787
RefSeq(タンパク質) NP_001284707 NP_001284708 NP_073624
場所(UCSC) 1 章: 9.94 – 9.99 MB 4章: 149.55 – 149.57 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ニコチンアミドモノヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ1 ( NMNAT1 )は、ヒトでは nmnat1 遺伝子 によってコードされる 酵素 である。 [5] [6] [7]これは、ニコチン アミドアデニンジヌクレオチド (NAD)の合成を触媒する ニコチンアミドヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ (NMNAT)のメンバーである 。 [8]
関数 補酵素 NADとその誘導体は、数百もの代謝 酸化還元 反応 に関与しており、タンパク質の ADPリボシル化 、 ヒストンの 脱アセチル化 、そしていくつかの Ca2 + シグナル伝達経路で利用されています。NMNAT(EC 2.7.7.1)はNAD生合成における中心的な酵素であり、ニコチンアミドモノヌクレオチド(NMN)またはニコチン酸モノヌクレオチド(NaMN)とATPのAMP部分との縮合を触媒してNADまたはNaADを生成します。 [7]
NMNAT1は、ニコチンアミドヌクレオチドアデニル基転移酵素(NMNAT)活性を持つ3つの 相同 遺伝子の中で最も広く発現している。NMNAT1を欠損した遺伝子組み換えマウスは初期胚発生中に死亡することから、この遺伝子が生物の生存に重要な役割を果たすことが示唆される。 [9] 一方、 主に神経組織で発現する NMNAT2を欠損したマウスは、発生は完了するものの生後まもなく死亡する。しかし、NMNAT1は細胞生存には必須ではなく、神経膠芽腫の腫瘍および細胞株ではこの遺伝子のホモ接合性欠失が起こる。しかし、 骨肉腫 などの他の腫瘍では、DNA損傷因子への曝露によりNMNAT1の発現が上昇し、 nmnat1遺伝子の不活性化によってこれらの細胞は シスプラチン を用いた 化学療法 に対する感受性が高まる 。 [10] この後者の効果は、NMNAT1ノックアウト細胞における核内NADレベルの低下と、NAD依存性DNA切断応答酵素 ポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ-1 (PARP1)によるDNA損傷検知の障害を伴う。 [10] 骨肉腫細胞がPARP1依存性DNA修復および生存においてNMNAT1由来のNADに依存することは、シスプラチン処理癌細胞に限らず、 アクチノマイシンD 処理腫瘍細胞株でも報告されている。 [ 11] これらのデータは、NMNAT1による核内NAD合成が骨肉腫だけでなく、おそらく他の腫瘍においても治療標的となる可能性があることを示唆している。 [10] [11]
NMNAT酵素活性は細胞レベルではおそらく不可欠であり、モデル生物におけるNMNAT活性の完全な消失は細胞の生存不能につながる。 [12]
NMNAT1の増強は軸索変性につながる SARM1 の作用に対抗するが [13] 、この効果はSARM1によるNAD+の枯渇を防ぐことによるものではない [8] 。
臨床的関連性 この遺伝子の変異は、網膜変性病態であるレーバー先天性黒内障 のLCA9型と関連していることが示されている 。 [14] [8] [15]
エージング 高齢マウスでは、肝臓( NAD+の de novo合成 の主要部位)における NMNAT1 遺伝子産物の顕著な減少が認められる。 [16] また、マウスの腎臓、卵母細胞、結腸においても、すべての NMNAT 遺伝子アイソフォーム 産物が加齢とともに減少する。 [16]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000173614 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000028992 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Schweiger M, Hennig K, Lerner F, Niere M, Hirsch-Kauffmann M, Specht T, et al. (2001年3月). 「NAD合成に必須の核酵素である組換えヒトニコチンアミドモノヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ(NMNAT)の特性評価」 FEBS Letters . 492 ( 1–2 ): 95–100 . doi : 10.1016/S0014-5793(01)02180-9 . PMID 11248244. ^ Emanuelli M, Carnevali F, Saccucci F, Pierella F, Amici A, Raffaelli N, et al. (2001年2月). 