リチャード・レンスキー

リチャード・E・レンスキー
2016年5月26日、リチャード・レンスキー氏と長期保存用フラスコおよびインキュベーター
生まれる（1956年8月13日）1956年8月13日
教育ノースカロライナ大学チャペルヒル校オーバリン大学
知られている大腸菌の長期進化実験
両親
親族リチャード・C・レンスキー（曽祖父）、ロイス・レンスキー（大叔母）
受賞歴NCSEダーウィンの友人賞（2017年）[ 1 ]スウォール・ライト賞（2012年）マッカーサー・フェローシップ（1996年）グッゲンハイム・フェローシップ（1991年）[ 2 ]
科学者としてのキャリア
フィールド進化生物学実験進化微生物学
機関ミシガン州立大学カリフォルニア大学アーバイン校
論文競争と撹乱がオサムシの個体群に与える影響 （1982年）
博士課程の指導教員ネルソン・ヘアストン
その他の学術アドバイザーブルース・レビン（ポストドクターメンター）
博士課程の学生ポール・E・ターナー、ザカリー・ブラント、マイケル・トラヴィサーノ
Webサイトレンズキ.mmg .msu .edu

telliamedrevisited .wordpress .com

the-ltee.org​

リチャード・E・レンスキー（1956年生まれ）は、アメリカの進化生物学者[ 3 ]であり、ミシガン州立大学微生物生態学のジョン・A・ハンナ特別教授である。彼は米国科学アカデミーの会員であり、マッカーサー・フェローでもある。レンスキーは、現在も継続中の研究で最もよく知られている。37年にわたる大腸菌の長期進化実験は、突然変異率、[ 4 ]クローン干渉、[ 5 ]抗生物質耐性、[ 6 ]新しい形質の進化、[ 7 ]種分化など、進化の中核プロセスの理解に役立ってきました。[ 8 ]彼はまた、 Avidaと呼ばれる自己複製生物 を使用してデジタルで進化を研究する先駆的な研究でもよく知られています。

若いころ

リチャード・レンスキーは、社会学者ゲルハルト・レンスキーと詩人ジャン・レンスキーの息子である。 [ 9 ]彼は児童文学作家ロイス・レンスキーの甥、ルター派評論家リチャード・C・H・レンスキーの曾孫、児童発達心理学者アリス・ホニグの義理の息子でもある。彼は1976年にオーバリン大学で学士号を取得し、1982年にノースカロライナ大学で博士号を取得した。 [ 10 ]

科学者としてのキャリア

博士号を取得後、レンスキーはマサチューセッツ大学アマースト校のブルース・レビン研究室で博士研究員として研究を始め、そこで微生物学の研究を始めました。1985年、レンスキーはカリフォルニア大学アーバイン校の生態学・進化生物学部の教授となり、1988年に同大学の准教授に昇進しました。[ 11 ] 1991年、レンスキーはミシガン州立大学に研究室を移し、同大学のNSF微生物生態学科学技術センターに加わりました。レンスキーはオックスフォード大学でロバート・メイと研究を行い、[ 12 ]モンペリエ大学ではイザベル・オリヴィエリの招きで 研究休暇を取得しました。

研究

大腸菌実験

2008年6月25日現在、進化を続ける12種類の大腸菌群

大腸菌の長期進化実験は、リチャード・レンスキーが率いる実験進化の進行中の研究であり、 1988年2月24日から無性生殖を行う大腸菌の12の当初は同一であった集団の遺伝的変化を追跡してきた。 [ 13 ]集団は2022年に75,000世代という節目に達した。[ 14 ]

実験開始以来、レンスキー氏とその同僚は、多様な遺伝的変化を報告してきた。進化的適応の中には、12の集団全てに生じたものもあれば、1つあるいは少数の集団にのみ現れたものもあった。特に注目すべき適応の一つは、好気環境においてクエン酸を炭素源として利用できる大腸菌株の進化である[ 15 ] 。大腸菌の特徴的な特性の一つは、有酸素条件下ではクエン酸をエネルギー源として利用できないことである[ 16 ] 。

