PARP1

PARP1
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
別名PARP1、ADPRT、ADPRT 1、ADPRT1、ARTD1、PARP、PARP-1、PPOL、pADPRT-1、ポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ1、ポリPARP、PARS
外部IDOMIM : 173870 ; MGI : 1340806 ; HomoloGene : 1222 ; GeneCards : PARP1 ; OMA : PARP1 - オーソログ
相同遺伝子
ヒトマウス
Entrez
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_001618

NM_007415

RefSeq(タンパク質)

NP_001609 NP_001609.2

該当なし

所在地(UCSC)チャネル1:226.36~226.41 Mbチャネル1:180.4~180.43 Mb
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ウィキデータ
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ポリ[ADP-リボース]ポリメラーゼ1PARP-1 )は、 NAD + ADP-リボシルトランスフェラーゼ1またはポリ[ADP-リボース]シンターゼ1としても知られ、ヒトではPARP1遺伝子によってコードされる酵素です。[ 5 ] PARPファミリー酵素の中で最も豊富で、このファミリーで使用されるNAD+の90%を占めます。[ 6 ] PARP1は主に細胞核に存在しますが、このタンパク質の細胞質画分も報告されています。[ 7 ]

機能

PARP1の働き:

  • NAD+を用いてポリADPリボース(PAR)を合成し、PAR部分をタンパク質に転移させる(ADPリボシル化)。[ 8 ]
  • 二本鎖に作用する BRCA と連携して、PARPファミリーのメンバーは一本鎖に作用します。また、BRCA が機能しなくなった場合は、PARP がそれらの役割も引き継ぎます (DNA 修復の場合)。

PARP1 は以下に関与しています:

PARP1 は以下によって活性化されます:

DNA損傷修復における役割

PARP1はDNA損傷を検知し、修復経路の選択を促す最初の応答者として働く。[ 12 ] PARP1はヒストンADPリボシル化によってクロマチン構造の脱緻密化を誘導し、また複数のDNA修復因子と相互作用してこれらを修飾することで修復効率に寄与する。[ 6 ] PARP1はヌクレオチド除去修復非相同末端結合微小相同性媒介末端結合相同組換え修復、DNAミスマッチ修復などの経路を含むいくつかのDNA修復プロセスの制御に関与している。[ 12 ]

PARP1は一本鎖DNA(ssDNA)切断の修復に関与している。siRNAを用いて細胞内PARP1レベルをノックダウンする、小分子を用いてPARP1の活性を阻害すると、ssDNA切断の修復が減少する。PARP1が存在しない状態では、DNA複製中にこれらの切断に遭遇すると、複製フォークが停止し、二本鎖DNA(dsDNA)切断が蓄積する。これらのdsDNA切断は相同組換え(HR)修復、つまり潜在的にエラーのない修復機構によって修復される。このため、PARP1を欠損する細胞は過剰組換え表現型(例:HR頻度の増加)を示し、[ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]これはpunアッセイを用いたマウスの生体内でも観察されている。[ 16 ]したがって、HR経路が機能している場合、PARP1ヌル変異体(機能するPARP1を持たない細胞)は不健康な表現型を示さず、実際、PARP1ノックアウトマウスでは負の表現型は示されず、腫瘍形成の発生率の増加も見られません。[ 17 ]

炎症における役割

PARP1は、腫瘍壊死因子インターロイキン6、誘導性一酸化窒素合成酵素などの炎症性メディエーターのNF-κB転写に必要である。[ 9 ] [ 18 ] PARP1活性は、多くの組織で加齢とともに増加する炎症性マクロファージに寄与する。[ 19 ] PARP1によるHMGB1高移動度群タンパク質のADPリボシル化は、アポトーシス細胞の除去を阻害し、それによって炎症を持続させる。[ 20 ]

喘息において、 PARP1はCD4+ T細胞好酸球樹状細胞などの免疫細胞の動員と機能を促進する。[ 18 ]

がんにおける過剰発現

PARP1は、非常にエラーを起こしやすいDNA修復経路であるマイクロホモロジー介在末端結合(MMEJ)に必要な6つの酵素の1つです。[ 21 ] MMEJは、欠失、転座、逆位、その他の複雑な再編成などの染色体異常と関連しています。PARP1が上方制御されると、MMEJが増加し、ゲノム不安定性を引き起こします。[ 22 ] チロシンキナーゼ活性化白血病では、PARP1が上方制御され、MMEJが増加します。[ 22 ]

