ハプログループE-V38

ハプログループE-V38（旧E3a / E1b1a）
起源の可能性のある時期41,400年前[1]
合体年齢39,200年前[1]
起源地の可能性東アフリカ[2] [3]
祖先E-P2
子孫E-M2、E-M329
突然変異の定義L222.1、V38、V100

ハプログループ E-V38はE1b1a-V38とも呼ばれ、主要なヒト Y 染色体 DNA ハプログループです。E-V38 は主にアフリカに分布しています。E-V38 には 2 つの基底分岐、E-M329とE-M2があります。[2] [a] [b] E-M329 は主に東アフリカで見られるサブクレードです。[2] E-M2 は西アフリカ、中央アフリカ、南アフリカ、およびアフリカ大湖地域で優勢なサブクレードです。また、北アフリカ、西アジア、南ヨーロッパにも中程度の頻度で見られます。

起源

Trombetta ら (2011) による 2 つの SNP (V38 と V100) の発見は、E-V38 系統樹を大幅に再定義しました。これにより、著者らは E-V38 が東アフリカに起源を持つ可能性があると示唆しました。V38 は、西アフリカに関連する E-M2 および北東アフリカに関連する E-M329 を、E-P2 と同様に東アフリカに起源を持つ可能性のある以前の共通祖先と結び付けます。[2]下流の SNP E-M180 は、14,000 年前と 10,000 年前の間に北アフリカの湿潤な南中央サハラのサバンナ/草原に起源を持つ可能性があります。 [4] [5] [6] [7] Wood ら (2005) と Rosa ら (2007) によると、 E-V38 は西アフリカに関連するE-M2 および北東アフリカに関連する E-M329 を、東アフリカに起源を持つ可能性のある以前の共通祖先と結び付けます。 (2007) によると、こうした人口移動によって中央アフリカ、南部アフリカ、南東部アフリカに以前から存在していた集団の Y 染色体の多様性が変化し、これらの地域で以前のハプログループ頻度 (ハプログループAおよびB-M60 ) が、現在支配的なE1b1a1系統に置き換わった。ただし、ムブティ族やコイサン族などの特定の集団に共通するY DNA ハプログループA1a、A1b、A2、A3、B-M60の存在を通じて、これらの地域では今日でも以前の居住者の痕跡を観察することができる。[8] [9] [10] Shriner ら (2018) も同様に、ハプログループ E1b1a-V38 が約 19,000 年前に緑のサハラ砂漠を東から西に移動したと示唆しており、その後、E1b1a1-M2が西アフリカまたは中央アフリカで発生した可能性がある。 （2018）はまた、この移動を鎌状赤血球変異を通じて追跡しており、その起源はおそらく緑のサハラ時代に遡ると考えられる。[3]

古代DNA

ガドら（2021）は、古代エジプトのラムセス3世と未知の人間E（おそらくペンタウェア）のミイラがハプログループE1b1aを有していたことを示唆しており、[11]このハプログループが最も高い頻度で出現するのは中央アフリカで約60％、西アフリカで約80％である。[12]

古代エジプト第18王朝のアマルナ時代のミイラの中には、ハプログループE1b1aとLを持つものもあった。[12] [13]

ポルトガルのカベソ・ダ・アモレイラでは、16世紀から18世紀の間に、セネガンビア沿岸地域（ガンビア、モーリタニア、セネガル）出身でハプログループE1b1aとL3b1aを持つ西アフリカの奴隷男性が 貝塚の間に埋葬されました。 [14]

分布

E-V38の頻度と多様性は西アフリカで最も高い。アフリカ内では、E-V38は西から東、そして南から北への傾斜分布を示す。言い換えれば、このハプログループの頻度は、西アフリカおよび南部アフリカから東アフリカおよび北部アフリカへと移動するにつれて低下する。[15]

サブクレード

E-M2

E1b1a1は、DYS271/M2/SY81、M291、P1/PN1、P189、P293、V43、およびV95というマーカーによって定義されます。E-M2は、多くの分岐を持つ多様なハプログループです。

E-M329

E1b1a2はSNP変異M329によって定義される。[c] E-M329は主に東アフリカで発見される。[2] E-M329はエチオピア南西部、特にオモティック語族の間で多く見られる。[16] [17]

