DNA誘導RNAポリメラーゼIIサブユニットRPB1 ( RPB1とも呼ばれる)は、ヒトの POLR2A遺伝子によってコードされる酵素です
機能
この遺伝子は、真核生物においてメッセンジャーRNAの合成を担うポリメラーゼであるRNAポリメラーゼIIの最大サブユニットをコードしています。この遺伝子産物は、ポリメラーゼ活性に必須のヘプタペプチドリピートからなるカルボキシ末端ドメインを含んでいます。これらのリピートには、 RNAポリメラーゼの活発な転写時にリン酸化されるセリンとスレオニン残基が含まれています。さらに、このサブユニットは、他のいくつかのポリメラーゼサブユニットと組み合わせて、ポリメラーゼのDNA結合ドメイン、つまりDNAテンプレートがRNAに転写される溝を形成します。[ 5 ]
相互作用
POLR2Aは以下と 相互作用することが示されています
- BRCA1、[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
- CREBBP , [ 10 ]
- CTDP1 , [ 7 ]
- CDK8 , [ 10 ]
- GTF2B , [ 7 ]
- GTF2F1、[ 7 ] [ 10 ]
- GTF2H4 , [ 7 ]
- MED21、[ 7 ] [ 10 ] [ 11 ]
- MED26 , [ 12 ]
- PCAF、[ 10 ]
- POLR2C , [ 13 ]
- POLR2E , [ 13 ]
- POLR2H , [ 13 ]
- POLR2L , [ 13 ]
- PQBP1 , [ 14 ]
- SMARCA2、[ 10 ] [ 15 ] [ 16 ]
- スマルカ4 [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ]
- SMARCB1 , [ 10 ] [ 15 ] [ 16 ]
- SMYD3 , [ 18 ]
- SND1 , [ 19 ]
- SUPT5H、[ 20 ] [ 21 ]
- TAF11 , [ 7 ]
- TBP、[ 7 ]
- TCEA1、[ 22 ] [ 23 ] [ 24 ]
- TCERG1、[ 25 ] および
- ZNF74 [ 26 ]
参考文献
- ^ a b c ENSG00000181222 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000284832, ENSG00000181222 – Ensembl、2017年5月
- ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000005198 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「ヒトPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「Entrez遺伝子:POLR2Aポリメラーゼ(RNA)II(DNA指向性)ポリペプチドA、220kDa」。
- ^ Krum SA, Miranda GA, Lin C, Lane TF (2003年12月). 「BRCA1はプロセッシブRNAポリメラーゼIIと会合する」 . J. Biol. Chem . 278 (52): 52012–20 . doi : 10.1074/jbc.M308418200 . PMID 14506230 .
- ^ a b c d e f g h Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (1997年5月). 「BRCA1はRNAポリメラーゼIIホロ酵素の構成要素である」. Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 94 (11): 5605–10 . Bibcode : 1997PNAS...94.5605S . doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . PMC 20825. PMID 9159119 .
- ^千葉 N, Parvin JD (2001年10月). 「複製阻害後の4つの異なるタンパク質複合体におけるBRCA1の再分布」 . J. Biol. Chem . 276 (42): 38549–54 . doi : 10.1074/jbc.M105227200 . PMID 11504724 .
- ^ Krum SA, Womack JE, Lane TF (2003年9月). 「ウシBRCA1は遺伝毒性ストレスに対して典型的な反応を示すが、in vitro転写活性化活性は低い」 . Oncogene . 22 (38): 6032–44 . doi : 10.1038/sj.onc.1206515 . PMID 12955082 .
- ^ a b c d e f g Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (1998年9月). 「クロマチン構造を変化させる因子を含むヒトRNAポリメラーゼII複合体」 . Mol . Cell. Biol . 18 (9): 5355–63 . doi : 10.1128/MCB.18.9.5355 . PMC 109120. PMID 9710619 .
- ^ Suñé C, Hayashi T, Liu Y, Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA (1997年10月). 「RNAポリメラーゼIIホロ酵素に関連する核タンパク質CA150は、Tat活性化ヒト免疫不全ウイルス1型転写に関与している」 . Mol. Cell. Biol . 17 (10): 6029–39 . doi : 10.1128 / MCB.17.10.6029 . PMC 232452. PMID 9315662 .
- ^ Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ, Florens L, Zybailov B, Swanson SK, Banks CA, Jin J, Cai Y, Washburn MP, Conaway JW, Conaway RC (2004年6月). 「多次元タンパク質同定技術によって同定されたコンセンサス哺乳類メディエーターサブユニットのセット」 . Mol. Cell . 14 (5): 685–91 . doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.006 . PMID 15175163 .
- ^ a b c d Acker J, de Graaff M, Cheynel I, Khazak V, Kedinger C, Vigneron M (1997年7月). 「ヒトRNAポリメラーゼIIサブユニット間の相互作用」 . J. Biol. Chem . 272 (27): 16815–21 . doi : 10.1074/jbc.272.27.16815 . PMID 9201987 .
