NCI-60
NCI -60癌細胞株パネルは、国立癌研究所（NCI）が抗癌作用の可能性を検出する化合物のスクリーニングに使用する60種類のヒト癌細胞株のグループです。 [1]
目的
このスクリーニング手順はNCI-60ヒト腫瘍細胞株スクリーニングと呼ばれ、 NCIの開発治療プログラム（DTP）の発見・開発サービスの一つです。 [2] [3] [4]各細胞株のスクリーニング率は、試験物質の細胞増殖抑制効果と細胞毒性効果を示しています。[2]
細胞株の多様性により、試験化合物をその効果パターンで比較することが可能であり、高い相関関係は潜在的に類似した効果メカニズムに対応している。[2] COMPAREツールは、 88,000以上の純粋化合物と34,000以上の粗抽出物（2017年1月6日現在）のデータベースとの自動比較を提供し、特定の試験物質に対するピアソン相関係数[アップデート]によってランク付けされた物質のリストを表示する。[5]
同じパネルは、分子標的プログラムにおいて分子標的の特性評価にも使用されています。測定項目には、タンパク質レベル、RNA測定、変異状態、酵素活性レベルが含まれます。[6]
細胞株
このパネルには、白血病、黒色腫、非小細胞肺癌、脳癌、卵巣癌、乳癌、大腸癌、腎臓癌、前立腺癌を代表する細胞株が含まれています。[1] [2]
スクリーニングプログラムで使用するために13の追加細胞株が評価されており、その中にはこれまで代表されていなかった小細胞肺癌由来の2つの細胞株が含まれている。[1]
2017年1月6日現在、1つを除くすべての細胞株は、[アップデート]追加の細胞株を含め、他の研究室でも利用可能です。[1]
誤認と誤分類
2000年代初頭から、いくつかの細胞株が調査時またはそれ以前に誤って識別または誤分類されていたことが判明しました。[7] [8] [9]
MDA-MB-435は、もともと乳がん細胞株として分類されていましたが、メラノーマ細胞株であることが確認されました。[7]さらに調査したところ、現在のMDA-MB-435は細胞株M14と同じ個体に由来していることが判明しました。[7]クローンの検査により、M14との混同はMDA-MB-435の開発初期、開発治療プログラムに導入される前に起こったことが明らかになりました。[7]
NCI/ADR-RESは、もともと乳がん細胞株として分類されていましたが、卵巣腫瘍細胞株であることが確認されました。[8] NCI/ADR-RESは、ある時点で細胞株OVCAR-8から派生したようです。[8]もともとこの細胞株はMCF-7/ADR-RESと命名されていましたが、分類の変更に合わせて改名されました。[8]
2つの脳腫瘍細胞株、SNB-19とU251が同一人物由来であることが発見されました。[9]このことから、混同の可能性が高いと考えられます。
61番目の細胞株であるMDA-Nは、誤分類されていたMDA-MB-435細胞株から派生したものであることが確認されました。[7]そのため、この細胞株も誤分類されており、実際にはメラノーマ細胞株ですが、2018年1月6日現在、[アップデート]公式ウェブサイトでは依然として乳がん細胞株として記載されています。[1]この細胞株は2018年1月6日現在、入手できません[アップデート]。[1]
国際細胞株認証委員会は、汚染細胞株のリストを維持している。[10]このリストには上記で報告された細胞株が含まれているが、通常、報告日や論文は、それぞれの細胞株に関する具体的な懸念を引き起こした最初の日付や論文よりもかなり後になっている。[10] [7] [8] [9]
誤った分類の継続的な使用
2014年現在、[アップデート]MDA-MB-435は2007年に正式にメラノーマ細胞株であると宣言された後も、数百もの研究で乳がんのモデルとして使用され、国際的に最も評価の高い査読付き学術誌にも掲載されています。[11]他の誤認細胞株についても同様です。[11]
NCI-60細胞株のリスト
| 細胞株 | 腫瘍の分類 | （潜在的に）誤認 | 元の分類 | 利用できません | 倍加時間（時間） | 接種密度 | セルロサウルスの識別番号とリンク |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CCRF-CEM | 白血病 | 26.7 | 40000 | CCRF-CEM (RRID:CVCL_0207) | |||
| HL-60(TB) | 白血病 | 28.6 | 40000 | HL-60(TB) (RRID:CVCL_A794) | |||
