SMPD4

SMPD4
識別子
エイリアス	SMPD4、NET13、NSMASE-3、NSMASE3、スフィンゴミエリンホスホジエステラーゼ4、SKNY、NEDMABA、NEDMEBA
外部ID	オミム：610457; MGI : 1924876;ホモロジーン: 9813;ジーンカード：SMPD4; OMA :SMPD4 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	染色体2（ヒト）
終わり	130,182,750 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	16番染色体（マウス）
終わり	17,462,692 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	下垂体; ; 下垂体前葉; ; 小脳の右半球; ; 甲状腺の左葉; ; 子宮頸管; ; 甲状腺の右葉; ; 心臓の頂点; ; 子宮体部; ; 右卵管; ; 左卵巣;
	上位の表現
	胚の尾; ; 耳小胞; ; 性器結節; ; 耳板; ; 球形嚢; ; 胚葉上層; ; 精母細胞; ; 一次視覚野; ; 上前頭回; ; 心室帯;
	より多くの参照表現データ
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	スフィンゴミエリンホスホジエステラーゼ活性; 加水分解酵素活性; 金属イオン結合; スフィンゴミエリンホスホジエステラーゼD活性;
細胞成分	膜の不可欠な構成要素; ゴルジ膜; トランスゴルジネットワーク; ゴルジ体; 小胞体膜; 小胞体; 膜;
生物学的プロセス	セラミドの生合成プロセス; 腫瘍壊死因子に対する細胞反応; スフィンゴミエリン分解過程; スフィンゴ糖脂質の代謝プロセス; グリセロリン脂質の分解プロセス; 代謝;
	出典：Amigo / QuickGO
オルソログ
	55627
	77626
	ENSG00000136699
	ENSMUSG00000005899
	Q9NXE4
	Q6ZPR5
	NM_001171083 ; NM_001171084 ; NM_017751 ; NM_017951
	NM_001164609 ; NM_001164610 ; NM_001164611 ; NM_029945
	NP_001164554 ; NP_060221 ; NP_060421 ; NP_060421.2
	NP_001158081 ; NP_001158082 ; NP_001158083 ; NP_084221
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

SMPD4
識別子
エイリアス	SMPD4、NET13、NSMASE-3、NSMASE3、スフィンゴミエリンホスホジエステラーゼ4、SKNY、NEDMABA、NEDMEBA
外部ID	オミム: 610457 ; MGI : 1924876 ;ホモロジーン: 9813 ;ジーンカード: SMPD4 ; OMA : SMPD4 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	染色体2（ヒト）
終わり	1億3018万2750bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	16番染色体（マウス）
終わり	17,462,692 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	下垂体; ; 下垂体前葉; ; 小脳の右半球; ; 甲状腺の左葉; ; 子宮頸管; ; 甲状腺の右葉; ; 心臓の頂点; ; 子宮体部; ; 右卵管; ; 左卵巣;
	上位の表現
	胚の尾; ; 耳小胞; ; 性器結節; ; 耳板; ; 球形嚢; ; 胚葉上層; ; 精母細胞; ; 一次視覚野; ; 上前頭回; ; 心室帯;
	より多くの参照表現データ
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	スフィンゴミエリンホスホジエステラーゼ活性; 加水分解酵素活性; 金属イオン結合; スフィンゴミエリンホスホジエステラーゼD活性;
細胞成分	膜の不可欠な構成要素; ゴルジ膜; トランスゴルジネットワーク; ゴルジ体; 小胞体膜; 小胞体; 膜;
生物学的プロセス	セラミドの生合成プロセス; 腫瘍壊死因子に対する細胞反応; スフィンゴミエリン分解過程; スフィンゴ糖脂質の代謝プロセス; グリセロリン脂質の分解プロセス; 代謝;
	出典：Amigo / QuickGO
オルソログ
	55627
	77626
	ENSG00000136699
	ENSMUSG00000005899
	Q9NXE4
	Q6ZPR5
	NM_001171083 ; NM_001171084 ; NM_017751 ; NM_017951
	NM_001164609 ; NM_001164610 ; NM_001164611 ; NM_029945
	NP_001164554 ; NP_060221 ; NP_060421 ; NP_060421.2
	NP_001158081 ; NP_001158082 ; NP_001158083 ; NP_084221
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スフィンゴミエリンホスホジエステラーゼ4は、ヒトではSMPD4遺伝子によってコードされる酵素である。^[⁵^]^[⁶^]

参考文献

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000136699 – Ensembl、2017年5月
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^ 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ Krut O, Wiegmann K, Kashkar H, Yazdanpanah B, Krönke M (2006年5月). 「新規腫瘍壊死因子応答性哺乳類中性スフィンゴミエリナーゼ-3はC末端アンカー型タンパク質である」 . The Journal of Biological Chemistry . 281 (19): 13784–93 . doi : 10.1074/jbc.M511306200 . PMID 16517606 .
^ 「Entrez遺伝子：SMPD4スフィンゴミエリンホスホジエステラーゼ4、中性膜（中性スフィンゴミエリナーゼ-3）」。