- ^ Humbert S, Saudou F (2002年5月). 「SCA1における細胞特異性に向けて」. Neuron . 34 ( 5): 669–70 . doi : 10.1016/s0896-6273(02)00715-8 . PMID 12062012. S2CID 15993809 .
- ^ a b c Sif S, Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE (2001年3月). 「mSin3A含有Brg1およびhBrmクロマチンリモデリング複合体の精製と特性解析」 . Genes Dev . 15 (5): 603–18 . doi : 10.1101/gad.872801 . PMC 312641. PMID 11238380 .
- ^ a b c Wang W、Côté J、Xue Y、Zhou S、Khavari PA、Biggar SR、Muchardt C、Kalpana GV、Goff SP、Yaniv M、Workman JL、Crabtree GR (1996 年 10 月)。「哺乳動物のSWI-SNF複合体の精製と生化学的不均一性」。エンボ J . 15 (19): 5370–82 .土井: 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00921.x。PMC 452280。PMID 8895581。
- ^ Zhao K, Wang W, Rando OJ, Xue Y, Swiderek K, Kuo A, Crabtree GR (1998年11月). 「Tリンパ球受容体シグナル伝達後のSWI/SNF様BAF複合体のクロマチンへの迅速かつホスホイノシトール依存的な結合」 . Cell . 95 (5): 625–36 . doi : 10.1016 / s0092-8674(00)81633-5 . PMID 9845365. S2CID 3184211 .
- ^ Hamamoto R, Furukawa Y, Morita M, Iimura Y, Silva FP, Li M, Yagyu R, Nakamura Y (2004年8月). 「SMYD3は癌細胞の増殖に関与するヒストンメチルトランスフェラーゼをコードする」Nat. Cell Biol . 6 (8): 731–40 . doi : 10.1038 / ncb1151 . PMID 15235609. S2CID 13456531 .
- ^ヤン J、エイトマキ S、ペス M、カーター K、サーリネン J、カルッキネン N、キーフ E、シルヴェンノイネン O (2002 年 9 月)。「STAT6とRNAポリメラーゼIIを架橋するSTAT6のコアクチベーターとしてのp100の同定」。エンボ J . 21 (18): 4950– 8.土井: 10.1093/emboj/cdf463。PMC 126276。PMID 12234934。
- ^ Kim JB, Yamaguchi Y, Wada T, Handa H, Sharp PA (1999年9月). 「Tat-SF1タンパク質はRAP30およびヒトSPT5タンパク質と会合する」. Mol . Cell. Biol . 19 (9): 5960–8 . doi : 10.1128/mcb.19.9.5960 . PMC 84462. PMID 10454543 .
- ^和田 哲、高木 哲、山口 裕、フェルダス A、今井 達、廣瀬 慎、杉本 哲、矢野 K、ハートツォッグ GA、ウィンストン F、ブラトフスキー S、半田 H (1998 年 2 月)。「DSIF、RNA ポリメラーゼ II の処理能力を制御する新規な転写伸長因子は、ヒト Spt4 および Spt5 ホモログで構成されています。 」遺伝子開発。12 (3): 343–56 .土井: 10.1101/gad.12.3.343。PMC 316480。PMID 9450929。
- ^ Conaway RC, Kong SE, Conaway JW (2003年8月). 「TFIISとGreB:似たような性質を持つ2つの転写伸長因子、粘着性フィンガー」 . Cell . 114 ( 3): 272–4 . doi : 10.1016/S0092-8674(03)00607-X . PMID 12914690. S2CID 14209300 .
- ^ Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (1998年10月). 「FCP1は、RNAポリメラーゼIIOのカルボキシル末端ドメインを脱リン酸化させるヒトタンパク質ホスファターゼのRAP74相互作用サブユニットである」 . J. Biol. Chem . 273 (42): 27593– 601. doi : 10.1074/jbc.273.42.27593 . PMID 9765293 .
- ^ Pan G, Aso T, Greenblatt J (1997年9月). 「プロモーター特異的な転写開始能を持ち、転写活性化因子に応答するヒトRNAポリメラーゼIIホロ酵素と伸長因子TFIISおよびエロンギンAとの相互作用」 . J. Biol. Chem . 272 (39): 24563–71 . doi : 10.1074/jbc.272.39.24563 . PMID 9305922 .
- ^ Carty SM, Goldstrohm AC, Suñé C, Garcia-Blanco MA, Greenleaf AL (2000年8月). 「核機能を組織化するタンパク質相互作用モジュール:CA150のFFドメインはRNAポリメラーゼIIのリン酸化CTDに結合する」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 ( 16): 9015–20 . Bibcode : 2000PNAS...97.9015C . doi : 10.1073/pnas.160266597 . PMC 16813. PMID 10908677 .
- ^ Grondin B, Côté F, Bazinet M, Vincent M, Aubry M (1997年10月). 「KRAB/Cys2-His2 ジンクフィンガータンパク質 ZNF74 と高リン酸化RNAポリメラーゼII最大サブユニットとの直接相互作用」 . J. Biol. Chem . 272 (44): 27877–85 . doi : 10.1074/jbc.272.44.27877 . PMID 9346935 .
さらに詳しい情報