Avidaシミュレーション

リチャード・レンスキーは、チャールズ・オフリア、クリス・アダミらと共同で、複雑なシステムの進化を詳細に分析できる人工生命コンピュータプログラムを用いた研究を行ってきた。このシステムでは、ユーザーがランダムな突然変異の頻度を設定でき、仮想世界内で自然選択が働き、有益な形質をもたらす突然変異が促進される（有害な突然変異は排除される）。Avidaと名付けられたこのプログラムは、人工ペトリ皿から始まり、そこで生物が繁殖し、数学的計算を行うことで、複製のためのコンピュータ処理時間の増加という形で報酬を得る。このプログラムは人工生物のコピーにランダムに突然変異を加え、その後、自然選択の対象となる。人工生命が繁殖するにつれて、様々な系統がそれぞれの環境に適応し進化していく。このプログラムは、高度に抽象化された形で、はるかに高速に生物の進化を再現することを目指している。[ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]

メディア

2013年8月、タイタス​​・ブラウンによる科学におけるソーシャルメディアの役割に関するプレゼンテーションに触発され、レンスキーはTelliamed Revisitedでブログを書き始め、@RELenskiとしてツイートし始めた。[ 21 ]

レンスキーの研究は大きな注目を集めており、カール・ジンマーの大腸菌に関する著書『ミクロコスム』やリチャード・ドーキンスの進化の証拠に関する著書『地上最大のショー』でも長々と議論されている。ドーキンスの議論には、レンスキーが2008年にコンサーバペディアの創設者アンドリュー・シュラフリーと交わした対話の説明も含まれている。この対話は、長期進化実験の対象集団の一つにおける好気性クエン酸利用の進化に関するレンスキーの説明に関する報告に対する反応としてシュラフリーが始めたものだった。この同じ発見は後に創造論者のケン・ハムによってビル・ナイとの進化に関する議論の中で引用されている。レンスキーはハムによる自分の研究の引用とハムがそこから導き出した結論を強く批判した。[ 22 ]

2021年、レンスキーはデレク・ミュラーによる長期進化実験についてヴェリタシウムのビデオでインタビューを受け、そのビデオは600万回以上視聴された。[ 23 ]

栄誉

レンスキーは1991年にグッゲンハイムフェローシップ、 1996年にマッカーサーフェローシップを受賞し、2006年には米国科学アカデミーに選出された。[ 24 ]

レンスキーは、アメリカ微生物学会[ 25 ]とアメリカ芸術科学アカデミー[ 26 ]のフェローであり、ミシガン州立大学の微生物生態学のジョン・A・ハンナ特別教授の称号を保持している。[ 27 ] 2012年にはアメリカ生態学会の初代フェローに就任した。[ 28 ]

2010 年 2 月 17 日、彼はBEACON センターとして知られる NSF 科学技術進化研究センターを共同設立しました。

彼は2018年にアメリカ哲学協会に選出された。 [ 29 ]

レンスキーは進化学会から2021年生涯功労賞を受賞した。[ 30 ]

選りすぐりの作品

  • Lenski, RE, M. Travisano. 1994. 「適応と多様化のダイナミクス：細菌集団を用いた10,000世代実験」 米国科学アカデミー紀要91: 6808-6814.
  • Lenski, RE, RM 1994年5月.「寄生虫と病原体における毒性の進化：二つの対立仮説の調和」  Journal of Theoretical Biology 169: 253-265.
  • Bohannan, BJM, RE Lenski. 2000. 遺伝的変化と群集進化の関連性：細菌とバクテリオファージの研究からの知見. エコロジーレターズ3: 362-377.
  • Lenski, RE, C. Ofria, RT Pennock, C. Adami. 2003. 複雑な特徴の進化的起源.  Nature 423: 139-144.
  • Blount, ZD, JE Barrick, CJ Davidson, RE Lenski. 2012. 実験的大腸菌集団における重要なイノベーションのゲノム解析.  Nature 489: 513-518.
  • Wiser, MJ, N. Ribeck, RE Lenski. 2013. 無性生殖個体群における適応の長期的ダイナミクス.  Science 342: 1364-1367.
  • テネイルロン, O., JE バリック, N. リベック, DE デザーレイジ, JL ブランチャード, A. ダスグプタ, GC ウー, S. ウィエルゴス, S. クルヴェイユ, C. メディグ, D. シュナイダー, RE レンスキ. 2016. 50,000世代実験におけるゲノム進化のテンポとモード.  Nature 536: 165-170. [DOI: 10.1038/nature18959]
  • ロソス、JB、R.E.レンスキ編、2016年。『進化は私たちの人生をどう形作るのか：生物学と社会に関するエッセイ』プリンストン大学出版局、プリンストン、ニュージャージー州。
  • ブラント, ZD, RE レンスキ, JB ロソス. 2018. 進化における偶然性と決定論：生命のテープを再生する.  Science 362: eaam5979. [DOI: 10.1126/science.aam5979]

