微生物学的培養

固体培地および液体培地での微生物培養

微生物学的培養または微生物培養)とは、管理された実験室環境下において、所定の培養培地中で微生物を増殖させる方法である。微生物培養は、分子生物学における研究ツールとして用いられる基礎的かつ基本的な診断法である

培養という用語は、培養される微生物を指す場合もあります。

微生物培養は、検査対象サンプル中の微生物の種類、その存在量、またはその両方を特定するために使用されます。微生物学における主要な診断法の一つであり、所定の培地中で病原体を増殖させることで感染症の原因を特定するツールとして用いられます。例えば、咽頭培養は、咽頭の奥の粘膜を削り取り、そのサンプルを培地に吸い取ることで行われます。これにより、連鎖球菌性咽頭炎の原因菌である化膿レンサ球菌などの有害な微生物をスクリーニングすることができます。 [1]さらに、「培養」という用語は、より一般的には、実験室で特定の種類の微生物を「選択的に培養する」ことを指す非公式な用語として使用されます。

微生物の純粋培養を分離することがしばしば不可欠です。純粋(または無菌)培養とは、他のや種類の存在なしに増殖する細胞または多細胞生物の集団です。純粋培養は単一の細胞または単一の生物に由来することもあり、その場合、細胞は互いに遺伝的にクローン化されています。微生物培養物をゲル化するために、アガロースゲル(寒天)培地が使用されます。寒天は海藻由来のゼラチン状物質です。寒天の安価な代替品としてグアーガムがあり、好熱菌の分離と維持に使用できます

歴史

最初の培養培地は、1860年にルイ・パスツールによって設計された液体培地でした。 [2]これは、1881年にロベルト・コッホが固体培地を開発するまで、研究室で使用されていました。 [3]コッホが固体培地に平らな板を使用する方法は、 1887年にユリウス・リヒャルト・ペトリの丸い箱に置き換えられました。[2]これらの基礎的な発明以来、科学者が微生物の培養を成長させ、識別し、精製するのに役立つ多様な培地と方法が進化してきました。

微生物培養の種類

炭疽菌の培養

原核生物培養

原核生物の培養には、古細菌を実験室で培養することが難しいため、通常は細菌が用いられます。[4]純粋な原核生物の培養物を得るためには、生物の単一細胞または単一コロニーから培養を開始する必要があります。[5]原核生物のコロニーは単一細胞の無性生殖細胞であるため、すべての細胞は遺伝的に同一であり、純粋培養となります。

ウイルス培養

ウイルスファージの培養には、ウイルスやファージが増殖する宿主細胞が必要です。バクテリオファージの場合、培養は細菌細胞に感染させて行います。その後、プレート上の細菌叢に生じたプラークからファージを分離できます。ウイルス培養は、適切な真核宿主細胞から得られます。画線平板法は、微生物集団を物理的に分離する方法で、接種ループを使用して固体寒天プレート上で接種物を前後に広げることで行います。インキュベーションするとコロニーが発生し、バイオマスから単一細胞が分離されます。微生物が純粋培養で分離されたら、さらなる研究や使用のために、保存培養と呼ばれる培養で生存可能な状態で保存する必要があります。これらの培養は、生物学的、免疫学的、および文化的特徴が失われないように維持する必要があります。

真核細胞培養

真核細胞培養は、真核生物の研究のための制御された環境を提供します。酵母、藻類、原生動物などの単細胞真核生物は、原核生物の培養と同様の方法で培養できます。C . elegansなどの多細胞微視的真核生物についても同様です

マクロな真核生物は実験室で培養するには大きすぎるものの、採取した細胞は培養することが可能です。これにより、研究者はマクロな真核生物の特定の部位やプロセスをin vitroで研究することができます。

培養方法

方法の概要
方法説明用途と利点
液体培養/ブロス培養生物は液体培地の入ったフラスコに接種される大量の微生物の培養、抗菌アッセイ、細菌の分化
寒天培地生物はペトリ皿に置かれるか、または塗抹されるコンパクトで積み重ね可能な、静止成長のための堅固な表面を提供します
寒天ベースのディップスティック本質的にはディップスティックの形をしたミニチュア寒天培地診断目的、どこでも使用可能、費用対効果が高く、使いやすい
選択的メディアと差別的メディア生物は特定の培地で培養され、特定のものを選択または区別する。未知の生物の特定、培養物の精製を支援
刺し傷培養微生物は試験管内の固体寒天に接種される短期保存、細菌の分化

液体培養

微生物培養の一つの方法は液体培養です。液体培養では、目的の微生物をルリアブロスなどの液体栄養培地に懸濁し、直立フラスコ内で培養します。これにより、科学者は大量の細菌やその他の微生物を培養し、様々な下流用途に利用することができます。

液体培養は、抗菌試験の準備に最適です。この試験では、液体培養液に細菌を接種し、一晩培養します(均一な増殖を促すため、「シェーカー」を用いて培養液を機械的に撹拌します)。その後、サンプルの一部を採取し、特定の薬剤またはタンパク質(抗菌ペプチド)の抗菌活性を試験します。

