RAD18

RAD18
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2MRE、2MRF、2Y43、2YBF​​
識別子
エイリアス	RAD18、RNF73、E3ユビキチンタンパク質リガーゼ、RAD18 E3ユビキチンタンパク質リガーゼ
外部ID	オミム: 605256 ; MGI : 1890476 ;ホモロジーン: 48572 ;ジーンカード: RAD18 ; OMA : RAD18 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 3番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 3p25.3 始める 8,775,402 bp [ 1 ] 終わり 8,963,773 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 6番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 6|6 E3 始める 112,596,811 bp [ 2 ] 終わり 112,673,647 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 睾丸 アキレス腱 心室帯 生殖腺 神経節隆起 小腸粘膜 子宮内膜間質細胞 結腸上皮 ランゲルハンス島 骨髄細胞 上位の表現 胚の尾 接合子 精母細胞 性器結節 精子細胞 二次卵母細胞 一次卵母細胞 胚葉上層 腰椎神経節 内腎髄質 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 金属イオン結合 ポリユビキチン修飾依存性タンパク質結合 Y型DNA結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 損傷したDNA結合 DNA結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ結合 一本鎖DNAヘリカーゼ活性 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 トランスフェラーゼ活性 タンパク質含有複合体結合 一本鎖DNA結合 細胞成分 細胞質 二本鎖切断部位 微小管形成中心 核 レプリケーションフォーク 中心体 Rad6-Rad18複合体 核封入体 細胞骨格 核質 核体 生物学的プロセス タンパク質モノユビキチン化 紫外線への反応 細胞死の負の調節 染色体分離の正の調節 DNA損傷刺激に対する細胞応答 複製後修復 タンパク質の自己ユビキチン化 DNA修復 タンパク質のユビキチン化 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 56852 58186 アンサンブル ENSG00000070950 ENSMUSG00000030254 ユニプロット Q9NS91 Q9QXK2 RefSeq (mRNA) NM_020165 NM_001167730 NM_021385 NM_001381931 NM_001381932 NM_001381933 RefSeq（タンパク質） NP_064550 NP_001161202 NP_067360 NP_001368860 NP_001368861 NP_001368862 場所（UCSC） 3章: 8.78 – 8.96 MB 6番目の文字: 112.6 – 112.67 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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E3ユビキチンタンパク質リガーゼRAD18は、ヒトではRAD18遺伝子によってコードされている酵素である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}ヒト大腸癌細胞株HCT116におけるノックアウトも作成されている。^{[ 8 ]}

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、S. cerevisiaeのDNA損傷修復タンパク質Rad18と非常に類似しています。酵母Rad18は、損傷したDNAの複製後修復に必要なユビキチン結合酵素であるRad6との相互作用を介して機能します。酵母Rad18と同様に、このタンパク質は保存されたリングフィンガーモチーフを介して酵母Rad6タンパク質のヒトホモログと相互作用することができます。このモチーフの変異は、紫外線損傷を受けたDNAの複製に欠陥をもたらし、複数の変異原に対する過敏症を引き起こします。^{[ 7 ]}

RAD18はE3ユビキチンリガーゼであり、ユビキチンをユビキチンキャリアから別のタンパク質（基質）へ移動させる。RAD18の活性の一つは、DNAトランスレジョン合成とテンプレートスイッチを促進することで複製フォークの崩壊を防ぐことである。 ^{[ 9 ]} RAD18はまた、複製後クロマチンにおける相同組換えによるDNA二本鎖切断の修復を誘導する役割も担っている。^{[ 9 ]} RAD18は、DNA切断部位にSMC5、SMC6（SMC5/6）複合体を リクルートすることで相同組換え修復を促進すると考えられる。 ^{[ 9 ]}

相互作用

^RAD18はHLTF、^{[ 10 ] 、} UBE2B ^{[ 5 ] 、[ 6 ]}、UBE2A ^{[ 5 ]}と相互作用することが示されている。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000070950 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000030254 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 立石 誠・桜庭 雄・増山 聡・井上 英・山泉 正治 (2000年7月). 「ヒトRad18の機能不全は複製後修復の欠陥と複数の変異原に対する過敏症を引き起こす」 .米国科学アカデミー紀要. 97 (14): 7927–32 . Bibcode : 2000PNAS...97.7927T . doi : 10.1073/ pnas.97.14.7927 . PMC 16647. PMID 10884424 .  
6. Xin H, Lin W, Sumanasekera W, Zhang Y, Wu X, Wang Z (2000年7月). 「ヒトRAD18遺伝子産物はHHR6AおよびHHR6Bと相互作用する」 . Nucleic Acids Research . 28 (14): 2847–54 . doi : 10.1093/nar/28.14.2847 . PMC 102657. PMID 10908344 .  
7. 「Entrez Gene: RAD18 RAD18 ホモログ (S. cerevisiae)」。
8. Shiomi N, Mori M, Tsuji H, Imai T, Inoue H, Tateishi S, Yamaizumi M, Shiomi T (2007-01-01). 「ヒトRAD18はPCNAモノユビキチン化を介さずにS期特異的な一本鎖切断修復に関与する」 . Nucleic Acids Research . 35 (2): e9. doi : 10.1093/nar/ gkl979 . PMC 1802632. PMID 17158148 .  
9. Palek M, Palkova N, Kleiblova P, Kleibl Z, Macurek L (2024年7月). 「RAD18は複製後クロマチンへの相同組換えによってDNA二本鎖切断修復を誘導する」 . Nucleic Acids Res . 52 (13): 7687– 7703. doi : 10.1093/nar/ gkae499 . PMC 11260465. PMID 38884202 .  
10. Unk I, Hajdú I, Fátyol K, Hurwitz J, Yoon JH, Prakash L, Prakash S, Haracska L (2008年3月). 「ヒトHLTFは増殖細胞核抗原のポリユビキチン化におけるユビキチンリガーゼとして機能する」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 105 (10): 3768–73 . Bibcode : 2008PNAS..105.3768U . doi : 10.1073 / pnas.0800563105 . PMC 2268824. PMID 18316726 .  

