ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
ヴァンプ7 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス VAMP7 、SYBL1、TI-VAMP、TIVAMP、VAMP-7、小胞関連膜タンパク質7 外部ID OMIM : 300053; MGI : 1096399; ホモロジーン : 4121; ジーンカード ：VAMP7; OMA :VAMP7 - オルソログ RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） 上位の表現 二次卵母細胞 単球 内皮細胞 臓側胸膜 壁側胸膜 糸球体 海綿骨 腎臓尿細管 後腎糸球体 脛骨
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バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 SNARE結合 SNAP受容体活性 シンタキシン結合 タンパク質結合 細胞成分 細胞外エクソソーム 輸送小胞 仮足 細胞質 輸送小胞膜 シナプス 膜の不可欠な構成要素 トランスゴルジネットワーク アズール顆粒膜 ゴルジ体 細胞接合 血小板α顆粒 細胞内膜小器官 ラメリポディウム 細胞の頂端部分 ニューロン投射 膜 細胞表面 食細胞小胞膜 小胞体 細胞質の核周囲領域 小胞体膜 分泌顆粒 分泌顆粒膜 リソソーム 細胞質小胞 後期エンドソーム膜 エンドソーム 貪食小胞 細胞膜 リソソーム膜 SNARE複合体 クラスリン被覆小胞膜 シナプス小胞 シナプス小胞膜の不可欠な構成要素 海馬苔状線維からCA3シナプスへ 生物学的プロセス オートファゴソームの成熟 微小管に沿った小胞輸送 ゴルジ体と小胞の融合 ゴルジ体から細胞膜へのタンパク質輸送 肥満細胞によるヒスタミン分泌の正の調節 SNARE複合体の組み立て カルシウムイオン制御によるエキソサイトーシス トリグリセリド輸送 小胞体からゴルジ小胞を介した輸送 ゴルジ体後小胞を介した輸送 液胞膜へのタンパク質標的化の制御 エキソサイトーシス ナチュラルキラー細胞の脱顆粒 貪食、貪食 タンパク質輸送 エンドソームからリソソームへの輸送 樹状突起形態形成の正の調節 小胞融合 小胞輸送 好中球脱顆粒 好酸球脱顆粒 エンドサイトーシス 膜組織 輸送 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001145149 NM_001185183 NM_005638
NM_001302138 NM_011515 NM_001359151
RefSeq（タンパク質） NP_001138621 NP_001172112 NP_005629
NP_001289067 NP_035645 NP_001346080
場所（UCSC） 染色体X: 155.88 – 155.94 Mb 該当なし PubMed 検索 [2] [3]
ウィキデータ
小胞関連膜タンパク質7 （ VAMP-7 ）は、ヒトでは SYBL1 遺伝子としても知られる VAMP7 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である。 [4] [5] [6]
関数 VAMP-7は、可溶性N-エチルマレイミド 感受性因子結合タンパク質受容体（ SNARE ）ファミリーに属する膜貫通タンパク質である 。VAMP-7は後期 エンドソーム および リソソームに局在し、輸送 小胞の 標的膜への融合に関与する 。 [6]
相互作用 VAMP-7はSNAP23 [7] [8] および AP3D1 [7] と 相互作用する ことが示されている 。
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さらに読む 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」. 遺伝子 . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Galli T, Zahraoui A, Vaidyanathan VV, Raposo G, Tian JM, Karin M, Niemann H, Louvard D (1998). 「上皮細胞の頂端細胞膜SNARE複合体における、破傷風神経毒非感受性の新規小胞関連膜タンパク質」. Mol. Biol. Cell . 9 (6): 1437–48 . doi :10.1091/mbc.9.6.1437. PMC 25366. PMID 9614185 . Advani RJ, Yang B, Prekeris R, Lee KC, Klumperman J, Scheller RH (1999). 「VAMP-7はエンドソームからリソソームへの小胞輸送を媒介する」. J. Cell Biol . 146 (4): 765–76 . doi :10.1083/jcb.146.4.765. PMC 2156136. PMID 10459012 . マタラッツォ MR、ククレーゼ M、ストラズッロ M、ヴァッカ M、クルチ A、ミアーノ MG、コッキア M、メルカダンテ G、トリノ A、ドゥルソ M、チッコディコーラ A、デスポジート M (1999)。 「ヒトおよびマウスのSYBL1遺伝子の構造と発現」。 遺伝子 。 240 (1): 233–8 . 土井 :10.1016/S0378-1119(99)00375-3。 PMID 10564831。 チッコディコーラ A、デスポジート M、エスポジート T、ジャンフランチェスコ F、ミリアッチョ C、ミアーノ MG、マタラッツォ MR、ヴァッカ M、フランツェ A、クッカレーセ M、コッキア M、クルチ A、テッラッチャーノ A、トリノ A、コッキア S、メルカダンテ G、パノーネ E、アルキディアコノ N、ロッキ M、シュレッシンガー D、ドゥルソ M (2000)。 「完全に配列決定された Xq/Yq 偽常染色体領域において、異なって調節され進化した遺伝子」。 ハム。モル。ジュネット 。 9 (3): 395–401 . 土井 : 10.1093/hmg/9.3.395 。 PMID 10655549。 