ハプログループR（Y-DNA）

ハプログループR
起源の可能性のある時期約27,000年前[ 1 ] [ 2 ]
起源地の可能性北アジア、[ 3 ]インド亜大陸、[ 4 ]中央アジア、または中東[ 5 ]
祖先P-M45 （P1c、以前はP1）は、 P*（P-F5850）の3つの主要な系統の1つです。
子孫R1（R-M173）、R2（R-M479）（R2）
突然変異の定義M207/Page37/UTY2、CTS207/M600/PF5992、CTS2426/M661/PF6033、CTS2913/M667、CTS3229/M672/PF6036/YSC0001265、CTS3622/PF6037、CTS5815/M696、CTS6417/Y480、CTS7876/PF6052、CTS7880/M725/PF6053、CTS8311/M732、CTS9005/M741、CTS10663/M788、CTS11075/M795/P6078、CTS11647/Y369、F33/M603/PF6013、 F63/M614/PF6016、F82/M620、F154/M636、F295/M685、F356/M703/PF5919、F370/M708/Y479、F459/Y482、F652/M805、F765、FGC1168、L248.3/M705.3、L747/M702/PF5918/YSC0000287、L760/M642/PF5877/YSC0000286、L1225/M789/YSC0000232、L1347/M792/PF6077/YSC0000233、M613、M628/PF5868、 M651/Y296、M718、M734/PF6057/S4/YSC0000201、M760/Y506、M764/PF5953、M799、P224/PF6050、P227、P229/PF6019、P232、P280、P285、PF5938、 PF6014/S9 [ 1 ]

ハプログループR（R-M207）は、 Y染色体DNAハプログループです。現代の人口に広く分布し、その数は膨大です。

いくつかの子孫サブクレードは、ヨーロッパ、中央アジア、南アジアで先史時代から発見されています。他のサブクレードは、西アジアとアフリカの一部で、低レベルではありますが、古くから存在していました。また、一部の専門家は、R-M207が北米のネイティブアメリカンの間で古くから存在していたという、より物議を醸す説を唱えていますが、この説はまだ広く受け入れられていません。[ 6 ]

遺伝学者スペンサー・ウェルズによると、ハプログループKは中東または中央アジアに起源を持つ。[ 5 ]しかし、Karafetら（2014）は、K2としても知られるK-M526の「急速な多様化…」は東南アジア（インドネシア付近）で発生し、後にアジア大陸に拡大した可能性が高いと提唱したが、ユーラシアで発生し、後にそこで絶滅した可能性も排除できず、どちらのシナリオも「同程度に倹約的」であると述べた。[ 7 ] Bergstormらによると、オーストラリア先住民に見られるハプログループK2b1（YハプログループS/M）と、ハプログループRおよびQ（YハプログループK2b2 /ルートP）の祖先は、東南アジアのサフル付近で分岐した。[ 8 ]

構造

ヒトY-DNA系統樹
ハプログループR
M207（R）

起源

遺伝学者スペンサー・ウェルズは、ハプログループKは中東または中央アジア、おそらくイランまたはパキスタンの地域で発生したと示唆している。[ 5 ]バーグストームらによると、オーストラリア先住民に見られる根深いハプログループK2b1（YハプログループS/M）と、ハプログループRおよびQ（YハプログループK2b2 /ルートP）の祖先は、サフル近郊の東南アジアで分岐した。[ 8 ]ハプログループP1は東南アジアで出現した可能性があるが、カラフェットらによると、この仮説は「婉曲的」であり、ユーラシア大陸の他の地域で発生した可能性も同様に高い。[ 7 ]ハプログループRを定義するSNP M207は、約27,000年前の上部旧石器時代に発生したと考えられている。 [ 2 ] [ 1 ]

マルタ少年（MA-1）の遺骨と墓の副葬品、エルミタージュ美術館、サンクトペテルブルク。[ 9 ]

基底R*の確認された例は、シベリアのバイカル湖近くのマルタ・ビューレト文化で発見された24,000年前の遺跡MA1として知られる1例のみである。[ 2 ] （R-M207(xM17,M124)の生存例は2012年に報告されたが、SNP M478の検査は行われなかった。そのため、アフガニスタンのバダフシャン出身の158人のタジク人男性サンプルの中の当該男性はR2に属する可能性がある。）