| K-562 | 白血病 | 19.6 | 5000 | K-562 (RRID:CVCL_0004) | |||
| モルト4 | 白血病 | 27.9 | 30000 | モルト4 (RRID:CVCL_0013) | |||
| RPMI-8226 | 白血病 | 33.5 | 20000 | RPMI-8226 (RRID:CVCL_0014) | |||
| SR-786 | 白血病 | 28.7 | 20000 | SR (RRID:CVCL_1711) | |||
| A549 | 非小細胞肺 | 22.9 | 7500 | A-549 (RRID:CVCL_0023) | |||
| EKVX | 非小細胞肺 | 43.6 | 20000 | EKVX (RRID:CVCL_1195) | |||
| ホップ62 | 非小細胞肺 | 39 | 10000 | HOP-62 (RRID:CVCL_1285) | |||
| ホップ92 | 非小細胞肺 | 79.5 | 20000 | ホップ92 (RRID:CVCL_1286) | |||
| NCI-H226 | 非小細胞肺 | 61 | 20000 | NCI-H226 (RRID:CVCL_1544) | |||
| NCI-H23 | 非小細胞肺 | 33.4 | 20000 | NCI-H23 (RRID:CVCL_1547) | |||
| NCI-H322M | 非小細胞肺 | 35.3 | 20000 | NCI-H322M (RRID:CVCL_1557) | |||
| NCI-H460 | 非小細胞肺 | 17.8 | 7500 | NCI-H460 (RRID:CVCL_0459) | |||
| NCI-H522 | 非小細胞肺 | 38.2 | 20000 | NCI-H522 (RRID:CVCL_1567) | |||
| コロ205 | 結腸 | 23.8 | 15000 | COLO 205 (RRID:CVCL_0218) | |||
| HCC-2998 | 結腸 | 31.5 | 15000 | HCC2998 (RRID:CVCL_1266) | |||
| HCT116 | 結腸 | 17.4 | 5000 | HCT 116 (RRID:CVCL_0291) | |||
| HCT-15 | 結腸 | 20.6 | 10000 | HCT 15 (RRID:CVCL_0292) | |||
| HT-29 | 結腸 | 19.5 | 5000 | HT-29 (RRID:CVCL_0320) | |||
| KM12 | 結腸 | 23.7 | 15000 | KM12 (RRID:CVCL_1331) | |||
| SW-620 | 結腸 | 20.4 | 10000 | SW620 (RRID:CVCL_0547) | |||
| SF-268 | 中枢神経系 | 33.1 | 15000 | SF268 (RRID:CVCL_1689) | |||
| SF-295 | 中枢神経系 | 29.5 | 10000 | SF295 (RRID:CVCL_1690) | |||
| SF-539 | 中枢神経系 | 35.4 | 15000 | SF539 (RRID:CVCL_1691) | |||
| SNB-19 | 中枢神経系 | はい | 中枢神経系 | 34.6 | 15000 | SNB-19 (RRID:CVCL_0535) | |
| SNB-75 | 中枢神経系 | 62.8 | 20000 | SNB-75 (RRID:CVCL_1706) | |||
| U251 | 中枢神経系 | はい | 中枢神経系 | 23.8 | 7500 | U-251MG (RRID:CVCL_0021) | |
| LOX IMVI | メラノーマ | 20.5 | 7500 | LOX-IMVI (RRID:CVCL_1381) | |||
| マルメ-3M | メラノーマ | 46.2 | 20000 | マルメ-3M (RRID:CVCL_1438) | |||
| M14 | メラノーマ | 26.3 | 15000 | M14 (RRID:CVCL_1395) | |||
| MDA-MB-435 | メラノーマ | はい | 胸 | 25.8 | 15000 | MDA-MB-435 (RRID:CVCL_0417) | |
| SK-MEL-2 | メラノーマ | 45.5 | 20000 | SK-MEL-2 (RRID:CVCL_0069) | |||
