PCBP2

PCBP2
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2AXY、2JZX、2P2R、2PQU、2PY9
識別子
エイリアス	PCBP2、HNRNPE2、HNRPE2、hnRNP-E2、ポリ(rC)結合タンパク質2
外部ID	オミム：601210; MGI : 108202;ホモロジーン: 74536;ジーンカード：PCBP2; OMA :PCBP2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	12番染色体（ヒト）
終わり	53,481,162 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	15番染色体（マウス）
終わり	102,500,061 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	神経節隆起; ; 心室帯; ; 子宮内膜間質細胞; ; 左精巣; ; 右精巣; ; 左卵巣; ; 右副腎皮質; ; 甲状腺の左葉; ; 甲状腺の右葉; ; 右卵巣;
	上位の表現
	網膜の神経層; ; 胚葉上層; ; 手; ; 心室帯; ; 体節; ; 大臼歯; ; 胸腺; ; 腹壁; ; 胚の尾; ; 心内膜クッション;
	より多くの参照表現データ
	; ; ; ;
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合; 酵素結合; 核酸結合; ユビキチンタンパク質リガーゼ結合; タンパク質結合; RNA結合; Cリッチ一本鎖DNA結合;
細胞成分	細胞外エクソソーム; 膜; 焦点接着; 核質; 細胞質; 核; 細胞質; シナプス後密度;
生物学的プロセス	スプライソソームを介したmRNAスプライシング; ウイルスに対する防御反応の負の調節; プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス; ウイルスに対する防御反応; mRNA代謝プロセス; I型インターフェロン産生の負の調節; 免疫システムのプロセス; 自然免疫反応; ウイルスRNAゲノム複製; IRES依存性ウイルス翻訳開始; RNA代謝プロセス;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	5094
	18521
	ENSG00000197111
	ENSMUSG00000056851
	Q15366
	Q61990
NM_031989 ; NM_001098620 ; NM_001128911 ; NM_001128912 ; NM_001128913;
	NM_001128914 ; NM_005016
	NM_001103165 ; NM_001103166 ; NM_001174073 ; NM_011042
NP_001092090 ; NP_001122383 ; NP_001122384 ; NP_001122385 ; NP_001122386;
	NP_005007 ; NP_114366
	NP_001096635 ; NP_001096636 ; NP_001167544 ; NP_035172 ; NP_001361700
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ポリ(rC)結合タンパク質2は、ヒトではPCBP2遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は多機能であると考えられる。PCBP-1およびhnRNPKとともに、主要な細胞内ポリ(rC)結合タンパク質に相当する。RNA結合に関与する可能性のある3つのK相同ドメイン（KH）を含む。このタンパク質はPCBP-1とともに、IRESのステムループIVとの配列特異的相互作用を介してポリオウイルスRNAの翻訳コアクチベーターとしても機能し、5'末端のクローバーリーフ構造に結合してポリオウイルスRNAの複製を促進する。

また、15-リポキシゲナーゼmRNA、ヒトパピローマウイルス16型L2 mRNA、およびA型肝炎ウイルスRNAの翻訳制御にも関与していることが示唆されています。コードされているタンパク質は、α-グロビンmRNAの安定性に関連する配列特異的なα-グロビンmRNP複合体の形成にも関与することが示唆されています。

このマルチエクソン構造mRNAは、レトロトランスポジションにより、類似の機能を有するイントロンレス遺伝子PCBP-1を生成すると考えられています。この遺伝子とPCBP-1には、遺伝子全体の重複によって生じたと考えられるパラログPCBP3およびPCBP4が存在します。また、処理された2つの擬遺伝子PCBP2P1およびPCBP2P2も存在します。現在、この遺伝子には2つの選択的スプライシング転写バリアントが記載されています。^[6]

ヒトでは、PCBP2遺伝子は、肝細胞癌に関与する転写された超保存要素である TUC338と重複している。^[7]

相互作用

PCBP2はHNRPK、^[8]PTBP1、HNRNPLと相互作用することが示されている。^[8]

参考文献

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さらに読む

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000197111 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000056851 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid8833161-5] Tommerup N, Leffers H (1997年5月). 「in situハイブリダイゼーションによるヒトKHボックス含有遺伝子の割り当て：HNRNPKは9q21.32-q21.33、PCBP1は2p12-p13、PCBP2は12q13.12-q13.13にマップされ、FRA12Aより遠位に位置する」. Genomics . 32 (2): 297–8 . doi :10.1006/geno.1996.0121. PMID 8833161.

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[Bra11-7] Braconi C, Valeri N, Kogure T, Gasparini P, Huang N, Nuovo GJ, Terracciano L, Croce CM, Patel T (2011-01-11). 「肝細胞癌における超保存的要素を持つ転写非コードRNAの発現と機能的役割」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 108 (2): 786–91 . Bibcode :2011PNAS..108..786B. doi : 10.1073/pnas.1011098108 . PMC 3021052. PMID 21187392 .

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