さらに読む

• 丸山 憲一、菅野 誠（1994年1月）. 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID  8125298 .
• 鈴木雄三、中川佳智、丸山健、須山明生、菅野誠一（1997年10月）. 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1– 2 ): 149– 56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID  9373149 .
• Mulder LC, Chakrabarti LA, Muesing MA (2002年7月). 「HIV-1インテグラーゼとDNA修復タンパク質hRad18の相互作用」 . The Journal of Biological Chemistry . 277 (30): 27489–93 . doi : 10.1074/jbc.M203061200 . PMID  12016221 .
• Nikiforov AA, Sasina LK, Svetlova MP, Solovjeva LV, Oei SL, Bradbury EM, Tomilin NV (2004). 「哺乳類細胞におけるヌクレアーゼFEN1の早期固定化と停止したDNA複製フォークにおけるhRAD18タンパク質の蓄積」. Doklady Biochemistry and Biophysics . 389 ( 1–6 ): 122–5 . doi : 10.1023/A:1023696425171 . PMID  12856420. S2CID  2646911 .
• Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004年8月). 「HeLa細胞核リン酸化タンパク質の大規模解析」 .米国科学アカデミー紀要. 101 (33): 12130–5 . Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/ pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
• 渡辺 憲治、立石 誠、川筋 正治、釣本 剛志、井上 秀、山泉 正治 (2004年10月). 「Rad18は物理的相互作用とPCNAモノユビキチン化を介してポレタを複製停止部位へ誘導する」 . The EMBO Journal . 23 (19): 3886–96 . doi : 10.1038/sj.emboj.7600383 . PMC  522788. PMID  15359278 .
• Nikiforov A, Svetlova M, Solovjeva L, Sasina L, Siino J, Nazarov I, Bradbury M, Tomilin N (2004年10月). 「哺乳類細胞においてDNA損傷によって引き起こされる複製フォークの停止におけるRad18タンパク質の蓄積は、上流のタンパク質リン酸化を伴う」.生化学および生物物理学的研究通信. 323 (3): 831–7 .書誌コード: 2004BBRC..323..831N . doi : 10.1016/j.bbrc.2004.08.165 . PMID  15381075 .
• 宮瀬 聡、立石 聡、渡辺 健、富田 健、鈴木 健、井上 秀、山泉 正之 (2005年1月). 「Rad6依存性モノユビキチン化およびポリユビキチン化によるRad18の異なる制御」 . The Journal of Biological Chemistry . 280 (1): 515–24 . doi : 10.1074/jbc.M409219200 . PMID  15509568 .
• 増山 聡、立石 誠、蓬田 健、西宗 勇、鈴木 健、桜庭 雄、井上 秀、小川 正治、山泉 正治 (2005年8月). 「正常および遺伝毒性条件下での哺乳類Rad18の発現制御と核内局在の動的変化」 . Genes to Cells . 10 (8): 753–62 . doi : 10.1111/j.1365-2443.2005.00874.x . PMID  16098139. S2CID  41733250 .
• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (2006年4月). 「ヒト有糸分裂紡錘体のリン酸化プロテオーム解析」 .米国科学アカデミー紀要. 103 (14): 5391–6 . Bibcode : 2006PNAS..103.5391N . doi : 10.1073/ pnas.0507066103 . PMC  1459365. PMID  16565220 .
• Bi X, Barkley LR, Slater DM, Tateishi S, Yamaizumi M, Ohmori H, Vaziri C (2006年5月). 「Rad18はDNAポリメラーゼκを制御し、S期チェックポイントを介した停止からの回復に必要である」 . Molecular and Cellular Biology . 26 (9): 3527–40 . doi : 10.1128/MCB.26.9.3527-3540.2006 . PMC  1447421. PMID  16611994 .
• Lloyd AG, Tateishi S, Bieniasz PD , Muesing MA, Yamaizumi M, Mulder LC (2006年5月). 「DNA修復タンパク質Rad18のウイルス感染への影響」 . PLOS Pathogens . 2 (5): e40. doi : 10.1371/journal.ppat.0020040 . PMC  1463017. PMID  16710452 .
• Yuasa MS, Masutani C, Hirano A, Cohn MA, Yamaizumi M, Nakatani Y, Hanaoka F. (2006年7月). 「Rad18、Rad6、Rev1を含むヒトDNAポリメラーゼη複合体；プロテオーム解析と複製フォーク停止中の細胞におけるクロマチン結合画分への複合体の標的化」 . Genes to Cells . 11 (7): 731–44. doi : 10.1111 / j.1365-2443.2006.00974.x . PMID  16824193. S2CID  32695133 .
• Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006年10月). 「確率に基づくアプローチによるハイスループットタンパク質リン酸化解析と部位局在化」. Nature Biotechnology . 24 (10): 1285–92 . doi : 10.1038/nbt1240 . PMID  16964243. S2CID  14294292 .
• Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006年11月). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」 . Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573 .

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