非定型SLC

非定型溶質輸送体ファミリー（非定型SLC）は、既知の溶質輸送体ファミリー（SLC）と祖先的な背景を共有する、二次的な活性輸送体または促進輸送体タンパク質であると考えられる新規タンパク質です。しかしながら、SLCの系統体系に基づく名称は付与されておらず、既存のSLCファミリーのいずれにも分類されていません。[1] [2]

非定型主要促進因子スーパーファミリー輸送ファミリー

非定型SLCのほとんどは、主要促進因子スーパーファミリー（MFS）に属するファミリーです。[3]これらの非定型SLCは、既知の溶質輸送体と祖先を共有する、二次的な活性輸送体または促進輸送体タンパク質であると考えられます。[1] [2] [4]しかし、これらはSLCルートシステムに従って命名されておらず、既存のSLCファミリーのいずれにも分類されていません。[1]非定型MFS輸送体ファミリー（ATMF）は、配列の類似性と系統発生の近さに基づいて分類されます。[3]

AMTF家族SLCファミリー
AMTF1MFSD9、MFSD10、MFSD14A、MFSD14BSLC46
AMTF2MFSD8
AMTF3MFSD4A、MFSD4B
AMTF4CLN3
AMTF5MFSD7SLC49
AMTF6MFSD1、MFSD5
AMTF7MFSD12
AMTF8MFSD2A、MFSD2B
AMTF9SV2A、SV2B、SV2C、SVOP、SVOPLSLC22
AMTF10MFSD11、UNC93A、UNC93B1
AMTF11SPNS1、SPNS2、SPNS3
AMTF12MFSD13A
AMTF13MFSD6
AMTF14MFSD6L
AMTF15MFSD3

MFS型の非定型SLCには、OCA2、CLN3、SPNS1、SPNS2、SPNS3、SV2A、SV2B、SV2C、SVOP、SVOPL、MFSD1、MFSD2A、MFSD2B、MFSD3、MFSD4A、[5] MFSD4B、MFSD5、MFSD6、MFSD6L、MFSD8、MFSD9 、 [ 5] MFSD10、 MFSD11 、MFSD12、MFSD13A、MFSD14A、MFSD14B 、 UNC93A [ 6] 、 UNC93B1などがあります。これらはすべて、主要促進因子スーパーファミリーに含まれる非定型SLCです。また、TMEM104（APCクラン）、OCA2（ITクラン）、CLN3（クランを持たない）はヒトでは非典型的なSLCである。[7] [8] [9]

非MFSトランスポートファミリー

非定型SLCのほとんどは主要促進因子スーパーファミリーに属しますが、例外としてTMEM104（APCスーパーファミリー）、OCA2（ITスーパーファミリー）、CLN3（未知のスーパーファミリー）があります。[1]

参考文献

  1. ^ abcd Perland E, Fredriksson R (2017年3月). 「二次能動輸送体の分類システム」. Trends in Pharmacological Sciences . 38 (3): 305– 315. doi :10.1016/j.tips.2016.11.008. PMID  27939446.
  2. ^ ab Sreedharan S, Stephansson O, Schiöth HB, Fredriksson R (2011年6月). 「いくつかの非定型溶質キャリアトランスポーターの長期にわたる進化的保存性と顕著な組織特異性」. Gene . 478 ( 1–2 ): 11–18 . doi :10.1016/j.gene.2010.10.011. PMID  21044875.
  3. ^ ab Perland E, Bagchi S, Klaesson A, Fredriksson R (2017年9月). 「主要促進因子スーパーファミリー型に属する29種類の新規非定型溶質輸送体の特性：進化的保存性、予測構造、および神経細胞における共発現」Open Biology . 7 (9) 170142. doi :10.1098/rsob.170142. PMC 5627054. PMID 28878041  . 
  4. ^ Höglund PJ, Nordström KJ, Schiöth HB, Fredriksson R (2011年4月). 「溶質輸送体ファミリーは驚くほど長い進化の歴史を持ち、人類のファミリーの大部分は左右相称動物の分岐以前から存在していた」. Molecular Biology and Evolution . 28 (4): 1531– 1541. doi :10.1093/molbev/msq350. PMC 3058773. PMID  21186191 . 
  5. ^ ab Perland E, Hellsten SV, Schweizer N, Arapi V, Rezayee F, Bushra M, Fredriksson R (2017). 「2つの新規ヒト非定型SLCトランスポーター、MFSD4AおよびMFSD9の構造予測とマウスにおける神経解剖学的分布」. PLOS ONE . 12 (10) e0186325. Bibcode :2017PLoSO..1286325P. doi : 10.1371/journal.pone.0186325 . PMC 5648162. PMID  29049335 . 
  6. ^ Ceder MM, Lekholm E, Hellsten SV, Perland E, Fredriksson R (2017). 「マウスにおける神経細胞および末梢で発現した膜結合型UNC93Aの栄養素利用への反応」. Frontiers in Molecular Neuroscience . 10 : 351. doi : 10.3389/fnmol.2017.00351 . PMC 5671512. PMID  29163028 . 
  7. ^ 「TMEM104 膜貫通タンパク質104 [ホモ・サピエンス (ヒト)] - 遺伝子 - NCBI」。www.ncbi.nlm.nih.gov . 2022年3月14日閲覧。
  8. ^ 「OCA2 OCA2 メラノソーム膜貫通タンパク質 [ホモサピエンス (ヒト)] - 遺伝子 - NCBI」。www.ncbi.nlm.nih.gov . 2022年3月14日閲覧。
  9. ^ 「CLN3 CLN3リソソーム／エンドソーム膜貫通タンパク質、バテニン [Homo sapiens (ヒト)] - 遺伝子 - NCBI」。www.ncbi.nlm.nih.gov . 2022年3月14日閲覧。
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