ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
SOCS6 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス SOCS6 、CIS-4、CIS4、HSPC060、SOCS-4、SOCS-6、SOCS4、SSI4、STAI4、STATI4、サイトカインシグナル伝達抑制因子6 外部ID オミム :605118; MGI : 1924885; ホモロジーン :3120; ジーンカード :SOCS6; OMA :SOCS6 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 18番染色体(マウス) [2] バンド 18|18 E4 始める 88,683,348 bp [2] 終わり 88,945,605 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 副鼻腔粘膜 上腕二頭筋 腹直筋の骨格筋組織 小腸粘膜 口腔 結腸粘膜 S状結腸粘膜 上腕二頭筋の骨格筋組織 右心室 精巣上体頭
上位の表現 耳小胞 耳板 接合子 球形嚢 二次卵母細胞 松果体 卵黄嚢 肋間筋 ヒラメ筋 内側膝状体
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質キナーゼ阻害活性 タンパク質結合 1-ホスファチジルイノシトール-3-キナーゼ調節活性 細胞成分 細胞質 免疫シナプス 細胞質 ホスファチジルイノシトール3キナーゼ複合体 生物学的プロセス 成長の調節 防御反応 プロテアソームによるタンパク質分解プロセス JAK-STATを介した受容体シグナル伝達経路 シグナル伝達の負の調節 細胞内シグナル伝達 T細胞活性化の負の制御 タンパク質のユビキチン化 タンパク質キナーゼ活性の負の調節 サイトカインを介したシグナル伝達経路 JAK-STATを介した受容体シグナル伝達経路の負の制御 翻訳後タンパク質修飾 ホスファチジルイノシトール3キナーゼ活性の調節 ホスファチジルイノシトールリン酸の生合成プロセス 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
サイトカインシグナル伝達抑制因子6 は、 ヒトでは SOCS6 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6] [7]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 SH2ドメイン とCIS相同ドメインを含む。したがって、このタンパク質は サイトカイン 誘導性STAT阻害因子(CIS)、あるいは サイトカインシグナル伝達抑制因子 (SOCS)またはSTAT誘導性STAT阻害因子(SSI) タンパク質ファミリー に属する。CISファミリーのメンバーは、サイトカイン誘導性サイトカインシグナル伝達の 負の調節因子として知られている。この遺伝子の発現は、 造血細胞 において GM-CSF および EPO によって誘導される 。この遺伝子の高発現レベルは、因子非依存性 慢性骨髄性白血病 (CML)および 赤白血病 (HEL) 細胞株 で確認されている。 [7]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000170677 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000056153 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 増原正人、坂元裕人、松本亜人、鈴木理人、安川博人、三井一樹、脇岡拓也、谷村真人、佐々木亜人、三澤宏人、横内正人、大坪正人、吉村亜人 (1997年11月)。 「新規CISファミリー遺伝子のクローニングと特性評価」。 Biochem Biophys Res Commun 。 239 (2): 439–46 . 土井 :10.1006/bbrc.1997.7484。 PMID 9344848。 ^ Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2000年11月). 「CD34陽性造血幹細胞/前駆細胞で発現する、これまで未同定であった300遺伝子のオープンリーディングフレームを持つcDNAのクローニングと機能解析」 Genome Res . 10 (10): 1546–60 . doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934. PMID 11042152 . ^ ab 「Entrez Gene: サイトカインシグナル伝達のSOCS6抑制因子6」。
さらに読む Kile BT, Schulman BA, Alexander WS, et al. (2002). 「SOCSボックス:破壊と劣化の物語」 Trends Biochem. Sci . 27 (5): 235–41 . doi :10.1016/S0968-0004(02)02085-6. PMID 12076535. Mooney RA, Senn J, Cameron S, et al. (2001). 「サイトカインシグナル伝達抑制因子-1および-6はインスリン受容体と会合し、それを阻害する。サイトカインを介したインスリン抵抗性の潜在的メカニズム」 J. Biol. Chem . 276 (28): 25889–93 . doi : 10.1074/jbc.M010579200 . PMID 11342531. Krebs DL, Uren RT, Metcalf D, et al. (2002). 「SOCS-6はインスリン受容体基質4に結合し、SOCS-6遺伝子を欠損したマウスは軽度の成長遅延を示す」 Mol. Cell. Biol . 22 (13): 4567– 78. doi :10.1128/MCB.22.13.4567-4578.2002. PMC 133908. PMID 12052866 . Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Bayle J, Letard S, Frank R, et al. (2004). 「サイトカインシグナル伝達抑制因子6はKITと会合し、KIT受容体シグナル伝達を制御する」 J. Biol. Chem . 279 (13): 12249–59 . doi : 10.1074/jbc.M313381200 . PMID 14707129. Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, et al. (2005). 「哺乳類細胞における動的シグナル伝達ネットワークのハイスループットマッピング」. Science . 307 (5715): 1621–5 . Bibcode :2005Sci...307.1621B. doi :10.1126/science.1105776. PMID : 15761153. S2CID : 39457788. Bayle J, Lopez S, Iwaï K, et al. (2006). 「E3ユビキチンリガーゼHOIL-1はSOCS6関連タンパク質のポリユビキチン化と分解を誘導する」 FEBS Lett . 580 (11): 2609–14 . doi : 10.1016/j.febslet.2006.03.093 . PMID 16643902. S2CID 44648698. Hwang MN, Ha TH, Park J, et al. (2007). 「PMAによるSOCS6の安定性向上には、N末端領域とPkcdelta活性化を介したErk経路が必要である」 Biochem. Biophys. Res. Commun . 354 (1): 184–9 . doi :10.1016/j.bbrc.2006.12.175. PMID 17210122. Hwang MN, Min CH, Kim HS, et al. (2007). 「SOCS6の核局在にはN末端領域が必要であり、Stat3タンパク質レベルを負に制御する」 Biochem. Biophys. Res. Commun . 360 (2): 333–8 . doi :10.1016/j.bbrc.2007.06.062. PMID 17603019.