Ward DM, Pevsner J, Scullion MA, Vaughn M, Kaplan J (2000). 「シンタキシン7およびVAMP-7は、肺胞マクロファージにおける後期エンドソーム-リソソームおよびホモタイプリソソーム融合に必要な可溶性N-エチルマレイミド感受性因子結合タンパク質受容体である」 Mol. Biol. Cell . 11 (7): 2327–33 . doi :10.1091/mbc.11.7.2327. PMC 14922. PMID 10888671 . Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」 Genome Res . 10 (11): 1788–95 . doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 . Antonin W, Holroyd C, Fasshauer D, Pabst S, Von Mollard GF, Jahn R (2000). 「後期エンドソームの融合を媒介するSNARE複合体は、SNAREの構造と機能の保存された特性を定義する」 EMBO J. 19 ( 23): 6453–64 . doi :10.1093/emboj/19.23.6453. PMC 305878. PMID 11101518 . Wade N, Bryant NJ, Connolly LM, Simpson RJ, Luzio JP, Piper RC, James DE (2001). 「b16メラノーマ細胞におけるシンタキシン7とマウスVps10pテールインタラクター1b、シンタキシン6、小胞関連膜タンパク質（VAMP）8、およびVAMP7との複合体形成」 J. Biol. Chem . 276 (23): 19820–7 . doi : 10.1074/jbc.M010838200 . PMID 11278762. Antonin W, Fasshauer D, Becker S, Jahn R, Schneider TR (2002). 「エンドソームSNARE複合体の結晶構造は、全てのSNAREに共通する構造原理を明らかにする」 Nat. Struct. Biol . 9 (2): 107–11 . doi :10.1038/nsb746. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F459-F . PMID 11786915. S2CID 17724790. Müller DJ, Schulze TG, Jahnes E, Cichon S, Krauss H, Kesper K, Held T, Maier W, Propping P, Nöthen MM, Rietschel M (2002). 「擬似常染色体X連鎖遺伝子SYBL1の多型と双極性感情障害との関連」 Am. J. Med. Genet . 114 (1): 74–8 . doi :10.1002/ajmg.10115. PMID 11840509. Bogdanovic A, Bennett N, Kieffer S, Louwagie M, Morio T, Garin J, Satre M, Bruckert F (2002). 「シンタキシン7、シンタキシン8、Vti1、およびVAMP7（小胞関連膜タンパク質7）は、Dictyostelium discoideumにおけるマクロピノサイトーシスコンパートメントの早期融合において活性SNARE複合体を形成する」 Biochem. J. 368 ( Pt 1): 29– 39. doi :10.1042/BJ20020845. PMC 1222979. PMID 12175335 . Matarazzo MR, De Bonis ML, Gregory RI, Vacca M, Hansen RS, Mercadante G, D'Urso M, Feil R, D'Esposito M (2002). 「擬似常染色体遺伝子SYBL1の対立遺伝子不活性化は、X染色体とY染色体に共通するエピジェネティックメカニズムによって制御されている」. Hum. Mol. Genet . 11 (25): 3191–8 . doi :10.1093/hmg/11.25.3191. PMID 12444103. Martinez-Arca S, Rudge R, Vacca M, Raposo G, Camonis J, Proux-Gillardeaux V, Daviet L, Formstecher E, Hamburger A, Filippini F, D'Esposito M, Galli T (2003). 「細胞外v-SNAREの局在と機能を制御する二重のメカニズム」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (15): 9011–6 . Bibcode :2003PNAS..100.9011M. doi : 10.1073/pnas.1431910100 . PMC 166429 . PMID 12853575. Di Leva F, Ferrante MI, Demarchi F, Caravelli A, Matarazzo MR, Giacca M, D'Urso M, D'Esposito M, Franzé A (2004). 「ヒトシナプトブレビン様1遺伝子の基礎転写は、セレノシステインtRNA遺伝子転写活性化因子-ジンクフィンガー143因子と進化的に保存されたシスエレメントとの相互作用を介して制御される」 J. Biol. Chem . 279 (9): 7734–9 . doi : 10.1074/jbc.M308140200 . PMID 14672948. Rao SK, Huynh C, Proux-Gillardeaux V, Galli T, Andrews NW (2004). 「シナプトタグミンVII制御性リソソームエキソサイトーシスに関与するSNAREの同定」 J. Biol. Chem . 279 (19): 20471–9 . doi : 10.1074/jbc.M400798200 . PMID 14993220.
外部リンク
この記事には、 パブリック ドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
