RASGRP1

RASGRP1
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	4L9M、4L9U
識別子
エイリアス	RASGRP1、CALDAG-GEFI、CALDAG-GEFII、RASGRP、hRasGRP1、RAS グアニル放出タンパク質 1、IMD64
外部ID	オミム：603962; MGI : 1314635;ホモロジーン: 4195;遺伝子カード: RASGRP1; OMA :RASGRP1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	15番染色体（ヒト）
終わり	38,565,575 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	染色体2（マウス）
終わり	117,173,482 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	橋; ; 小脳虫部; ; ブロードマン野23; ; 視床の外側核群; ; 内皮細胞; ; ブロードマン領域46; ; 嗅内皮質; ; 小脳半球; ; 眼窩前頭皮質; ; 中側頭回;
	上位の表現
	嗅結節; ; 外側膝状体; ; 内側膝状体; ; 内側背側核; ; 鉤状部; ; 側坐核; ; 橋核; ; 上前頭回; ; 淡蒼球; ; 一次運動野;
	より多くの参照表現データ
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	カルシウムイオン結合; タンパク質ホモ二量体化活性; ホスファチジルコリン結合; 亜鉛イオン結合; ホスファチジルセリン結合; 金属イオン結合; ジアシルグリセロール結合; 脂質結合; グアニルヌクレオチド交換因子活性; GTPase活性化因子活性;
細胞成分	細胞質; ゴルジ体; 小胞体膜; 膜; 肥満細胞顆粒; ゴルジ膜; 小胞体; 細胞質; 細胞膜; 細胞内解剖学的構造;
生物学的プロセス	細胞分化; タンパク質リン酸化の正の制御; 胸腺におけるT細胞分化の正の調節; 細胞内シグナル伝達; ホスホリパーゼC活性の調節; MAPキナーゼ活性の正の調節; ナチュラルキラー細胞分化の正の調節; 抗原刺激に対する炎症反応; 微小管に沿った小胞輸送; GTPase活性の活性化; GTPase活性の調節; サイトカイン産生; Rasタンパク質シグナル伝達の正の制御; ナチュラルキラー細胞活性化の正の調節; JNKカスケードの正の制御; 分泌顆粒の局在; MAPKカスケード; ホスファチジルイノシトール3キナーゼシグナル伝達の調節; GTPase活性の正の調節; 顆粒球マクロファージコロニー刺激因子産生の正の調節; タンパク質複合体のオリゴマー化; ERK1およびERK2カスケードの正の制御; ERK1とERK2カスケードの調節; 腫瘍壊死因子産生の正の調節; Rasタンパク質シグナル伝達; 肥満細胞の脱顆粒; p38MAPKカスケードの制御; ナチュラルキラー細胞を介した細胞傷害の正の制御; シグナル伝達; 低分子GTPaseを介したシグナル伝達;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	10125
	19419
	ENSG00000172575
	ENSMUSG00000027347
	O95267
	Q9Z1S3
	NM_001128602 ; NM_001306086 ; NM_005739
	NM_011246
	NP_001122074 ; NP_001293015 ; NP_005730
	NP_035376
	ウィキデータ
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RASグアニル放出タンパク質1は、ヒトではRASGRP1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

関数

RASグアニルヌクレオチド放出タンパク質（RASGRP）は、Rasスーパーファミリーのグアニンヌクレオチド交換因子（GEF）ドメインを有する遺伝子ファミリーのメンバーです。RASGRPは、ジアシルグリセロール（DAG ）制御性のヌクレオチド交換因子として機能し、結合した GDPを GTPに交換することでRasを特異的に活性化します。RASGRPはErk/MAPキナーゼカスケードを活性化し、T細胞およびB細胞の分化、恒常性維持、分化を制御します。^[7]

遺伝子

異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシングによる転写バリアントが同定されている。対応するラット遺伝子rbc7は5'-エクソンを欠失しており、これは90kDのタンパク質をコードすると予測されるより大きなラット転写産物の5'-および3'-切断型である。この短い転写産物はヒトでは発見されていない。^[7]