PARP1はプロモーター領域のETS部位がエピジェネティックに低メチル化されている場合にも過剰発現し、これが子宮内膜がん[ 23 ] 、 BRCA変異卵巣がん[ 24 ]、BRCA変異漿液性卵巣がん[ 25 ]への進行に寄与する。

PARP1は、神経芽腫[ 26 ] 、 HPV感染性口腔咽頭癌[ 27 ] 、精巣腫瘍およびその他の生殖細胞腫瘍[ 28]、ユーイング肉腫[ 29 ] 、悪性リンパ腫[ 30 ] 、乳癌[ 31 ] 、大腸癌[ 32 ]など、他の多くの癌でも過剰発現します

がんでは、1 つ以上の DNA 修復遺伝子の発現が欠損していることが非常に多いですが、DNA 修復遺伝子の過剰発現はがんではそれほど一般的ではありません。たとえば、生殖細胞で少なくとも 36 個の DNA 修復酵素に突然変異による欠陥があると、がんのリスクが増大します (遺伝性がん症候群)。( DNA 修復不全症も参照)。同様に、1 つ以上のがんにおいて、少なくとも 12 個の DNA 修復遺伝子がエピジェネティックに抑制されていることが頻繁に発見されています。(エピジェネティックに低下した DNA 修復とがんも参照)。通常、DNA 修復酵素の発現欠損は修復されない DNA 損傷の増加をもたらし、これが複製エラー (損傷乗り越え合成) によって突然変異とがんを引き起こします。しかし、PARP1 によるMMEJ修復は非常に不正確であるため、この場合は、発現不足ではなく、過剰発現が明らかにがんを引き起こします。

BRCA1およびBRCA2との相互作用

BRCA1BRCA2は、HR経路の機能に少なくとも部分的には必要です。BRCA1またはBRCA2が欠損した細胞は、PARP1阻害またはノックダウンに対して非常に感受性が高く、アポトーシスによる細胞死に至ることが示されています。これは、BRCA1とBRCA2の両方の正常なコピーを少なくとも1つ持つ細胞とは対照的です。多くの乳がんは、BRCA1またはBRCA2、あるいは経路における他の必須遺伝子の変異により、BRCA1/BRCA2 HR修復経路に欠陥を有しています(後者は「BRCAness」を持つがんと呼ばれます)。BRCAnessを持つ腫瘍はPARP1阻害剤に対して非常に感受性が高いと仮定されており、マウスを用いた実験では、これらの阻害剤がBRCA1/2欠損異種移植片の腫瘍化を阻止し、BRCA1/2欠損異種移植片から以前に形成された腫瘍を根絶できることが実証されています。

がん治療への応用

PARP1阻害剤は、がん治療における有効性が試験されている。[ 33 ] PARP1阻害剤は、腫瘍の阻害剤に対する高い感受性と、機能的なBRCA HR経路を持つ残存する健康な細胞への悪影響がないことを踏まえ、BRCA遺伝子変異を伴うがんに対して非常に効果的な治療法となる可能性があると仮説が立てられている。これは、すべての細胞に対して高い毒性を示し、健康な細胞にDNA損傷を引き起こし、二次的ながんの発生につながる可能性がある従来の化学療法とは対照的である。[ 34 ] [ 35 ]

エージング

13種の哺乳類(ラット、モルモット、ウサギ、マーモセット、ヒツジ、ブタ、ウシ、ピグミーチンパンジー、ウマ、ロバ、ゴリラゾウ、およびヒト)の透過処理した単核白血球血液細胞で測定されたPARP活性(主にPARP1による)は、種の最大寿命と相関している。 [ 36 ]百歳以上(100歳以上)のヒトの血液サンプルから樹立されたリンパ芽球様細胞株は、より若い(20歳から70歳)人の細胞株よりも有意に高いPARP活性を示している。[ 37 ] Wrnタンパク質は、ヒトの早期老化障害であるウェルナー症候群の患者に欠損している。PARP1およびWrnタンパク質は、DNA切断の処理に関与する複合体の一部である。[ 38 ]これらの発見は、 長寿とPARP媒介DNA修復能力との関連を示している。さらに、PARPは活性酸素種の産生を抑制する作用もあり、DNAやタンパク質への酸化ダメージを阻害することで寿命の延長に寄与する可能性があります。[ 39 ]これらの観察結果は、PARP活性が哺乳類の長寿に寄与していることを示唆しており、老化のDNA損傷理論と一致しています。

