HNRNPK

HNRNPK
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1J5K、1KHM、1ZZI、1ZZJ、1ZZK
識別子
エイリアス	HNRNPK、CSBP、HNRPK、TUNP、AUKS、異種核リボ核タンパク質K
外部ID	オミム: 600712 ; MGI : 99894 ;ホモロジーン: 81909 ;ジーンカード: HNRNPK ; OMA : HNRNPK - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 9番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 9q21.32 始める 83,968,083 bp [ 1 ] 終わり 83,980,616 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 13番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 13|13 B1 始める 58,391,142 bp [ 2 ] 終わり 58,403,343 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 アキレス腱 心室帯 神経節隆起 付録 単球 右卵管 平滑筋組織 左卵巣 甲状腺の右葉 甲状腺の左葉 上位の表現 胚の尾 性器結節 心室帯 神経管 胚葉上層 卵巣 中脳 神経節隆起 精母細胞 網膜の神経層 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 タンパク質結合 核酸結合 DNA結合 一本鎖DNA結合 RNA結合 カドヘリン結合 タンパク質ドメイン特異的結合 同一のタンパク質結合 細胞成分 細胞質 膜 焦点接着 核 触媒ステップ2スプライソソーム 細胞投影 細胞外エクソソーム ポドソーム スプライセオソーム複合体 細胞接合 細胞外マトリックス 核質 細胞質ストレス顆粒 生物学的プロセス 受容体を介したエンドサイトーシスの正の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 スプライソソームを介したmRNAスプライシングの負の制御 p53クラスメディエーターによるDNA損傷に対する内因性アポトーシスシグナル伝達経路の調節 転写の制御、DNAテンプレート 転写、DNAテンプレート ウイルスプロセス RNA処理 mRNA処理 低密度リポタンパク質粒子のクリアランスの調節 スプライソソームを介したmRNAスプライシング シグナル伝達 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 アポトーシス過程の負の調節 RNAスプライシング RNAポリメラーゼIIによる転写 RNA代謝プロセス 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 3190 15387 アンサンブル ENSG00000165119 ENSMUSG00000021546 ユニプロット P61978 P61979 RefSeq (mRNA) NM_002140 NM_031262 NM_031263 NM_001318186 NM_001318187 NM_001318188 NM_001301340 NM_001301341 NM_001301343 NM_001301344 NM_001301345 NM_025279 RefSeq（タンパク質） NP_001305115 NP_001305116 NP_001305117 NP_002131 NP_112552 NP_112553 NP_001288269 NP_001288270 NP_001288272 NP_001288273 NP_001288274 NP_079555 NP_001347419 NP_001347420 NP_001347422 NP_001347423 NP_001347424 場所（UCSC） 9章: 83.97 – 83.98 MB 13章: 58.39 – 58.4 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

異種核リボ核タンパク質K（タンパク質Kとも呼ばれる）は、ヒトではHNRNPK遺伝子によってコードされているタンパク質である。^{[ 5 ]}細胞核内に存在し、異種リボ核タンパク質粒子の構成要素としてプレメッセンジャーRNA （mRNA）に結合している。サルの相同タンパク質はタンパク質H16として知られている。どちらのタンパク質も一本鎖DNAだけでなくRNAにも結合し、ほとんどの遺伝子転写を担うタンパク質であるRNAポリメラーゼIIの活性を刺激することができる。DNAおよびRNAに対するタンパク質の相対的な親和性は溶液条件によって変化し、逆相関しているため、強いDNA結合を促進する条件ではRNA結合は弱くなる。^{[ 6 ]}

タンパク質 K の RNA 結合ドメインに類似している他のタンパク質の RNA 結合タンパク質ドメインは、K 相同ドメインまたはKHドメインと呼ばれます。

プロテインKは大腸癌に関連した研究の対象となっており、点突然変異を含むアイソフォームの発現を誘導するRNA編集イベントが癌細胞に特異的であることが明らかになっている。^{[ 7 ]}