臨床的意義

2016年11月、12歳の患者が反復性感染症のため入院しました。科学者たちは、原因として遺伝的問題が考えられています。より具体的には、RASGRP1遺伝子の欠陥により不活性化していることが遺伝的原因です。

RASGRP1はナチュラルキラー細胞のダイニンの機能に関与しています。ダイニンはモータータンパク質であるため、細胞内の元素を循環させる役割を担っています。オレンジ博士の研究室での研究により、ナチュラルキラー細胞の欠陥とダイニンの機能的関連性が明らかになり、他の観察結果と併せて、医師たちは患者の治療にレナリドミドという薬剤を試しました。この薬剤は、RASGRP1変異による特定の影響を回復させることができました。

参考文献

^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000172575 – Ensembl、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000027347 – Ensembl、2017年5月
^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ Bottorff D, Ebinu J, Stone JC (1999年5月). 「Ras活性化因子RasGRP：マウスおよびヒトのcDNA配列と染色体位置」. Mamm Genome . 10 (4): 358–61 . doi :10.1007/s003359901001. PMID 10087292. S2CID 34266456.
^ Kawasaki H, Springett GM, Toki S, Canales JJ, Harlan P, Blumenstiel JP, Chen EJ, Bany IA, Mochizuki N, Ashbacher A, Matsuda M, Housman DE, Graybiel AM (1998年11月). 「基底核に高度に濃縮されたRapグアニンヌクレオチド交換因子」. Proc Natl Acad Sci USA . 95 (22): 13278–83 . Bibcode :1998PNAS...9513278K. doi : 10.1073/pnas.95.22.13278 . PMC 23782. PMID 9789079 .
^ abc 「Entrez Gene: RASGRP1 RASグアニル放出タンパク質1（カルシウムおよびDAG調節）」。