系統学

系統発生の歴史

2002年以前、Y染色体系統樹には学術文献において少なくとも7つの命名体系が存在していました。これが大きな混乱を招きました。2002年、主要な研究グループが集結し、Y染色体コンソーシアム（YCC）が設立されました。彼らは共同論文を発表し、全員が使用に合意した単一の新しい系統樹を作成しました。その後、集団遺伝学と遺伝系譜学に関心を持つ市民科学者のグループがワーキンググループを結成し、何よりもタイムリーであることを目指したアマチュア系統樹を作成しました。以下の表は、2002年の画期的なYCC系統樹の時点で、これらの研究成果をまとめたものです。これにより、古い文献をレビューする研究者は、複数の命名体系を迅速に切り替えることができます。

YCC 2002/2008 (速記)（α）（β）（γ）（δ）（ε）（ζ）（η）YCC 2002（手書き）YCC 2005（手書き）YCC 2008（手書き）YCC 2010r（手書き）ISOGG 2006ISOGG 2007ISOGG 2008ISOGG 2009ISOGG 2010ISOGG 2011ISOGG 2012
E-P292133A13ユーロピウム3水素BE*EEEEEEEEEE
E-M332133A13ユーロピウム3水素BE1*E1E1aE1aE1E1E1aE1aE1aE1aE1a
E-M442133A13ユーロピウム3水素BE1aE1aE1a1E1a1E1aE1aE1a1E1a1E1a1E1a1E1a1
E-M752133A13ユーロピウム3水素BE2aE2E2E2E2E2E2E2E2E2E2
E-M542133A13ユーロピウム3水素BE2bE2bE2bE2b1-------
E-P2253414ユーロピウム3水素BE3*E3E1bE1b1E3E3E1b1E1b1E1b1E1b1E1b1
E-M283515ユーロピウム水素BE3a*E3aE1b1E1b1aE3aE3aE1b1aE1b1aE1b1aE1b1a1E1b1a1
E-M5883515ユーロピウム水素BE3a1E3a1E1b1a1E1b1a1E3a1E3a1E1b1a1E1b1a1E1b1a1E1b1a1a1aE1b1a1a1a
E-M116.283515ユーロピウム水素BE3a2E3a2E1b1a2E1b1a2E3a2E3a2E1b1a2E1b1a2E1ba12削除された削除された
E-M14983515ユーロピウム水素BE3a3E3a3E1b1a3E1b1a3E3a3E3a3E1b1a3E1b1a3E1b1a3E1b1a1a1cE1b1a1a1c
E-M15483515ユーロピウム水素BE3a4E3a4E1b1a4E1b1a4E3a4E3a4E1b1a4E1b1a4E1b1a4E1b1a1a1g1cE1b1a1a1g1c
E-M15583515ユーロピウム水素BE3a5E3a5E1b1a5E1b1a5E3a5E3a5E1b1a5E1b1a5E1b1a5E1b1a1a1dE1b1a1a1d
E-M1083515ユーロピウム水素BE3a6E3a6E1b1a6E1b1a6E3a6E3a6E1b1a6E1b1a6E1b1a6E1b1a1a1eE1b1a1a1e
E-M35253414ユーオー4水素BE3b*E3bE1b1b1E1b1b1E3b1E3b1E1b1b1E1b1b1E1b1b1削除された削除された
E-M78253414ユーオー4水素BE3b1*E3b1E1b1b1aE1b1b1a1E3b1aE3b1aE1b1b1aE1b1b1aE1b1b1aE1b1b1a1E1b1b1a1
E-M148253414ユーオー4水素BE3b1aE3b1aE1b1b1a3aE1b1b1a1c1E3b1a3aE3b1a3aE1b1b1a3aE1b1b1a3aE1b1b1a3aE1b1b1a1c1E1b1b1a1c1
E-M81253414ユーオー4水素BE3b2*E3b2E1b1b1bE1b1b1b1E3b1bE3b1bE1b1b1bE1b1b1bE1b1b1bE1b1b1b1E1b1b1b1a
E-M107253414ユーオー4水素BE3b2aE3b2aE1b1b1b1E1b1b1b1aE3b1b1E3b1b1E1b1b1b1E1b1b1b1E1b1b1b1E1b1b1b1aE1b1b1b1a1
E-M165253414ユーオー4水素BE3b2bE3b2bE1b1b1b2E1b1b1b1b1E3b1b2E3b1b2E1b1b1b2aE1b1b1b2aE1b1b1b2aE1b1b1b2aE1b1b1b1a2a
E-M123253414ユーオー4水素BE3b3*E3b3E1b1b1cE1b1b1cE3b1cE3b1cE1b1b1cE1b1b1cE1b1b1cE1b1b1cE1b1b1b2a
E-M34253414ユーオー4水素BE3b3a*E3b3aE1b1b1c1E1b1b1c1E3b1c1E3b1c1E1b1b1c1E1b1b1c1E1b1b1c1E1b1b1c1E1b1b1b2a1
E-M136253414ユーオー4水素BE3ba1E3b3a1E1b1b1c1aE1b1b1c1a1E3b1c1aE3b1c1aE1b1b1c1a1E1b1b1c1a1E1b1b1c1a1E1b1b1c1a1E1b1b1b2a1a1