さらに読む

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996年4月). 「改良されたショットガンライブラリー構築のための「ダブルアダプター」法」.分析生化学. 236 (1): 107–13 . doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
ヒリアー・LD、レノン・G、ベッカー・M、ボナルド・MF、チアペリ・B、チッソー・S、ディートリッヒ・N、デュビューク・T、ファヴェッロ・A、ギッシュ・W、ホーキンス・M、ハルトマン・M、クカバ・T、レイシー・M、ル・M、ル・N、マーディス・E、ムーア・B、モリス・M、パーソンズ・J、プランゲ・C、リフキン・L、ロールフィング・T、シェレンバーグ・K、ベントソアレス M、タン F、ティエリーメグ J、トレバスキス E、アンダーウッド K、ウォルドマン P、ウォーターストン R、ウィルソン R、マーラ M (1996 年 9 月)。「280,000 個のヒト発現配列タグの生成と分析」。ゲノム研究。6 (9): 807–28 .土井: 10.1101/gr.6.9.807。PMID 8889549。
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997年4月). 「大規模連結cDNAシーケンシング」 .ゲノム研究. 7 (4): 353–8 . doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146. PMID 9110174 .
永瀬剛志、菊野亮、石川紀雄、広澤正之、小原修 (2000年2月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 XVI. 脳由来の新規cDNAクローン150個の完全配列。in vitroで巨大タンパク質をコードする」 . DNA Research . 7 (1): 65– 73. doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID 10718198 .
ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ベッヒャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルーム H、ラウバー J、デュスターホフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、メーヴェス HW、オッテンヴェルダー B、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブット R、コーン B、クライン M、プストカ A (2001 年 3 月)。「ヒトの遺伝子とタンパク質のカタログを目指して: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」。ゲノム研究。11 (3): 422–35 .土井: 10.1101/gr.GR1547R。PMC 311072。PMID 11230166。
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Jana A, Pahan K (2004年10月). 「ヒト免疫不全ウイルス1型gp120は、酸化還元制御された中性スフィンゴミエリナーゼ活性化を介してヒト一次ニューロンのアポトーシスを誘導する」 . The Journal of Neuroscience . 24 (43): 9531–40 . doi : 10.1523/JNEUROSCI.3085-04.2004 . PMC 1955476. PMID 15509740 .
木村和也、若松A、鈴木裕、太田隆、西川隆、山下R、山本J、関根M、釣谷和、若栗H、石井S、杉山隆、斉藤和、磯野Y、入江R、櫛田N、米山隆、大塚R、神田K、横井隆、近藤H、我妻M、村川隆、石田S、石橋隆、高橋・藤井A、棚瀬隆、永井和、菊池英、中井和、磯貝哲、菅野Ｓ（2006年1月）。「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定上の代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」。ゲノム研究。16 (1): 55–65 .土井: 10.1101/gr.4039406。PMC 1356129。PMID 16344560。
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」 .分子システム生物学. 3 (1 ) : 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948. PMID 17353931 .

スフィンゴミエリンホスホジエステラーゼ4は、ヒトではSMPD4遺伝子によってコードされる酵素である。^[5]^[6]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000136699 – Ensembl、2017年5月
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さらに読む

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永瀬剛志、菊野亮、石川紀雄、広澤正之、小原修 (2000年2月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 XVI. 脳由来の新規cDNAクローン150個の完全配列はin vitroで巨大タンパク質をコードする」DNA Research . 7 (1): 65– 73. doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID 10718198.
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Lehner B, Sanderson CM (2004年7月). 「ヒトmRNA分解におけるタンパク質相互作用フレームワーク」. Genome Research . 14 (7): 1315–23 . doi :10.1101/gr.2122004. PMC 442147. PMID 15231747 .
Jana A, Pahan K (2004年10月). 「ヒト免疫不全ウイルス1型gp120は、酸化還元制御された中性スフィンゴミエリナーゼ活性化を介してヒト一次ニューロンのアポトーシスを誘導する」. The Journal of Neuroscience . 24 (43): 9531–40 . doi :10.1523/JNEUROSCI.3085-04.2004. PMC 1955476. PMID 15509740 .
木村和也、若松A、鈴木裕、太田隆、西川隆、山下R、山本J、関根M、釣谷和、若栗H、石井S、杉山隆、斉藤和、磯野Y、入江R、櫛田N、米山隆、大塚R、神田K、横井隆、近藤H、我妻M、村川隆、石田S、石橋隆、高橋・藤井A、棚瀬隆、永井和、菊池英、中井和、磯貝哲、菅野 S (2006 年 1 月)。「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定上の代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」。ゲノム研究。16 (1): 55–65。土井:10.1101/gr.4039406。PMC 1356129。PMID 16344560。
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」. Molecular Systems Biology . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948 . PMID 17353931 .

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000136699 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000005899 – Ensembl、2017年5月

[3] 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid16517606-5] Krut O, Wiegmann K, Kashkar H, Yazdanpanah B, Krönke M (2006年5月). 「新規腫瘍壊死因子応答性哺乳類中性スフィンゴミエリナーゼ-3はC末端アンカー型タンパク質である」 . The Journal of Biological Chemistry . 281 (19): 13784–93 . doi : 10.1074/jbc.M511306200 . PMID 16517606 .

[entrez-6] 「Entrez遺伝子：SMPD4スフィンゴミエリンホスホジエステラーゼ4、中性膜（中性スフィンゴミエリナーゼ-3）」。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000136699 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000005899 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid16517606-5] Krut O, Wiegmann K, Kashkar H, Yazdanpanah B, Krönke M (2006年5月). 「新規腫瘍壊死因子応答性哺乳類中性スフィンゴミエリナーゼ-3はC末端アンカー型タンパク質である」. The Journal of Biological Chemistry . 281 (19): 13784–93 . doi : 10.1074/jbc.M511306200 . PMID 16517606.

[entrez-6] 「Entrez遺伝子：SMPD4スフィンゴミエリンホスホジエステラーゼ4、中性膜（中性スフィンゴミエリナーゼ-3）」。

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