ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
POP1 識別子 エイリアス POP1 、POP1ホモログ、リボヌクレアーゼP/MRPサブユニット、ANXD2 外部ID オミム :602486; MGI : 1914974; ホモロジーン :41000; ジーンカード :POP1; OMA :POP1 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 15番染色体(マウス) [2] バンド 15|15 B3.1 始める 34,495,450 bp [2] 終わり 34,530,794 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 睾丸 生殖腺 子宮内膜間質細胞 神経節隆起 心室帯 ランゲルハンス島 アキレス腱 心臓の頂点 顆粒球 直腸
上位の表現 接合子 一次卵母細胞 手 心室帯 胚葉上層 胚の尾 吻側回遊流 二次卵母細胞 近位尿細管 レンズ
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バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 リボヌクレアーゼP活性 加水分解酵素活性 リボヌクレアーゼMRP活性 RNA結合 細胞成分 核小体リボヌクレアーゼP複合体 核 リボヌクレアーゼMRP複合体 核質 細胞外空間 核小体 ミトコンドリア ゴルジ体 細胞内膜小器官 多量体リボヌクレアーゼP複合体 生物学的プロセス tRNA分解プロセス RNA処理 RNAホスホジエステル結合の加水分解 RNAホスホジエステル結合加水分解、エンドヌクレアーゼ tRNAの処理 tRNA 5'リーダー除去 出典:Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001145860 NM_001145861 NM_015029
RefSeq(タンパク質) NP_001139332 NP_001139333 NP_055844 NP_055844.2
場所(UCSC) 8章: 98.12 – 98.16 Mb 15章: 34.5 – 34.53 MB PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
リボヌクレアーゼP/MRPタンパク質サブユニットPOP1 は、ヒトでは POP1 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
関数 POP1は、ミトコンドリアRNA処理のための エンドリボヌクレアーゼ複合体と リボヌクレアーゼP複合体という、2つの異なる核小体 リボ核 タンパク質 複合体 を構成するタンパク質サブユニットです 。このタンパク質は核に局在し、RNA前駆体の処理において機能する リボヌクレアーゼ です。 [7]
臨床的意義 POP1は結合組織疾患患者の自己抗原でもある。POP1遺伝子の変異は重度の無呼吸性骨 異形成症 を引き起こす。 [8]
相互作用 POP1(遺伝子)はPOP4 と 相互作用する ことが示されている 。 [9]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000104356 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000022325 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Pluk H、van Eenennaam H、Rutjes SA、Pruijn GJ、van Venrooij WJ (1999 年 4 月)。 「ヒトRNase MRPリボ核タンパク質複合体におけるRNA-タンパク質相互作用」。 RNA 。 5 (4): 512–24 . 土井 :10.1017/S1355838299982079。 PMC 1369778 。 PMID 10199568。 ^ Lygerou Z, Pluk H, van Venrooij WJ, Seraphin B (1997年1月). 「hPop1:ヒトRNase PおよびRNase MRPリボ核タンパク質に共通する自己抗原性タンパク質サブユニット」. EMBO J. 15 ( 21): 5936–48 . doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00980.x. PMC 452370. PMID 8918471 . ^ 「Entrez Gene: POP1による前駆体1、リボヌクレアーゼP/MRPサブユニットの処理(S. cerevisiae)」。 ^ Glazov EA, Zankl, A, Donskoi, M, Kenna, TJ, Thomas, GP, Clark, GR, Duncan, EL, Brown, MA (2011年3月). 「四人家族における全エクソーム再配列解析により、POP1変異が新規骨格異形成症の原因であることが特定された」. PLOS Genetics . 7 (3) e1002027. doi : 10.1371/journal.pgen.1002027 . PMC 3063761. PMID 21455487 . ^ Welting TJ, van Venrooij Walther J, Pruijn Ger JM (2004). 「ヒトRNase MRPリボ核タンパク質複合体のサブユニット間の相互作用」. Nucleic Acids Res . 32 (7). イギリス: 2138–46 . doi :10.1093/nar/gkh539. PMC 407822. PMID 15096576 .
さらに読む 野村 暢、永瀬 剛、宮島 暢、他 (1995). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. II. ヒト細胞株KG-1由来のcDNAクローン解析により推定された40個の新規遺伝子(KIAA0041-KIAA0080)のコード配列」. DNA Res . 1 (5): 223–9 . doi : 10.1093/dnares/1.5.223 . PMID 7584044. Schmiedeknecht G, Büchler C, Schmitz G (1998). 「双方向プロモーターがp14.5遺伝子をRNase PおよびRNase MRPタンパク質サブユニットhPOP1遺伝子に連結する」 Biochem. Biophys. Res. Commun . 241 (1): 59– 67. doi :10.1006/bbrc.1997.7772. PMID 9405234. Dundr M, Olson MO (1999). 「部分的にプロセシングされたpre-rRNAは、有糸分裂中の核小体由来のフォーカスにおいてプロセシング成分と共存して保存される」 Mol. Biol. Cell . 9 (9): 2407–22 . doi :10.1091/mbc.9.9.2407. PMC 25507. PMID 9725903 . Jiang T, Guerrier-Takada C, Altman S (2001). 「ヒト核RNase Pサブユニットにおけるタンパク質-RNA相互作用」 RNA . 7 (7): 937–41 . doi :10.1017/S1355838201010299. PMC 1370153. PMID 11455963 . van Eenennaam H, van der Heijden A, Janssen RJ, et al. (2002). 「基本ドメインは、複合体の会合とは独立して、RNase MRP複合体のタンパク質サブユニットを核小体へ誘導する」 Mol. Biol. Cell . 12 (11): 3680–9 . doi :10.1091/mbc.12.11.3680. PMC 60285. PMID 11694598 . Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. (2002). 「ヒト核小体の指向性プロテオーム解析」. Curr. Biol . 12 (1): 1– 11. Bibcode :2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Welting TJ, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2004). 「ヒトRNase MRPリボ核タンパク質複合体のサブユニット間の相互作用」. Nucleic Acids Res . 32 (7): 2138–46 . doi :10.1093/nar/gkh539. PMC 407822. PMID 15096576 . Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). 「HeLa細胞核リン酸化タンパク質の大規模解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5 . Bibcode :2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 . Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). 「核小体プロテオームダイナミクス」. Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740. Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」 Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. Welting TJ, Kikkert BJ, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2006). 「タンパク質サブユニットとヒトRNase MRPおよびRNase P複合体との異なる会合」. RNA . 12 (7): 1373–82 . doi :10.1261/rna.2293906. PMC 1484433. PMID 16723659 . この記事には、 パブリック ドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。