snRNP70

SNRNP70
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2L5I、2L5J、3CW1、3PGW、4PJO、4PKD​​
識別子
エイリアス	SNRNP70、RNPU1Z、RPU1、SNRP70、Snp1、U1-70K、U170K、U1AP、U1RNP、SnRNP70、小核リボ核タンパク質U1サブユニット70
外部ID	オミム: 180740 ; MGI : 98341 ;ホモロジーン: 20672 ;ジーンカード: SNRNP70 ; OMA : SNRNP70 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 19番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 19q13.33 始める 49,085,419 bp [ 1 ] 終わり 49,108,605 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 7番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 7 B3|7 29.28 cM 始める 45,025,877 bp [ 2 ] 終わり 45,045,166 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 小脳の右半球 腓骨神経 右卵管 甲状腺の右葉 左卵巣 子宮体部 右卵巣 甲状腺の左葉 子宮頸管 膵臓の体 上位の表現 網膜の神経層 性器結節 胚の尾 一次視覚野 上前頭回 心室帯 卵黄嚢 海馬歯状回顆粒細胞 リップ 胚葉上層 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 核酸結合 mRNA結合 U1 snRNP結合 U1 snRNA結合 RNA結合 細胞成分 核の粒子 核質 前触媒スプライセオソーム スプライセオソーム複合体 コミットメントコンプレックス U2型プレスプライソソーム 核 U1 snRNP 細胞質 生物学的プロセス スプライソソームを介したmRNAスプライシング スプライソソームを介したmRNAスプライシングの正の制御 mRNA処理 シャペロンを介したオートファジーの負の制御 RNAスプライシングの調節 RNAスプライシング ATP依存性活性の調節 タンパク質のリフォールディングの負の制御 腫瘍壊死因子に対する細胞反応 レチノイン酸に対する細胞反応 トランスフォーミング成長因子β刺激に対する細胞応答 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6625 20637 アンサンブル ENSG00000104852 ENSMUSG00000063511 ユニプロット P08621 Q62376 RefSeq (mRNA) NM_001009820 NM_001301069 NM_003089 NM_009224 RefSeq（タンパク質） NP_001287998 NP_003080 NP_033250 場所（UCSC） 19章: 49.09 – 49.11 Mb 7章: 45.03 – 45.05 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

snRNP70はU1小核リボ核タンパク質70 kDaとしても知られ、ヒトではSNRNP70遺伝子によってコードされるタンパク質^{[ 5 ]}である。^{[ 6 ] [ 7 ]} snRNP70はU1スプライソソームRNAと会合し、スプライソソームの中核構成要素であるU1snRNPを形成する小核リボ核タンパク質である。U1-70Kタンパク質とスプライソソーム複合体の他の構成要素は、アルツハイマー病の散発性および家族性症例の両方において、界面活性剤不溶性の凝集体を形成する。^{[ 8 ] [ 9 ]} U1-70Kはアルツハイマー病の神経原線維変化においてタウと共局在する。

相互作用

snRNP70はASF/SF2、^{[ 10 ] [ 11 ]} SRPK1、^{[ 12 ] [ 13 ]} ZRANB2と相互作用することが示されている。^{[ 14 ]}