R-M207の主要な分岐であるR1（R-M173）とR2（R-M479）は、どちらもその基底的な原型、すなわちR1*とR2*の状態で存在していない可能性があります。科学文献には、生存例も死亡例も確認された例はありません。（ただし、R2*については、比較的研究が進んでいません。）

R* と R1* は希少であるにもかかわらず、特に R1 からのサブクレードが地理的にも数的にも比較的急速に拡大していることがしばしば指摘されています。「R1a と R1b はどちらも若い星のような拡大を構成しています」( Karafet 2008 )。

特にR1bの広範な地理的分布も注目されている。Hallastら（2014）は、中央アジアで発見された生存例には以下が含まれると述べている。

  • R-M269 (R1b1a1a2) の「最も深いサブクレード」 - 西ヨーロッパで最も数が多い R1b の分岐、および
  • 希少なサブクレード R-PH155 (R1b1b) はブータン人 1 名とタジク人 1 名にのみ発見されました。

(Hallast らは、R-PH155 が「R1a/R1b の分岐とほぼ同じくらい古い」と示唆しましたが、R-PH155 は後に R-L278 (R1b1) のサブ系統であることが発見され、系統学名 R1b1b が与えられました。)

分布

YハプログループR-M207は、ヨーロッパ、南アジア、中央アジア全域で広く見られます（Kayser 2003）。コーカサス山脈とシベリアにも分布しています。アフリカの一部の少数民族も、R-M207のサブクレードを高頻度に保有しています。

ハプログループPなどの提案された移住ルート。[ 10 ]

アメリカ大陸やオーストラリアの一部の先住民にも高レベルの R-M207 がみられますが、これが根深いものなのか、近世初期のヨーロッパの植民地化の影響なのかは不明です。

R（R-M207）

ハプログループR* Y-DNA（xR1,R2）は、シベリアのバイカル湖近くのマルタで発見された24,000年前の遺体から発見されました。 [ 11 ] 2013年には、東キルギスタンのキルギス人 の男性132人のうち1人からR-M207が発見されました。[ 12 ]

R1（R-M173）

ハプログループ R には多くの下流変異が存在する ( Semino 2000およびRosser 2000 )。

当初、ネイティブアメリカンにおけるハプログループR1bの起源については議論がありました。初期の2つの研究では、このハプログループがネイティブアメリカンのシベリア起源系統の一つである可能性が示唆されました。しかし、現在ではこの可能性は低いと考えられています。なぜなら、ネイティブアメリカンによく見られるR1b系統は、ほとんどの場合西ヨーロッパ人の系統と同一であり、その最も高い集中度は北米東部の様々な文化的に無関係な部族に見られるからです。[ 13 ]

そのため、複数の著者によれば、R1bは1492年以降にヨーロッパ人が北米に移住した際に混血によって導入された可能性が高いと考えられています。[ 14 ] [ 15 ] [ 16 ]

R2（R-M479）

ハプログループR-M479は、マーカーM479の存在によって定義されます。R-M479系統のパラグループは主に南アジアに見られますが、ポルトガル人、スペイン人、タタール人（ロシア、バシコルトスタン）、オセチア人（コーカサス）にも根深い例が見られます（Myres 2010）。