| SK-MEL-28 | メラノーマ | 35.1 | 10000 | SK-MEL-28 (RRID:CVCL_0526) | |||
| SK-MEL-5 | メラノーマ | 25.2 | 10000 | SK-MEL-5 (RRID:CVCL_0527) | |||
| UACC-257 | メラノーマ | 38.5 | 20000 | UACC-257 (RRID:CVCL_1779) | |||
| UACC-62 | メラノーマ | 31.3 | 10000 | UACC-62 (RRID:CVCL_1780) | |||
| IGROV-1 | 卵巣 | 31 | 10000 | IGROV-1 (RRID:CVCL_1304) | |||
| OVCAR-3 | 卵巣 | 34.7 | 10000 | OVCAR-3 (RRID:CVCL_0465) | |||
| OVCAR-4 | 卵巣 | 41.4 | 15000 | OVCAR-4 (RRID:CVCL_1627) | |||
| OVCAR-5 | 卵巣 | 48.8 | 20000 | OVCAR-5 (RRID:CVCL_1628) | |||
| OVCAR-8 | 卵巣 | 26.1 | 10000 | OVCAR-8 (RRID:CVCL_1629) | |||
| NCI/ADR-RES（元々はMCF-7/ADR-RES） | 卵巣 | はい | 胸 | 34 | 15000 | NCI-ADR-RES (RRID:CVCL_1452) | |
| SK-OV-3 | 卵巣 | 48.7 | 20000 | SK-OV-3 (RRID:CVCL_0532) | |||
| 786-O | 腎臓 | 22.4 | 10000 | 786-O (RRID:CVCL_1051) | |||
| A498 | 腎臓 | 66.8 | 25000 | A-498 (RRID:CVCL_1056) | |||
| ACHN | 腎臓 | 27.5 | 10000 | ACHN (RRID:CVCL_1067) | |||
| CAKI-1 | 腎臓 | 39 | 10000 | カキ-1 (RRID:CVCL_0234) | |||
| RXF 393 | 腎臓 | 62.9 | 15000 | RXF 393L (RRID:CVCL_1673) | |||
| SN12C | 腎臓 | 29.5 | 15000 | SN12C (RRID:CVCL_1705) | |||
| TK-10 | 腎臓 | 51.3 | 15000 | TK-10 (RRID:CVCL_1773) | |||
| UO-31 | 腎臓 | 41.7 | 15000 | UO-31 (RRID:CVCL_1911) | |||
| PC-3 | 前立腺 | 27.1 | 7500 | PC-3 (RRID:CVCL_0035) | |||
| DU-145 | 前立腺 | 32.3 | 10000 | DU145 (RRID:CVCL_0105) | |||
| MCF7 | 胸 | 25.4 | 10000 | MCF-7 (RRID:CVCL_0031) | |||
| MDA-MB-231 | 胸 | 41.9 | 20000 | MDA-MB-231 (RRID:CVCL_0062) | |||
| MDA-MB-468 | 胸 | 62 | 2000 | MDA-MB-468 (RRID:CVCL_0419) | |||
| HS 578T | 胸 | 53.8 | 20000 | Hs 578T (RRID:CVCL_0332) | |||
| MDA-N | メラノーマ | はい | 胸 | 利用不可 | 22.5 | 15000 | MDA-N (RRID:CVCL_1910) |
| BT-549 | 胸 | 53.9 | 20000 | BT-549 (RRID:CVCL_1092) | |||
| T-47D | 胸 | 45.5 | 20000 | T-47D (RRID:CVCL_0553) |
追加の細胞株のリスト
| 細胞株 | 腫瘍の分類 | 種 | 接種密度 | セルロサウルスの識別番号とリンク |
|---|---|---|---|---|
| LXFL 529 | 非小細胞肺 | 人間 | 10000 | LXFL 529L (RRID:CVCL_D085) |
| DMS 114 | 小細胞肺 | 人間 | 20000 | DMS 114 (RRID:CVCL_1174) |
| SHP-77 | 小細胞肺 | 人間 | 40000 | SHP-77 (RRID:CVCL_1693) |
