PCR
PcrA はプラスミドコピー減少の略で、グラム陽性病原体である黄色ブドウ球菌のプラスミドローリングサークル複製に影響を受ける染色体にコード化された遺伝子のスクリーニングで最初に発見されたヘリカーゼです。
生物学的機能
遺伝学的および生化学的研究により、ヘリカーゼはプラスミドのローリングサークル複製と紫外線照射によるDNA損傷の修復に必須であることが示されています。ヘリカーゼは、複製開始タンパク質によって複製起点が切断された二本鎖プラスミドDNAの巻き戻しを触媒します。また、遺伝学的および生化学的研究により、ヘリカーゼはグラム陽性細菌においてRecAを介した組換えのレベルを調節することで細胞生存に重要な役割を果たすことが示されています。
生化学的性質
ヘリカーゼは単量体トランスロカーゼであり、ATPを利用してDNAを解く。好ましい基質は3'オーバーハングを含む一本鎖DNAである。PcrAのプロセッシビティは、プラスミド複製開始タンパク質の存在下で増加する。
結晶構造
ヘリカーゼの構造は高解像度で解読されており、一本鎖DNA上の転座機構として「インチワーム運動」が示唆されている。生成物と基質の複合体において観察されるヘリカーゼの立体配座変化に基づき、メキシカンウェーブモデルが提唱されている。
分類
PcrA は、大腸菌ヘリカーゼ UvrD および Rep と真核生物ヘリカーゼ Srs2 を 含む SF1 スーパーファミリーのヘリカーゼに属します。
文学
- Iordanescu, S (1993年10月). 「プラスミドpT181の複製に影響を与える変異によって同定された黄色ブドウ球菌染色体遺伝子pcrAの特性解析」Mol Gen Genet . 241 ( 1–2 ): 185–92 . doi : 10.1007 / BF00280216 . PMID 8232203. S2CID 685186 .
- Petit, MA; Dervyn, E; Rose, M; Entian, KD; McGovern, S; Ehrlich, SD; Bruand, C (1998年7月). 「PcrAは、修復とローリングサークル複製の両方の機能を果たす、枯草菌の必須DNAヘリカーゼである」 . Mol Microbiol . 29 (1): 261–73 . doi : 10.1046 / j.1365-2958.1998.00927.x . PMID 9701819. S2CID 39193812 .
- Petit, MA; Ehrlich, D (2002年6月). 「組み換えタンパク質の毒性に対抗する必須細菌ヘリカーゼ」 . EMBO J. 21 ( 12): 3137–47 . doi : 10.1093/emboj/cdf317 . PMC 126070. PMID 12065426 .
- Chang, TL; Naqvi, A; Anand, SP; Kramer, MG; Munshi, R; Khan, SA (2002年11月). 「 Staphylococcus aureus PcrAヘリカーゼの生化学的特性とプラスミドローリングサークル複製における役割」 . J Biol Chem . 277 (48): 45880–6 . doi : 10.1074/jbc.m207383200 . PMID 12244110 .
- Anand, SP; Zheng, H; Bianco, PR; Leuba, SH; Khan, SA (2007年6月). 「PcrAのDNAヘリカーゼ活性は、RecAタンパク質のDNAからの置換やRecAを介した鎖交換の阻害には不要である」 . J Bacteriol . 189 (12): 4502–9 . doi : 10.1128/jb.00376-07 . PMC 1913354. PMID 17449621 .
- Soultanas, P; Dillingham, MS; Papadopoulos, F; Phillips, SE; Thomas, CD; Wigley, DB (1999年3月). 「プラスミド複製開始タンパク質RepDはPcrA DNAヘリカーゼの複製能を高める」. Nucleic Acids Res . 27 (6): 1421–8 . doi : 10.1093/nar/27.6.1421 . PMC 148333. PMID 10037801 .
- Velankar, SS; Soultanas, P; Dillingham, MS; Subramanya, HS; Wigley, DB (1999年4月). 「PcrA DNAヘリカーゼとDNA基質の複合体の結晶構造はインチワーム機構を示唆する」 . Cell . 97 (1): 75– 84. doi : 10.1016/s0092-8674(00)80716-3 . PMID 10199404 .