1 つのまれなサブグループが、おそらく創始者効果の結果として、アシュケナージ系ユダヤ人の間でのみ発生する可能性があります。

参照

遺伝学

Y-DNA R-M207サブクレード

Y-DNAバックボーンツリー

参考文献

  1. ^ a b c ISOGG、Y-DNAハプログループRとそのサブクレード – 2016（2016年12月12日）。
  2. ^ a b c Raghavan, M. et al. 2014. 上部旧石器時代シベリアゲノムがネイティブアメリカンの二重祖先を明らかにする、Nature、505、87–91。
  3. ^ Mahal, David G.; Matsoukas, Ianis G. (2018). 「インド亜大陸における民族の地理的起源：Y-DNAハプログループによる古代の足跡の探究」 . Frontiers in Genetics . 9 : 4. doi : 10.3389/fgene.2018.00004 . ISSN 1664-8021 . PMC 5787057. PMID 29410676.これはインドとパキスタンで最大のハプログループの一つであり、本研究で使用したデータセットの中でも最大のハプログループである。約2万7000年前に北アジアで起源を持つ（ISOGG, 2016）。これはヨーロッパで最も一般的なハプログループの一つであり、一部の地域ではその分派が人口の80%に達しています（Eupedia, 2017）。Y染色体M207変異を持つ男性の子孫の一部は、中央アジアのどこかから南下し、約1万年前にインドに到達しました（Wells, 2007）。   
  4. ^ドリーム、ジョージ・L・ヴァン（2021年5月25日）『民族言語学的先史時代：言語、遺伝子、物質文化の観点から見た世界の人類化』 BRILL社、204頁。ISBN 978-90-04-44837-7。
  5. ^ a b cウェルズ、スペンサー（2007年11月20日）『Deep Ancestry: The Landmark DNA Quest to Decipher Our Distant Past』ナショナルジオグラフィック・ブックス、p. 79、ISBN 978-1-4262-0211-7。「Kが広範囲に分布していることを考えると、おそらく中東または中央アジア、おそらくイランまたはパキスタンの地域で発生したと考えられます。」
  6. ^ Zhao, Zhongming; Khan, Faisal; Borkar, Minal; Herrera, Rene; Agrawal, Suraksha (2009). 「北インド人における3つの異なる父系系統の存在：560個のY染色体の研究」 Annals of Human Biology . 36 (1): 46– 59. doi : 10.1080/03014460802558522 . ISSN 0301-4460 . PMC 2755252 . PMID 19058044 .図3   
  7. ^ a b Karafet TM, Mendez FL, Sudoyo H, Lansing JS, Hammer MF (2015年3月). 「東南アジアにおけるY染色体ハプログループK-M526の系統分類学的解像度の向上と急速な多様化」 . European Journal of Human Genetics . 23 (3): 369– 73. doi : 10.1038/ejhg.2014.106 . PMC 4326703. PMID 24896152 .  このパターンから、P-P295は東南アジア起源であり、サブハプログループRとQの祖先が後にアジア大陸に進出したという仮説が立てられます。別の説明としては、アジア全域における祖先P-P295*染色体の絶滅が考えられます。これらのシナリオはいずれも同様に簡潔です。P*染色体がインドネシアからアジア大陸へ移動したか、ユーラシア大陸におけるP-P295*準グループの絶滅が考えられます。
  8. ^ a b Bergström, Anders; Nagle, Nano; Chen, Yuan; McCarthy, Shane; Pollard, Martin O.; Ayub, Qasim; Wilcox, Stephen; Wilcox, Leah; van Oorschot, Roland AH; McAllister, Peter; Williams, Lesley; Xue, Yali; Mitchell, R. John; Tyler-Smith, Chris (2016年3月). 「オーストラリア先住民アボリジニY染色体の深いルーツ」 . Current Biology . 26 (6): 809– 813. Bibcode : 2016CBio...26..809B . doi : 10.1016 / j.cub.2016.01.028 . PMC 4819516. PMID 26923783 .  「放射性炭素年代測定された約45千年前のユーラシア人サンプルのY染色体上の欠損突然変異数から推定される、1部位あたり年間0.76 × 10−9の点突然変異率を適用すると[18]、サフルのK∗/M染色体とそれに最も近いRおよびQハプログループとの間の分岐時間は54.3千年（95%信頼区間[CI]：48.0～61.6千年）と推定されます（図1B）」 - (図1B)：「ハプログループK∗およびMのY染色体の系統発生。これは、(A)に表示されている大きな樹形図の一部を詳細に示しており、ハプログループK∗およびMの染色体に焦点を当てています。系統発生上K∗およびMに最も近いハプログループQおよびRは、サンプル数が非常に多いため、模式的に表示されています。オーストラリア先住民とパプア人のサンプルは、視覚的に区別しやすいように 2 つの異なる赤色で色分けされています。
