ヌクレオポリン214

NUP214
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスNUP214、CAIN、CAN、D9S46E、N214、p250、核ポリン214kDa、核ポリン214、IIAE9
外部IDオミム: 114350 ; MGI : 1095411 ;ホモロジーン: 38008 ;ジーンカードNUP214 ; OMA : NUP214 - オルソログ
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_005085 NM_001318324 NM_001318325

NM_172268

RefSeq(タンパク質)

NP_001305253 NP_001305254 NP_005076

NP_758472 NP_001395026

場所(UCSC)9章: 131.13 – 131.23 MB2章: 31.86 – 31.94 Mb
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ウィキデータ
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ヌクレオポリン214Nup2014)は、ヒトではNUP214遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

関数

核膜孔複合体は核膜を横切る巨大な構造で、核と細胞質の間の高分子の流れを制御する入り口を形成している。真核細胞では、核膜孔複合体の主要構成要素はヌクレオポリンである。この遺伝子はFGリピートを含むヌクレオポリンのメンバーである。この遺伝子によってコードされるタンパク質は核膜孔複合体の細胞質面に局在し、適切な細胞周期の進行と核質間輸送に必要とされる。この遺伝子の3'部位は、急性骨髄性白血病および骨髄異形成症候群に関連するt(6,9)転座において、6番染色体上のDEK遺伝子と融合遺伝子を形成する。[ 7 ]

構造

Nup214のN末端ドメインの構造は、7枚羽根のβプロペラフォールドと、それに続く30残基のC末端延長ペプチドセグメント(CTE)を示している。CTEはβプロペラに折り畳まれ、その底面に結合する。[ 8 ] ADP結合状態のヘリカーゼDdx19に結合したNup214 NTDの構造は、2つのタンパク質間の相互作用の分子的基盤を明らかにしている。Ddx19の保存された残基は、in vitroおよびin vivoでの複合体形成に重要であることが示されている。驚くべきことに、相互作用表面は強く反対の表面電位を示し、ヘリカーゼ表面は正に帯電し、Nup214表面は負に帯電している。Ddx19はATP結合状態のRNAにのみ結合し、RNAとNup214 NTDの結合は相互に排他的であることが示された。[ 9 ]

相互作用

NUP214 は以下と相互作用することが示されています。

参考文献

  1. ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000126883Ensembl、2017年5月
  2. ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000001855Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「ヒトPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^ Kraemer D, Wozniak RW, Blobel G, Radu A (1994年2月). 「骨髄性白血病発症に関連する推定癌遺伝子産物であるヒトCANタンパク質は、細胞質に面した核膜孔複合体タンパク質である」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 91 (4): 1519–23 . Bibcode : 1994PNAS...91.1519K . doi : 10.1073/pnas.91.4.1519 . PMC 43191. PMID 8108440 .  
  6. ^ von Lindern M, Poustka A, Lerach H, Grosveld G (1990年8月). 「急性非リンパ性白血病の特定のサブタイプに関連する(6;9)染色体転座は、9q34上の標的遺伝子の異常な転写を引き起こす」 . Molecular and Cellular Biology . 10 (8): 4016–26 . doi : 10.1128/mcb.10.8.4016 . PMC 360912. PMID 2370860 .  
  7. ^ a b「Entrez遺伝子:NUP214核ポリン214kDa」
  8. ^ Napetschnig J, Blobel G, Hoelz A (2007). 「ヒトプロトオンコゲンNup214/CANのN末端ドメインの結晶構造」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 104 (6): 1783–8 . Bibcode : 2007PNAS..104.1783N . doi : 10.1073/ pnas.0610828104 . PMC 1794303. PMID 17264208 .  
  9. ^ a b Napetschnig J, Kassube SA, Debler EW, Wong RW, Blobel G, Hoelz A (2009). 「核孔タンパク質Nup214とDEADボックスヘリカーゼDdx19の相互作用の構造的・機能的解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 106 (9): 3089–94 . Bibcode : 2009PNAS..106.3089N . doi : 10.1073/pnas.0813267106 . PMC 2651337. PMID 19208808 .  
  10. ^ a b Herold A, Suyama M, Rodrigues JP, Braun IC, Kutay U, Carmo-Fonseca M, Bork P, Izaurralde E (2000年12月). 「TAP (NXF1) は、保存されたモジュール構造を持つ推定RNA輸出因子の多重遺伝子ファミリーに属する」 . Molecular and Cellular Biology . 20 ( 23): 8996– 9008. doi : 10.1128/mcb.20.23.8996-9008.2000 . PMC 86553. PMID 11073998 .  
  11. ^ Schmitt I, Gerace L (2001年11月). 「TapのC末端シャトルドメインを介した核輸送のin vitro解析」 . The Journal of Biological Chemistry . 276 (45): 42355–63 . doi : 10.1074/jbc.M103916200 . PMID 11551912 . 
  12. ^ Carman JA, Nadler SG (2004年3月). 「トリステトラプロリンと核孔タンパク質CAN/Nup214の直接的な会合」.生化学および生物理学的研究通信. 315 (2): 445–9 . doi : 10.1016/j.bbrc.2004.01.080 . PMID 14766228 . 

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