関数

この遺伝子は、普遍的に発現する異種核リボ核タンパク質（hnRNP）のサブファミリーに属します。hnRNPはRNA結合タンパク質であり、異種核RNA （hnRNA）と複合体を形成します。これらのタンパク質は核内のpre-mRNAと関連しており、pre-mRNAのプロセシングやmRNAの代謝・輸送の他の側面に影響を及ぼすと考えられています。すべてのhnRNPは核内に存在しますが、一部は核と細胞質の間を往復しているようです。

hnRNPタンパク質は、それぞれ異なる核酸結合特性を有する。この遺伝子によってコードされるタンパク質は核質に局在し、 RNAに結合するKHドメインを3回繰り返して有する。このタンパク質は、他のhnRNPタンパク質とは結合選択性において異なり、ポリ(C)に強く結合する。このタンパク質は、細胞周期の進行においても重要な役割を果たすと考えられている。この遺伝子には、複数の選択的スプライシングによる転写バリアントが報告されているが、完全に記述されているのは3つだけである。^{[ 8 ]}

HNRNPK遺伝子の両コピーの変異はマウスにおいて胎児致死を引き起こす。両コピーの遺伝子がノックアウトされたマウスは、胚発生14日目までに死亡する。^{[ 9 ]}

臨床的意義

岡本症候群

HNRNPKの変異は、オカモト症候群（オー・クライン症候群とも呼ばれる）を引き起こす。 ^{[ 10 ]}

血液がん

急性骨髄性白血病細胞の約2%に、HNRNPKを囲む領域の欠失が見つかっている。さらに、 HNRNPK遺伝子の1つを人工的にノックアウトしたマウスの大多数は骨髄癌を発症し、3分の1はリンパ系癌を、4%は肝細胞癌を発症した。また、マウスは体が小さく、臓器の発達が遅れており、出生後死亡率が高かった（30%）。生存したマウスの平均寿命は、野生型マウスの50%未満だった。HNRNPKの欠損は、特定の血液細胞の分化に関与する転写因子であるCEBPAのp42アイソフォーム、およびDNA修復のために細胞発達を一時停止する役割を果たすp21（サイクリン依存性キナーゼ阻害因子1）のレベルを特異的に低下させると思われる。^{[ 11 ]}

HNRNPKの過剰発現は、転写ではなく翻訳に関わる異なるメカニズムを介して癌に寄与すると思われる。^{[ 11 ]}

相互作用

HNRPK は以下と相互作用することが示されています。

• CSK、^{[ 12 ]}
• DDX1 , ^{[ 13 ]}
• HNRNPL、^{[ 14 ]}
• KHDRBS1 , ^{[ 15 ]}
• PCBP2 , ^{[ 14 ]}
• PRMT1、^{[ 16 ] [ 17 ]}および
• PTBP1 ^{[ 14 ]}​

KHドメインを含むヒトタンパク質

AKAP1 ; ANKHD1 ; ANKRD17 ; ASCC1 ; BICC1 ; DDX43 ; DDX53 ; DPPA5 ; FMR1 ; FUBP1 ; FUBP3 ; FXR1 ; FXR2 ; HDLBP ; HNRPK ; IGF2BP1 ; IGF2BP2 ; IGF2BP3 ; KHDRBS1 ; KHDRBS2 ; KHDRBS3 ; KHSRP ; KRR1 ; MEX3A ; MEX3B ; MEX3C ; MEX3D ; ノヴァ1 ; ノヴァ2 ; PCBP1 ; PCBP2 ; PCBP3 ; PCBP4 ; PNO1 ; PNPT1 ; QKI ; SF1 ; TDRKH ;

参考文献

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さらに読む

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外部リンク

• PDBe-KBのUniProt : P61978 (ヒト異種核リボ核タンパク質 K (HNRPK))についてPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。

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