参考文献

  1. ^ 「MSUのリチャード・レンスキー氏が2017年のダーウィンの友人賞を受賞」。
  2. ^ 「ジョン・サイモン・グッゲンハイム財団 | リチャード・E・レンスキー」。
  3. ^ "Richard Lenski" .ミシガン州立大学. 2008年. 2008年9月17日閲覧。
  4. ^テナイヨン、オリヴィエ;バリック、ジェフリー E.リベック、ノア。デセラジ、ダニエル E.ブランチャード、ジェフリー L.ダスグプタ、アウルコ。ウー、ガブリエル C.ヴィエルゴス、セバスチャン。クルヴェイエ、ステファン (2016-08-11)。「50,000世代実験におけるゲノム進化のテンポとモード」。自然。536 (7615): 165–170。ビブコード: 2016Natur.536..165T。土井：10.1038/nature18959。ISSN 0028-0836。PMC 4988878。PMID 27479321。   
  5. ^ Maddamsetti, Rohan; Lenski, Richard E.; Barrick, Jeffrey E. (2015-06-01). 「大腸菌を用いた長期進化実験における適応、クローン干渉、および頻度依存的相互作用」 . Genetics . 200 ( 2): 619– 631. doi : 10.1534/genetics.115.176677 . ISSN 0016-6731 . PMC 4492384. PMID 25911659 .   
  6. ^ Lenski, RE (1998-12-01). 「細菌の進化と抗生物質耐性のコスト」.国際微生物学. 1 (4): 265– 270. ISSN 1139-6709 . PMID 10943373 .  
  7. ^ Blount, Zachary D.; Borland, Christina Z.; Lenski, Richard E. (2008-06-10). 「大腸菌の実験的集団における歴史的偶発性と重要なイノベーションの進化」 . Proceedings of the National Academy of Sciences . 105 (23): 7899– 7906. Bibcode : 2008PNAS..105.7899B . doi : 10.1073/pnas.0803151105 . ISSN 0027-8424 . PMC 2430337. PMID 18524956 .   
  8. ^ Meyer, Justin R.; Dobias, Devin T.; Medina, Sarah J.; Servilio, Lisa; Gupta, Animesh; Lenski, Richard E. (2016-11-24). 「バクテリオファージラムダの異所性および同所性における生態学的種分化」 . Science . 354 (6317): 1301– 1304. Bibcode : 2016Sci...354.1301M . doi : 10.1126/science.aai8446 . ISSN 0036-8075 . PMID 27884940 .  
  9. ^リチャード・レンスキー [@relenski] (2014年8月17日). 「父親の90歳の誕生日にリチャード・レンスキーとゲルハルト・レンスキーが撮った写真」（ツイート） . 2014年8月18日閲覧– Twitter経由.
  10. ^キャンベル, ニール・A.; リース, ジェーン・B. (2005).生物学(第7版). ピアソン, ベンジャミン・カミングス. pp.  538–539 ​​. ISBN 978-0-8053-7146-8。
  11. ^ 「リチャード・レンスキー | 略歴」lenski.mmg.msu.edu . 2024年8月23日閲覧。
  12. ^ Lenski, Richard E.; May, Robert M. (1994-08-07). 「寄生虫と病原体における毒性の進化：二つの競合する仮説の調和」 . Journal of Theoretical Biology . 169 (3): 253– 265. Bibcode : 1994JThBi.169..253L . doi : 10.1006/jtbi.1994.1146 . ISSN 0022-5193 . PMID 7967617 .  
  13. ^ Lenski, Richard E. (2000). 「創始株の起源」 . Richard E. Lenski ホームページ. ミシガン州立大学. 2018年5月31日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2008年6月18日閲覧。