PARP1はチロシルtRNA合成酵素(TyrRS)との相互作用を通じてレスベラトロールの主な機能標的であると思われる。 [ 40 ] チロシルtRNA合成酵素はストレス条件下で核に移行し、PARP1のNAD +依存性自己ポリADPリボシル化を刺激する。 [ 40 ]これにより、PARP1の機能はクロマチン構築タンパク質からDNA損傷応答因子および転写調節因子へと変化する。[ 41 ]

PARP1のメッセンジャーRNAレベルとタンパク質レベルは、PARP1のプロモーター領域にある複数のETS1結合部位と相互作用するETS1転写因子の発現レベルによって部分的に制御される。 [ 42 ] ETS1転写因子がPARP1プロモーター上の結合部位に結合できる程度は、PARP1プロモーター上のETS1結合部位のCpGアイランドのメチル化状態に依存する。[ 23 ] PARP1プロモーターのETS1結合部位のこれらのCpGアイランドがエピジェネティックに低メチル化されて いる場合、PARP1は高レベルで発現する。[ 23 ] [ 24 ]

高齢者(69~75歳)の細胞では、 PARP1およびPARP2遺伝子の恒常的発現レベルが、若年成人(19~26歳)の細胞と比較して半分に減少している。しかし、百歳以上の人(100~107歳の人)では、PARP1の恒常的発現レベルは若年者と同程度である。[ 43 ]百歳以上の人のこの高いPARP1発現レベルは、 H 2 O 2による亜致死的酸化的DNA損傷 の修復をより効率的にすることが示されている。[ 43 ] DNA修復能の向上は長寿に寄与すると考えられている(老化におけるDNA損傷理論を参照)。百歳以上の人のPARP1の恒常的レベルが高いのは、PARP1発現のエピジェネティック制御の変化によるものと考えられていた。[ 43 ]

サーチュイン1とPARP1はどちらも、活性に必要なNAD+に対してほぼ同等の親和性を持っています。[ 44 ]しかし、DNA損傷によりPARP1のレベルが100倍以上増加し、SIRT1にほとんど残らない可能性があります。[ 44 ]

細胞死における役割

重度のDNA損傷の後、PARP1が過剰に活性化されると細胞死につながることがあります。[ 45 ]当初、酵素の過剰活性化はアポトーシス細胞死に関連付けられていましたが[ 46 ] [ 47 ]、後に、PARP1を介した細胞死は壊死性細胞死の特徴(すなわち、早期の細胞膜破壊、ミトコンドリアの構造的および機能的変化)を示すことが判明しました。[ 48 ] [ 49 ]これらの知見は、酸化ストレス誘導性細胞死が中心的な細胞イベントである虚血再灌流障害(脳卒中、心臓、腸など)のさまざまなモデルにおけるPARP阻害剤とPARP1ノックアウト表現型の組織保護効果を示す以前およびその後の報告の説明を提供しました。[ 50 ]その後、アポトーシス誘導因子(AIF、誤称)が、パルタナトスと呼ばれるPARP1介在制御壊死性細胞死経路の重要なメディエーターとして特定されました。[ 51 ]

植物PARP1

植物は動物のPARP1とかなりの類似性を持つPARP1を持っており、DNA損傷、感染、その他のストレスに対する植物の応答におけるポリ(ADP-リボシル)化の役割が研究されている。[ 52 ] [ 53 ]興味深いことに、シロイヌナズナ(およびおそらく他の植物)では、DNA損傷と細菌病原性に対する防御応答において、PARP2はPARP1よりも重要な役割を果たしている。[ 54 ] 植物PARP2は、PARP1と中程度の類似性を持つPARP調節ドメインと触媒ドメインを持ち、植物および動物PARP1タンパク質のZnフィンガーDNA結合モチーフではなく、N末端SAP DNA結合モチーフを持っている。[ 54 ]

相互作用

PARP1は以下と 相互作用することが示されています

参照

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