シアノバクテリア Synechococcus PCC 7002の液体培養

代替手段として、静置液体培養法が用いられる場合がある。この培養法は振盪培養を行わず、微生物に酸素勾配を与える。[6]

寒天培地

特定の標的(非細菌、結核菌など)が求められていない症例における、細菌感染の可能性のある症例に対するワークアップアルゴリズムの例。ニューイングランドの現場で最もよく見られる状況と病原体を用いています。左上近くの灰色のボックスは、様々な源や目的で日常的に使用される培地のベン図を示しています。

微生物培養は、様々なサイズのペトリ皿に、寒天培地を薄く敷き詰めた培地で行うことができます。ペトリ皿の培地に目的の細菌を接種した後、選択した細菌の増殖に最適な温度(例えば、ヒトや動物由来の培養では通常37℃(体温)で、環境由来の培養では通常より低い温度)で培養します。目的の増殖レベルに達した後、寒天培地を逆さまにして冷蔵庫で長期間保存し、将来の実験のために細菌を保管することができます。

寒天培地をプレートに流し込み固める前に、様々な添加剤を加えることができます。細菌の種類によっては、特定の添加剤の存在下でのみ増殖することができます。これは、抗生物質耐性遺伝子を含む改変細菌株を作成する際にも利用できます。選択した抗生物質を寒天培地に加えると、耐性を付与する遺伝子挿入物を含む細菌細胞のみが増殖できるようになります。これにより、研究者は形質転換に成功したコロニーのみを選択することができます。

寒天ベースのディップスティック

ディップスライド、デジタルディップスティック[7]など、ディップスティック形式に実装された寒天培地の小型版は、診断目的でポイントオブケアで使用できる可能性を示しています。これらは寒天培地に比べて費用対効果が高く、操作に専門知識や実験室環境を必要としないため、ポイントオブケアで使用できます。

選択的メディアと差別的メディア

選択培地と分化培地は、培養されている微生物の特性を明らかにします。この種の培地は、選択培地、分化培地、または選択培地と分化培地の両方である場合があります。複数種類の選択培地と分化培地で培養することで、混合培養物を精製し、未知の培養物を同定するために必要な特性を科学者に明らかにすることができます。

選択的メディア

選択培地は、特定の種類の微生物の生育を許容する一方で、他の微生物の生育を阻害することで、微生物を区別するために使用されます。例えば、エオシンメチレンブルー(EMB)は、EMB上で生育が阻害されるグラム陽性細菌を選抜し、EMB上で生育が阻害されないグラム陰性細菌を選抜するために使用できます。[8]

差分メディア

科学者は微生物を培養する際に、分化培地を用いて特定の生化学的特性を明らかにします。これらの特性は、既知の微生物の特性と比較することで、未知の培養物を同定するために用いられます。その一例がマッコンキー寒天培地(MAC)です。この培地は、発酵によって酸が生成されると色が変化するpH指示薬を用いて、乳糖発酵細菌を同定します。[9]

マルチターゲットパネル

マルチターゲットパネルでは、以前に培養されたコロニーから分離された細菌が各ウェルに分配されます。各ウェルには、増殖培地と生化学検査用の成分が含まれており、検査対象に対する細菌の特性に応じてウェルの吸光度が変化します。パネルは機械で培養され、その後、比色法、濁度法、蛍光法などの光ベースの方法で各ウェルが分析されます。[10]これらの結果は、様々な細菌種の既知の結果データベースと自動的に比較され、現在のパネルに存在する細菌種を診断します。同時に、抗生物質感受性試験も実施されます。

刺し傷培養

運動性細菌と非運動性細菌は、穿刺線に沿って区別できます。運動性細菌(左)は穿刺線から外側に増殖しますが、非運動性細菌(右)は穿刺線に沿ってのみ存在します。

穿刺培養は寒天培地に似ていますが、試験管内で固形寒天を培養します。細菌は、接種針またはピペットチップを寒天培地の中央に刺すことで導入されます。細菌は刺した部分で増殖します。[11]穿刺培養は、培養物の短期保存または輸送に最も一般的に使用されます。さらに、穿刺培養は、培養された微生物の運動性や酸素要求性などの特性を明らかにすることができます。

好熱性微生物の固体プレート培養

50~70℃の温度で生育するバチルス・アシドカルダリウス、バチルス・ステアロサーモフィルス、サーマス・アクアティカス、サーマス・サーモフィルスなどの好熱性微生物の固体プレート培養では、上記の好熱性細菌の計数や分離、またはその両方において、寒天よりも低アシルの清澄化ジェランガムが好ましいゲル化剤であることが証明されています。[12]

細胞培養コレクション

微生物培養コレクションは、微生物系統学の研究のための標準的な参照微生物、細胞株、その他の材料の生培養物の取得、認証、生産、保存、カタログ作成、配布に重点を置いています[13] [14]培養コレクションはタイプ株の保管庫でもあります。