「ヒトNMNアデニルトランスフェラーゼの分子クローニング、染色体局在、組織mRNAレベル、細菌発現、および酵素特性」 Journal of Biological Chemistry . 276 (1): 406– 412. doi : 10.1074/jbc.M008700200 . PMID 11027696. ^ ab 「Entrez遺伝子:NMNAT1ニコチンアミドヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ1」。 ^ abc Brazill JM, Li C, Zhu Y, Zhai RG (2017). 「NMNAT:NAD + 合成酵素であり、シャペロンであり、神経保護因子でもある」 Current Opinion in Genetics & Development . 44 : 156– 162. doi :10.1016/j.gde.2017.03.014. PMC 5515290 . PMID 28445802. ^ Fletcher RS, Lavery GG (2018). 「NAD+代謝の制御におけるニコチンアミドリボシドキナーゼの出現」. Journal of Molecular Endocrinology . 61 (3): R107 – R121 . doi :10.1530/JME-18-0085. PMC 6145238. PMID 30307159 . ^ abc Kiss A, Raduly AP, Regdon Z, Polgar Z, Tarapcsak S, Sturniolo I, et al. (2020-05-07). 「核NAD+合成を標的とするとDNA修復が阻害され、代謝適応が阻害され、U-2OS骨肉腫細胞の化学感受性が上昇する」. Cancers . 12 (5) E1180. doi : 10.3390/cancers12051180 . ISSN 2072-6694. PMC 7281559. PMID 32392755 . ^ Kiss A, Csikos C, Regdon Z, Polgar Z, Virag L, Hegedus C (2021-08-18). 「NMNAT1はアクチノマイシンD誘導性骨肉腫細胞死における生存因子である」. International Journal of Molecular Sciences . 22 (16): 8869. doi : 10.3390/ijms22168869 . ISSN 1422-0067. PMC 8396190. PMID 34445574 . ^ Muller FL, Colla S, Aquilanti E, Manzo VE, Genovese G, Lee J, 他 (2012年8月). 「パッセンジャー遺伝子の欠失はがんにおける治療上の脆弱性を生み出す」. Nature 488 ( 7411 ): 337– 342. Bibcode :2012Natur.488..337M. doi :10.1038/nature11331. PMC 3712624. PMID 22895339 . ^ 佐々木裕、中川哲、マオX、ディアントニオA、ミルブラントJ (2016年10月)。 「+枯渇」。 eライフ 。 5 . 土井 : 10.7554/eLife.19749 。 PMC 5063586 。 PMID 27735788。 ^ Koenekoop RK, Wang H, Majewski J, Wang X, Lopez I, Ren H, et al. (2012年9月). 「NMNAT1の変異はレーバー先天性黒内障を引き起こし、網膜変性症の新たな病態経路を特定する」 Nature Genetics 44 ( 9). Finding of Rare Disease Genes (FORGE) Canada Consortium: 1035– 1039. doi :10.1038/ng.2356. PMC 3657614. PMID 22842230 . ^ Jadeja RN、Thounaojam MC、Martin PM (2020). 「NAD+代謝の老化網膜および網膜変性への影響」. 酸化医学と細胞長寿命 . 2020 2692794. doi : 10.1155/2020/2692794 . PMC 7238357. PMID 32454935 . ^ ab McReynolds MR, Chellappa K, Baur JA (2020). 「加齢に伴うNAD + の減少」. Experimental Gerontology . 134 110888. doi :10.1016/j.exger.2020.110888. PMC 7442590. PMID 32097708 .
