シグナリングゲートウェイ(ウェブサイト)
Signaling Gatewayは、カリフォルニア大学サンディエゴ校のサンディエゴ・スーパーコンピュータセンターが運営するシグナル伝達経路に特化したウェブポータルです。Alliance for Cellular SignalingとNatureの共同研究によって開始されました[ 1 ]。主な機能はMolecule Pagesデータベースです。
Molecule Pages Database(オンラインデータベースジャーナル)
Signaling Gateway Molecule Pagesは、「細胞シグナル伝達に関与する8000種類以上の哺乳類タンパク質(マウスとヒト)に関する必須情報」を含むデータベースです。[ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]
分子ページのコンテンツは、招待された専門家によって執筆され、査読を受けています。公開されたページは、デジタルオブジェクト識別子(DOI)によって引用可能です。分子ページのすべてのデータは、一般公開されています。
データはPDF、XML、BioPAX / SBPAX、SBMLにエクスポートできます。
MIRIAMレジストリの詳細。[ 5 ]
公開された分子ページの一部
- Robitaille, Aaron; Hall, Michael (2008). 「MTOR」. AfCS-Nature Molecule Pages . doi : 10.1038/mp.a000094.01 .
- 武丸健一 (2006). 「カテニンβ」. AfCS-Nature Molecule Pages . doi : 10.1038/mp.a000506.01 .
- Rousseau, Simon (2011). 「P38αMAPキナーゼ」. AfCS-Nature Molecule Pages . doi : 10.1038/mp.a001717.01 .
- 加藤勝 (2008). 「Frizzled 7」. AfCS-Nature Molecule Pages . doi : 10.1038/mp.a000965.01 .
参考文献
- ^ Alison Abbott (2002). 「細胞シグナル伝達のための同盟:未知の領域へ」 . Nature . 420 (6916): 600– 601. Bibcode : 2002Natur.420..600A . doi : 10.1038/420600a . PMID 12478259. S2CID 4428387 .
- ^ Dinasarapu AR, Saunders B, Ozerlat I, Azam K, Subramaniam S (2011). 「シグナリングゲートウェイ分子ページ - データモデルの観点」 .バイオインフォマティクス. 27 (12): 1736– 1738. doi : 10.1093/bioinformatics/btr190 . PMC 3106186. PMID 21505029 .
- ^ Brian Saunders、Stephen Lyon、Matthew Day、Brenda Riley、Emily Chenette、Shankar Subramaniam (2008). 「The Molecule Pages database」 . Nucleic Acids Research . 36 (suppl 1) (データベース号): D700– D706. doi : 10.1093/nar/gkm907 . PMC 2238911. PMID 17965093 .
- ^ Joshua Li; Yuhong Ning; Warren Hedley; Brian Saunders; Yongsheng Chen; Nicole Tindill; Timo Hannay; Shankar Subramaniam (2002). 「分子ページデータベース」 . Nature . 420 (6916): 716– 717. Bibcode : 2002Natur.420..716L . doi : 10.1038/nature01307 . PMID 12478304 .
- ^ MIRIAMレジストリの一部としてのSGMP