ヒトのタンパク質コード遺伝子
AFF2 識別子 別名 AFF2 、FMR2、FMR2P、FRAXE、MRX2、OX19、AF4/FMR2ファミリーメンバー2、XLID109 外部ID OMIM : 300806; MGI : 1202294; HomoloGene : 136314; GeneCards : AFF2; OMA :AFF2 - オーソログ 遺伝子の位置（ マウス ） 染色体 X染色体（マウス） [2] バンド X|X A7.1- A7.2 開始 68,403,900 bp [2] 終了 68,911,643 bp [2]
RNA発現 パターン Bgee ヒト マウス （相同遺伝子） 最もよく発現している 神経節隆起 アキレス腱 脳室帯 骨髄細胞 ブロードマン脳領域23 歯周線維 小脳皮質 小脳半球 右肺 中側頭回
最もよく発現している 生殖結節 顆粒球 脊髄の腰椎亜節 胚尾 海馬歯状回顆粒細胞 神経節隆起 上前頭回 胚 脳室帯 一次視覚野
より多くの参照発現データ
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能 グアニン四重鎖RNA結合 RNA結合 二本鎖DNA結合 DNA結合転写因子活性 細胞成分 生物学的プロセス mRNAの処理 RNAスプライシングの調節 脳の発達 RNAスプライシング 学習または記憶 遺伝子発現の調節 遺伝子発現の負の調節 核スペックル組織 DNAテンプレートによる転写の調節 出典：Amigo / QuickGO
相同遺伝子 種 ヒト マウス エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_002025 NM_001169122 NM_001169123 NM_001169124 NM_001169125 NM_001170628
RefSeq（タンパク質） NP_001162593 NP_001162594 NP_001162595 NP_001162596 NP_001164099 NP_002016
場所（UCSC） Chr X: 148.5 – 149 Mb 染色体X: 68.4 – 68.91 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
AF4/FMR2ファミリーメンバー2 は、ヒトでは AFF2 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] AFF2 の変異は 乳がんの 症例に関与していることが示唆されている 。 [6]
この遺伝子のCCGリピート伸長は、 X連鎖性知的障害、特に 脆弱XE型精神遅滞 （FRAXE）として知られる症候群と関連しています 。FRAXEは、非症候群性X連鎖性知的障害の最も一般的な形態の一つです。この遺伝子は、この病態にちなんでFMR2（脆弱精神遅滞2）とも呼ばれています。 [7]
ゲノミクス この遺伝子はX染色体長腕（Xq27.3-Xq28）に位置し、少なくとも500kbに及ぶ22のエクソンを持ちます。選択的スプライシングが発生する可能性があり、エクソン2、3、5、7、および21が関与します。通常、コードされるタンパク質は1311 コドンの長さです。 胎盤 および成人の 脳 では8.7kbの転写産物として発現します 。 [ 要出典 ]
通常の5'非翻訳領域は10～35回のCCGリピート配列を持ち、通常は15～20回である。病原性伸展領域では典型的に200回以上のリピート配列を持ち、メチル化されている。 [ 要出典 ]
この遺伝子はAFFファミリー遺伝子に属し、現在4つのメンバー、 AFF1 /AF4、AFF2/FMR2、 AFF3 /LAF4、AFF4/AF5q31が存在します。 [8] すべてのAFFタンパク質は核内に局在し、RNA伸長に正の作用を示す転写活性化因子として機能します。AFF2/FMR2、AFF3/LAF4、AFF4/AF5q31は核スペックル（pre-mRNAスプライシング因子の貯蔵／修飾部位と考えられている核内構造）に局在し、グアニン四重鎖構造に対して高い見かけの親和性でRNAに結合することができます。これらは、グアニン四重鎖RNA形成構造との相互作用を介して選択的スプライシングを調節すると考えられます。
このファミリーの他のメンバーは、染色体転座の結果として融合遺伝子を形成し、骨髄性/リンパ性または混合系 白血病 の発症に関与することが報告されています。
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000155966 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000031189 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「Entrez Gene: AFF2 AF4/FMR2 ファミリー、メンバー 2」。 ^ がんゲノムアトラスネットワーク（2012年10月）. 「ヒト乳がんの包括的な分子ポートレート」. Nature . 490 (7418): 61– 70. Bibcode :2012Natur.490...61T. doi :10.1038/nature11412. PMC 3465532. PMID 23000897 . ^ Stettner GM, Shoukier M, Höger C, Brockmann K, Auber B (2011年8月). 「FMR2遺伝子の小さな欠失によって引き起こされる家族性の知的障害と自閉症的行動」. American Journal of Medical Genetics. Part A. 155A ( 8): 2003–7 . doi :10.1002/ajmg.a.34122. PMID 21739600. S2CID 9568277. ^ メルコ M、ドゥゲ D、ベンサイド M、ゾンガロ S、フェルヘッゲン C、ゲツ J、バルドーニ B (2011 年 5 月)。 「RNA結合タンパク質のAFF（AF4/FMR2）ファミリーの機能的特徴付け：FRAXE知的障害の分子病理学への洞察」。 ヒト分子遺伝学 。 20 (10): 1873 – 85. doi : 10.1093/hmg/ddr069 。 PMID 21330300。