| DLD-1 | 結腸 | 人間 | 50000 | DLD-1 (RRID:CVCL_0248) |
| KM20L2 | 結腸 | 人間 | 10000 | KM20L2 (RRID:CVCL_D889) |
| SNB-78 | 中枢神経系 | 人間 | 20000 | SNB-78 (RRID:CVCL_B321) |
| XF 498 | 中枢神経系 | 人間 | 20000 | XF 498 (RRID:CVCL_8928) |
| RPMI-7951 | メラノーマ | 人間 | 20000 | RPMI-7951 (RRID:CVCL_1666) |
| M19-メル | メラノーマ | 人間 | 10000 | M19-MEL (RRID:CVCL_B415) |
| RXF-631 | 腎臓 | 人間 | 10000 | RXF 631L (RRID:CVCL_A780) |
| SN12K1 | 腎臓 | 人間 | 10000 | SN12K1 (RRID:CVCL_D106) |
| P388 | 白血病 | ねずみ | 50000 | P388 (RRID:CVCL_7222) |
| P388/ADR | 白血病 | ねずみ | 50000 | P388/ADR (RRID:CVCL_IZ75) |
参考文献
- ^ abcdefgh 「in vitroスクリーニングにおける細胞株」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015年5月8日。 2018年1月6日閲覧。
- ^ abcd 「NCI-60ヒト腫瘍細胞株スクリーニング」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015年8月26日。 2018年1月6日閲覧。
- ^ 「Discovery & Development Services」. Developmental Therapeutics Program .国立がん研究所. 2015年8月26日. 2018年1月6日閲覧。
- ^ 「開発治療プログラムへようこそ」。開発治療プログラム。国立がん研究所。 2018年1月6日閲覧。
- ^ 「COMPARE分析」.開発治療プログラム.国立がん研究所. 2015年8月11日. 2018年1月6日閲覧。
- ^ 「分子標的」.開発治療プログラム. 国立がん研究所. 2015年5月12日. 2018年1月7日閲覧。
- ^ abcdef 「MDA-MB-435とその派生株であるMDA-Nはメラノーマ細胞株であり、乳がん細胞株ではない」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015年5月8日。 2018年1月6日閲覧。
- ^ abcde 「細胞株NCI/ADR-RESは卵巣腫瘍細胞株であり、乳がん細胞株ではない」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015年5月8日。 2018年1月6日閲覧。
- ^ abc 「CNS細胞株SNB-19とU251は同一個体由来」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015年5月8日。 2018年1月6日閲覧。
- ^ ab 交差汚染または誤認細胞株データベース（PDF）、8.0、国際細胞株認証委員会（ICLAC）、2016年12月1日、 2018年1月6日閲覧
- ^ ab Prasad, Vidudala VTS; Gopalan, Ramprasad OG (2015年6月2日). 「2014年現在も、メラノーマ細胞株MDA-MB-435をヒト乳がんモデルとして継続使用」npj Breast Cancer . 1 : 15002–. doi :10.1038/npjbcancer.2015.2. PMC 5515196 . PMID 28721362.
- ^ ab 「Cellosaurus検索結果：「NCI60 cancer cell line panel」で61件ヒット」Cellosaurus .スイス・バイオインフォマティクス研究所. 2018年1月7日閲覧。参照には、検索結果にリンクされたページのリストが含まれます。
- ^ 「Cellosaurus - 細胞株に関する知識リソース」Cellosaurus .スイス・バイオインフォマティクス研究所. 2018年1月17日閲覧。参照には、追加細胞株リストに記載されているそれぞれの細胞株名で検索して見つかったページが含まれます。