さらに読む

Dower NA, Stang SL, Bottorff DA, Ebinu JO, Dickie P, Ostergaard HJ, Stone JC (2000). 「RasGRPはマウス胸腺細胞の分化とTCRシグナル伝達に必須である」. Nature Immunology . 1 (4): 317–21 . doi :10.1038/79766. PMID 11017103. S2CID 7724240.
Priatel JJ, Teh SJ, Dower NA, Stone JC, et al. (2002). 「RasGRP1はT細胞の発達、恒常性、分化に重要な低グレードTCRシグナルを伝達する」. Immunity . 17 (5): 617–27 . doi : 10.1016/S1074-7613(02)00451-X . PMID 12433368.
Priatel JJ, Chen X, Zenewicz LA, Shen H, Harder KW, Horwitz MS, et al. (2007). 「RasGRP1を欠損したマウスの慢性免疫不全はCD4 T細胞の免疫活性化と疲弊を引き起こす」J. Immunol . 179 (4): 2143–52 . doi : 10.4049/jimmunol.179.4.2143 . PMID 17675473.
Priatel JJ, Chen X, Dhanji S, Abraham N, et al. (2006). 「RasGRP1はCD4 T細胞の発達に重要な分化促進TCRシグナルを伝達する」J. Immunol . 177 (3): 1470–80 . doi : 10.4049/jimmunol.177.3.1470 . PMID 16849453.
Priatel JJ, Chen X, Huang YH, Chow MT, Zenewicz LA, Coughlin JJ, Shen H, Stone JC, Tan R, et al. (2010). 「RasGRP1はナイーブCD8 T細胞による抗原誘導性発達プログラミングを制御する」J. Immunol . 184 (2): 666– 76. doi : 10.4049/jimmunol.0803521 . PMID 20007535.
Ebinu JO, Bottorff DA, Chan EY, et al. (1998). 「RasGRP：カルシウムおよびジアシルグリセロール結合モチーフを有するRasグアニルヌクレオチド放出タンパク質」. Science . 280 (5366): 1082–6 . Bibcode :1998Sci...280.1082E. doi :10.1126/science.280.5366.1082. PMID: 9582122.
Topham MK, Prescott SM (2001). 「ジアシルグリセロールキナーゼζは新たなメカニズムによってRasの活性化を制御する」. J. Cell Biol . 152 (6): 1135–43 . doi :10.1083/jcb.152.6.1135. PMC 2199204. PMID 11257115 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Bivona TG, Pérez De Castro I, Ahearn IM, et al. (2003). 「ホスホリパーゼCγはRasGRP1を介してゴルジ体上のRasを活性化する」Nature 424 (6949): 694–8 . Bibcode :2003Natur.424..694B. doi :10.1038/nature01806. PMID : 12845332. S2CID : 4403046.
Madani S, Hichami A, Cherkaoui-Malki M, et al. (2004). 「オメガ3およびオメガ6脂肪酸を含むジアシルグリセロールはRasGRPに結合し、MAPキナーゼの活性化を調節する」J. Biol. Chem . 279 (2): 1176–83 . doi : 10.1074/jbc.M306252200 . PMID 14583629.
Klinger MB, Guilbault B, Goulding RE, Kay RJ (2005). 「RasGRP1の発現調節異常はT細胞受容体とは独立して胸腺リンパ腫の発生を誘導する」Oncogene . 24 (16): 2695–704 . doi :10.1038/sj.onc.1208334. PMID 15829980. S2CID 23262099.
Liu Y, Zhu M, Nishida K, et al. (2007). 「マスト細胞機能とIgE介在性アレルギー反応におけるRasGRP1の重要な役割」. J. Exp. Med . 204 (1): 93– 103. doi :10.1084/jem.20061598. PMC 2118421. PMID 17190838 .
Roose JP, Mollenauer M, Ho M, et al. (2007). 「2種類のRas活性化因子、RasGRPとSOSの異常な相互作用が、リンパ球における高感度かつ強力なRas活性化を確立する」Mol. Cell. Biol . 27 (7): 2732–45 . doi :10.1128/MCB.01882-06. PMC 1899892. PMID 17283063 .
Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」Mol. Syst. Biol . 3 (1) 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .
Pasvolsky R, Feigelson SW, Kilic SS, et al. (2007). 「LAD-III症候群は、リンパ球、好中球、および血小板におけるRap-1活性化因子CalDAG-GEFIの発現不全と関連する」J. Exp. Med . 204 (7): 1571–82 . doi :10.1084/jem.20070058. PMC 2118641. PMID 17576779 .
Kosco KA, Cerignoli F, Williams S, et al. (2007). 「SKAP55はRasGRP1に結合することで、T細胞抗原受容体誘導性Ras-Erk-AP1経路活性化を調節する」Mol. Immunol . 45 (2): 510–22 . doi :10.1016/j.molimm.2007.05.024. PMID 17658605.
Yasuda S, Stevens RL, Terada T, et al. (2007). 「全身性エリテマトーデス患者サブセットにおけるRasグアニルヌクレオチド放出タンパク質1の発現異常」J. Immunol . 179 (7): 4890–900 . doi : 10.4049 /jimmunol.179.7.4890 . PMID 17878389.

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザにおける RASGRP1 ヒト遺伝子の位置。
UCSC ゲノムブラウザにおける RASGRP1 ヒト遺伝子の詳細。

この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000172575 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000027347 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid10087292-5] Bottorff D, Ebinu J, Stone JC (1999年5月). 「Ras活性化因子RasGRP：マウスおよびヒトのcDNA配列と染色体位置」. Mamm Genome . 10 (4): 358–61 . doi :10.1007/s003359901001. PMID 10087292. S2CID 34266456.

[pmid9789079-6] Kawasaki H, Springett GM, Toki S, Canales JJ, Harlan P, Blumenstiel JP, Chen EJ, Bany IA, Mochizuki N, Ashbacher A, Matsuda M, Housman DE, Graybiel AM (1998年11月). 「基底核に高度に濃縮されたRapグアニンヌクレオチド交換因子」. Proc Natl Acad Sci USA . 95 (22): 13278–83 . Bibcode :1998PNAS...9513278K. doi : 10.1073/pnas.95.22.13278 . PMC 23782. PMID 9789079 .

[entrez-7] 「Entrez Gene: RASGRP1 RASグアニル放出タンパク質1（カルシウムおよびDAG調節）」。