SecYタンパク質
| SecYタンパク質/Sec61α | |||||||
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 タンパク質伝導チャネルの構造。[ 1 ] | |||||||
| 識別子 | |||||||
| シンボル | 長官 | ||||||
| ファム | PF00344 | ||||||
| インタープロ | IPR002208 | ||||||
| プロサイト | PDOC00612 | ||||||
| SCOP2 | 1rh5 /スコープ/ SUPFAM | ||||||
| TCDB | 3.A.5 | ||||||
| OPMスーパーファミリー | 19 | ||||||
| OPMタンパク質 | 1rh5 | ||||||
| メンブラノーム | 165 | ||||||
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SecYタンパク質は、細菌のSec輸送経路およびタンパク質分泌ATPase複合体の主要な膜貫通サブユニットであり、 SecYEGトランスロコンとしても知られています。SecYEG複合体の相同体は真核生物および古細菌に存在し、Sec61αとして知られています。[ 2 ]
グラム陰性細菌において、シグナルペプチドを運ぶタンパク質の一部は、プレタンパク質トランスロカーゼ経路を介して内膜を透過して分泌される。タンパク質は細胞質内で前駆体として産生され、膜内のトランスロカーゼ構成要素へと導くためにシャペロンサブユニットを必要とする。 [ 3 ]そこから成熟したタンパク質は外膜へ輸送されるか、ペリプラズムタンパク質として残留する。トランスロカーゼタンパク質サブユニットは細菌染色体上にコードされている。
トランスロカーゼ経路は、シャペロンタンパク質（SecB）、ATPase（SecA）、膜貫通複合体（SecY、SecE、SecG）、そして成熟ペプチドのペリプラズムへの放出を促進する2つの追加膜タンパク質（SecDおよびSecF）を含む7つのタンパク質から構成されています。[ 3 ]シャペロンタンパク質SecB [ 4 ]は、細菌細胞質内で「二量体の二量体」として存在する、高酸性のホモ四量体タンパク質です。SecBは翻訳後にプレタンパク質を折り畳まれていない状態に保ち、これを末梢膜タンパク質ATPase SecAに輸送して分泌させます。[ 5 ]
細胞質領域2と3、およびTMドメイン1、2、4、5、7、および10はよく保存されています。保存された細胞質領域は細胞質分泌因子と相互作用すると考えられており、TMドメインはタンパク質輸出に関与している可能性があります。[ 6 ] SecYは一部の藻類の葉緑体ゲノムにもコードされており、そこでは色素藻類と隠蔽藻類に存在する葉緑体小胞体（CER）の2つの膜を介した原核生物のようなタンパク質輸出システムに関与している可能性があります。[ 7 ]
亜科
ミトコンドリアでは
SecYタンパク質は、最も遺伝子が豊富なミトコンドリアゲノムを持つ2つの真核生物系統であるヤコビ類とマンタモナス・スフィラエナエのミトコンドリアゲノムで発見されました。[ 8 ]
マンタモナスにおけるSecYの発見は、ヤコビッド類におけるこのタンパク質の進化的起源を解明するのに役立ち、アルファプロテオバクテリアへのミッシングリンクとして機能した。[ 8 ]
このドメインを含むヒトタンパク質
参照
参考文献
- ^ Van den Berg B, Clemons WM, Collinson I, Modis Y, Hartmann E, Harrison SC, Rapoport TA (2004年1月). 「タンパク質伝導チャネルのX線構造」. Nature . 427 (6969): 36– 44. Bibcode : 2004Natur.427...36B . doi : 10.1038/ nature02218 . PMID 14661030. S2CID 4360143 .
- ^ Auer J, Spicker G, Böck A (1991年6月). 「古細菌Methanococcus vannieliiにおける真正細菌のsecY相同遺伝子の存在」. Biochimie . 73 (6): 683–8 . doi : 10.1016/0300-9084(91)90048-6 . PMID 1764515 .
- ^ a b Bieker KL, Phillips GJ, Silhavy TJ (1990年6月). 「大腸菌のsec遺伝子とprl遺伝子」. Journal of Bioenergetics and Biomembranes . 22 (3): 291– 310. doi : 10.1007/BF00763169 . PMID 2202721. S2CID 10694864 .
- ^ Driessen AJ (2001年5月). 「SecB、二つの顔を持つ分子シャペロン」(PDF) . Trends in Microbiology . 9 (5): 193–6 . doi : 10.1016/S0966-842X(01)01980-1 . hdl : 11370/4e5ebfac-d58c-42db-b42e-01c22d469a82 . PMID 11336818 .
- ^ Müller JP (1999年7月). 「大腸菌におけるプレタンパク質過剰発現によるSecB合成への影響」. FEMS Microbiology Letters . 176 (1): 219–27 . doi : 10.1111/j.1574-6968.1999.tb13665.x . PMID 10418149 .
- ^ Suh JW, Boylan SA, Thomas SM, Dolan KM, Oliver DB, Price CW (1990年2月). 「枯草菌からのsecYホモログの単離：真正細菌における共通タンパク質輸出経路の証拠」. Molecular Microbiology . 4 (2): 305–14 . doi : 10.1111/j.1365-2958.1990.tb00597.x . PMID 2110998. S2CID 27373166 .
- ^ Douglas SE (1992年2月). 「Cryptomonas phiのプラスチドゲノムにsecYホモログが発見される」 . FEBS Letters . 298 (1): 93–6 . Bibcode : 1992FEBSL.298...93D . doi : 10.1016/0014-5793(92)80029- G . PMID 1544427. S2CID 22351990 .
- ^ a b Moreira, David; Blaz, Jasmin; Kim, Eunsoo; Eme, Laura (2024年8月19日). 「ユニークな祖先由来のタンパク質輸送システムを持つ遺伝子豊富なミトコンドリア」Current Biology . 34 (16): 3812– 3819. Bibcode : 2024CBio...34.3812M . doi : 10.1016/j.cub.2024.07.017 .
さらに読む
- Lewis, AJO; Hegde, RS (2021年12月15日). 「普遍的なタンパク質トランスポーターSecYとYidCの統一的な進化的起源」 . BMC Biology . 19 (1): 266. doi : 10.1186/s12915-021-01171-5 . PMC 8675477. PMID 34911545 .