参考文献 Mulley JC, Yu S, Loesch DZ, Hay DA, Donnelly A, Gedeon AK, Carbonell P, López I, Glover G, Gabarrón I (1995年3月). 「FRAXEと精神遅滞」. Journal of Medical Genetics . 32 (3): 162–9 . doi :10.1136/jmg.32.3.162 . PMC 1050310. PMID 7783162 Gecz J, Gedeon AK, Sutherland GR , Mulley JC (1996年5月). 「FRAXE型精神遅滞に関連する遺伝子FMR2の同定」. Nature Genetics . 13 (1): 105–8 . doi :10.1038/ng0596-105. PMID 8673085. S2CID 40161014. Gu Y, Shen Y, Gibbs RA, Nelson DL (1996年5月). 「FRAXE CCGリピートとCpGアイランドに関連する新規遺伝子FMR2の同定」. Nature Genetics . 13 (1): 109–13 . doi :10.1038/ng0596-109. PMID 8673086. S2CID 6781698. Chakrabarti L, Knight SJ, Flannery AV, Davies KE (1996年2月). 「FRAXE脆弱部位における軽度精神障害の候補遺伝子」. Human Molecular Genetics . 5 (2): 275–82 . doi : 10.1093/hmg/5.2.275 . PMID 8824884. Gécz J, Oostra BA, Hockey A, Carbonell P, Turner G, Haan EA, Sutherland GR , Mulley JC (1997年3月). 「FRAXE型精神遅滞家系におけるFMR2発現」. ヒト分子遺伝学 . 6 (3): 435–41 . doi : 10.1093/hmg/6.3.435 . PMID 9147647. Gecz J, Bielby S, Sutherland GR , Mulley JC (1997年9月). 「新しい転写活性化因子ファミリーの一員であるFMR2の遺伝子構造と細胞内局在」. Genomics . 44 (2): 201–13 . doi :10.1006/geno.1997.4867. PMID 9299237. Chakrabarti L, Bristulf J, Foss GS, Davies KE (1998年3月). 「マウス脳内および発達過程におけるFMR2ホモログの発現」. Human Molecular Genetics . 7 (3): 441–8 . doi : 10.1093/hmg/7.3.441 . PMID 9467002. Gecz J, Mulley JC (1999). 「13.7 kbの大型FMR2アイソフォームの特性評価と発現」. European Journal of Human Genetics . 7 (2): 157–62 . doi : 10.1038/sj.ejhg.5200279 . PMID 10196698. Murray A, Webb J, Dennis N, Conway G, Morton N (1999年10月). 「FMR2遺伝子の微小欠失は早産性卵巣不全の重要な原因となる可能性がある」. Journal of Medical Genetics . 36 (10): 767–70 . doi :10.1136/jmg.36.10.767. PMC 1734234. PMID 10528856 . ディアス ネト E、コレア RG、ヴェルジョフスキー アルメイダ S、ブリオネス MR、永井 MA、ダ シウバ W、ザーゴ MA、ボルディン S、コスタ FF、ゴールドマン GH、カルヴァーリョ AF、松隈 A、バイア GS、シンプソン DH、ブランスタイン A、デ オリベイラ PS、ブッチャー P、ヨンジニール CV、オヘア MJ、ソアレス F、ブレンターニRR、レイス LF、デ・ソウザ SJ、シンプソン AJ (2000 年 3 月)。 「ORF 発現配列タグを使用したヒト トランスクリプトームのショットガン シーケンス」。 アメリカ合衆国国立科学アカデミーの議事録 。 97 (7): 3491– 6. Bibcode :2000PNAS...97.3491D。 doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800. Lo Nigro C, Faravelli F, Cavani S, Perroni L, Novello P, Vitali M, Bricarelli FD, Grasso M (2000年3月). 「知的障害のある被験者と表現型的に正常な双子の兄弟におけるFRAXE遺伝子変異」. European Journal of Human Genetics . 8 (3): 157–62 . doi : 10.1038/sj.ejhg.5200425 . PMID 10780779. Tzeng CC, Tzeng PY, Sun HS, Chen RM, Lin SJ (2000年6月). 「台湾における非特異的精神遅滞患者におけるFMR1およびFMR2遺伝子変異スクリーニングの意義」. 診断分子病理学 . 9 (2): 75–80 . doi :10.1097/00019606-200006000-00002. PMID 10850542. ムスメシ SA、スクデリ C、フェッリ R、アネロ G、サルッツォ R、ボスコ P、エリア M (2000 年 9 月)。 「FRAXE精神遅滞にも特有の脳波パターンが存在するのでしょうか?」 臨床神経生理学 。 111 (9): 1632 – 6. 土井 :10.1016/S1388-2457(00)00367-9。 PMID 10964075。S2CID 42912350 。 Hillman MA, Gecz J (2001). 「脆弱XE関連家族性精神遅滞タンパク質2（FMR2）は強力な転写活性化因子として作用する」. Journal of Human Genetics . 46 (5): 251–9 . doi : 10.1007/s100380170074 . PMID 11355014. Kitano T, Schwarz C, Nickel B, Pääbo S (2003年8月). 「ヒトとチンパンジーにおける10のX染色体座位における遺伝子多様性パターン」. Molecular Biology and Evolution . 20 (8): 1281–9 . doi : 10.1093/molbev/msg134 . PMID 12777533. Brylawski BP, Chastain PD, Cohen SM, Cordeiro-Stone M, Kaufman DG (2007年4月). 「脆弱X遺伝子FMR1のプロモーターにおけるDNA複製起点のマッピング」. Experimental and Molecular Pathology . 82 (2): 190–6 . doi :10.1016/j.yexmp.2006.10.004. PMC 1934615. PMID 17196195 .
外部リンク UCSC ゲノムブラウザ におけるヒトAFF2ゲノムの位置とAFF2遺伝子の詳細ページ
