微生物集団生物学
微生物集団生物学は、集団生物学の原理を微生物に応用したものです。
他の生物学分野との区別
微生物集団生物学は、実際には、細菌、古細菌、微小真菌（酵母など）、その他の微小真核生物（「原生動物」や 藻類など）、およびウイルスの生態と進化を理解するために集団生態学と集団遺伝学を応用したものです。
微生物集団生物学には、微生物の共進化や捕食者と被食者の相互作用など、微生物間の群集相互作用（群集生態学）の進化と生態学も含まれます。さらに、微生物集団生物学では、微生物とより巨視的な生物との相互作用（宿主と寄生者の相互作用など）を考慮しますが、厳密には巨視的な生物というよりも微視的な生物の観点から考えるべきです。微生物集団生物学の多くは、微生物進化生態学とも言えるでしょう。一方、微生物集団生物学者は通常（微生物生態学者とは異なり）、生態系の生物的要素と非生物的要素の間の栄養循環とエネルギー移動を研究する生態系生態学における微生物の役割の問題にはあまり関心がありません。
微生物集団生物学には、分子進化や系統発生の側面が含まれる場合があります。しかしながら、厳密に言えば、これらの重点は、微視的生物と巨視的生物の両方に当てはまる、より普遍的な真理を理解するための手段としてではなく、微生物の進化と生態学の問題を理解するために用いられるべきです。したがって、そのような研究における微生物は、単なる分子的あるいは進化的還元主義的なモデル系としてではなく、生物として認識されるべきです。したがって、RNAのin vitro進化の研究は 微生物集団生物学ではなく、また、非微生物配列の系統発生をin silicoで生成することも、たとえどちらかの側面が何らかの形で（特に意図せずして）実際の微生物集団の進化と類似しているとしても、微生物集団生物学ではありません。
微生物集団生物学は、より一般的な生態学的・進化学的仮説の検証を伴う場合があり（そして多くの場合、そうしています）、ここでも微生物に一定の重点を置くことが重要です。なぜなら、この「問い主導型」の微生物集団生物学は、ある時点で微生物を用いた集団生物学へと変化するからです。これらの潜在的に異なる重点の出発点はある程度恣意的であるため、微生物集団生物学という学問分野が何を構成し、何を構成しないかについては、曖昧で普遍的に受け入れられているとは言えない境界線が存在します。
微生物集団生物学ゴードン会議
微生物集団生物学ゴードン研究会議は奇数年に一度開催されており、これまでニューイングランド（通常はニューハンプシャー州）で開催されています。2007年の会議のウェブページでは、会議の開催概要が次のように紹介されています。
微生物集団生物学は、微生物科学のみならず、その分野における多様な最先端の課題を網羅しています。進化生物学を基盤とし、統合的なアプローチを強く採用した本学会は、過去の会合において、適応のダイナミクスと遺伝学から、突然変異率の進化、群集生態学、進化ゲノミクス、利他主義、疫学に至るまで、幅広いテーマを取り上げてきました。
この会議は決して退屈ではありません。生物学における最も重要かつ論争の多い問題のいくつかがここで徹底的に議論されたからです。
会議の履歴はここでご覧いただけます。
次回の微生物集団生物学ゴードン会議は 2025 年に予定されています。過去 (および将来) の会議に関する情報は次のようにまとめられます。
| 年 | 椅子 | 副議長 | 追加情報 |
|---|---|---|---|
| 2023年（2021年は中止） | ヴォーン・クーパー、ロージー・レッドフィールド | リース・カッセン、クリスティーナ・バーチ | GRCページ |
| 2019 | ベンジャミン・B・カー | ヴォーン・クーパー、ロージー・レッドフィールド | GRCページ |
| 2017 | エヴァ・トップ＆ラリー・フォーニー | ベンジャミン・B・カー | GRCページ |
| 2015 | マイケル・トラヴィサーノ | エヴァ・トップ＆ラリー・フォーニー | GRCページ |
| 2013 | ポール・E・ターナー | マイケル・トラヴィサーノ | GRCページ |
| 2011 | ジェームズ・J・ブル | ポール・E・ターナー | GRCページ |
| 2009 | アンソニー・M・ディーン | ジェームズ・J・ブル | GRCページ |
| 2007 | ポール・B・レイニー | アンソニー・M・ディーン | GRCページ |
| 2005 | マーガレット・A・ライリー | ポール・B・レイニー | GRCページ |
| 2003 | シヴ・GE・アンダーソン | マーガレット・A・ライリー | GRCページ |
| 2001 | リン・チャオ | シヴ・GE・アンダーソン | GRCページ |
| 1999 | ハワード・オックマン | リチャード・モクソン | GRCページ |
| 1997 | ジュリアン・P・アダムス | スーザン・M・ローゼンバーグ | GRCページ |
| 1995 | ダニエル・E・ディクハウゼン | リチャード・E・レンスキー | GRCページ |
| 1993 | ジョン・ロス | ロージー・レッドフィールド | GRCページ |
| 1991 | アラン・M・キャンベル | ダニエル・E・ディクハウゼン | GRCページ |
| 1989 | モニカ・ライリー | コンラッド・A・ストック | GRCページ |
| 1987 | バリー・G・ホール | ダニエル・E・ディクハウゼン | GRCページ |
| 1985 | ブルース・R・レビン | ダニエル・L・ハートル バリー・G・ホール | GRCページ |
参照
外部リンク
- 微生物集団生物学
- ファージ会議
- ヒトマイクロバイオームプロジェクト
