シキミ酸キナーゼ
| シキミ酸キナーゼ | |||||||||
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 Erwinia chrysanthemiのシキミ酸キナーゼ | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | スキー | ||||||||
| ファム | PF01202 | ||||||||
| ファム一族 | CL0023 | ||||||||
| インタープロ | IPR000623 | ||||||||
| プロサイト | PDOC00868 | ||||||||
| SCOP2 | 2shk / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| OPMスーパーファミリー | 124 | ||||||||
| OPMタンパク質 | 1e6c | ||||||||
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| シキミ酸キナーゼ | |||||||||
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 結核菌由来のシキミ酸キナーゼの漫画表現。αヘリックスは赤、中央のβシートは黄色、ループは緑で示されている。 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 2.7.1.71 | ||||||||
| CAS番号 | 9031-51-0 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | ブレンダエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZymeビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイクル | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | アミゴー / クイックゴー | ||||||||
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シキミ酸キナーゼ（EC 2.7.1.71）は、シキミ酸のATP依存性リン酸化を触媒し、シキミ酸3-リン酸を生成する酵素です。[1]この反応は、植物や細菌が芳香族アミノ酸や二次代謝物の共通前駆体を合成するために用いるシキミ酸経路[2]の第5段階です。この酵素の系統名はATP:シキミ酸3-ホスホトランスフェラーゼです。一般的に用いられる他の名称には、シキミ酸キナーゼ（リン酸化）やシキミ酸キナーゼIIなどがあります。
背景
シキミ酸経路は7つの酵素反応から成り、ホスホエノールピルビン酸とエリスロース4-リン酸をコリスミ酸に変換します。コリスミ酸は、芳香族アミノ酸であるフェニルアラニン、チロシン、トリプトファンの共通前駆体です。芳香族アミノ酸はタンパク質の合成に使用され、植物、真菌、細菌においては、フェニルプロパノイドやアルカロイドなどの様々な特殊な代謝産物を生成します。コリスミ酸およびこの経路の他のいくつかの中間体は、葉酸、キニン酸、キノンなどの他の代謝産物の前駆体として機能します。この経路においてシキミ酸キナーゼに先行する4つの酵素は、DAHP合成酵素、3-デヒドロキナ酸合成酵素、3-デヒドロキナ酸脱水酵素、およびシキミ酸脱水素酵素であり、シキミ酸キナーゼに後続する2つの酵素は、 EPSP合成酵素とコリスミ酸合成酵素である。真菌および原生生物において、シキミ酸キナーゼはAROM複合体の一部であり、シキミ酸経路の5つの中心的なステップは共存している。[3]この経路は、芳香族アミノ酸を食物から摂取しなければならないヒトなどの動物には見られない。
活動
シキミ酸キナーゼによって触媒される反応を以下に示します。
この反応は、ATPからシキミ酸の3-ヒドロキシル基へのリン酸基の転移を伴う。したがって、シキミ酸キナーゼは、シキミ酸とATPという2つの基質と、シキミ酸3-リン酸とADPという2つの生成物を持つ。[4]
例
このドメインを含むヒトタンパク質には、MAPK7とTHNSL1 が含まれる。
参考文献
- ^ Morell H, Sprinson DB (1968年2月). 「Salmonella typhimuriumのシキミ酸キナーゼアイソザイム」. The Journal of Biological Chemistry . 243 (3): 676–7 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)93656-2 . PMID 4866525.
- ^ Herrmann KM, Weaver LM (1999年6月). 「シキミ酸経路」. Annual Review of Plant Physiology and Plant Molecular Biology . 50 : 473–503 . doi :10.1146/annurev.arplant.50.1.473. PMID 15012217.
- ^ Arora Verasztó H, Logotheti M, Albrecht R, Leitner A, Zhu H, Hartmann MD (2020年7月). 「五官能性AROM複合体の構造と機能ダイナミクス」. Nature Chemical Biology . 16 (9): 973– 978. doi :10.1038/s41589-020-0587-9. PMID 32632294. S2CID 220375879.
- ^ Hartmann MD, Bourenkov GP, Oberschall A, Strizhov N, Bartunik HD (2006年12月). 「結核菌由来シキミ酸キナーゼによるリン酸化転移触媒のメカニズム」. Journal of Molecular Biology . 364 (3): 411–23 . doi :10.1016/j.jmb.2006.09.001. PMID 17020768.