  14. ^ Lenski, Richard (2023年2月15日). 「大腸菌を用いた長期進化実験のデザイン再考」 . Journal of Molecular Evolution . 91 (1): 241– 253. Bibcode : 2023JMolE..91..241L . doi : 10.1007/s00239-023-10095-3 . PMID: 36790511. S2CID : 256869639 .  
  15. ^ Blount, Zachary D.; Borland, Christina Z.; Lenski, Richard E. (2008). 「歴史的偶然性と大腸菌実験集団における重要なイノベーションの進化」 . Proceedings of the National Academy of Sciences . 105 (23): 7899–906 . Bibcode : 2008PNAS..105.7899B . doi : 10.1073 / pnas.0803151105 . JSTOR 25462703. PMC 2430337. PMID 18524956 .   
  16. ^ブラント, ザカリー; ボーランド, クリスティーナ; レンスキー, リチャード (2008年6月10日). 「歴史的偶然性と大腸菌実験集団における重要なイノベーションの進化」. PNAS . 105 ( 23): 7899–7906 . Bibcode : 2008PNAS..105.7899B . doi : 10.1073/pnas.0803151105 . PMC 2430337. PMID 18524956 .  
  17. ^ Lenski, RE; Ofria, C .; Pennock, RT ; Adami, C. (2003). 「複雑な特徴の進化的起源」(PDF) . Nature . 423 (6936): 139– 144. Bibcode : 2003Natur.423..139L . doi : 10.1038/nature01568 . PMID 12736677. S2CID 4401833. 2021年1月21日時点のオリジナル(PDF)からアーカイブ。 2013年8月20日閲覧。  
  18. ^ 「デジタル生物を用いた進化過程の確認」アメリカ科学振興協会。2011年3月21日閲覧。
  19. ^ 「人工生命実験は複雑な機能がどのように進化するかを示す」アメリカ科学振興協会。2011年3月21日閲覧。
  20. ^ Richard E. Lenski、Charles Ofria、Claus O. Wilke、Jia Lan Wang、Christoph Adami (2001-07-19). 「高突然変異率におけるデジタル生物の進化は、最も平坦な生物の生存につながる」 ( PDF) . Nature . 412 (6844): 331–3 . Bibcode : 2001Natur.412..331W . doi : 10.1038/35085569 . PMID 11460163. S2CID 1482925 .  
  21. ^ Richard Lenski (2013年8月19日). 「Welcome to Telliamed Revisited」 .
  22. ^ https://telliamedrevisited.wordpress.com/2014/02/05/ham-on-nye-debate-follow-up-1/、 https://telliamedrevisited.wordpress.com/2014/02/06/ham-on-nye-debate-follow-up-2/、 https://telliamedrevisited.wordpress.com/2014/02/07/zachary-blount-on-ham-on-nye-debate-follow-up-3/
  23. ^ Veritasium (2021年6月16日).最長継続中の進化実験. 2024年8月23日閲覧– YouTubeより.
  24. ^米国科学アカデミー会員リスト、「会員ディレクトリ」、リチャード・E・レンスキー、2006年
  25. ^ 「アメリカ微生物学アカデミー」 ASM.org 2024年8月23日閲覧。
  26. ^ 「Richard E. Lenski | American Academy of Arts and Sciences」 . www.amacad.org . 2024年8月23日. 2024年8月23日閲覧。
  27. ^ 「Richard Lenski | Honored Faculty | Michigan State University」 msu.edu . 2024年8月23日閲覧。
  28. ^ 「ESAフェロー」アメリカ生態学会. 2025年8月16日閲覧。
  29. ^ 「2018年春季会議における新会員の選出」。
  30. ^ 「進化学会」www.evolutionsociety.org . 2021年7月4日閲覧。
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