ホモ・サピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| SOCS5 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| 別名 | SOCS5、CIS6、CISH6、Cish5、SOCS-5、サイトカインシグナル伝達抑制因子5 |
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| 外部ID | OMIM : 607094; MGI : 2385459; HomoloGene : 10495; GeneCards : SOCS5; OMA :SOCS5 - オーソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | 染色体 | 17番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 17|17 E4 | 開始 | 87,415,107 bp [2] |
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| 終了 | 87,445,267 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| Bgee | | ヒト | マウス(相同遺伝子) |
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| 最もよく発現している | - 精子
- 口腔粘膜細胞
- 内皮細胞
- 胚芽上皮
- 乳管
- 壁側胸膜
- 伏在静脈
- 小脳虫部
- 子宮内膜間質細胞
- 脈絡叢上皮
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| | 最もよく発現している | - 黒質
- 腹内側核
- 扁桃体前部
- 側坐核
- 外側中隔核
- 嗅結節
- 乳頭体
- 淡蒼球
- 外側視床下部
- 視床下部鉤状部
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| | その他の参考発現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | - 上皮成長因子受容体結合
- タンパク質キナーゼ阻害活性
- 受容体チロシンキナーゼ結合
- タンパク質結合
- 1-ホスファチジルイノシトール-3-キナーゼ調節活性
| | 細胞成分 | - 細胞質
- 細胞質ゾル
- ホスファチジルイノシトール3キナーゼ複合体
| | 生物学的プロセス | - JAK-STATを介した受容体シグナル伝達経路
- 細胞内シグナル伝達
- 上皮成長因子受容体シグナル伝達経路
- 上皮成長因子活性化受容体活性の負の調節
- 細胞の成長
- タンパク質のユビキチン化
- 成長の調節
- プロテアソームユビキチン依存性タンパク質分解プロセスの正の調節
- JAK-STATを介した受容体シグナル伝達経路の負の制御
- Tヘルパー2細胞分化の負の制御
- Tヘルパー1細胞分化の正の調節
- シグナル伝達の負の調節
- インターロイキン-6産生の負の調節
- 炎症反応の負の調節
- 低密度リポタンパク質粒子刺激に対する細胞応答
- 単球走化性タンパク質-1産生の負の制御
- 流体せん断応力に対する血管内皮細胞の反応
- 翻訳後タンパク質修飾
- サイトカインを介したシグナル伝達経路
- ホスファチジルイノシトール3キナーゼ活性の調節
- ホスファチジルイノシトールリン酸の生合成プロセス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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サイトカインシグナル伝達抑制因子5は、ヒトではSOCS5遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、SH2ドメインとSOCS BOXドメインを含む。したがって、このタンパク質はサイトカインシグナル伝達抑制因子(SOCS)ファミリー、あるいはSTAT誘導性STAT阻害因子(SSI)タンパク質ファミリーに属する。SOCSファミリーのメンバーは、サイトカイン誘導性サイトカインシグナル伝達の負の調節因子として知られている。このタンパク質の具体的な機能はまだ解明されていない。同一のタンパク質をコードする2つの選択的スプライシング転写バリアントが報告されている。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000171150 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000037104 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 石川 功、永瀬 剛、須山 正之、宮島 暢、田中 明、小谷 秀、野村 暢、小原 修 (1998年12月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. X. in vitroで巨大タンパク質をコードできる脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列」. DNA Res . 5 (3): 169–76 . doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . PMID 9734811.
- ^ ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ボッチャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルーム H、ラウバー J、ダスターホフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、ミューズ HW、オッテンヴァルダー B、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブット R、コーン B、クラインM、プウストカ A (2001 年 3 月)。 「ヒト遺伝子とタンパク質のカタログに向けて: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」。ゲノム解析11 (3): 422–35 .土井:10.1101/gr.GR1547R。PMC 311072。PMID 11230166。
- ^ ab 「Entrez Gene: サイトカインシグナル伝達のSOCS5抑制因子5」。
さらに詳しい情報
- Kile BT、Schulman BA、Alexander WS、他 (2002).「SOCSボックス:破壊と劣化の物語」Trends Biochem. Sci . 27 (5): 235–41 . doi :10.1016/S0968-0004(02)02085-6. PMID 12076535
- Wang J, Campbell IL (2002). 「脳におけるサイトカインシグナル伝達:SOCSを導入するか?」J. Neurosci. Res . 67 (4): 423–7 . doi : 10.1002/jnr.10145 . PMID 11835308. S2CID 33269663.
- Krebs DL, Hilton DJ (2001). 「SOCSタンパク質:サイトカインシグナル伝達の負の調節因子」. Stem Cells . 19 (5): 378–87 . doi : 10.1634/stemcells.19-5-378 . PMID 11553846. S2CID 20847942.
- 尾崎 明、関 勇、福島 明、久保 正之 (2005). 「マウスモデルにおけるサイトカインシグナル抑制因子(SOCS)3およびSOCS5によるアレルギー性結膜炎の制御」J. Immunol . 175 (8): 5489–97 . doi : 10.4049/jimmunol.175.8.5489 . PMID 16210657.
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- 関 勇、林 功、松本 明、他 (2002). 「サイトカインシグナル伝達抑制因子5(SOCS5)の発現はIL-4依存性STAT6活性化およびTh2分化を負に制御する」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (20): 13003–8 . Bibcode :2002PNAS...9913003S. doi : 10.1073/pnas.202477099 . PMC 130576. PMID 12242343 .
- Magrangeas F, Apiou F, Denis S, et al. (2000). 「CIS6のクローニングと発現、in situハイブリダイゼーションによる染色体3p22および2p21への割り当て」Cytogenet. Cell Genet . 88 ( 1–2 ): 78–81 . doi :10.1159/000015490. PMID 10773671. S2CID 19983548.
- Hilton DJ, Richardson RT, Alexander WS, et al. (1998). 「C末端SOCSボックスを含む20種類のタンパク質は5つの構造クラスを形成する」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (1): 114–9 . Bibcode :1998PNAS...95..114H. doi : 10.1073/pnas.95.1.114 . PMC 18144. PMID 9419338 .