ヌクレオポリン153

NUP153
利用可能な構造 PDB ヒトUniProt検索：PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2EBQ、2EBR、2EBV、2GQE、4U0C、4U0D
識別子
エイリアス	NUP153、HN153、ヌクレオポリン153kDa、ヌクレオポリン153
外部ID	オミム: 603948 ; MGI : 2385621 ;ホモロジーン: 68442 ;ジーンカード: NUP153 ; OMA : NUP153 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 6番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 6p22.3 始める 17,615,035 bp [ 1 ] 終わり 17,706,925 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 13番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 13|13 A5 始める 46,833,381 bp [ 2 ] 終わり 46,881,416 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 二次卵母細胞 鼻咽頭上皮 軟骨組織 脛骨 胚上皮 脈絡叢上皮 羊水 太ももの皮膚 壁側胸膜 腹直筋の骨格筋組織 上位の表現 胚の尾 原始的な条線 性器結節 生殖腺隆起 毛様体 パネートセル 腹壁 内側神経節隆起 下顎突出 精子細胞 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 タンパク質膜アダプター活性 金属イオン結合 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 核局在配列結合 核膜孔の構造成分 細胞成分 核膜 核周辺 膜 核孔 核質 核小体 核封入体 核孔 核バスケット 核 核孔中心輸送チャネル 細胞質 宿主細胞 生物学的プロセス mRNA輸送 核膜孔複合体の組み立て ウイルスの宿主核への侵入 タンパク質輸送 ウイルスの宿主細胞への侵入 ウイルスプロセス 核からのRNA輸出の負の制御 核からのmRNAの輸出 核へのタンパク質の輸入 解糖系の調節 核からのtRNAの輸出 タンパク質のSUMO化 ウイルス転写 miRNAによる遺伝子サイレンシングの制御 ウイルスの細胞内輸送 熱に対する細胞反応の調節 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 9972 218210 アンサンブル ENSG00000124789 ENSMUSG00000021374 ユニプロット P49790 該当なし RefSeq (mRNA) NM_001278209 NM_001278210 NM_005124 NM_175749 RefSeq（タンパク質） NP_001265138 NP_001265139 NP_005115 該当なし 場所（UCSC） 6章: 17.62 – 17.71 Mb 13章: 46.83 – 46.88 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

ヌクレオポリン153（Nup153 ）は、ヒトではNUP153遺伝子によってコードされるタンパク質です。脊椎動物の核膜孔複合体（NPC）バスケットの必須構成要素であり、NPCのアン​​カーに必須です。また、輸入核膜タンパク質のドッキング部位としても機能します。^{[ 5 ]} NPCの細胞質側では、Nup358が同様の役割を果たしています。

背景

核膜孔複合体は、核と細胞質の間における高分子の制御された移動を媒介する極めて精巧な構造です。これらの複合体は少なくとも100種類の異なるポリペプチドサブユニットから構成され、その多くはヌクレオポリンファミリーに属します。ヌクレオポリンは、細胞質側に配向したO-結合型N-アセチルグルコサミン残基と、ペンタペプチド配列XFXFGの多数の繰り返しを特徴とする、核膜孔複合体特異的な糖タンパク質です。

構造

ヌクレオポリン153の質量は153 kDa（そのため、ヌクレオポリン153という名前が付けられている）である。フィラメント状で、3つの異なるドメインから構成されている。N末端領域には孔標的ドメインが同定されており、中央領域には複数のジンクフィンガーモチーフが、C末端領域には複数のXFXFGリピートがそれぞれ含まれている。^{[ 6 ]}

相互作用

NUP153はSENP2 ^{[ 7 ] [ 8 ]}およびKPNB1 ^{[ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]}と相互作用することが示されている。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000124789 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000021374 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Moroianu J, Blobel G, Radu A (1997). 「RanGTPを介したカリオフェリンαの核外輸送は核孔タンパク質Nup153との相互作用を伴う」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 94 (18): 9699– 704. Bibcode : 1997PNAS...94.9699M . doi : 10.1073/pnas.94.18.9699 . PMC 23253. PMID 9275187 .  
6. 「Entrez遺伝子：NUP153核ポリン153kDa」。
7. Hang, Jun; Dasso Mary (2002年5月). 「ヒトSUMO-1プロテアーゼSENP2と核膜孔の関連性」 . J. Biol. Chem . 277 (22): 19961–6 . doi : 10.1074/jbc.M201799200 . ISSN 0021-9258 . PMID 11896061 .  
8. Zhang, Hong; Saitoh Hisato; Matunis Michael J (2002年9月). 「SUMO修飾経路の酵素は核膜孔複合体のフィラメントに局在する」 . Mol . Cell. Biol . 22 (18): 6498– 508. doi : 10.1128/MCB.22.18.6498-6508.2002 . ISSN 0270-7306 . PMC 135644. PMID 12192048 .   
9. Nakielny, S; Shaikh S; Burke B; Dreyfuss G (1999年4月). 「Nup153は新規Ran結合ドメインを有するM9含有可動性核膜タンパク質である」 . EMBO J. 18 ( 7): 1982–95 . doi : 10.1093/ emboj /18.7.1982 . ISSN 0261-4189 . PMC 1171283. PMID 10202161 .   
10. Kehlenbach, RH; Gerace L (2000年6月). 「核輸送機構のリン酸化はin vitroにおける核タンパク質輸入をダウンレギュレートする」 . J. Biol. Chem . 275 (23): 17848–56 . doi : 10.1074/jbc.M001455200 . ISSN 0021-9258 . PMID 10749866 .  
11. Ben-Efraim, I; Gerace L (2001年1月). 「核内輸送経路における核膜タンパク質に対するインポーチンβの親和性増加の勾配」 . J. Cell Biol . 152 (2): 411–7 . doi : 10.1083 /jcb.152.2.411 . ISSN 0021-9525 . PMC 2199621. PMID 11266456 .   

