DDX5

DDX5
利用可能な構造 PDB オーソログ検索：PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3FE2、4A4D​​
識別子
別名	DDX5、G17P1、HLR1、HUMP68、p68、DEADボックスヘリカーゼ5
外部ID	OMIM : 180630 ; MGI : 105037 ; HomoloGene : 1655 ; GeneCards : DDX5 ; OMA : DDX5 - オーソログ
遺伝子の位置（ヒト） 染色体 17番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 17q23.3 開始 64,498,254 bp [ 1 ] 終了 64,508,199bp [ 1 ]
遺伝子位置（マウス） 染色体 11番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 11 E1|11 70.01 cM 開始 106,671,181 bp [ 2 ] 終了 106,680,011 bp [ 2 ]
RNA発現パターン Bgee ヒト マウス（相同遺伝子） 最もよく発現している アキレス腱 骨髄細胞 顆粒球 下垂体前葉 右副腎皮質 平滑筋組​​織 結腸上皮 生殖腺 単球 甲状腺右葉 最もよく発現している 小脳葉 小脳虫部 網膜の神経層 嗅結節 顆粒球 手綱 正中隆起 松果体 弓状核 外側中隔核 その他の参考発現データ バイオGPS その他の参考発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 ヌクレオチド結合 ヘリカーゼ活性 カルシウム依存性タンパク質結合 カルモジュリン結合 タンパク質結合 アンドロゲン受容体結合 核酸結合 酵素結合 プレmRNA結合 加水分解酵素活性 ATP結合 RNAヘリカーゼ活性 RNA結合 mRNA 3'-UTR結合 リボ核タンパク質複合体結合 プロモーター特異的クロマチン結合 MH2ドメイン結合 SMAD結合 R-SMAD結合 一次miRNA結合 転写コレギュレーター活性 細胞構成要素 触媒ステップ2 スプライソソーム 膜 核小体 スプライソソーム複合体 細胞外エクソソーム 核 細胞外マトリックス 核質 SMADタンパク質複合体 細胞質 リボ核タンパク質複合体 生物学的プロセス 骨格筋細胞分化の調節 DNAテンプレート転写の調節 リズミカルなプロセス ウイルスゲノム複製の調節 mRNAの処理 mRNA転写 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の調節 DNAテンプレート転写 細胞増殖 骨芽細胞分化の調節 RNA二次構造の巻き戻し p53クラスメディエーターによる内因性アポトーシスシグナル伝達経路 RNAスプライシング アンドロゲン受容体シグナル伝達経路の調節 DNA損傷応答の正の調節、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達 スプライソソームを介したmRNAスプライシング スプライソソームを介した選択的mRNAスプライシングの制御 核転写されたmRNAの分解プロセス スプライソソームを介した選択的mRNAスプライシング RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 細胞内エストロゲン受容体シグナル伝達経路 アンドロゲン受容体シグナル伝達経路 上皮間葉転換 筋芽細胞分化 RNAポリメラーゼIIによるpri-miRNA転写 BMPシグナル伝達経路 RNAポリメラーゼIIによるpri-miRNA転写の制御 miRNAによる遺伝子サイレンシングに関与するmiRNAの産生の正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 ヒト マウス Entrez 1655 13207 アンサンブル ENSG00000108654 ENSMUSG00000020719 UniProt P17844 Q61656 RefSeq (mRNA) NM_004396 NM_001320595 NM_001320596 NM_001320597 NM_007840 NM_001355676 NM_001355677 RefSeq（タンパク質） NP_001307524 NP_001307525 NP_001307526 NP_004387 該当なし 場所（UCSC） 17番染色体：64.5～64.51 Mb 11番染色体：106.67～106.68 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
ヒトの表示/編集 マウスの表示/編集

ATP依存性RNAヘリカーゼDDX5（おそらくDEADボックスタンパク質5またはRNAヘリカーゼp68）は、ヒトではDDX5遺伝子によってコードされている酵素です。^{[ 5 ]}

機能

保存されたモチーフAsp - Glu - Ala -Asp（DEAD）を特徴とするDEADボックスタンパク質は、推定上のRNAヘリカーゼです。翻訳開始、核およびミトコンドリアのスプライシング、リボソームおよびスプライソソームの組み立てなど、RNA二次構造の変化を伴う多くの細胞プロセスに関与しています。分布パターンに基づいて、このファミリーの一部のメンバーは、胚形成、精子形成、^{[ 6 ]}、および細胞の成長と分裂に関与していると考えられています。この遺伝子は、RNA依存性ATPaseであるDEADボックスタンパク質と、サルウイルス40腫瘍抗原と特異的に反応する増殖関連核抗原をコードしています。この遺伝子は13のエクソンで構成され、複数のイントロン配列を含む選択的スプライシング転写産物が検出されていますが、これらの転写産物によってコードされるアイソフォームは同定されていません。^{[ 5 ]}

相互作用

DDX5は、以下のものと 相互作用することが示されています

• AKAP8 , ^{[ 7 ]}
• DDX17（p72）^{[ 8 ]}
• DHX9（RNAヘリカーゼA）^{[ 9 ]}
• エストロゲン受容体α , ^{[ 10 ]}
• フィブリラリン, ^{[ 11 ]}
• HDAC1 , ^{[ 12 ]}
• p53、^{[ 13 ]}
• CTCF ^{[ 14 ]}​

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000108654 – Ensembl、2017年5月
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4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 「Entrez遺伝子：DDX5 DEAD（Asp-Glu-Ala-Asp）ボックスポリペプチド5」。
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さらに読む

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