自己免疫における役割

snRNP70に対する抗体は混合性結合組織病と関連している。^{[ 15 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000104852 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000063511 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Spritz RA, Strunk K, Surowy CS, Hoch SO, Barton DE, Francke U (1987年12月). 「ヒトU1-70K snRNPタンパク質：cDNAクローニング、染色体局在、発現、選択的スプライシング、RNA結合」 . Nucleic Acids Research . 15 (24): 10373–91 . doi : 10.1093 / nar/15.24.10373 . PMC 339950. PMID 2447561 .  
6. 「Entrez Gene：SNRP70小核リボ核タンパク質70kDaポリペプチド（RNP抗原）」。
7. Spritz RA, Strunk K, Surowy CS, Mohrenweiser HW (1990年10月). 「ヒトU1-70Kリボ核タンパク質抗原遺伝子：構成、ヌクレオチド配列、および遺伝子座19q13.3へのマッピング」. Genomics . 8 (2): 371–9 . doi : 10.1016/0888-7543(90)90295-6 . PMID 2147422 . 
8. Diner I, Hales CM, Bishof I, Rabenold L, Duong DM, Yi H, Laur O, Gearing M, Troncoso J, Thambisetty M, Lah JJ, Levey AI, Seyfried NT (2014年12月). 「アルツハイマー病における核内小分子リボ核タンパク質U1-70Kの凝集特性」 . The Journal of Biological Chemistry . 289 (51): 35296– 313. doi : 10.1074 / jbc.M114.562959 . PMC 4271217. PMID 25355317 .  
9. Hales CM, Seyfried NT, Dammer EB, Duong D, Yi H, Gearing M, Troncoso JC, Mufson EJ, Thambisetty M, Levey AI, Lah JJ (2014年4月). 「アルツハイマー病における常染色体優性遺伝子変異および21トリソミーに起因するU1小核リボ核タンパク質（snRNP）凝集」 . Molecular Neurodegeneration . 9 15. doi : 10.1186/1750-1326-9-15 . PMC 4022210. PMID 24773620 .  
10. Xiao SH, Manley JL (1998年11月). 「リン酸化・脱リン酸化はスプライシング因子ASF/SF2の活性に異なる影響を与える」 . The EMBO Journal . 17 (21): 6359–67 . doi : 10.1093/emboj/17.21.6359 . PMC 1170960. PMID 9799243 .  
11. Cao W, Garcia-Blanco MA (1998年8月). 「ヒトU1 70kタンパク質のセリン／アルギニンに富むドメインはASF/SF2結合に必要かつ十分である」 . The Journal of Biological Chemistry . 273 (32): 20629–35 . doi : 10.1074/jbc.273.32.20629 . PMID 9685421 . 
12. Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (1998年2月). 「SRPK2：哺乳類細胞におけるpre-mRNAスプライシング因子の相互作用と局在を媒介する、発現レベルが異なるSRタンパク質特異的キナーゼ」 . The Journal of Cell Biology . 140 (4): 737–50 . doi : 10.1083/jcb.140.4.737 . PMC 2141757. PMID 9472028 .  
13. Kamachi M, Le TM, Kim SJ, Geiger ME, Anderson P, Utz PJ (2002年11月). 「ヒト自己免疫血清を用いた自己抗原キナーゼシグナル伝達経路同定のための分子プローブ」 . The Journal of Experimental Medicine . 196 (9): 1213–25 . doi : 10.1084/jem.20021167 . PMC 2194102. PMID 12417631 .  
14. Adams DJ, van der Weyden L, Mayeda A, Stamm S, Morris BJ, Rasko JE (2001年7月). 「ZNF265 ― 選択的スプライシングを誘導できる新規スプライセオソームタンパク質」 . The Journal of Cell Biology . 154 (1): 25– 32. doi : 10.1083/jcb.200010059 . PMC 2196870. PMID 11448987 .  
15. Sato T, Fujii T, Yokoyama T, Fujita Y, Imura Y, Yukawa N, Kawabata D, Nojima T, Ohmura K, Usui T, Mimori T (2010年12月). 「脳脊髄液中の抗U1 RNP抗体は、全身性エリテマトーデスおよび混合性結合組織病における中枢神経精神症状と関連する」. Arthritis and Rheumatism . 62 (12): 3730–40 . doi : 10.1002/art.27700 . hdl : 2433/142082 . PMID 20722023 . 