さらに読む 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」. 遺伝子 . 138 ( 1–2 ): 171–174 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Garavaglia S, D'Angelo I, Emanuelli M, Carnevali F, Pierella F, Magni G, et al. (2002). 「ヒトNMNアデニリルトランスフェラーゼの構造。NAD恒常性維持に重要な核内酵素」 Journal of Biological Chemistry . 277 (10): 8524– 8530. doi : 10.1074/jbc.M111589200 . PMID 11751893. Werner E, Ziegler M, Lerner F, Schweiger M, Muller YA, Heinemann U (2002). 「ヒトニコチンアミドモノヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ(NMNAT)の結晶化と予備的X線解析」. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography . 58 (Pt 1): 140– 142. Bibcode :2002AcCrD..58..140W. doi :10.1107/S0907444901017437. PMID : 11752792. Zhou T, Kurnasov O, Tomchick DR, Binns DD, Grishin NV, Marquez VE, et al. (2002). 「ヒトニコチンアミド/ニコチン酸モノヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼの構造.腫瘍溶解性薬剤チアゾフリンの二重基質特異性と活性化の基盤」 Journal of Biological Chemistry . 277 (15): 13148– 13154. doi : 10.1074/jbc.M111469200 . PMID 11788603. Fernando FS, Conforti L, Tosi S, Smith AD, Coleman MP (2002). 「緩徐なワラー変性症(C57BL/Wld(s))マウスで変異した遺伝子のヒトホモログ」. Gene . 284 ( 1– 2): 23– 29. doi :10.1016/S0378-1119(02)00394-3. PMID 11891043. Werner E, Ziegler M, Lerner F, Schweiger M, Heinemann U (2002). 「ヒトニコチンアミドモノヌクレオチドアデニルトランスフェラーゼとNMNの複合体の結晶構造」 FEBS Letters . 516 ( 1–3 ): 239– 244. doi : 10.1016/S0014-5793(02)02556-5 . PMID 11959140. Raffaelli N, Sorci L, Amici A, Emanuelli M, Mazzola F, Magni G (2002). 「新規ヒトニコチンアミドモノヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼの同定」. 生化学および生物理学的研究通信 . 297 (4): 835– 840. doi :10.1016/S0006-291X(02)02285-4. PMID 12359228. Zhang X, Kurnasov OV, Karthikeyan S, Grishin NV, Osterman AL, Zhang H (2003). 「ヒト細胞質NMN/NaMNアデニリルトランスフェラーゼの構造解析とヒトNAD生合成への関与」. Journal of Biological Chemistry . 278 (15): 13503– 13511. doi : 10.1074/jbc.M300073200 . PMID 12574164. Yalowitz JA, Xiao S, Biju MP, Antony AC, Cummings OW, Deeg MA, et al. (2004). 「ヒト脳ニコチンアミド5'-モノヌクレオチドアデニルトランスフェラーゼ-2の特性解析とヒト膵臓における発現」 The Biochemical Journal . 377 (Pt 2): 317– 326. doi :10.1042/BJ20030518. PMC 1223862. PMID 14516279 . 鈴木雄三、山下亮、城田正之、榊原雄三、千葉淳、水島-菅野淳、他 (2004). 「ヒト遺伝子とマウス遺伝子の配列比較により、プロモーター領域に相同ブロック構造が認められる」. Genome Research . 14 (9): 1711– 1718. doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316. PMID 15342556 . Berger F, Lau C, Dahlmann M, Ziegler M (2006). 「ヒトニコチンアミドモノヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ3アイソフォームの細胞内コンパートメントと異なる触媒特性」 Journal of Biological Chemistry . 280 (43): 36334– 36341. doi : 10.1074/jbc.M508660200 . PMID 16118205. Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, et al. (2006). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635– 648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573. Berger F, Lau C, Ziegler M (2007). 「核内NAD生合成酵素NMNアデニル酸トランスフェラーゼ1のリン酸化状態によるポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ1活性の制御」 米国科学アカデミー紀要 . 104 (10): 3765– 3770. Bibcode :2007PNAS..104.3765B. doi : 10.1073/pnas.0609211104 . PMC 1820658. PMID 17360427 .
PDBギャラリー
1gzu :ヒトニコチンアミドモノヌクレオチドアデニルトランスフェラーゼとNMNの複合体の結晶構造
1kku :ヒト核ニコチンアミドモノヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼの結晶構造
1kqn :NADと複合体を形成したNMN/NaMNアデニリルトランスフェラーゼの結晶構造
1kqo :脱アミドNADと複合体を形成したNMN/NaMNアデニリルトランスフェラーゼの結晶構造
1kr2 :チアゾフリンアデニンジヌクレオチド(TAD)と複合体を形成したヒトNMN/NAMNアデニリルトランスフェラーゼの結晶構造