VPS28

VPS28
識別子
エイリアス	VPS28、ESCRT-Iサブユニット、ESCRT-IのVPS28サブユニット
外部ID	オミム: 611952 ; MGI : 1914164 ;ホモロジーン: 69205 ;ジーンカード: VPS28 ; OMA : VPS28 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 8番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 8q24.3 始める 144,423,601 bp [ 1 ] 終わり 144,428,563 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 15番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 15|15 D3 始める 76,506,287 bp [ 2 ] 終わり 76,510,286 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 右卵管 左精巣 心臓の頂点 甲状腺の右葉 右卵巣 左卵巣 十二指腸 眼底 右精巣 甲状腺の左葉 上位の表現 足首関節 顔面運動核 右肺葉 中脳の中心灰白質 蝸牛管の前庭膜 脊髄前角 膀胱の移行上皮 分界条核 顆粒球 副腎 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質含有複合体結合 ユビキチン結合 タンパク質結合 細胞成分 細胞質 細胞質 エンドソーム 膜 後期エンドソーム膜 細胞膜 初期エンドソーム エンドソーム膜 細胞外エクソソーム ESCRT I複合体 宿主細胞 生物学的プロセス ウイルスの細胞内輸送 ユビキチン依存性エンドサイトーシスの正の制御 タンパク質分解プロセスの正の調節 宿主ESCRT複合体を介したウイルスの出芽 ウイルスのライフサイクル 多小胞体アセンブリ エンドソーム輸送 タンパク質ユビキチン化の負の制御 タンパク質輸送 多小胞体選別経路を介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 多小胞体選別経路を介したユビキチン依存性タンパク質分解過程に関与する液胞へのタンパク質輸送 マクロオートファジー 輸送 多小胞体選別経路によるエンドソーム輸送 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 51160 66914 アンサンブル ENSG00000160948 ENSG00000285339 ENSMUSG00000115987 ユニプロット Q9UK41 Q548N1 Q9D1C8 RefSeq (mRNA) NM_016208 NM_183057 NM_025842 NM_001305668 RefSeq（タンパク質） NP_057292 NP_898880 NP_057292.1 NP_001292597 NP_080118 場所（UCSC） 8章: 144.42 – 144.43 Mb 15章: 76.51 – 76.51 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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液胞タンパク質選別関連タンパク質28ホモログは、ヒトではVPS28遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ]}

関数

この遺伝子は、多小胞体／後期エンドソーム経路を介した細胞表面受容体のエンドソーム選別に関わるタンパク質をコードしている。コードされているタンパク質は、ユビキチン化されたタンパク質の選別に関与するESCRT-I複合体（輸送に必要なエンドソーム複合体）の3つのサブユニットの1つである。ESCRT-Iの他の2つのサブユニットは、腫瘍感受性遺伝子101（TSG101）としても知られる液胞タンパク質選別23（VPS23）と液胞タンパク質選別37（VPS37）である。異なるアイソフォームをコードする2つの代替転写産物が報告されている。さらに代替転写産物が存在する可能性もあるが、これらの転写産物によってコードされるタンパク質は実験的に検証されていない。^{[ 5 ]}

相互作用

VPS28はTSG101と相互作用することが示されている。^{[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]}

参考文献

1. ENSG00000285339 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000160948, ENSG00000285339 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000115987 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 「Entrez Gene: VPS28液胞タンパク質選別28ホモログ（S. cerevisiae）」。
6. ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .  
7. Stuchell MD, Garrus JE, Müller B, Stray KM, Ghaffarian S, McKinnon R, Kräusslich HG, Morham SG, Sundquist WI (2004年8月). 「ヒトエンドソーム輸送に必要な選別複合体（ESCRT-I）とHIV-1の出芽における役割」 . J. Biol. Chem . 279 (34): 36059–71 . doi : 10.1074/jbc.M405226200 . PMID 15218037 . 
8. Bishop N, Woodman P (2001年4月). 「TSG101/哺乳類VPS23と哺乳類VPS28は直接相互作用し、VPS4誘導性エンドソームにリクルートされる」 . J. Biol. Chem . 276 (15): 11735–42 . doi : 10.1074/jbc.M009863200 . PMID 11134028 . 

さらに読む

• Raiborg C, Rusten TE, Stenmark H (2004). 「タンパク質の多小胞エンドソームへの選別」. Curr. Opin. Cell Biol . 15 (4): 446– 55. doi : 10.1016/S0955-0674(03)00080-2 . PMID  12892785 .
• Bishop N, Woodman P (2001). 「TSG101/哺乳類VPS23と哺乳類VPS28は直接相互作用し、VPS4誘導性エンドソームにリクルートされる」 . J. Biol. Chem . 276 (15): 11735–42 . doi : 10.1074/jbc.M009863200 . PMID  11134028 .
• 鈴木 浩, 福西 雄一, 香川 郁, 齋藤 亮, 小田 秀, 遠藤 剛, 近藤 聡, 坊野 秀, 岡崎 雄一, 林崎 雄一 (2001). 「マウス完全長cDNAを用いたタンパク質間相互作用パネル」 . Genome Res . 11 ( 10): 1758–65 . doi : 10.1101/gr.180101 . PMC  311163. PMID 11591653  .
• Bishop N, Horman A, Woodman P (2002). 「哺乳類のクラスE vpsタンパク質はユビキチンを認識し、エンドソームタンパク質-ユビキチン複合体の除去に作用する」 . J. Cell Biol . 157 (1): 91– 101. doi : 10.1083/jcb.200112080 . PMC  2173266. PMID  11916981 .
• Martin-Serrano J, Zang T, Bieniasz PD (2003). 「レトロウイルスの出芽におけるESCRT-Iの役割」 . J. Virol . 77 (8): 4794– 804. doi : 10.1128/JVI.77.8.4794-4804.2003 . PMC  152150. PMID  12663786 .
• Tanzi GO, Piefer AJ, Bates P (2003). 「馬伝染性貧血ウイルスは粒子放出時に宿主の小胞タンパク質選別機構を利用する」 . J. Virol . 77 (15): 8440–7 . doi : 10.1128/JVI.77.15.8440-8447.2003 . PMC  165230. PMID  12857913 .
• Martin-Serrano J, Yarovoy A, Perez-Caballero D, Bieniasz PD, Yaravoy A (2003). 「異なるレトロウイルス後期出芽ドメインは、代替アダプタータンパク質を用いて液胞タンパク質選別因子をリクルートする」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (21): 12414–9 . Bibcode : 2003PNAS..10012414M . doi : 10.1073 /pnas.2133846100 . PMC  218772. PMID  14519844 .
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• Eastman SW, Martin-Serrano J, Chung W, Zang T, Bieniasz PD (2005). 「ウイルスの出芽に重要な輸送Iに必要なエンドソーム選別複合体の構成因子、ヒトVPS37Cの同定」 . J. Biol. Chem . 280 (1): 628–36 . doi : 10.1074/jbc.M410384200 . PMID  15509564 .
• ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .

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