SFPQ

SFPQ
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 4WII、4WIJ、4WIK
識別子
エイリアス	SFPQ、POMP100、PPP1R140、PSF、スプライシング因子プロリンおよびグルタミンリッチ
外部ID	オミム: 605199 ; MGI : 1918764 ;ホモロジーン: 3714 ;ジーンカード：SFPQ ; OMA : SFPQ - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 染色体1（ヒト）[ 1 ] バンド 1p34.3 始める 35,176,378 bp [ 1 ] 終わり 35,193,446 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 4番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 4 D2.2|4 61.2 cM 始める 1億2702万1324塩基対[ 2 ] 終わり 1億2703万7013bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 上腕二頭筋腱 心室帯 神経節隆起 右卵管 腓骨神経 小脳半球 小脳の右半球 左卵巣 右卵巣 精子 上位の表現 胚の尾 性器結節 心室帯 下顎突出 吻側回遊流 上顎突出 胚葉上層 腹壁 神経節隆起 網膜の神経層 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 ヒストン脱アセチル化酵素結合 クロマチン結合 転写シス調節領域結合 タンパク質結合 核酸結合 DNA結合 タンパク質ホモ二量体化活性 RNA結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 Eボックスバインディング 細胞成分 細胞質 パラスペックル 核マトリックス RNAポリメラーゼII転写調節因子複合体 クロマチン 核 核質 細胞外マトリックス 核の粒子 樹状突起細胞質 生物学的プロセス ヒストンH3の脱アセチル化 DNA組み換え 転写の制御、DNAテンプレート リズミカルなプロセス 概日リズムの負の調節 mRNA処理 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 染色体の組織 転写、DNAテンプレート DNA損傷刺激に対する細胞応答 細胞周期の調節 概日リズムの調節 相同組換えによる二本鎖切断修復 RNAスプライシング 酸化ストレス誘導性内因性アポトーシスシグナル伝達経路の正の制御 姉妹染色分体接着の正の調節 転写の負の制御、DNAテンプレート スプライソソームを介した選択的mRNAスプライシング DNA修復 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 自然免疫反応の活性化 免疫システムのプロセス 自然免疫反応 メッセンジャーリボ核タンパク質複合体の樹状突起輸送 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6421 71514 アンサンブル ENSG00000116560 ENSMUSG00000028820 ユニプロット P23246 Q8VIJ6 RefSeq (mRNA) NM_005066 NM_023603 RefSeq（タンパク質） NP_005057 NP_076092 場所（UCSC） 1章: 35.18 – 35.19 Mb 4章: 127.02 – 127.04 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

プロリンおよびグルタミンに富むスプライシング因子は、ヒトではSFPQ遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ]}

相互作用

SFPQはPTBP1、^{[ 5 ] [ 7 ]} NONO、^{[ 8 ]} CDC5L ^{[ 9 ]}およびユビキチンC ^{[ 10 ]}と相互作用することが示されている。

参考文献

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さらに読む

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