主要な国立文化財コレクション。[13] [14]
コレクションの頭字語名前位置
ATCCアメリカンタイプカルチャーコレクションバージニアマナサス
BCCMベルギー微生物共同コレクションベルギーのブリュッセルある分散型調整セル
CCUGヨーテボリ大学文化コレクションスウェーデン、ヨーテボリ
CECTColección Española de Cultivos Tipoスペイン、バレンシア
CIPパスツール研究所コレクションパリフランス
DSMZ微生物有機体とゼルクルトゥーレンのドイツ植物園ブラウンシュヴァイクドイツ
ICMP植物由来微生物の国際コレクションオークランドニュージーランド
JCM日本微生物コレクションつくば市、茨城県日本
NCTC国立タイプカルチャーコレクション英国ロンドン公衆衛生局
NCIMB産業・食品・海洋細菌の国立コレクションアバディーンスコットランド
NCMR国立微生物資源センタープネ、インド
NCPPB植物病原細菌国立コレクションヨーク、イギリス
MTCC微生物型培養コレクションおよび遺伝子バンクチャンディーガル、インド

参照

参考文献

  1. ^ Healthwise, Incorporated (2010年6月28日). 「咽頭培養検査」. WebMD . 2013年3月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2013年3月10日閲覧
  2. ^ ab Bonnet, M.; Lagier, JC; Raoult, D.; Khelaifia, S. (2020年3月). 「選択的および非選択的条件による細菌培養:臨床微生物学における培養培地の進化」. New Microbes and New Infections . 34. doi :10.1016/j.nmni.2019.100622. PMC 6961714. PMID 31956419  . 
  3. ^ バス、スリジョニ;ボーズ、チャンドラ。オジャ、ヌプール。ダス、ナバジット。ダス、ジャガリー。パル、ムリンモイ。スカント州クラナ(2015 年 4 月 30 日)。 「細菌および真菌の増殖培地の進化」。生体情報11 (4): 182–184土井:10.6026/97320630011182。PMC 4479053PMID  26124557。 
  4. ^ ラフィク、ムハンマド;ハッサン、ヌール。リーマン、マリハ。ハヤト、ムハンマド。ナディーム、ガラシュト。ハッサン、ファルワ。イクバル、ナヴィード。アリ、ハズラト。ザダ、サーヒブ。カン・インチェン。サジャド、ワシム。ジャマル、ムシン(2023-12-07)。 「培養不可能な古細菌の培養の課題とアプローチ」。生物学12 (12): 1499.土井: 10.3390/biology12121499ISSN  2079-7737。PMC 10740628PMID  38132325。 
  5. ^ Fröhlich, Jürgen; König, Helmut (2000年12月1日). 「単一原核細胞の単離のための新技術」 . FEMS Microbiology Reviews . 24 (5): 567– 572. doi :10.1016/S0168-6445(00)00045-0 – Oxford Academic経由.
  6. ^ Old, DC; Duguid, JP (1970). 「静的液体培地における線毛細菌の選択的増殖」. Journal of Bacteriology . 103 (2). American Society for Microbiology: 447– 456. doi :10.1128/JB.103.2.447-456.1970. PMC 248102. PMID 4914569  . 
  7. ^ イセリ, エムレ; ビッグゲル, マイケル; グーセンス, ハーマン; ムーンズ, ピーター; ファン・デル・ウィンガート, ウーター (2020). 「デジタルディップスティック:ポイントオブケアにおける小型細菌検出とデジタル定量化」. Lab on a Chip . 20 (23): 4349– 4356. doi : 10.1039/D0LC00793E . ISSN  1473-0197. PMID  33169747.
  8. ^ 「6.3C: 選択培地と差別培地」Biology LibreTexts . 2017年5月11日. 2024年3月3日閲覧
  9. ^ Jung, Benjamin; Hoilat, Gilles J. (2024)、「MacConkey Medium」、StatPearls、Treasure Island (FL): StatPearls Publishing、PMID  32491326 、 2024年3月3日閲覧。
  10. ^ McPherson, RA; Pincus, MR (2017). Henry's Clinical Diagnosis and Management by Laboratory Methods (第23版). Elsevier Health Sciences. ISBN 978-0-323-41315-2
  11. ^ “Addgene: Addgene Stab Culture からプレートへの線状培養”. www.addgene.org . 2018年4月8日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2018年3月21日閲覧
  12. ^ Lin, Chi ChungおよびCasida, LE (1984)「好熱性微生物の増殖のための培地におけるゲル化剤としてのGELRITE」応用環境微生物学47, 427–429。
  13. ^ ab マディガン、マイケル・T. (2012).ブロック微生物学(第13版). サンフランシスコ: ベンジャミン・カミングス. ISBN 9780321649638
  14. ^ ab Uruburu, F. (2003). 「文化コレクションの歴史とサービス」(PDF) . International Microbiology . 6 (2): 101– 103. doi :10.1007/s10123-003-0115-2. hdl : 10550/12955 . PMID  12811589. S2CID  19711069.
  • EFFCA - 欧州食品飼料培養協会。微生物培養物の生産と利用、そして法規制に関する情報。
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