  9. ^ Lbova, Liudmila (2021). 「シベリア旧石器時代遺跡マルタ：幼少期考古学研究のためのユニークな情報源」 .進化人間科学. 3 : 8, 図6-1. doi : 10.1017/ehs.2021.5 . PMC 10427291. PMID 37588521 .  
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  11. ^ Raghavan M, Skoglund P, Graf KE, Metspalu M, Albrechtsen A, Moltke I, et al. (2014年1月). 「上部旧石器時代シベリアのゲノムがネイティブアメリカンの二重祖先を明らかにする」 . Nature . 505 ( 7481): 87– 91. Bibcode : 2014Natur.505...87R . doi : 10.1038/nature12736 . PMC 4105016. PMID 24256729 .  
  12. ^ Di Cristofaro J、Pennarun E、Mazières S、Myres NM、Lin AA、Temori SA、他。 (2013 年 10 月 18 日)。「アフガニスタンのヒンドゥークシュ：ユーラシア亜大陸の遺伝子の流れが集まる場所」。プロスワン。8 (10) e76748。Bibcode : 2013PLoSO...876748D。土井：10.1371/journal.pone.0076748。PMC 3799995。PMID 24204668。  
  13. ^ボルニック、デボラ；ボルニック、ダニエル；スミス、デイビッド（2006年）「北米東部のネイティブアメリカンにおける男性と女性の遺伝的歴史の非対称性」分子生物学と進化23 ( 11): 2161– 2174. doi : 10.1093/molbev/msl088 . PMID 16916941 . 多くの場合、特定のハプログループが古代のネイティブアメリカンの系統を表すのか、それとも1492年以降の混合を表すのかについては広く合意が得られていますが、ハプログループR-M173の地位については最近議論が続いています。一部の研究者は、このハプログループは創始的なネイティブアメリカンの系統を表すと主張していますが（Lell et al. 2002; Bortolini et al. 2003）、他の研究者は、それが最近のヨーロッパ人との混合を反映していると主張しています（Tarazona-Santos and Santos 2002; Bosch et al. 2003; Zegura et al. 2004）。北米東部では、このハプログループ内のハプロタイプの変異パターンは後者の仮説を支持しています。R-M173ハプロタイプは、他の創始的ハプログループのハプロタイプのように人口や文化圏ごとにクラスター化せず、ほとんどがR-M173ハプロタイプと一致するか、密接に関連しています。ヨーロッパでは一般的だがアジアでは稀なハプロタイプである。このパターンは、ネイティブアメリカンのR-M173ハプロタイプがアジアのハプロタイプから派生したものであるとすれば予想されていたものとは逆であり、北米東部におけるR-M173ハプログループの存在は、近年のヨーロッパ人との混合によるものであることを示唆している。
  14. ^ボルニック、デボラ・アン（2005年）『北アメリカ東部の遺伝的先史時代：古代および現代のDNAによる証拠』カリフォルニア大学デービス校、p.83。「ハプログループ R - M173 は、P-M45* と同様に、最近 (1492 年以降) のヨーロッパ人の混合を表す可能性が高い (Tarazona-Santos および Santos 2002、Bosch 他 2003)。」
  15. ^ラフ、ジェニファー（2022年2月8日）『起源：アメリカ大陸の遺伝史』グランドセントラル出版、  59～ 60頁。ISBN 978-1-5387-4970-8。ネイティブアメリカンのY染色体創始者ハプログループには、Q-M3（およびそのサブハプログループであるQ-CTS1780）、C3-MPB373（おそらくC-P39-Z30536）が含まれます。R1bなど、ネイティブアメリカン集団に見られる他のハプログループは、ヨーロッパ人との接触後の混合の結果である可能性が高いと考えられます（44）。
  16. ^マルヒ、リパン・シン;ゴンザレス・オリバー、アンジェリカ。シュローダー、カリ・ブリット。他。 （2008年12月）。「北アメリカ先住民の間の Y 染色体の分布: アタパスカ族の人口史の研究」。アメリカ物理人類学ジャーナル。137 (4): 412–424 .土井: 10.1002/ajpa.20883。PMC 2584155。PMID 18618732。  ハプログループ Q および C に属さないすべての個人は、これらのハプロタイプが非ネイティブ混合の結果である可能性が高いため、ハプロタイプデータセットから除外されました (Tarazona-Santos および Santos、2002 年、Zegura 他、2004 年、Bolnick 他、2006 年)。ハプログループ C の頻度は北アメリカ北西部で最も高く、ヨーロッパ人との混合に起因するハプログループ R の頻度は北アメリカ北東部で最大に達します。

さらに読む

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