研究出版物

YCC ツリーの作成には、以下の研究チームがそれぞれの出版物ごとに参加しました。

  • α Jobling と Tyler-Smith 2000 および Kaladjieva 2001
  • βアンダーヒル2000
  • γハマー 2001
  • δカラフェット 2001
  • εセミノ 2000
  • ζス 1999
  • ηカペリ 2001

系統樹

このハプログループサブクレードの系統樹は、Y染色体コンソーシアム（YCC）2008年系統樹[18] 、 ISOGG Y-DNAハプログループE系統樹[5] 、およびその後に発表された研究に基づいています。

  • E1b1a (L222.1, V38, V100)
    • E1b1a1 (DYS271/M2/SY81、M291、P1/PN1、P189、P293、V43、V95、Z1101、Z1107、Z1116、Z1120、Z1122、Z1123、Z1124、Z1125、Z1127、Z1130、Z1133)
    • E1b1a2 (M329)

参照

WikiquoteにはハプログループE-V38に関連する引用があります。

遺伝学

Y-DNA Eサブクレード

Y-DNAバックボーンツリー

注記

  1. ^ E-M329は以前はE1b1cおよびE1b1*として知られていました
  2. ^ E-M2は以前はE3aおよびE1b1aとして知られていました
  3. ^ E-M329 は以前は E1b1c として知られていました。

参考文献

  1. ^ ab "E-V38 YTree".
  2. ^ abcde Trombetta, Beniamino; Fulvio Cruciani; Daniele Sellitto; Rosaria Scozzari (2011年1月6日). MacAulay, Vincent (編). 「新たに特徴付けられた二元多型を用いて明らかにされたヒトY染色体ハプログループE1b1 (E-P2) の新しいトポロジー」. PLOS ONE . 6 (1) e16073. Bibcode :2011PLoSO...616073T. doi : 10.1371/journal.pone.0016073 . PMC 3017091 . PMID  21253605。ハプログループE1b1には現在、2つの基底分岐E-V38（E1b1a）とE-M215（E1b1b）が含まれており、V38/V100は、以前に分離された2つの系統E-M2（旧E1b1a）とE-M329（旧E1b1c）に加わっています。これら2つの系統はそれぞれ、独特の地理的分布をしています。E-M2はサハラ以南のアフリカで最も一般的なハプログループであり、頻度のピークは西部（約80％）と中央アフリカ（約60％）にあります。同じハプログループは北アフリカにも存在しますが、頻度は低く（通常10％未満）なっています[9]–[11]。一方、ハプログループE-M329は、E-M2が事実上存在しない東部アフリカでほぼ独占的に観察されました[10]、[12およびRS未発表データ]。 E1b1の2番目の基底枝であるE-M215は、南ヨーロッパから北アフリカおよび東アフリカまで広範囲に分布しており、起源はアフリカではないかと提唱されている[8]。今回報告された新たなトポロジーは、ハプログループE1b1の起源に関して重要な示唆を与える。系統地理学的倹約の原理を用いると、E1b1bの三分岐がE-M2とE-M329の共通祖先に帰結したことは、ハプログループE1b1が以前示唆されていたように東アフリカに起源を持つという仮説[10]、そしてサハラ以南のアフリカで頻繁に観察されるE-M2染色体が東アフリカに存在する共通祖先に由​​来するという仮説を強く支持する。 
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変換表のソース

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