さらに読む

• Moroianu J (2000). 「核内輸送と核外輸送の経路」. J. Cell. Biochem . Suppl 32-33 (S32): 76– 83. doi : 10.1002 /(SICI)1097-4644(1999)75:32+<76::AID-JCB10>3.0.CO;2-Q . PMID  10629106. S2CID 45613755 . 
• Adam SA (2002). 「核膜孔複合体」 . Genome Biol . 2 (9) REVIEWS0007. doi : 10.1186 / gb-2001-2-9-reviews0007 . PMC  138961. PMID  11574060 .
• McMorrow I, Bastos R, Horton H, Burke B (1994). 「ヒト核膜孔複合体タンパク質hnup153をコードするcDNAの配列解析」. Biochim. Biophys. Acta . 1217 (2): 219–23 . doi : 10.1016/0167-4781(94)90040-X . PMID  8110839 .
• Yaseen NR, Blobel G (1997). 「ヒトカリオフェリンβ3のクローニングと特性解析」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (9): 4451–6 . Bibcode : 1997PNAS...94.4451Y . doi : 10.1073/ pnas.94.9.4451 . PMC  20743. PMID  9114010 .
• Zolotukhin AS, Felber BK (1999). 「核孔タンパク質nup98とnup214はヒト免疫不全ウイルス1型Revの核外輸送に関与する」 . J. Virol . 73 (1): 120–7 . doi : 10.1128/JVI.73.1.120-127.1999 . PMC  103815. PMID  9847314 .
• Ullman KS, Shah S, Powers MA, Forbes DJ (1999). 「核膜タンパク質nup153は複数の種類の核外輸送において重要な役割を果たす」 . Mol. Biol. Cell . 10 (3): 649– 64. doi : 10.1091/mbc.10.3.649 . PMC  25193. PMID  10069809 .
• Nakielny S, Shaikh S, Burke B, Dreyfuss G (1999). 「Nup153は新規Ran結合ドメインを有するM9含有可動性核膜タンパク質である」 . EMBO J. 18 ( 7): 1982–95 . doi : 10.1093/emboj / 18.7.1982 . PMC  1171283. PMID  10202161 .
• Bachi A, Braun IC, Rodrigues JP, et al. (2000). 「TAPのC末端ドメインは核膜孔複合体と相互作用し、特異的なCTE含有RNA基質の輸出を促進する」 . RNA . 6 ( 1): 136– 58. doi : 10.1017/S1355838200991994 . PMC  1369901. PMID  10668806 .
• Kehlenbach RH, Gerace L (2000). 「核輸送機構のリン酸化はin vitroにおける核タンパク質輸入をダウンレギュレーションする」 . J. Biol. Chem . 275 (23): 17848–56 . doi : 10.1074/jbc.M001455200 . PMID  10749866 .
• Kutay U, Hartmann E, Treichel N, et al. (2001). 「インポーチンβスーパーファミリーに属する2つの新規RanGTP結合タンパク質の同定」 . J. Biol. Chem . 275 (51): 40163–8 . doi : 10.1074/jbc.M006242200 . hdl : 11858/00-001M-0000-0015-3D4E-B . PMID  11024021 .
• Herold A, Suyama M, Rodrigues JP, et al. (2000). 「TAP (NXF1) は、保存されたモジュール構造を持つ推定RNA輸出因子の多重遺伝子ファミリーに属する」 . Mol. Cell. Biol . 20 (23): 8996– 9008. doi : 10.1128/MCB.20.23.8996-9008.2000 . PMC  86553. PMID  11073998 .
• Hofmann W, Reichart B, Ewald A, et al. (2001). 「Rev応答エレメント（RRE）および構成輸送エレメント（CTE）を含むレトロウイルスRNAの核外輸送に必要な補因子。アクチンの意外な役割」 . J. Cell Biol . 152 (5): 895– 910. doi : 10.1083 / jcb.152.5.895 . PMC  2198816. PMID  11238447 .
• Ben-Efraim I, Gerace L (2001). 「核内輸送経路におけるインポーチンβと核膜タンパク質の親和性増加の勾配」 . J. Cell Biol . 152 (2): 411–7 . doi : 10.1083/jcb.152.2.411 . PMC  2199621. PMID 11266456  .
• Dimaano C, Ball JR, Prunuske AJ, Ullman KS (2002). 「RNA会合は核膜孔タンパク質Nup153の機能的に保存されたドメインを定義する」 . J. Biol. Chem . 276 (48): 45349–57 . doi : 10.1074/jbc.M102592200 . PMID  11567018 .
• Walther TC, Fornerod M, Pickersgill H, et al. (2001). 「核孔タンパク質Nup153は核膜孔バスケットの形成、核膜孔複合体のアンカー、そして核タンパク質サブセットの輸送に必須である」. EMBO J. 20 ( 20): 5703–14 . doi : 10.1093/emboj/20.20.5703 . PMC  125666. PMID  11598013 .
• Brownawell AM, Macara IG (2002). 「新規カリオフェリンExportin-5は二本鎖RNA結合タンパク質の核外輸送を媒介する」 . J. Cell Biol . 156 (1): 53– 64. doi : 10.1083/jcb.200110082 . PMC  2173575. PMID  11777942 .
• Hang J, Dasso M (2002). 「ヒトSUMO-1プロテアーゼSENP2と核膜孔の関連性」 . J. Biol. Chem . 277 (22): 19961–6 . doi : 10.1074/jbc.M201799200 . PMID  11896061 .

「 https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Nucleoporin_153&oldid=1314857028」から取得