さらに読む

• Wilk HE, Schaefer KP, Agris PF, Boak AM, Kovacs SA (1991年7月). 「U1 SnRNPとHnRNPの会合は、スプライスサイト非依存的なU1 SnRNPタンパク質とHnRNAの初期の非特異的相互作用を伴う」. Molecular and Cellular Biochemistry . 106 (1): 55– 66. doi : 10.1007/BF00231189 . PMID  1833625. S2CID  22696966 .
• Query CC, Bentley RC, Keene JD (1989年4月). 「70K U1 snRNPタンパク質のU1 RNA結合ドメイン内に同定された共通RNA認識モチーフ」. Cell . 57 (1): 89– 101. doi : 10.1016 / 0092-8674(89)90175-X . PMID  2467746. S2CID  22127152 .
• Du Clos TW (1989年10月). 「C反応性タンパク質はU1小核リボ核タンパク質と反応する」 . Journal of Immunology . 143 (8): 2553–9 . doi : 10.4049/jimmunol.143.8.2553 . PMID  2477447. S2CID  84070596 .
• Theissen H, Etzerodt M, Reuter R, Schneider C, Lottspeich F, Argos P, Lührmann R, Philipson L (1986年12月). 「U1 RNA関連70Kタンパク質のヒトcDNAのクローニング」 . The EMBO Journal . 5 (12): 3209–17 . doi : 10.1002/ j.1460-2075.1986.tb04631.x . PMC  1167314. PMID  3028775 .
• Romac JM, Graff DH, Keene JD (1994年7月). 「U1小核リボ核タンパク質（snRNP）70Kタンパク質は、RNA結合ドメインの核局在シグナルを介してU1 snRNP粒子とは独立して輸送される」 . Molecular and Cellular Biology . 14 (7): 4662–70 . doi : 10.1128/MCB.14.7.4662 . PMC  358839. PMID  7516470 .
• Wu JY, Maniatis T (1993年12月). 「スプライス部位選択と選択的スプライシング制御に関与するタンパク質間の特異的相互作用」. Cell . 75 (6): 1061–70 . doi : 10.1016 / 0092-8674(93)90316-I . PMID  8261509. S2CID  22951690 .
• Woppmann A, Will CL, Kornstädt U, Zuo P, Manley JL, Lührmann R (1993年6月). 「スプライシング因子に典型的なアルギニン／セリンリッチドメインをリン酸化させるsnRNP関連キナーゼ活性の同定」 . Nucleic Acids Research . 21 (12): 2815–22 . doi : 10.1093/nar/21.12.2815 . PMC  309659. PMID  8332490 .
• Northemann W, Berg H, Stahnke G, Walter M, Hunt N, Fenning S (1995年12月). 「ヒト68kDa (U1) リボ核タンパク質抗原における阻害因子の同定」. Protein Expression and Purification . 6 (6): 748–56 . doi : 10.1006/prep.1995.0005 . PMID  8746626 .
• Zhang WJ, Wu JY (1996年10月). 「構成的スプライシングおよび選択的スプライシングに関与する新規SRタンパク質p54の機能特性」 . Molecular and Cellular Biology . 16 (10): 5400–8 . doi : 10.1128/MCB.16.10.5400 . PMC  231539. PMID  8816452 .
• Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996年9月). 「正規化と減算：遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」 . Genome Research . 6 (9): 791–806 . doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
• Hong W, Bennett M, Xiao Y, Feld Kramer R, Wang C, Reed R (1997年1月). 「U2 snRNPとスプライセオソーム複合体Eの関連」 . Nucleic Acids Research . 25 (2): 354–61 . doi : 10.1093 / nar/25.2.354 . PMC  146436. PMID  9016565 .
• クライン・グネヴィーク JM、ファン・アールセン Y、ファン・デル・ケンプ A、ネリセン R、プルイン GJ、ファン・フェンローイ WJ (1997 年 8 月)。 「U1 snRNP 特異的プロテイン C の核内蓄積は、核内での拡散と滞留によるものです。」実験細胞研究。235 (1): 265–73 .土井: 10.1006/excr.1997.3663。PMID  9281376。
• Zhang WJ, Wu JY (1998年2月). 「Sip1、pre-mRNAスプライシングに必須な新規RSドメイン含有タンパク質」 . Molecular and Cellular Biology . 18 (2): 676–84 . doi : 10.1128/MCB.18.2.676 . PMC  108778. PMID 9447963  .
• Blencowe BJ, Issner R, Nickerson JA, Sharp PA (1998年4月). 「pre-mRNAスプライシングのコアクチベーター」 . Genes & Development . 12 (7): 996–1009 . doi : 10.1101/gad.12.7.996 . PMC  316672. PMID  9531537 .
• Cao W, Garcia-Blanco MA (1998年8月). 「ヒトU1 70kタンパク質のセリン／アルギニンに富むドメインはASF/SF2結合に必要かつ十分である」 . The Journal of Biological Chemistry . 273 (32): 20629–35 . doi : 10.1074/jbc.273.32.20629 . PMID  9685421 .
• Neubauer G, King A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (1998年9月). 「質量分析とESTデータベース検索による多タンパク質スプライソソーム複合体の特性解析」Nature Genetics . 20 (1): 46– 50. doi : 10.1038/1700 . PMID  9731529 . S2CID  585778 .
• Xiao SH, Manley JL (1998年11月). 「リン酸化・脱リン酸化はスプライシング因子ASF/SF2の活性に異なる影響を及ぼす」 . The EMBO Journal . 17 (21): 6359–67 . doi : 10.1093/emboj/17.21.6359 . PMC  1170960. PMID  9799243 .
• Dumortier H, Klein Gunnewiek J, Roussel JP, van Aarssen Y, Briand JP, van Venrooij WJ, Muller S (1998年12月). 「U1Cタンパク質の少なくとも3つの線状領域は、溶液中のタンパク質表面およびヒトスプライソソームU1 snRNP粒子上に露出しているが、ジンクフィンガードメインは露出していない」 . Nucleic Acids Research . 26 (23): 5486–91 . doi : 10.1093 / nar/26.23.5486 . PMC  147990. PMID  9826776 .

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