TARBP2

TARBP2
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2CPN、3ADL、3LLH、4WYQ
識別子
エイリアス	TARBP2、LOQS、TRBP、TRBP1、TRBP2、RISCローディング複合体RNA結合サブユニット、RISCローディング複合体のTARBP2サブユニット
外部ID	オミム: 605053 ; MGI : 103027 ;ホモロジーン: 7562 ;ジーンカード：TARBP2 ; OMA : TARBP2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 12番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 12q13.13 始める 53,500,921 bp [ 1 ] 終わり 53,506,431 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 15番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 15 F3|15 57.65 cM 始める 102,426,627 bp [ 2 ] 終わり 102,432,111 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 小脳の右半球 右卵管 甲状腺の右葉 右副腎 右副腎皮質 横行結腸粘膜 顆粒球 甲状腺の左葉 肝臓の右葉 膵臓の体 上位の表現 精母細胞 卵黄嚢 睾丸 精子細胞 胚葉上層 胚 中脳 神経管 心臓 胚 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質N末端結合 タンパク質結合 siRNA結合 RNA結合 酵素結合 プレmRNA結合 二本鎖RNA結合 同一のタンパク質結合 タンパク質ホモ二量体化活性 プレmiRNA結合 miRNA結合 細胞成分 細胞質 細胞質 細胞質の核周囲領域 核 核質 核体 RISCローディング複合体 RISC複合体 生物学的プロセス ウイルス転写の調節 タンパク質キナーゼ活性の負の調節 多細胞生物の成長 翻訳の積極的な規制 単一受精 宿主によるウイルスに対する防御反応の負の調節 精子細胞の発達 ウイルスゲノム複製の正の制御 翻訳の規制 miRNAによる遺伝子サイレンシングに関与するmiRNAの産生 miRNA代謝プロセス 遺伝子サイレンシング RNA干渉に関与するsiRNAの産生 pre-miRNA処理 miRNAによる遺伝子サイレンシングに関与するmiRNAの産生の制御 骨格筋組織の再生 筋細胞分化の正の調節 神経前駆細胞の増殖 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6895 21357 アンサンブル ENSG00000139546 ENSMUSG00000023051 ユニプロット Q15633 P97473 RefSeq (mRNA) NM_004178 NM_134323 NM_134324 NM_001253795 NM_009319 RefSeq（タンパク質） NP_004169 NP_599150 NP_599151 NP_001240724 NP_033345 場所（UCSC） 12章: 53.5 – 53.51 Mb 15章: 102.43 – 102.43 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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RISCローディング複合体サブユニットTARBP2は、ヒトではTARBP2遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ]}

関数

後天性免疫不全症候群（AIDS）の原因物質であるHIV-1は、複製サイクル中に染色体に組み込まれたDNAを生成するRNAゲノムを含む。転写活性化因子TatによるHIV-1遺伝子発現の活性化は、転写開始部位の下流に位置するRNA調節エレメント（TAR）に依存する。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、HIV-1 TAR RNA調節エレメントのバルジとループの間に結合し、ウイルスのTatタンパク質と相乗的にHIV-1遺伝子発現を活性化する。選択的スプライシングの結果、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが生じる。この遺伝子には擬似遺伝子も存在する。^{[ 6 ]}

相互作用

TARBP2はプロテインキナーゼR ^{[ 7 ] [ 8 ]}およびRBM14 ^{[ 9 ]}と相互作用することが示されている。

参考文献

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さらに読む

• Cosentino GP, Venkatesan S, Serluca FC, Green SR, Mathews MB, Sonenberg N (1995年10月). 「二本鎖RNA依存性プロテインキナーゼとTAR RNA結合タンパク質はin vivoでホモ二量体およびヘテロ二量体を形成する」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 92 (21): 9445–9 . Bibcode : 1995PNAS...92.9445C . doi : 10.1073/pnas.92.21.9445 . PMC  40818. PMID  7568151 .
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